CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : CodonNum = 38

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a38Q38RnonsyncAacGa16292162900.99987725504-25506
ORF3a38Q38RnonsyncAAcGG1629220.0001227625504-25506
ORF3a38Q38LnonsyncAacTa254925410.99686225504-25506
ORF3a38Q38LnonsynCAaTTa254980.0031384925504-25506
ORF3a38Q38deldelCAA---765765125504-25506
ORF3a38Q38PnonsyncAacCa467467125504-25506
ORF3a38Q38QsyncaAcaG382382125504-25506
ORF3a38Q38EnonsynCaaGaa281281125504-25506
ORF3a38Q38KnonsynCaaAaa147147125504-25506
ORF3a38Q38HnonsyncaAcaT128850.66406225504-25506
ORF3a38Q38HnonsyncaAcaC128430.33593825504-25506
ORF3a38Q38XnonsynCaaTaa8181125504-25506
ORF3a38Q38del1delcAac-a320.66666725504-25506
ORF3a38Q38del1delCaa-aa310.33333325504-25506
ORF3a38Q38YnonsynCaATaC22125504-25506
ORF3a38Q38WnonsynCAATGG22125504-25506
ORF3a38Q38SnonsynCAaTCa11125504-25506

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a38Q38RcAacGa1629016292All0.003116
ORF3a38Q38RcAAcGG216292All0
ORF3a38Q38RcAacGa1376013761B.1.2210.977412
ORF3a38Q38RcAAcGG113761B.1.2210.000071
ORF3a38Q38LcAacTa25412549All0.000486
ORF3a38Q38LCAaTTa82549All0.000002
ORF3a38Q38LcAacTa15711577B.1.1.70.001406
ORF3a38Q38LCAaTTa61577B.1.1.70.000005
ORF3a38Q38RcAacGa11971197B.1.221.30.9975
ORF3a38Q38delCAA---765765All0.000146
ORF3a38Q38LcAacTa639639B.1.1.5190.025375
ORF3a38Q38PcAacCa467467All0.000089
ORF3a38Q38QcaAcaG382382All0.000073
ORF3a38Q38RcAacGa344344B.1.221.11
ORF3a38Q38PcAacCa308308B.1.1.2310.95356
ORF3a38Q38ECaaGaa281281All0.000054
ORF3a38Q38RcAacGa249249B.1.221.21
ORF3a38Q38RcAacGa240240B.1.221.41
ORF3a38Q38delCAA---192192AY.260.005436
ORF3a38Q38delCAA---153153B.1.6300.801047
ORF3a38Q38KCaaAaa147147All0.000028
ORF3a38Q38RcAacGa139139AY.260.003935
ORF3a38Q38HcaAcaT85128All0.000016
ORF3a38Q38HcaAcaC43128All0.000008
ORF3a38Q38QcaAcaG8787B.1.177.860.01596
ORF3a38Q38XCaaTaa8181All0.000015
ORF3a38Q38ECaaGaa8181AY.40.000126
ORF3a38Q38RcAacGa7979B.10.000724
ORF3a38Q38PcAacCa7777AL.11
ORF3a38Q38RcAacGa7777B.1.1.70.000069
ORF3a38Q38ECaaGaa7272B.1.4270.003636
ORF3a38Q38QcaAcaG6969AY.1090.051036
ORF3a38Q38LcAacTa6868AY.40.000106
ORF3a38Q38delCAA---5454B.1.177.820.025776
ORF3a38Q38delCAA---5050B.1.1.70.000045
ORF3a38Q38LcAacTa4545B.1.10.000816
ORF3a38Q38delCAA---4343AY.430.000191
ORF3a38Q38LcAacTa4141AY.390.001013
ORF3a38Q38ECaaGaa3939AY.1020.001034
ORF3a38Q38QcaAcaG3939B.1.1.70.000035
ORF3a38Q38RcAacGa3536B.1.1770.000461
ORF3a38Q38RcAAcGG136B.1.1770.000013
ORF3a38Q38delCAA---3535B.1.1770.000461
ORF3a38Q38KCaaAaa3232B.1.617.20.00012
ORF3a38Q38PcAacCa3131B.1.1.70.000028
