CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : CodonNum = 260

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a260M260InonsynatGatT424033940.80047226170-26172
ORF3a260M260InonsynatGatA42408410.19834926170-26172
ORF3a260M260InonsynatGatC424050.0011792526170-26172
ORF3a260M260KnonsynaTgaAg114411380.99475526170-26172
ORF3a260M260KnonsynaTGaAA114460.0052447626170-26172
ORF3a260M260deldelATG---852852126170-26172
ORF3a260M260TnonsynaTgaCg695695126170-26172
ORF3a260M260LnonsynAtgTtg5504640.84363626170-26172
ORF3a260M260LnonsynAtgCtg550860.15636426170-26172
ORF3a260M260VnonsynAtgGtg5215200.99808126170-26172
ORF3a260M260VnonsynAtGGtT52110.0019193926170-26172
ORF3a260M260NnonsynaTGaAT45370.82222226170-26172
ORF3a260M260NnonsynaTGaAC4580.17777826170-26172
ORF3a260M260RnonsynaTgaGg19180.94736826170-26172
ORF3a260M260RnonsynATgCGg1910.052631626170-26172
ORF3a260M260del1delatGat-1570.46666726170-26172
ORF3a260M260del1delAtg-tg1570.46666726170-26172
ORF3a260M260del1delaTGaC-1510.066666726170-26172
ORF3a260M260PnonsynATgCCg11126170-26172
ORF3a260M260del2delATg--g11126170-26172

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a260M260IatGatT33944240All0.000649
ORF3a260M260IatGatA8414240All0.000161
ORF3a260M260IatGatC54240All0.000001
ORF3a260M260KaTgaAg11381144All0.000218
ORF3a260M260KaTGaAA61144All0.000001
ORF3a260M260delATG---852852All0.000163
ORF3a260M260IatGatT799832B.1.617.20.003009
ORF3a260M260IatGatA33832B.1.617.20.000124
ORF3a260M260IatGatT611785AY.30.006077
ORF3a260M260IatGatA174785AY.30.001731
ORF3a260M260TaTgaCg695695All0.000133
ORF3a260M260LAtgTtg464550All0.000089
ORF3a260M260LAtgCtg86550All0.000016
ORF3a260M260VAtgGtg520521All0.000099
ORF3a260M260VAtGGtT1521All0
ORF3a260M260TaTgaCg431431AY.440.002623
ORF3a260M260IatGatT228407AY.40.000355
ORF3a260M260IatGatA179407AY.40.000279
ORF3a260M260IatGatT335350AY.430.001484
ORF3a260M260IatGatA15350AY.430.000066
ORF3a260M260IatGatT279279AY.1020.007397
ORF3a260M260IatGatT279279P.60.877358
ORF3a260M260LAtgTtg255261B.1.617.20.00096
ORF3a260M260LAtgCtg6261B.1.617.20.000023
ORF3a260M260IatGatA249249AY.4.20.0054
ORF3a260M260VAtgGtg160160B.1.1.70.000143
ORF3a260M260KaTgaAg136137AY.4.20.00295
ORF3a260M260KaTGaAA1137AY.4.20.000022
ORF3a260M260IatGatT111132B.1.1.70.000099
ORF3a260M260IatGatA20132B.1.1.70.000018
ORF3a260M260IatGatC1132B.1.1.70.000001
ORF3a260M260delATG---116116AY.260.003284
ORF3a260M260LAtgTtg106106B.1.36.250.233996
ORF3a260M260IatGatT9495AY.390.002323
ORF3a260M260IatGatA195AY.390.000025
ORF3a260M260KaTgaAg9494P.10.001481
ORF3a260M260delATG---9191B.10.000834
ORF3a260M260KaTgaAg8989B.1.1.70.00008
ORF3a260M260VAtgGtg8585B.1.5750.025789
ORF3a260M260KaTgaAg8585B.1.617.20.00032
ORF3a260M260VAtgGtg8282AY.50.001693
ORF3a260M260KaTgaAg7879AY.40.000121
ORF3a260M260KaTGaAA179AY.40.000002
ORF3a260M260delATG---7878B.1.1.70.00007
ORF3a260M260IatGatT6068AY.440.000365
ORF3a260M260IatGatA868AY.440.000049
ORF3a260M260KaTgaAg6060AY.440.000365
