CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : CodonNum = 262 & Codon = ---

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a262P262deldelCCA---532532126176-26178

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a262P262delCCA---532532All0.000102
ORF3a262P262delCCA---6565B.1.1.70.000058
ORF3a262P262delCCA---5555AY.440.000335
ORF3a262P262delCCA---4444AY.40.000068
ORF3a262P262delCCA---4242AY.250.000253
ORF3a262P262delCCA---3131B.1.617.20.000117
ORF3a262P262delCCA---2626AY.470.000809
ORF3a262P262delCCA---2323AY.130.003703
ORF3a262P262delCCA---1717B.1.20.00015
ORF3a262P262delCCA---1515AY.510.013636
ORF3a262P262delCCA---1313B.1.177.210.000994
ORF3a262P262delCCA---1212AY.30.000119
ORF3a262P262delCCA---1111AY.1030.000068
ORF3a262P262delCCA---1111B.10.000101
ORF3a262P262delCCA---99B.1.1770.000119
ORF3a262P262delCCA---88B.1.6210.000708
ORF3a262P262delCCA---77AY.1180.000439
ORF3a262P262delCCA---77AY.4.20.000152
ORF3a262P262delCCA---660.333333
ORF3a262P262delCCA---66AY.430.000027
ORF3a262P262delCCA---66AY.90.000406
ORF3a262P262delCCA---66B.1.5260.000141
ORF3a262P262delCCA---55AY.290.000079
ORF3a262P262delCCA---55AY.98.10.000242
ORF3a262P262delCCA---55B.1.3890.00501
ORF3a262P262delCCA---55B.1.6370.000365
ORF3a262P262delCCA---55P.10.000079
ORF3a262P262delCCA---44AY.120.10.001284
ORF3a262P262delCCA---33AY.1020.00008
ORF3a262P262delCCA---33AY.260.000085
ORF3a262P262delCCA---33AY.390.000074
ORF3a262P262delCCA---33AY.750.000168
ORF3a262P262delCCA---33B.1.1.5190.000119
ORF3a262P262delCCA---33B.1.258.110.001189
ORF3a262P262delCCA---33B.1.5250.000339
ORF3a262P262delCCA---33R.10.00027
ORF3a262P262delCCA---22AY.120.000632
ORF3a262P262delCCA---22AY.3.10.000171
ORF3a262P262delCCA---22AY.450.000243
ORF3a262P262delCCA---22AY.75.10.000361
ORF3a262P262delCCA---22AY.990.002099
ORF3a262P262delCCA---22B.1.1.280.000622
ORF3a262P262delCCA---22B.1.1600.000062
ORF3a262P262delCCA---22B.1.177.40.000422
ORF3a262P262delCCA---22B.1.177.70.00033
ORF3a262P262delCCA---22B.1.36.10.002281
ORF3a262P262delCCA---22C.260.014706
ORF3a262P262delCCA---22Q.10.000253
ORF3a262P262delCCA---11AU.10.001266
ORF3a262P262delCCA---11AY.1000.000046
ORF3a262P262delCCA---11AY.1170.000085
ORF3a262P262delCCA---11AY.1190.000035
ORF3a262P262delCCA---11AY.1200.000037
ORF3a262P262delCCA---11AY.200.000039
ORF3a262P262delCCA---11AY.5.30.000337
ORF3a262P262delCCA---11AY.670.000464
ORF3a262P262delCCA---11AY.680.000274
ORF3a262P262delCCA---11AY.740.000116
ORF3a262P262delCCA---11B.1.10.000018
ORF3a262P262delCCA---11B.1.1.2160.00089
ORF3a262P262delCCA---11B.1.1.2850.006536
ORF3a262P262delCCA---11B.1.1.3170.000412
ORF3a262P262delCCA---11B.1.1.330.000421
ORF3a262P262delCCA---11B.1.1.3720.000689
ORF3a262P262delCCA---11B.1.1.4320.001266
ORF3a262P262delCCA---11B.1.1.5170.006803
ORF3a262P262delCCA---11B.1.177.600.000218
ORF3a262P262delCCA---11B.1.177.870.000728
ORF3a262P262delCCA---11B.1.2370.004975
ORF3a262P262delCCA---11B.1.2580.000067
ORF3a262P262delCCA---11B.1.2650.001271
ORF3a262P262delCCA---11B.1.2980.002114
ORF3a262P262delCCA---11B.1.3200.001245
ORF3a262P262delCCA---11B.1.36.290.000517
ORF3a262P262delCCA---11B.1.3800.006623
ORF3a262P262delCCA---11B.1.4270.00005
ORF3a262P262delCCA---11B.1.4970.000315
ORF3a262P262delCCA---11B.1.5210.004975
ORF3a262P262delCCA---11B.1.5510.00129
ORF3a262P262delCCA---11B.1.621.10.000506
ORF3a262P262delCCA---11D.20.000075
ORF3a262P262delCCA---11P.1.140.000048
ORF3a262P262delCCA---11P.20.000187