ORF3a38Q38delCAA---3030AY.40.000047
ORF3a38Q38HcaAcaC1529B.1.1.70.000013
ORF3a38Q38HcaAcaT1429B.1.1.70.000013
ORF3a38Q38LcAacTa2525AY.5.40.006918
ORF3a38Q38ECaaGaa2525B.1.617.20.000094
ORF3a38Q38QcaAcaG2424AY.1200.000892
ORF3a38Q38KCaaAaa2424AY.610.002515
ORF3a38Q38QcaAcaG2323AY.40.000036
ORF3a38Q38delCAA---2323B.1.10.000417
ORF3a38Q38delCAA---2020AY.250.00012
ORF3a38Q38HcaAcaT1619AY.250.000096
ORF3a38Q38HcaAcaC319AY.250.000018
ORF3a38Q38QcaAcaG1818B.1.20.000158
ORF3a38Q38ECaaGaa1717B.1.1.250.009665
ORF3a38Q38LcAacTa1717B.1.1.4120.129771
ORF3a38Q38PcAacCa1515AY.430.000066
ORF3a38Q38RcAacGa1515B.1.617.20.000056
ORF3a38Q38LcAacTa1414AY.1030.000087
ORF3a38Q38RcAacGa1313AY.1030.000081
ORF3a38Q38RcAacGa1313B.1.2100.027719
ORF3a38Q38delCAA---1313B.1.617.20.000049
ORF3a38Q38KCaaAaa1212AY.320.00639
ORF3a38Q38RcAacGa1212B.1.10.000218
ORF3a38Q38QcaAcaG1212B.1.621.10.00607
ORF3a38Q38KCaaAaa1111AY.250.000066
ORF3a38Q38QcaAcaG1111B.1.617.20.000041
ORF3a38Q38LcAacTa1010AY.250.00006
ORF3a38Q38QcaAcaG1010AY.30.000099
ORF3a38Q38PcAacCa1010B.10.000092
ORF3a38Q38LcAacTa1010B.1.617.20.000038
ORF3a38Q38ECaaGaa99AY.390.000222
ORF3a38Q38QcaAcaG99AY.760.043478
ORF3a38Q38ECaaGaa99B.1.1.70.000008
ORF3a38Q38delCAA---99B.1.2580.000599
ORF3a38Q38QcaAcaG99B.1.5260.000212
ORF3a38Q38delCAA---88AY.1030.00005
ORF3a38Q38LcAacTa88AY.330.000534
ORF3a38Q38KCaaAaa88AY.40.000012
ORF3a38Q38HcaAcaT88AY.7.10.000902
ORF3a38Q38PcAacCa88B.1.10.000145
ORF3a38Q38HcaAcaT78B.1.10.000127
ORF3a38Q38HcaAcaC18B.1.10.000018
ORF3a38Q38XCaaTaa88B.1.1.70.000007
ORF3a38Q38RcAacGa88B.1.1600.00025
ORF3a38Q38LcAacTa88B.1.2580.000532
ORF3a38Q38delCAA---77AY.390.000173
ORF3a38Q38XCaaTaa77AY.40.000011
ORF3a38Q38RcAacGa77AY.40.000011
ORF3a38Q38XCaaTaa77B.10.000064
ORF3a38Q38LcAacTa77B.1.1.700.002387
ORF3a38Q38RcAacGa77B.1.160.320.030043
ORF3a38Q38RcAacGa77B.1.177.430.01034
ORF3a38Q38HcaAcaT57B.1.20.000044
ORF3a38Q38HcaAcaC27B.1.20.000018
ORF3a38Q38RcAacGa77B.1.36.10.007982
ORF3a38Q38LcAacTa77Q.80.001154
ORF3a38Q38delCAA---66AY.440.000037
ORF3a38Q38KCaaAaa66B.1.1600.000187
ORF3a38Q38ECaaGaa66B.1.20.000053
ORF3a38Q38QcaAcaG66B.1.4290.000141
ORF3a38Q38HcaAcaC46B.1.617.20.000015
ORF3a38Q38HcaAcaT26B.1.617.20.000008
ORF3a38Q38delCAA---66P.10.000095
ORF3a38Q38XCaaTaa55AY.1030.000031
ORF3a38Q38HcaAcaT55AY.1210.000677
ORF3a38Q38QcaAcaG55AY.250.00003
ORF3a38Q38KCaaAaa55AY.430.000022
ORF3a38Q38XCaaTaa55AY.430.000022
ORF3a38Q38HcaAcaT55AY.470.000156
ORF3a38Q38QcaAcaG55AY.9.10.000419
ORF3a38Q38QcaAcaG55B.1.1.500.003394
ORF3a38Q38KCaaAaa55B.1.20.000044
ORF3a38Q38delCAA---55B.1.20.000044
ORF3a38Q38delCAA---55B.1.438.10.000536