ORF3a260M260delATG---5959AY.440.000359
ORF3a260M260delATG---5656AY.40.000087
ORF3a260M260KaTgaAg5353B.1.1.2180.407692
ORF3a260M260IatGatT4951B.1.20.000431
ORF3a260M260IatGatA251B.1.20.000018
ORF3a260M260NaTGaAT3745All0.000007
ORF3a260M260NaTGaAC845All0.000002
ORF3a260M260delATG---4545AY.250.000271
ORF3a260M260KaTgaAg4141AY.1200.001524
ORF3a260M260KaTgaAg4141AY.140.003609
ORF3a260M260KaTgaAg3939B.1.4080.143911
ORF3a260M260TaTgaCg3636B.1.1.70.000032
ORF3a260M260delATG---3636B.1.617.20.000136
ORF3a260M260KaTgaAg3334AY.30.000328
ORF3a260M260KaTGaAA134AY.30.00001
ORF3a260M260TaTgaCg3333AY.40.000051
ORF3a260M260LAtgTtg2232B.1.1.70.00002
ORF3a260M260LAtgCtg1032B.1.1.70.000009
ORF3a260M260IatGatT3031AY.1130.004272
ORF3a260M260IatGatA131AY.1130.000142
ORF3a260M260delATG---3131AY.470.000964
ORF3a260M260IatGatT3131B.1.258.170.003223
ORF3a260M260KaTgaAg2929AY.1030.00018
ORF3a260M260IatGatT2129AY.1030.00013
ORF3a260M260IatGatA829AY.1030.00005
ORF3a260M260IatGatT2429AY.1140.005547
ORF3a260M260IatGatA529AY.1140.001156
ORF3a260M260IatGatT2629AY.340.002521
ORF3a260M260IatGatC329AY.340.000291
ORF3a260M260LAtgCtg2729AY.40.000042
ORF3a260M260LAtgTtg229AY.40.000003
ORF3a260M260IatGatA1828AY.250.000108
ORF3a260M260IatGatT1028AY.250.00006
ORF3a260M260delATG---2727AY.130.004346
ORF3a260M260VAtgGtg2727B.1.20.000238
ORF3a260M260KaTgaAg2426AY.250.000144
ORF3a260M260KaTGaAA226AY.250.000012
ORF3a260M260KaTgaAg2626B.1.1600.000811
ORF3a260M260TaTgaCg2525B.1.617.20.000094
ORF3a260M260IatGatT2323AY.39.1.10.016667
ORF3a260M260NaTGaAT2323B.1.1.2180.176923
ORF3a260M260VAtgGtg2222AY.290.000347
ORF3a260M260IatGatA2222B.1.1.3450.956522
ORF3a260M260delATG---2121AY.30.000209
ORF3a260M260delATG---2020AY.510.018182
ORF3a260M260IatGatT2020AY.9.20.000735
ORF3a260M260KaTgaAg2020B.1.3110.005491
ORF3a260M260RaTgaGg1819All0.000003
ORF3a260M260RATgCGg119All0
ORF3a260M260delATG---1919AY.430.000084
ORF3a260M260LAtgTtg1919AZ.20.015599
ORF3a260M260IatGatT1019B.10.000092
ORF3a260M260IatGatA919B.10.000082
ORF3a260M260delATG---1919B.1.20.000167
ORF3a260M260VAtgGtg1717AY.40.000026
ORF3a260M260IatGatT1617B.1.4290.000376
ORF3a260M260IatGatA117B.1.4290.000024
ORF3a260M260TaTgaCg1616AY.1030.000099
ORF3a260M260IatGatT1516AY.230.001046
ORF3a260M260IatGatA116AY.230.00007
ORF3a260M260TaTgaCg1616AY.99.20.001475
ORF3a260M260VAtgGtg1616B.1.177.850.086957
ORF3a260M260del1atGat-715All0.000001
ORF3a260M260del1Atg-tg715All0.000001
ORF3a260M260del1aTGaC-115All0
ORF3a260M260KaTgaAg1515AY.1020.000398
ORF3a260M260IatGatT1515AY.1200.000558
ORF3a260M260KaTgaAg1515AY.470.000467
ORF3a260M260IatGatT1515AY.99.20.001382
ORF3a260M260IatGatA814AY.1160.002294
ORF3a260M260IatGatT614AY.1160.001721
ORF3a260M260IatGatA1313AY.46.60.000939
ORF3a260M260KaTgaAg1313AY.750.000728
ORF3a260M260delATG---1313B.1.177.210.000994
ORF3a260M260IatGatT1313B.1.36.10.014823
ORF3a260M260IatGatT1012AY.1170.000845
ORF3a260M260IatGatA212AY.1170.000169
ORF3a260M260LAtgCtg1212AY.340.001164
ORF3a260M260delATG---1212AY.50.000248
