CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : CodonNum = 251

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a251G251VnonsyngGtgTt807480690.99938126143-26145
ORF3a251G251VnonsyngGTgTA807430.00037156326143-26145
ORF3a251G251VnonsyngGTgTG807420.00024770926143-26145
ORF3a251G251CnonsynGgtTgt10931093126143-26145
ORF3a251G251DnonsyngGtgAt9879860.99898726143-26145
ORF3a251G251DnonsyngGTgAC98710.0010131726143-26145
ORF3a251G251SnonsynGgtAgt9239220.99891726143-26145
ORF3a251G251SnonsynGgTAgC92310.0010834226143-26145
ORF3a251G251GsynggTggC1451220.84137926143-26145
ORF3a251G251GsynggTggG145170.11724126143-26145
ORF3a251G251GsynggTggA14560.041379326143-26145
ORF3a251G251deldelGGT---2929126143-26145
ORF3a251G251del1delGgt-gt21200.95238126143-26145
ORF3a251G251del1delGGT-NN2110.04761926143-26145
ORF3a251G251RnonsynGgtCgt1050.526143-26145
ORF3a251G251RnonsynGgTAgA1020.226143-26145
ORF3a251G251RnonsynGgTAgG1020.226143-26145
ORF3a251G251RnonsynGgTCgG1010.126143-26145
ORF3a251G251AnonsyngGtgCt66126143-26145
ORF3a251G251TnonsynGGTACC22126143-26145
ORF3a251G251MnonsynGGTATG22126143-26145
ORF3a251G251InonsynGGTATA22126143-26145
ORF3a251G251FnonsynGGtTTt11126143-26145
ORF3a251G251EnonsyngGTgAA11126143-26145
ORF3a251G251LnonsynGGTTTA11126143-26145

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a251G251VgGtgTt80698074All0.001543
ORF3a251G251VgGTgTA38074All0.000001
ORF3a251G251VgGTgTG28074All0
ORF3a251G251VgGtgTt27532753B0.351866
ORF3a251G251VgGtgTt26582658B.400.968306
ORF3a251G251CGgtTgt10931093All0.000209
ORF3a251G251DgGtgAt986987All0.000189
ORF3a251G251DgGTgAC1987All0
ORF3a251G251SGgtAgt922923All0.000176
ORF3a251G251SGgTAgC1923All0
ORF3a251G251CGgtTgt791791P.10.012461
ORF3a251G251VgGtgTt421421B.390.981352
ORF3a251G251SGgtAgt401401B.1.1.70.000359
ORF3a251G251DgGtgAt370370AY.30.00368
ORF3a251G251DgGtgAt344344B.1.36.260.982857
ORF3a251G251VgGtgTt299299B.280.980328
ORF3a251G251VgGtgTt277277B.290.97193
ORF3a251G251VgGtgTt258258B.310.962687
ORF3a251G251VgGtgTt183183B.1.4990.192227
ORF3a251G251VgGtgTt171171B.610.982759
ORF3a251G251GggTggC122145All0.000023
ORF3a251G251GggTggG17145All0.000003
ORF3a251G251GggTggA6145All0.000001
ORF3a251G251SGgtAgt145145B.10.001328
ORF3a251G251VgGtgTt125125B.350.976562
ORF3a251G251VgGtgTt124124B.410.992
ORF3a251G251VgGtgTt9595B.580.969388
ORF3a251G251CGgtTgt7575B.1.1.70.000067
ORF3a251G251VgGtgTt7272B.340.986301
ORF3a251G251VgGtgTt6969B.430.985714
ORF3a251G251VgGtgTt6767B.300.985294
ORF3a251G251VgGtgTt6161B.600.968254
ORF3a251G251SGgtAgt5959B.1.617.20.000222
ORF3a251G251DgGtgAt4949AY.920.014076
ORF3a251G251DgGtgAt4747AY.4.20.001019
ORF3a251G251VgGtgTt4646B.330.978723
ORF3a251G251VgGtgTt4242B.381