ORF3a38Q38delCAA---44AY.4.20.000087
ORF3a38Q38delCAA---44AY.4.50.00043
ORF3a38Q38RcAacGa44AY.430.000018
ORF3a38Q38ECaaGaa44AY.9.20.000147
ORF3a38Q38LcAacTa44B.10.000037
ORF3a38Q38delCAA---44B.10.000037
ORF3a38Q38HcaAcaT34B.10.000027
ORF3a38Q38HcaAcaC14B.10.000009
ORF3a38Q38QcaAcaG44B.1.10.000073
ORF3a38Q38KCaaAaa44B.1.1.70.000004
ORF3a38Q38QcaAcaG44B.1.1600.000125
ORF3a38Q38QcaAcaG44B.1.1770.000053
ORF3a38Q38LcAacTa44B.1.177.70.000659
ORF3a38Q38LcAacTa44B.1.20.000035
ORF3a38Q38delCAA---44P.1.90.019231
ORF3a38Q38del1cAac-a23All0
ORF3a38Q38del1Caa-aa13All0
ORF3a38Q38HcaAcaC33AY.1130.000427
ORF3a38Q38delCAA---33AY.1200.000112
ORF3a38Q38ECaaGaa33AY.200.000117
ORF3a38Q38HcaAcaT23AY.4.20.000043
ORF3a38Q38HcaAcaC13AY.4.20.000022
ORF3a38Q38LCAaTTa23AY.430.000009
ORF3a38Q38LcAacTa13AY.430.000004
ORF3a38Q38delCAA---33AY.450.000365
ORF3a38Q38RcAacGa33B.1.1.1620.088235
ORF3a38Q38RcAacGa33B.1.1.390.001529
ORF3a38Q38KCaaAaa33B.1.1.3980.009677
ORF3a38Q38RcAacGa33B.1.1.5190.000119
ORF3a38Q38delCAA---33B.1.160.240.013274
ORF3a38Q38XCaaTaa33B.1.1770.00004
ORF3a38Q38RcAacGa33B.1.177.730.001699
ORF3a38Q38LcAacTa33B.1.177.750.003122
ORF3a38Q38RcAacGa33B.1.177.870.002183
ORF3a38Q38XCaaTaa33B.1.20.000026
ORF3a38Q38QcaAcaG33B.1.2580.0002
ORF3a38Q38LcAacTa33B.1.3510.000089
ORF3a38Q38delCAA---33B.1.4270.000151
ORF3a38Q38KCaaAaa33B.1.5270.011111
ORF3a38Q38LcAacTa33B.1.5770.002062
ORF3a38Q38KCaaAaa33R.10.00027
ORF3a38Q38delCAA---33U.30.011583
ORF3a38Q38HcaAcaC220.111111
ORF3a38Q38XCaaTaa220.111111
ORF3a38Q38YCaATaC220.111111
ORF3a38Q38YCaATaC22All0
ORF3a38Q38WCAATGG22All0
ORF3a38Q38QcaAcaG22AY.1020.000053
ORF3a38Q38KCaaAaa22AY.1020.000053
ORF3a38Q38KCaaAaa22AY.1030.000012
ORF3a38Q38QcaAcaG22AY.1030.000012
ORF3a38Q38RcAacGa22AY.1130.000285
ORF3a38Q38RcAacGa22AY.1210.000271
ORF3a38Q38delCAA---22AY.130.000322
ORF3a38Q38HcaAcaT22AY.230.000139
ORF3a38Q38RcAacGa22AY.250.000012
ORF3a38Q38ECaaGaa22AY.250.000012
ORF3a38Q38KCaaAaa22AY.290.000032
ORF3a38Q38LcAacTa22AY.30.00002
ORF3a38Q38HcaAcaC12AY.40.000002
ORF3a38Q38HcaAcaT12AY.40.000002
ORF3a38Q38LcAacTa22AY.420.00008
ORF3a38Q38QcaAcaG22AY.430.000009
ORF3a38Q38HcaAcaC12AY.430.000004
ORF3a38Q38HcaAcaT12AY.430.000004
ORF3a38Q38XCaaTaa22AY.440.000012
ORF3a38Q38RcAacGa22AY.440.000012
ORF3a38Q38QcaAcaG22AY.440.000012
ORF3a38Q38delCAA---22AY.46.20.001271
ORF3a38Q38delCAA---22AY.50.000041
ORF3a38Q38HcaAcaT22AY.50.000041
ORF3a38Q38delCAA---22AY.590.001059
ORF3a38Q38delCAA---22AY.60.000082
ORF3a38Q38KCaaAaa22AY.660.002139
ORF3a38Q38RcAacGa22AY.660.002139
ORF3a38Q38delCAA---22AY.670.000929
ORF3a38Q38delCAA---22AY.750.000112