ORF3a260M260IatGatA712B.1.5260.000165
ORF3a260M260IatGatT512B.1.5260.000118
ORF3a260M260TaTgaCg1212P.10.000189
ORF3a260M260delATG---1111AY.1030.000068
ORF3a260M260IatGatT611AY.290.000095
ORF3a260M260IatGatA511AY.290.000079
ORF3a260M260KaTgaAg1111AY.430.000049
ORF3a260M260TaTgaCg1111AY.98.10.000533
ORF3a260M260IatGatT911B.1.10.000163
ORF3a260M260IatGatA211B.1.10.000036
ORF3a260M260KaTgaAg1111B.1.2580.000732
ORF3a260M260IatGatT1011B.1.36.290.005173
ORF3a260M260IatGatA111B.1.36.290.000517
ORF3a260M260delATG---1111B.1.6210.000974
ORF3a260M260IatGatT911P.10.000142
ORF3a260M260IatGatA211P.10.000032
ORF3a260M260KaTgaAg1111R.10.00099
ORF3a260M260KaTgaAg1010AY.1180.000626
ORF3a260M260KaTgaAg1010AY.230.000697
ORF3a260M260TaTgaCg1010AY.250.00006
ORF3a260M260IatGatT1010AY.460.001041
ORF3a260M260IatGatT910AY.50.000186
ORF3a260M260IatGatA110AY.50.000021
ORF3a260M260KaTgaAg1010AY.99.20.000922
ORF3a260M260KaTgaAg1010B.10.000092
ORF3a260M260LAtgTtg910B.1.1600.000281
ORF3a260M260LAtgCtg110B.1.1600.000031
ORF3a260M260IatGatA910B.1.2580.000599
ORF3a260M260IatGatT110B.1.2580.000067
ORF3a260M260TaTgaCg99AY.290.000142
ORF3a260M260VAtgGtg99AY.30.00009
ORF3a260M260KaTgaAg99AY.380.004493
ORF3a260M260VAtgGtg99AY.440.000055
ORF3a260M260IatGatT99AY.7.10.001014
ORF3a260M260LAtgTtg99B.1.1.5190.000357
ORF3a260M260delATG---99B.1.1770.000119
ORF3a260M260KaTgaAg99B.1.258.170.000936
ORF3a260M260TaTgaCg88AY.1020.000212
ORF3a260M260IatGatT88AY.46.40.001316
ORF3a260M260TaTgaCg88AY.750.000448
ORF3a260M260KaTgaAg88B.1.10.000145
ORF3a260M260IatGatT88B.1.1170.1
ORF3a260M260VAtgGtg88B.1.2430.000557
ORF3a260M260KaTgaAg88B.1.2430.000557
ORF3a260M260delATG---88B.1.3110.002197
ORF3a260M260IatGatT77A.280.018519
ORF3a260M260delATG---77AY.1180.000439
ORF3a260M260VAtgGtg77AY.200.000272
ORF3a260M260LAtgCtg77AY.250.000042
ORF3a260M260delATG---77AY.4.20.000152
ORF3a260M260KaTgaAg77AY.700.00146
ORF3a260M260IatGatT67AY.980.000474
ORF3a260M260IatGatA17AY.980.000079
ORF3a260M260delATG---77AY.98.10.000339
ORF3a260M260IatGatT77B.1.1.2220.001428
ORF3a260M260KaTgaAg77B.1.20.000062
ORF3a260M260VAtgGtg77B.1.4290.000165
ORF3a260M260delATG---77P.10.00011
ORF3a260M260IatGatT66AY.1070.002796
ORF3a260M260delATG---66AY.290.000095
ORF3a260M260IatGatA56AY.3.10.000426
ORF3a260M260IatGatT16AY.3.10.000085
ORF3a260M260TaTgaCg66AY.39.1.10.004348
ORF3a260M260VAtgGtg66AY.430.000027
ORF3a260M260KaTgaAg66AY.610.000629
ORF3a260M260delATG---66AY.90.000406
ORF3a260M260delATG---66B.1.5260.000141
ORF3a260M260TaTgaCg66B.1.6090.002876
ORF3a260M260VAtgGtg66B.1.617.20.000023
ORF3a260M260RaTgaGg66P.10.000095
ORF3a260M260KaTgaAg55A.10.001409
ORF3a260M260LAtgTtg55AY.1170.000423
ORF3a260M260LAtgTtg55AY.1180.000313
ORF3a260M260TaTgaCg55AY.1200.000186
ORF3a260M260KaTgaAg55AY.290.000079
ORF3a260M260del1Atg-tg55AY.70.00098
ORF3a260M260IatGatT55AY.940.002213
ORF3a260M260VAtgGtg55B.1.1.3480.003981
ORF3a260M260KaTgaAg55B.1.177.730.002831
ORF3a260M260delATG---55B.1.3890.00501
ORF3a260M260IatGatT55B.1.5610.001985