ORF3a251G251VgGtgTt3940B.10.000357
ORF3a251G251VgGTgTA140B.10.000009
ORF3a251G251VgGtgTt3939AY.1030.000242
ORF3a251G251DgGtgAt3939B.10.000357
ORF3a251G251VgGtgTt3737B.321
ORF3a251G251VgGtgTt3333B.370.942857
ORF3a251G251SGgtAgt3232B.1.3510.000951
ORF3a251G251VgGtgTt3030B.421
ORF3a251G251delGGT---2929All0.000006
ORF3a251G251CGgtTgt2626AY.40.00004
ORF3a251G251SGgtAgt2525AY.390.000618
ORF3a251G251del1Ggt-gt2021All0.000004
ORF3a251G251del1GGT-NN121All0
ORF3a251G251CGgtTgt2121AY.430.000093
ORF3a251G251SGgtAgt2020AY.250.00012
ORF3a251G251GggTggC1819P.10.000284
ORF3a251G251GggTggG119P.10.000016
ORF3a251G251VgGtgTt1818AY.40.000028
ORF3a251G251CGgtTgt1818B.1.177.180.020882
ORF3a251G251SGgtAgt1717AY.430.000075
ORF3a251G251VgGtgTt1616B.1.1.70.000014
ORF3a251G251SGgtAgt1616B.1.2031
ORF3a251G251GggTggC1616B.1.4270.000808
ORF3a251G251SGgtAgt1515AY.40.000023
ORF3a251G251GggTggC1315B.10.000119
ORF3a251G251GggTggA215B.10.000018
ORF3a251G251SGgtAgt1515B.1.2210.001065
ORF3a251G251SGgtAgt1414AY.1020.000371
ORF3a251G251CGgtTgt1414AY.1030.000087
ORF3a251G251SGgtAgt1414AY.1200.000521
ORF3a251G251GggTggC714B.1.1.70.000006
ORF3a251G251GggTggG714B.1.1.70.000006
ORF3a251G251DgGtgAt1414B.1.1650.166667
ORF3a251G251VgGtgTt1313B.361
ORF3a251G251SGgtAgt1212AY.7.10.001352
ORF3a251G251VgGtgTt1212B.1.10.000218
ORF3a251G251GggTggC1111AY.440.000067
ORF3a251G251CGgtTgt1111AY.750.000616
ORF3a251G251del1Ggt-gt1011AY.99.20.000922
ORF3a251G251del1GGT-NN111AY.99.20.000092
ORF3a251G251RGgtCgt510All0.000001
ORF3a251G251RGgTAgA210All0
ORF3a251G251RGgTAgG210All0
ORF3a251G251RGgTCgG110All0
ORF3a251G251CGgtTgt1010B.1.2390.01221
ORF3a251G251VgGtgTt1010B.441
ORF3a251G251CGgtTgt99P.1.120.004356
ORF3a251G251CGgtTgt88AY.1180.000501
ORF3a251G251CGgtTgt88AY.30.00008
ORF3a251G251SGgtAgt88AY.30.00008
ORF3a251G251GggTggC78AY.40.000011
ORF3a251G251GggTggG18AY.40.000002
ORF3a251G251DgGtgAt88AY.70.001568
ORF3a251G251CGgtTgt88B.1.1770.000105
ORF3a251G251DgGtgAt88B.1.360.001167
ORF3a251G251GggTggC88B.1.617.20.00003
ORF3a251G251DgGtgAt77AY.440.000043
ORF3a251G251CGgtTgt77B.1.10.000127
ORF3a251G251SGgtAgt77B.1.10.000127
ORF3a251G251delGGT---77B.1.1.70.000006
ORF3a251G251DgGtgAt77B.1.1.70.000006
ORF3a251G251VgGtgTt77B.1.617.20.000026
ORF3a251G251VgGtgTt77B.550.020649
ORF3a251G251DgGtgAt77P.10.00011
ORF3a251G251AgGtgCt66All0.000001
ORF3a251G251GggTggC66AY.250.000036
ORF3a251G251DgGtgAt66AY.520.004886
ORF3a251G251SGgtAgt66B.1.1.4660.052174
ORF3a251G251SGgtAgt66B.1.20.000053
ORF3a251G251CGgtTgt66B.1.617.20.000023
ORF3a251G251DgGtgAt66C.360.005464
ORF3a251G251RGgTAgA250.111111
ORF3a251G251RGgTAgG250.111111
ORF3a251G251RGgtCgt150.055556
ORF3a251G251DgGtgAt55AY.40.000008
ORF3a251G251CGgtTgt55AY.440.00003