ORF3a38Q38HcaAcaT22AY.770.002255
ORF3a38Q38delCAA---22AY.810.003984
ORF3a38Q38LcAacTa22AY.9.20.000073
ORF3a38Q38delCAA---22AY.9.20.000073
ORF3a38Q38QcaAcaG22AY.9.20.000073
ORF3a38Q38delCAA---22AY.980.000158
ORF3a38Q38LcAacTa22AY.980.000158
ORF3a38Q38RcAacGa22B0.000256
ORF3a38Q38QcaAcaG22B.10.000018
ORF3a38Q38KCaaAaa22B.10.000018
ORF3a38Q38LcAacTa22B.1.1.10.000653
ORF3a38Q38RcAacGa22B.1.1.250.001137
ORF3a38Q38LcAacTa22B.1.1.2620.030303
ORF3a38Q38RcAacGa22B.1.1.3980.006452
ORF3a38Q38delCAA---22B.1.1.5190.000079
ORF3a38Q38PcAacCa22B.1.140.035088
ORF3a38Q38delCAA---22B.1.160.330.00885
ORF3a38Q38PcAacCa22B.1.20.000018
ORF3a38Q38RcAacGa22B.1.20.000018
ORF3a38Q38RcAacGa22B.1.22.10.0625
ORF3a38Q38PcAacCa22B.1.2210.000142
ORF3a38Q38WCAATGG22B.1.2210.000142
ORF3a38Q38XCaaTaa22B.1.2580.000133
ORF3a38Q38QcaAcaG22B.1.258.140.001961
ORF3a38Q38XCaaTaa22B.1.3510.000059
ORF3a38Q38KCaaAaa22B.1.3510.000059
ORF3a38Q38HcaAcaT22B.1.351.20.000605
ORF3a38Q38XCaaTaa22B.1.3990.003868
ORF3a38Q38LcAacTa22B.1.4290.000047
ORF3a38Q38LcAacTa22B.1.438.10.000215
ORF3a38Q38delCAA---22B.1.5250.000226
ORF3a38Q38QcaAcaG22B.1.5750.000607
ORF3a38Q38LcAacTa22B.1.5960.000174
ORF3a38Q38RcAacGa22B.1.5960.000174
ORF3a38Q38XCaaTaa22B.1.617.20.000008
ORF3a38Q38delCAA---22B.1.6210.000177
ORF3a38Q38HcaAcaC12C.370.000116
ORF3a38Q38HcaAcaT12C.370.000116
ORF3a38Q38XCaaTaa22D.20.00015
ORF3a38Q38delCAA---22D.20.00015
ORF3a38Q38LcAacTa22P.10.000032
ORF3a38Q38QcaAcaG22P.10.000032
ORF3a38Q38LcAacTa22P.1.160.000748
ORF3a38Q38PcAacCa22W.20.009662
ORF3a38Q38LcAacTa11A0.000387
ORF3a38Q38RcAacGa11A.10.000282
ORF3a38Q38delCAA---11A.2.30.004739
ORF3a38Q38SCAaTCa11All0
ORF3a38Q38QcaAcaG11AY.1000.000046
ORF3a38Q38XCaaTaa11AY.1000.000046
ORF3a38Q38delCAA---11AY.1020.000027
ORF3a38Q38HcaAcaT11AY.1030.000006
ORF3a38Q38KCaaAaa11AY.1100.000113
ORF3a38Q38delCAA---11AY.1110.000183
ORF3a38Q38RcAacGa11AY.1110.000183
ORF3a38Q38delCAA---11AY.1130.000142
ORF3a38Q38delCAA---11AY.1140.000231
ORF3a38Q38delCAA---11AY.1170.000085
ORF3a38Q38RcAacGa11AY.1190.000035
ORF3a38Q38XCaaTaa11AY.1200.000037
ORF3a38Q38ECaaGaa11AY.1200.000037
ORF3a38Q38LcAacTa11AY.160.00038
ORF3a38Q38LcAacTa11AY.190.00114
ORF3a38Q38KCaaAaa11AY.200.000039
ORF3a38Q38PcAacCa11AY.200.000039
ORF3a38Q38QcaAcaG11AY.200.000039
ORF3a38Q38delCAA---11AY.200.000039
ORF3a38Q38delCAA---11AY.230.00007
ORF3a38Q38XCaaTaa11AY.23.10.000417
ORF3a38Q38XCaaTaa11AY.250.000006
ORF3a38Q38PcAacCa11AY.250.000006
ORF3a38Q38QcaAcaG11AY.260.000028
ORF3a38Q38QcaAcaG11AY.270.000065
ORF3a38Q38delCAA---11AY.280.00189
ORF3a38Q38delCAA---11AY.290.000016
ORF3a38Q38XCaaTaa11AY.290.000016