ORF3a260M260delATG---55B.1.6370.000365
ORF3a260M260delATG---440.222222
ORF3a260M260IatGatT44AY.1060.00134
ORF3a260M260delATG---44AY.120.10.001284
ORF3a260M260NaTGaAT44AY.30.00004
ORF3a260M260IatGatT44AY.34.10.00204
ORF3a260M260KaTgaAg44AY.390.000099
ORF3a260M260delATG---44AY.390.000099
ORF3a260M260IatGatT24AY.4.50.000215
ORF3a260M260IatGatA24AY.4.50.000215
ORF3a260M260KaTgaAg44AY.530.00115
ORF3a260M260TaTgaCg44AY.60.000165
ORF3a260M260VAtgGtg44B.10.000037
ORF3a260M260IatGatT44B.1.1.2180.030769
ORF3a260M260NaTGaAT44B.1.1.4640.005891
ORF3a260M260delATG---44B.1.1.5190.000159
ORF3a260M260delATG---44B.1.1600.000125
ORF3a260M260KaTgaAg44B.1.1770.000053
ORF3a260M260TaTgaCg44B.1.20.000035
ORF3a260M260LAtgCtg24B.1.20.000018
ORF3a260M260LAtgTtg24B.1.20.000018
ORF3a260M260IatGatA34B.1.2340.000396
ORF3a260M260IatGatT14B.1.2340.000132
ORF3a260M260IatGatT44B.1.3130.026316
ORF3a260M260IatGatA34B.1.3510.000089
ORF3a260M260IatGatT14B.1.3510.00003
ORF3a260M260delATG---44B.1.5250.000453
ORF3a260M260KaTgaAg44B.1.5750.001214
ORF3a260M260IatGatT44B.1.5880.00364
ORF3a260M260KaTgaAg44P.1.140.000191
ORF3a260M260IatGatT44P.40.015209
ORF3a260M260KaTgaAg33A.2.50.001497
ORF3a260M260delATG---33AY.1020.00008
ORF3a260M260LAtgTtg23AY.1020.000053
ORF3a260M260LAtgCtg13AY.1020.000027
ORF3a260M260RaTgaGg33AY.1030.000019
ORF3a260M260IatGatT33AY.120.000948
ORF3a260M260IatGatT33AY.260.000085
ORF3a260M260delATG---33AY.3.10.000256
ORF3a260M260KaTgaAg33AY.3.10.000256
ORF3a260M260TaTgaCg33AY.39.10.000119
ORF3a260M260NaTGaAC33AY.440.000018
ORF3a260M260KaTgaAg33AY.450.000365
ORF3a260M260delATG---33AY.450.000365
ORF3a260M260IatGatT33AY.450.000365
ORF3a260M260KaTgaAg33AY.46.20.001906
ORF3a260M260KaTgaAg33AY.46.60.000217
ORF3a260M260LAtgCtg33AY.470.000093
ORF3a260M260IatGatT23AY.610.00021
ORF3a260M260IatGatA13AY.610.000105
ORF3a260M260IatGatT23AY.680.000547
ORF3a260M260IatGatA13AY.680.000274
ORF3a260M260IatGatT33AY.750.000168
ORF3a260M260delATG---33AY.750.000168
ORF3a260M260IatGatT33AY.780.004622
ORF3a260M260IatGatT23AY.920.000575
ORF3a260M260IatGatA13AY.920.000287
ORF3a260M260IatGatT33AY.98.10.000145
ORF3a260M260IatGatA23B0.000256
ORF3a260M260IatGatT13B0.000128
ORF3a260M260NaTGaAT33B.10.000027
ORF3a260M260LAtgCtg23B.1.10.000036
ORF3a260M260LAtgTtg13B.1.10.000018
ORF3a260M260IatGatT33B.1.1.2160.002671
ORF3a260M260KaTgaAg33B.1.1.4160.002715
ORF3a260M260VAtgGtg33B.1.1600.000094
ORF3a260M260delATG---33B.1.177.40.000633
ORF3a260M260VAtgGtg33B.1.2340.000396
ORF3a260M260delATG---33B.1.258.110.001189
ORF3a260M260IatGatT23B.1.360.000292
ORF3a260M260IatGatA13B.1.360.000146
ORF3a260M260KaTgaAg33B.1.4000.001287
ORF3a260M260IatGatT33B.1.466.20.001174
ORF3a260M260VAtgGtg33B.1.5260.000071
ORF3a260M260NaTGaAC23B.1.617.20.000008
ORF3a260M260NaTGaAT13B.1.617.20.000004
ORF3a260M260TaTgaCg33B.1.6210.000266
ORF3a260M260IatGatA23C.370.000232
ORF3a260M260IatGatT13C.370.000116
ORF3a260M260delATG---33R.10.00027
ORF3a260M260del1atGat-220.111111
