CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : CodonNum = 38 & Codon = ---

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a38Q38deldelCAA---765765125504-25506

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a38Q38delCAA---765765All0.000146
ORF3a38Q38delCAA---192192AY.260.005436
ORF3a38Q38delCAA---153153B.1.6300.801047
ORF3a38Q38delCAA---5454B.1.177.820.025776
ORF3a38Q38delCAA---5050B.1.1.70.000045
ORF3a38Q38delCAA---4343AY.430.000191
ORF3a38Q38delCAA---3535B.1.1770.000461
ORF3a38Q38delCAA---3030AY.40.000047
ORF3a38Q38delCAA---2323B.1.10.000417
ORF3a38Q38delCAA---2020AY.250.00012
ORF3a38Q38delCAA---1313B.1.617.20.000049
ORF3a38Q38delCAA---99B.1.2580.000599
ORF3a38Q38delCAA---88AY.1030.00005
ORF3a38Q38delCAA---77AY.390.000173
ORF3a38Q38delCAA---66AY.440.000037
ORF3a38Q38delCAA---66P.10.000095
ORF3a38Q38delCAA---55B.1.20.000044
ORF3a38Q38delCAA---55B.1.438.10.000536
ORF3a38Q38delCAA---44AY.4.20.000087
ORF3a38Q38delCAA---44AY.4.50.00043
ORF3a38Q38delCAA---44B.10.000037
ORF3a38Q38delCAA---44P.1.90.019231
ORF3a38Q38delCAA---33AY.1200.000112
ORF3a38Q38delCAA---33AY.450.000365
ORF3a38Q38delCAA---33B.1.160.240.013274
ORF3a38Q38delCAA---33B.1.4270.000151
ORF3a38Q38delCAA---33U.30.011583
ORF3a38Q38delCAA---22AY.130.000322
ORF3a38Q38delCAA---22AY.46.20.001271
ORF3a38Q38delCAA---22AY.50.000041
ORF3a38Q38delCAA---22AY.590.001059
ORF3a38Q38delCAA---22AY.60.000082
ORF3a38Q38delCAA---22AY.670.000929
ORF3a38Q38delCAA---22AY.750.000112
ORF3a38Q38delCAA---22AY.810.003984
ORF3a38Q38delCAA---22AY.9.20.000073
ORF3a38Q38delCAA---22AY.980.000158
ORF3a38Q38delCAA---22B.1.1.5190.000079
ORF3a38Q38delCAA---22B.1.160.330.00885
ORF3a38Q38delCAA---22B.1.5250.000226
ORF3a38Q38delCAA---22B.1.6210.000177
ORF3a38Q38delCAA---22D.20.00015
ORF3a38Q38delCAA---11A.2.30.004739
ORF3a38Q38delCAA---11AY.1020.000027
ORF3a38Q38delCAA---11AY.1110.000183
ORF3a38Q38delCAA---11AY.1130.000142
ORF3a38Q38delCAA---11AY.1140.000231
ORF3a38Q38delCAA---11AY.1170.000085
ORF3a38Q38delCAA---11AY.200.000039
ORF3a38Q38delCAA---11AY.230.00007
ORF3a38Q38delCAA---11AY.280.00189
ORF3a38Q38delCAA---11AY.290.000016
ORF3a38Q38delCAA---11AY.29.10.000221
ORF3a38Q38delCAA---11AY.30.00001
ORF3a38Q38delCAA---11AY.330.000067
ORF3a38Q38delCAA---11AY.39.10.00004
ORF3a38Q38delCAA---11AY.420.00004
ORF3a38Q38delCAA---11AY.600.000938
ORF3a38Q38delCAA---11AY.610.000105
ORF3a38Q38delCAA---11AY.650.000533
ORF3a38Q38delCAA---11AY.70.000196
ORF3a38Q38delCAA---11AY.75.10.00018
ORF3a38Q38delCAA---11AY.900.000684
ORF3a38Q38delCAA---11AY.910.00073
ORF3a38Q38delCAA---11AY.930.000273
ORF3a38Q38delCAA---11AY.98.10.000048
ORF3a38Q38delCAA---11AY.990.001049
ORF3a38Q38delCAA---11AY.99.20.000092
ORF3a38Q38delCAA---11B0.000128
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.1.2220.000204
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.1.2250.007194
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.1.280.000311
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.1.2840.000107
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.1.3110.000358
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.1.390.00051
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.1.4090.002833
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.1600.000031
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.177.60.000977
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.214.20.0006
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.2210.000071
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.2410.000812
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.2430.00007
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.6370.000073
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.6380.052632
ORF3a38Q38delCAA---11P.1.120.000484
ORF3a38Q38delCAA---11P.1.140.000048
ORF3a38Q38delCAA---11P.1.150.000232