ORF3a38Q38XCaaTaa11AY.29.10.000221
ORF3a38Q38RcAacGa11AY.29.10.000221
ORF3a38Q38delCAA---11AY.29.10.000221
ORF3a38Q38KCaaAaa11AY.30.00001
ORF3a38Q38ECaaGaa11AY.30.00001
ORF3a38Q38XCaaTaa11AY.30.00001
ORF3a38Q38delCAA---11AY.30.00001
ORF3a38Q38PcAacCa11AY.30.00001
ORF3a38Q38ECaaGaa11AY.3.10.000085
ORF3a38Q38delCAA---11AY.330.000067
ORF3a38Q38KCaaAaa11AY.34.10.00051
ORF3a38Q38KCaaAaa11AY.380.000499
ORF3a38Q38KCaaAaa11AY.390.000025
ORF3a38Q38XCaaTaa11AY.390.000025
ORF3a38Q38QcaAcaG11AY.390.000025
ORF3a38Q38delCAA---11AY.39.10.00004
ORF3a38Q38HcaAcaT11AY.39.10.00004
ORF3a38Q38PcAacCa11AY.40.000002
ORF3a38Q38KCaaAaa11AY.4.20.000022
ORF3a38Q38HcaAcaC11AY.4.50.000107
ORF3a38Q38delCAA---11AY.420.00004
ORF3a38Q38ECaaGaa11AY.420.00004
ORF3a38Q38ECaaGaa11AY.430.000004
ORF3a38Q38KCaaAaa11AY.440.000006
ORF3a38Q38ECaaGaa11AY.440.000006
ORF3a38Q38HcaAcaC11AY.450.000122
ORF3a38Q38ECaaGaa11AY.460.000104
ORF3a38Q38XCaaTaa11AY.460.000104
ORF3a38Q38LcAacTa11AY.460.000104
ORF3a38Q38RcAacGa11AY.460.000104
ORF3a38Q38XCaaTaa11AY.46.40.000165
ORF3a38Q38QcaAcaG11AY.46.60.000072
ORF3a38Q38RcAacGa11AY.470.000031
ORF3a38Q38PcAacCa11AY.50.000021
ORF3a38Q38LcAacTa11AY.60.000041
ORF3a38Q38delCAA---11AY.600.000938
ORF3a38Q38XCaaTaa11AY.610.000105
ORF3a38Q38delCAA---11AY.610.000105
ORF3a38Q38QcaAcaG11AY.610.000105
ORF3a38Q38RcAacGa11AY.610.000105
ORF3a38Q38LcAacTa11AY.640.000595
ORF3a38Q38LcAacTa11AY.650.000533
ORF3a38Q38delCAA---11AY.650.000533
ORF3a38Q38delCAA---11AY.70.000196
ORF3a38Q38delCAA---11AY.75.10.00018
ORF3a38Q38XCaaTaa11AY.790.001211
ORF3a38Q38QcaAcaG11AY.820.001357
ORF3a38Q38HcaAcaT11AY.820.001357
ORF3a38Q38ECaaGaa11AY.840.000437
ORF3a38Q38LcAacTa11AY.850.000427
ORF3a38Q38RcAacGa11AY.9.20.000037
ORF3a38Q38KCaaAaa11AY.9.20.000037
ORF3a38Q38delCAA---11AY.900.000684
ORF3a38Q38delCAA---11AY.910.00073
ORF3a38Q38delCAA---11AY.930.000273
ORF3a38Q38delCAA---11AY.98.10.000048
ORF3a38Q38delCAA---11AY.990.001049
ORF3a38Q38delCAA---11AY.99.20.000092
ORF3a38Q38XCaaTaa11AZ.20.000821
ORF3a38Q38delCAA---11B0.000128
ORF3a38Q38LcAacTa11B0.000128
ORF3a38Q38del1Caa-aa11B.10.000009
ORF3a38Q38ECaaGaa11B.10.000009
ORF3a38Q38ECaaGaa11B.1.10.000018
ORF3a38Q38XCaaTaa11B.1.10.000018
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.1.10.000327
ORF3a38Q38LcAacTa11B.1.1.1390.022727
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.1.1570.000913
ORF3a38Q38XCaaTaa11B.1.1.1980.001468
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.1.2000.007463
ORF3a38Q38KCaaAaa11B.1.1.2140.000055
ORF3a38Q38HcaAcaT11B.1.1.2140.000055
ORF3a38Q38KCaaAaa11B.1.1.2220.000204