ORF3a260M260delATG---22A.270.003311
ORF3a260M260LAtgTtg22AH.20.024096
ORF3a260M260LAtgTtg22AY.1030.000012
ORF3a260M260VAtgGtg22AY.1030.000012
ORF3a260M260NaTGaAC22AY.1030.000012
ORF3a260M260IatGatT22AY.1080.002205
ORF3a260M260VAtgGtg22AY.1090.001479
ORF3a260M260LAtgTtg12AY.1100.000113
ORF3a260M260LAtgCtg12AY.1100.000113
ORF3a260M260IatGatA12AY.1150.005208
ORF3a260M260IatGatT12AY.1150.005208
ORF3a260M260TaTgaCg22AY.1180.000125
ORF3a260M260IatGatT22AY.1190.000071
ORF3a260M260KaTgaAg22AY.1190.000071
ORF3a260M260delATG---22AY.120.000632
ORF3a260M260LAtgTtg22AY.1200.000074
ORF3a260M260KaTgaAg22AY.200.000078
ORF3a260M260IatGatT12AY.200.000039
ORF3a260M260IatGatA12AY.200.000039
ORF3a260M260IatGatA22AY.210.003795
ORF3a260M260KaTgaAg22AY.260.000057
ORF3a260M260LAtgCtg22AY.30.00002
ORF3a260M260KaTgaAg22AY.34.10.00102
ORF3a260M260VAtgGtg22AY.360.000296
ORF3a260M260LAtgTtg12AY.4.20.000022
ORF3a260M260LAtgCtg12AY.4.20.000022
ORF3a260M260KaTgaAg22AY.4.2.10.000298
ORF3a260M260IatGatA12AY.4.2.10.000149
ORF3a260M260IatGatT12AY.4.2.10.000149
ORF3a260M260delATG---22AY.4.50.000215
ORF3a260M260IatGatA12AY.420.00004
ORF3a260M260IatGatT12AY.420.00004
ORF3a260M260LAtgCtg12AY.430.000004
ORF3a260M260LAtgTtg12AY.430.000004
ORF3a260M260LAtgTtg12AY.440.000006
ORF3a260M260LAtgCtg12AY.440.000006
ORF3a260M260TaTgaCg22AY.460.000208
ORF3a260M260IatGatT22AY.46.50.000397
ORF3a260M260TaTgaCg22AY.50.000041
ORF3a260M260IatGatT22AY.5.30.000675
ORF3a260M260IatGatT22AY.5.40.000553
ORF3a260M260IatGatA22AY.60.000082
ORF3a260M260VAtgGtg22AY.660.002139
ORF3a260M260delATG---22AY.75.10.000361
ORF3a260M260IatGatT22AY.840.000875
ORF3a260M260IatGatA22AY.90.000135
ORF3a260M260TaTgaCg22AY.9.10.000167
ORF3a260M260KaTgaAg22AY.960.004149
ORF3a260M260VAtgGtg22AY.98.10.000097
ORF3a260M260delATG---22AY.990.002099
ORF3a260M260TaTgaCg22B.10.000018
ORF3a260M260del1atGat-22B.10.000018
ORF3a260M260TaTgaCg22B.1.10.000036
ORF3a260M260TaTgaCg22B.1.1.1700.002494
ORF3a260M260KaTgaAg22B.1.1.2220.000408
ORF3a260M260LAtgTtg22B.1.1.2410.004141
ORF3a260M260delATG---22B.1.1.280.000622
ORF3a260M260KaTgaAg22B.1.1.2840.000215
ORF3a260M260IatGatT22B.1.1.2890.004167
ORF3a260M260IatGatT22B.1.1160.023256
ORF3a260M260LAtgCtg22B.1.1390.001466
ORF3a260M260RaTgaGg22B.1.1770.000026
ORF3a260M260VAtgGtg22B.1.1770.000026
ORF3a260M260delATG---22B.1.177.70.00033
ORF3a260M260KaTgaAg22B.1.177.870.001456
ORF3a260M260IatGatT22B.1.1920.018519
ORF3a260M260IatGatT22B.1.2210.000142
ORF3a260M260delATG---22B.1.2430.000139
ORF3a260M260IatGatT22B.1.2430.000139
ORF3a260M260TaTgaCg22B.1.2580.000133
ORF3a260M260KaTgaAg22B.1.3510.000059
ORF3a260M260delATG---22B.1.36.10.002281
ORF3a260M260IatGatT22B.1.36.180.00084
ORF3a260M260delATG---22B.1.36.290.001035
ORF3a260M260TaTgaCg22B.1.36.290.001035
ORF3a260M260KaTgaAg22B.1.3670.001585
ORF3a260M260IatGatT22B.1.4480.005249
ORF3a260M260TaTgaCg22B.1.5250.000226
ORF3a260M260KaTgaAg22B.1.5550.044444
ORF3a260M260TaTgaCg22B.1.5960.000174
ORF3a260M260IatGatT22B.1.6190.001742
