CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : CodonNum = 262 & Codon = cTa

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a262P262LnonsyncCacTa133813370.99925326176-26178

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a262P262LcCacTa13371338All0.000256
ORF3a262P262LcCacTa246247B.1.1.70.00022
ORF3a262P262LcCacTa204204AY.250.001227
ORF3a262P262LcCacTa167167AY.440.001016
ORF3a262P262LcCacTa142142B.1.20.00125
ORF3a262P262LcCacTa120120B.1.5250.013579
ORF3a262P262LcCacTa7070AY.40.000109
ORF3a262P262LcCacTa4545B.1.177.600.00983
ORF3a262P262LcCacTa3131B.10.000284
ORF3a262P262LcCacTa2626AY.430.000115
ORF3a262P262LcCacTa2323AY.1030.000143
ORF3a262P262LcCacTa2222B.1.36.170.01087
ORF3a262P262LcCacTa1717B.1.4270.000858
ORF3a262P262LcCacTa1313AY.1020.000345
ORF3a262P262LcCacTa1313AY.30.000129
ORF3a262P262LcCacTa1313D.50.064677
ORF3a262P262LcCacTa1212B.1.1.5190.000477
ORF3a262P262LcCacTa1111B.1.617.20.000041
ORF3a262P262LcCacTa1111C.360.010018
ORF3a262P262LcCacTa99P.10.000142
ORF3a262P262LcCacTa88AY.290.000126
ORF3a262P262LcCacTa66B.1.3510.000178
ORF3a262P262LcCacTa55AY.200.000194
ORF3a262P262LcCacTa55AY.46.20.003177
ORF3a262P262LcCacTa55AY.46.60.000361
ORF3a262P262LcCacTa55B.1.1390.003666
ORF3a262P262LcCacTa44AY.390.000099
ORF3a262P262LcCacTa44AY.470.000124
ORF3a262P262LcCacTa44AY.98.10.000194
ORF3a262P262LcCacTa44B.1.10.000073
ORF3a262P262LcCacTa44B.1.5260.000094
ORF3a262P262LcCacTa44B.1.5960.000349
ORF3a262P262LcCacTa33AY.4.20.000065
ORF3a262P262LcCacTa33B.1.2210.000213
ORF3a262P262LcCacTa33B.1.4680.017143
ORF3a262P262LcCacTa22AA.10.014493
ORF3a262P262LcCacTa22AY.1160.000574
ORF3a262P262LcCacTa22AY.230.000139
ORF3a262P262LcCacTa22AY.260.000057
ORF3a262P262LcCacTa22AY.270.000129
ORF3a262P262LcCacTa22AY.420.00008
ORF3a262P262LcCacTa22AY.480.00093
ORF3a262P262LcCacTa22AY.940.000885
ORF3a262P262LcCacTa22B.1.1.260.010471
ORF3a262P262LcCacTa22B.1.258.30.00335
ORF3a262P262LcCacTa22B.1.4090.001563
ORF3a262P262LcCacTa22B.1.4290.000047
ORF3a262P262LcCacTa22B.1.4990.002101
ORF3a262P262LcCacTa22B.1.6210.000177
ORF3a262P262LcCacTa22R.10.00018
ORF3a262P262LcCacTa11A.10.000282
ORF3a262P262LcCacTa11A.23.10.000704
ORF3a262P262LcCacTa11AE.80.000489
ORF3a262P262LcCacTa11AY.10.000396
ORF3a262P262LcCacTa11AY.1000.000046
ORF3a262P262LcCacTa11AY.1070.000466
ORF3a262P262LcCacTa11AY.1090.00074
ORF3a262P262LcCacTa11AY.1140.000231
ORF3a262P262LcCacTa11AY.1180.000063
ORF3a262P262LcCacTa11AY.1190.000035
ORF3a262P262LcCacTa11AY.120.000316
ORF3a262P262LcCacTa11AY.130.000161
ORF3a262P262LcCacTa11AY.46.40.000165
ORF3a262P262LcCacTa11AY.50.000021
ORF3a262P262LcCacTa11AY.550.000917
ORF3a262P262LcCacTa11AY.620.000436
ORF3a262P262LcCacTa11AY.660.00107
ORF3a262P262LcCacTa11AY.75.10.00018
ORF3a262P262LcCacTa11AY.790.001211
ORF3a262P262LcCacTa11AY.910.00073
ORF3a262P262LcCacTa11AY.990.001049
ORF3a262P262LcCacTa11AY.99.20.000092
ORF3a262P262LcCacTa11B.1.1.10.000327
ORF3a262P262LcCacTa11B.1.1.2140.000055
ORF3a262P262LcCacTa11B.1.1.2220.000204
ORF3a262P262LcCacTa11B.1.1.3060.000438
ORF3a262P262LcCacTa11B.1.1.3170.000412
ORF3a262P262LcCacTa11B.1.1.3180.000302
ORF3a262P262LcCacTa11B.1.1.700.000341
ORF3a262P262LcCacTa11B.1.1260.001276
ORF3a262P262LcCacTa11B.1.1600.000031
ORF3a262P262LcCacTa11B.1.177.210.000076
ORF3a262P262LcCacTa11B.1.230.006061
ORF3a262P262LcCacTa11B.1.2400.000216
ORF3a262P262LcCacTa11B.1.2600.003344
ORF3a262P262LcCacTa11B.1.36.290.000517
ORF3a262P262LcCacTa11B.1.5650.00081
ORF3a262P262LcCacTa11B.1.5690.014493
ORF3a262P262LcCacTa11B.1.5950.000261
ORF3a262P262LcCacTa11B.1.6370.000073
ORF3a262P262LcCacTa11B.400.000364
ORF3a262P262LcCacTa11B.60.00091
ORF3a262P262LcCacTa11D.20.000075
ORF3a262P262LcCacTa11P.1.140.000048
ORF3a262P262LcCacTa11Q.80.000165