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.1.2220.000204
ORF3a38Q38LcAacTa11B.1.1.2220.000204
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.1.2250.007194
ORF3a38Q38SCAaTCa11B.1.1.2310.003096
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.1.2770.000759
ORF3a38Q38KCaaAaa11B.1.1.2790.001121
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.1.280.000311
ORF3a38Q38LcAacTa11B.1.1.2840.000107
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.1.2840.000107
ORF3a38Q38LcAacTa11B.1.1.3060.000438
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.1.3110.000358
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.1.3510.002793
ORF3a38Q38XCaaTaa11B.1.1.390.00051
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.1.390.00051
ORF3a38Q38HcaAcaT11B.1.1.390.00051
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.1.4090.002833
ORF3a38Q38QcaAcaG11B.1.1.4480.002033
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.1.4620.008621
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.1.470.005348
ORF3a38Q38PcAacCa11B.1.1.510.001718
ORF3a38Q38ECaaGaa11B.1.1.5190.00004
ORF3a38Q38QcaAcaG11B.1.1.5190.00004
ORF3a38Q38LcAacTa11B.1.1.5230.001563
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.1.5230.001563
ORF3a38Q38LcAacTa11B.1.1.630.000386
ORF3a38Q38KCaaAaa11B.1.1.630.000386
ORF3a38Q38del1cAac-a11B.1.1.70.000001
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.1.700.000341
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.1.830.00271
ORF3a38Q38LcAacTa11B.1.1.990.02381
ORF3a38Q38XCaaTaa11B.1.1260.001276
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.1600.000031
ORF3a38Q38ECaaGaa11B.1.1770.000013
ORF3a38Q38HcaAcaC11B.1.1770.000013
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.177.170.000821
ORF3a38Q38LcAacTa11B.1.177.210.000076
ORF3a38Q38XCaaTaa11B.1.177.210.000076
ORF3a38Q38XCaaTaa11B.1.177.310.011494
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.177.310.011494
ORF3a38Q38XCaaTaa11B.1.177.320.00135
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.177.440.000519
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.177.500.004695
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.177.60.000977
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.177.60.000977
ORF3a38Q38XCaaTaa11B.1.177.60.000977
ORF3a38Q38KCaaAaa11B.1.177.650.000665
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.177.70.000165
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.177.750.001041
ORF3a38Q38PcAacCa11B.1.177.790.002342
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.177.810.000189
ORF3a38Q38XCaaTaa11B.1.2060.000816