ORF3a260M260delATG---22C.260.014706
ORF3a260M260KaTgaAg22C.370.000232
ORF3a260M260KaTgaAg22D.50.00995
ORF3a260M260VAtgGtg22P.10.000032
ORF3a260M260IatGatT22P.1.150.000465
ORF3a260M260VAtgGtg22P.1.70.000639
ORF3a260M260IatGatA12P.1.70.000319
ORF3a260M260IatGatT12P.1.70.000319
ORF3a260M260delATG---22Q.10.000253
ORF3a260M260IatGatT22Q.10.000253
ORF3a260M260IatGatT22Q.20.001227
ORF3a260M260IatGatT11A0.000387
ORF3a260M260IatGatA11A.2.50.000499
ORF3a260M260LAtgTtg11A.270.001656
ORF3a260M260IatGatA11A.30.002096
ORF3a260M260del2ATg--g11All0
ORF3a260M260PATgCCg11All0
ORF3a260M260delATG---11AU.10.001266
ORF3a260M260TaTgaCg11AY.1000.000046
ORF3a260M260delATG---11AY.1000.000046
ORF3a260M260IatGatA11AY.1000.000046
ORF3a260M260VAtgGtg11AY.1020.000027
ORF3a260M260TaTgaCg11AY.1040.001984
ORF3a260M260IatGatT11AY.1050.000643
ORF3a260M260KaTgaAg11AY.1100.000113
ORF3a260M260IatGatT11AY.1110.000183
ORF3a260M260KaTgaAg11AY.1130.000142
ORF3a260M260KaTgaAg11AY.1140.000231
ORF3a260M260KaTGaAA11AY.1160.000287
ORF3a260M260delATG---11AY.1170.000085
ORF3a260M260VAtgGtg11AY.1180.000063
ORF3a260M260TaTgaCg11AY.1190.000035
ORF3a260M260delATG---11AY.1190.000035
ORF3a260M260delATG---11AY.1200.000037
ORF3a260M260TaTgaCg11AY.1210.000135
ORF3a260M260IatGatT11AY.160.00038
ORF3a260M260del1atGat-11AY.160.00038
ORF3a260M260KaTgaAg11AY.160.00038
ORF3a260M260LAtgTtg11AY.16.10.00047
ORF3a260M260IatGatT11AY.16.10.00047
ORF3a260M260KaTgaAg11AY.20.000356
ORF3a260M260TaTgaCg11AY.20.000356
ORF3a260M260delATG---11AY.200.000039
ORF3a260M260TaTgaCg11AY.230.00007
ORF3a260M260LAtgTtg11AY.230.00007
ORF3a260M260TaTgaCg11AY.23.10.000417
ORF3a260M260KaTgaAg11AY.240.000431
ORF3a260M260VAtgGtg11AY.250.000006
ORF3a260M260KaTgaAg11AY.270.000065
ORF3a260M260IatGatT11AY.270.000065
ORF3a260M260del2ATg--g11AY.30.00001
ORF3a260M260TaTgaCg11AY.30.00001
ORF3a260M260TaTgaCg11AY.320.000532
ORF3a260M260KaTgaAg11AY.330.000067
ORF3a260M260IatGatT11AY.330.000067
ORF3a260M260LAtgTtg11AY.330.000067
ORF3a260M260TaTgaCg11AY.340.000097
ORF3a260M260KaTgaAg11AY.360.000148
ORF3a260M260TaTgaCg11AY.380.000499
ORF3a260M260LAtgTtg11AY.390.000025
ORF3a260M260VAtgGtg11AY.390.000025
ORF3a260M260LAtgTtg11AY.39.10.00004
ORF3a260M260IatGatT11AY.39.10.00004
ORF3a260M260delATG---11AY.39.10.00004
ORF3a260M260IatGatA11AY.4.10.000737
ORF3a260M260VAtgGtg11AY.4.20.000022
ORF3a260M260delATG---11AY.4.2.10.000149
ORF3a260M260TaTgaCg11AY.4.30.000842
ORF3a260M260VAtgGtg11AY.4.40.000409
ORF3a260M260IatGatT11AY.4.40.000409
ORF3a260M260TaTgaCg11AY.4.50.000107
ORF3a260M260KaTgaAg11AY.4.50.000107
ORF3a260M260IatGatT11AY.410.000294
ORF3a260M260KaTgaAg11AY.420.00004
ORF3a260M260TaTgaCg11AY.430.000004
ORF3a260M260PATgCCg11AY.430.000004
ORF3a260M260RATgCGg11AY.430.000004
ORF3a260M260NaTGaAT11AY.430.000004
ORF3a260M260delATG---11AY.46.10.001027
ORF3a260M260KaTgaAg11AY.46.40.000165
ORF3a260M260VAtgGtg11AY.470.000031
ORF3a260M260IatGatT11AY.490.003195
ORF3a260M260KaTgaAg11AY.50.000021
ORF3a260M260delATG---11AY.5.30.000337
ORF3a260M260IatGatT11AY.500.000799
ORF3a260M260delATG---11AY.530.000288
ORF3a260M260IatGatT11AY.590.00053
ORF3a260M260VAtgGtg11AY.60.000041
ORF3a260M260LAtgCtg11AY.60.000041
ORF3a260M260RaTgaGg11AY.620.000436
ORF3a260M260KaTgaAg11AY.620.000436
ORF3a260M260KaTgaAg11AY.650.000533
ORF3a260M260IatGatT11AY.670.000464
ORF3a260M260delATG---11AY.670.000464
ORF3a260M260delATG---11AY.680.000274
ORF3a260M260IatGatA11AY.700.000209
ORF3a260M260TaTgaCg11AY.720.001361
ORF3a260M260IatGatT11AY.740.000116
ORF3a260M260delATG---11AY.740.000116
ORF3a260M260KaTgaAg11AY.75.10.00018
ORF3a260M260KaTgaAg11AY.790.001211
ORF3a260M260LAtgCtg11AY.80.000606
ORF3a260M260IatGatT11AY.850.000427
ORF3a260M260KaTgaAg11AY.850.000427
ORF3a260M260IatGatT11AY.870.000833
ORF3a260M260IatGatT11AY.880.000884
ORF3a260M260LAtgTtg11AY.9.20.000037
ORF3a260M260IatGatT11AY.900.000684
ORF3a260M260TaTgaCg11AY.920.000287
ORF3a260M260VAtgGtg11AY.950.000761
ORF3a260M260IatGatT11AY.960.002075
ORF3a260M260KaTgaAg11AY.980.000079
ORF3a260M260KaTgaAg11AY.98.10.000048
ORF3a260M260RaTgaGg11B.10.000009
ORF3a260M260LAtgTtg11B.10.000009
ORF3a260M260VAtgGtg11B.1.10.000018
ORF3a260M260NaTGaAC11B.1.10.000018
ORF3a260M260delATG---11B.1.10.000018
ORF3a260M260IatGatT11B.1.1.100.001115
ORF3a260M260RaTgaGg11B.1.1.1530.001095
ORF3a260M260KaTgaAg11B.1.1.1910.004762
ORF3a260M260TaTgaCg11B.1.1.2140.000055
ORF3a260M260KaTgaAg11B.1.1.2140.000055
ORF3a260M260LAtgTtg11B.1.1.2140.000055
ORF3a260M260delATG---11B.1.1.2160.00089
ORF3a260M260LAtgCtg11B.1.1.2200.001859
ORF3a260M260VAtgGtg11B.1.1.2410.00207
ORF3a260M260IatGatT11B.1.1.280.000311
ORF3a260M260delATG---11B.1.1.2850.006536
ORF3a260M260VAtgGtg11B.1.1.3060.000438
ORF3a260M260delATG---11B.1.1.3170.000412
ORF3a260M260VAtgGtg11B.1.1.3180.000302
ORF3a260M260IatGatA11B.1.1.3180.000302
ORF3a260M260delATG---11B.1.1.330.000421
ORF3a260M260IatGatA11B.1.1.3320.03125
ORF3a260M260del1atGat-11B.1.1.3530.020833
ORF3a260M260delATG---11B.1.1.3720.000689
ORF3a260M260IatGatT11B.1.1.4030.025641
ORF3a260M260delATG---11B.1.1.4320.001266
ORF3a260M260delATG---11B.1.1.440.00241
ORF3a260M260IatGatC11B.1.1.470.005348
ORF3a260M260IatGatT11B.1.1.5170.006803
ORF3a260M260delATG---11B.1.1.5170.006803
ORF3a260M260VAtgGtg11B.1.1.5190.00004
ORF3a260M260IatGatT11B.1.1.5190.00004
ORF3a260M260LAtgTtg11B.1.1.5250.005464
ORF3a260M260RaTgaGg11B.1.1.70.000001
ORF3a260M260del1Atg-tg11B.1.1.70.000001
ORF3a260M260delATG---11B.1.1.700.000341
ORF3a260M260VAtgGtg11B.1.1280.000635
ORF3a260M260IatGatT11B.1.1770.000013
ORF3a260M260delATG---11B.1.177.240.001295
ORF3a260M260VAtgGtg11B.1.177.320.00135
ORF3a260M260VAtgGtg11B.1.177.50.001242
ORF3a260M260delATG---11B.1.177.600.000218
ORF3a260M260KaTgaAg11B.1.177.860.000183
ORF3a260M260delATG---11B.1.177.870.000728
ORF3a260M260del1Atg-tg11B.1.20.000009
ORF3a260M260RaTgaGg11B.1.20.000009
ORF3a260M260IatGatT11B.1.2060.000816
ORF3a260M260TaTgaCg11B.1.2100.002132
ORF3a260M260IatGatT11B.1.2140.003663
ORF3a260M260LAtgTtg11B.1.2210.000071