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.214.20.0006
ORF3a38Q38ECaaGaa11B.1.214.30.007143
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.2210.000071
ORF3a38Q38LcAacTa11B.1.2210.000071
ORF3a38Q38QcaAcaG11B.1.2350.002519
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.2360.002053
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.2400.000216
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.2410.000812
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.2430.00007
ORF3a38Q38QcaAcaG11B.1.2430.00007
ORF3a38Q38XCaaTaa11B.1.2430.00007
ORF3a38Q38ECaaGaa11B.1.2580.000067
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.2580.000067
ORF3a38Q38PcAacCa11B.1.2800.007143
ORF3a38Q38XCaaTaa11B.1.351.20.000303
ORF3a38Q38PcAacCa11B.1.360.000146
ORF3a38Q38LcAacTa11B.1.360.000146
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.3670.000792
ORF3a38Q38LcAacTa11B.1.3750.00082
ORF3a38Q38LcAacTa11B.1.3890.001002
ORF3a38Q38KCaaAaa11B.1.4270.00005
ORF3a38Q38XCaaTaa11B.1.4290.000024
ORF3a38Q38HcaAcaC11B.1.4700.001404
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.4730.019231
ORF3a38Q38HcaAcaC11B.1.5260.000024
ORF3a38Q38KCaaAaa11B.1.5580.004566
ORF3a38Q38HcaAcaC11B.1.5640.000426
ORF3a38Q38KCaaAaa11B.1.5750.000303
ORF3a38Q38del1cAac-a11B.1.5800.004065
ORF3a38Q38HcaAcaT11B.1.5960.000087
ORF3a38Q38PcAacCa11B.1.6090.000479
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.6090.000479
ORF3a38Q38QcaAcaG11B.1.617.10.000129
ORF3a38Q38LcAacTa11B.1.617.10.000129
ORF3a38Q38RcAacGa11B.1.6210.000089
ORF3a38Q38KCaaAaa11B.1.6280.000352
ORF3a38Q38LcAacTa11B.1.6280.000352
ORF3a38Q38HcaAcaC11B.1.6300.005236
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.6370.000073
ORF3a38Q38LcAacTa11B.1.6370.000073
ORF3a38Q38delCAA---11B.1.6380.052632
ORF3a38Q38XCaaTaa11B.580.010204
ORF3a38Q38LcAacTa11B.60.00091
ORF3a38Q38XCaaTaa11B.6.60.000889
ORF3a38Q38QcaAcaG11C.350.000774
ORF3a38Q38RcAacGa11C.350.000774
ORF3a38Q38QcaAcaG11D.20.000075
ORF3a38Q38KCaaAaa11P.10.000016
ORF3a38Q38XCaaTaa11P.10.000016
ORF3a38Q38RcAacGa11P.10.000016
ORF3a38Q38HcaAcaT11P.10.000016
ORF3a38Q38RcAacGa11P.1.100.000269
ORF3a38Q38QcaAcaG11P.1.100.000269
ORF3a38Q38delCAA---11P.1.120.000484
ORF3a38Q38XCaaTaa11P.1.140.000048
ORF3a38Q38delCAA---11P.1.140.000048
ORF3a38Q38RcAacGa11P.1.140.000048
ORF3a38Q38RcAacGa11P.1.150.000232
ORF3a38Q38delCAA---11P.1.150.000232
ORF3a38Q38QcaAcaG11P.1.20.001156
ORF3a38Q38RcAacGa11P.1.70.000319
ORF3a38Q38LcAacTa11P.1.70.000319
ORF3a38Q38HcaAcaC11P.40.003802
ORF3a38Q38LcAacTa11Q.40.000455
ORF3a38Q38RcAacGa11Q.80.000165