ORF3a260M260TaTgaCg11B.1.2210.000071
ORF3a260M260KaTgaAg11B.1.2220.001692
ORF3a260M260TaTgaCg11B.1.2340.000132
ORF3a260M260LAtgCtg11B.1.2360.002053
ORF3a260M260delATG---11B.1.2370.004975
ORF3a260M260delATG---11B.1.2580.000067
ORF3a260M260delATG---11B.1.2650.001271
ORF3a260M260delATG---11B.1.2980.002114
ORF3a260M260VAtgGtg11B.1.3110.000275
ORF3a260M260delATG---11B.1.3200.001245
ORF3a260M260TaTgaCg11B.1.3510.00003
ORF3a260M260LAtgCtg11B.1.3510.00003
ORF3a260M260KaTgaAg11B.1.360.000146
ORF3a260M260LAtgTtg11B.1.36.390.002217
ORF3a260M260IatGatT11B.1.36.70.004
ORF3a260M260IatGatA11B.1.3780.006849
ORF3a260M260delATG---11B.1.3800.006623
ORF3a260M260IatGatT11B.1.3980.002976
ORF3a260M260VAtgGtg11B.1.4270.00005
ORF3a260M260delATG---11B.1.4270.00005
ORF3a260M260IatGatA11B.1.4270.00005
ORF3a260M260LAtgTtg11B.1.4290.000024
ORF3a260M260KaTgaAg11B.1.4290.000024
ORF3a260M260VAtgGtg11B.1.438.10.000107
ORF3a260M260IatGatA11B.1.438.10.000107
ORF3a260M260delATG---11B.1.4590.004082
ORF3a260M260LAtgTtg11B.1.4700.001404
ORF3a260M260IatGatT11B.1.4700.001404
ORF3a260M260delATG---11B.1.4970.000315
ORF3a260M260LAtgCtg11B.1.5030.002488
ORF3a260M260IatGatT11B.1.5090.000866
ORF3a260M260delATG---11B.1.5210.004975
ORF3a260M260TaTgaCg11B.1.5240.001406
ORF3a260M260VAtGGtT11B.1.5250.000113
ORF3a260M260KaTgaAg11B.1.5510.00129
ORF3a260M260delATG---11B.1.5510.00129
ORF3a260M260VAtgGtg11B.1.5560.007519
ORF3a260M260IatGatT11B.1.5600.00463
ORF3a260M260LAtgTtg11B.1.5650.00081
ORF3a260M260KaTgaAg11B.1.5950.000261
ORF3a260M260VAtgGtg11B.1.5950.000261
ORF3a260M260KaTgaAg11B.1.5960.000087
ORF3a260M260delATG---11B.1.5960.000087
ORF3a260M260IatGatT11B.1.5960.000087
ORF3a260M260delATG---11B.1.617.10.000129
ORF3a260M260TaTgaCg11B.1.617.10.000129
ORF3a260M260del1atGat-11B.1.617.20.000004
ORF3a260M260VAtgGtg11B.1.6210.000089
ORF3a260M260KaTgaAg11B.1.6210.000089
ORF3a260M260IatGatT11B.1.6210.000089
ORF3a260M260del1aTGaC-11B.1.6210.000089
ORF3a260M260delATG---11B.1.621.10.000506
ORF3a260M260TaTgaCg11B.1.6270.00202
ORF3a260M260KaTgaAg11B.1.6280.000352
ORF3a260M260IatGatT11B.1.6370.000073
ORF3a260M260TaTgaCg11B.1.6370.000073
ORF3a260M260VAtgGtg11B.30.000831
ORF3a260M260TaTgaCg11B.4.70.010101
ORF3a260M260LAtgCtg11B.400.000364
ORF3a260M260KaTgaAg11B.550.00295
ORF3a260M260KaTgaAg11C.140.004329
ORF3a260M260RaTgaGg11C.180.002591
ORF3a260M260IatGatT11C.230.005814
ORF3a260M260KaTgaAg11C.300.001727
ORF3a260M260delATG---11D.20.000075
ORF3a260M260TaTgaCg11D.20.000075
ORF3a260M260IatGatT11L.30.003546
ORF3a260M260IatGatT11N.50.001767
ORF3a260M260IatGatT11P.1.140.000048
ORF3a260M260delATG---11P.1.140.000048
ORF3a260M260KaTgaAg11P.1.150.000232
ORF3a260M260RaTgaGg11P.1.150.000232
ORF3a260M260IatGatA11P.1.170.000162
ORF3a260M260IatGatA11P.20.000187
ORF3a260M260delATG---11P.20.000187
ORF3a260M260delATG---11P.60.003145
ORF3a260M260NaTGaAT11P.60.003145
ORF3a260M260KaTgaAg11Q.10.000126
ORF3a260M260VAtgGtg11Q.10.000126
ORF3a260M260IatGatT11Q.30.000145
ORF3a260M260IatGatT11Q.70.001111