ORF3a251G251SGgtAgt55AY.440.00003
ORF3a251G251SGgtAgt55AY.750.00028
ORF3a251G251VgGtgTt55AY.90.000338
ORF3a251G251CGgtTgt55B.10.000046
ORF3a251G251CGgtTgt55B.1.1.3180.001509
ORF3a251G251GggTggC45B.1.20.000035
ORF3a251G251GggTggG15B.1.20.000009
ORF3a251G251CGgtTgt55B.1.2210.000355
ORF3a251G251CGgtTgt55B.1.4290.000118
ORF3a251G251SGgtAgt55P.1.160.001871
ORF3a251G251GggTggG240.111111
ORF3a251G251VgGTgTA240.111111
ORF3a251G251VgGTgTG240.111111
ORF3a251G251GggTggA240.111111
ORF3a251G251SGgtAgt44AY.1030.000025
ORF3a251G251GggTggC44AY.200.000155
ORF3a251G251VgGtgTt44AY.250.000024
ORF3a251G251delGGT---44AY.430.000018
ORF3a251G251VgGtgTt44AY.440.000024
ORF3a251G251SGgtAgt44AY.9.20.000147
ORF3a251G251SGgtAgt44B.1.1.2770.003035
ORF3a251G251DgGtgAt44B.1.1.3280.067797
ORF3a251G251del1Ggt-gt44B.1.1.70.000004
ORF3a251G251SGgtAgt44B.1.1770.000053
ORF3a251G251DgGtgAt44B.1.36.80.004
ORF3a251G251delGGT---44B.1.5250.000453
ORF3a251G251VgGtgTt44B.1.6210.000354
ORF3a251G251CGgtTgt44B.1.6280.001409
ORF3a251G251CGgtTgt44C.370.000464
ORF3a251G251CGgtTgt33A.10.000846
ORF3a251G251DgGtgAt33AY.1020.00008
ORF3a251G251DgGtgAt33AY.1030.000019
ORF3a251G251GggTggC33AY.1030.000019
ORF3a251G251DgGtgAt33AY.290.000047
ORF3a251G251SGgtAgt33AY.470.000093
ORF3a251G251SGgtAgt33B.1.1.3170.001235
ORF3a251G251SGgtAgt33B.1.1.4160.002715
ORF3a251G251SGgtAgt33B.1.1.5190.000119
ORF3a251G251SGgtAgt33B.1.1600.000094
ORF3a251G251GggTggC33B.1.1770.00004
ORF3a251G251VgGtgTt33B.1.1770.00004
ORF3a251G251VgGtgTt33B.1.20.000026
ORF3a251G251SGgtAgt33B.1.2580.0002
ORF3a251G251SGgtAgt33B.1.3490.002144
ORF3a251G251CGgtTgt33B.1.466.20.001174
ORF3a251G251DgGtgAt33B.1.4800.007463
ORF3a251G251VgGtgTt33B.1.4970.000944
ORF3a251G251SGgtAgt33B.1.5260.000071
ORF3a251G251DgGtgAt33B.1.617.20.000011
ORF3a251G251CGgtTgt33P.1.140.000143
ORF3a251G251GggTggC33P.1.70.000958
ORF3a251G251CGgtTgt33P.30.004785
ORF3a251G251SGgtAgt33P.30.004785
ORF3a251G251DgGtgAt33Q.20.00184
ORF3a251G251delGGT---220.111111
ORF3a251G251MGGTATG220.111111
ORF3a251G251IGGTATA220.111111
ORF3a251G251TGGTACC220.111111
ORF3a251G251VgGtgTt22A0.000774
ORF3a251G251VgGtgTt22A.20.001324
ORF3a251G251TGGTACC22All0
ORF3a251G251MGGTATG22All0
ORF3a251G251IGGTATA22All0
ORF3a251G251CGgtTgt22AY.1000.000092
ORF3a251G251SGgtAgt22AY.1190.000071
ORF3a251G251DgGtgAt22AY.230.000139
ORF3a251G251DgGtgAt22AY.250.000012
ORF3a251G251VgGtgTt22AY.30.00002
ORF3a251G251VgGtgTt22AY.300.000791
ORF3a251G251VgGtgTt22AY.360.000296
ORF3a251G251VgGtgTt22AY.4.20.000043
ORF3a251G251DgGtgAt22AY.430.000009
ORF3a251G251GggTggC12AY.430.000004
ORF3a251G251GggTggG12AY.430.000004
ORF3a251G251SGgtAgt22AY.460.000208
ORF3a251G251DgGtgAt12AY.46.60.000072
ORF3a251G251DgGTgAC12AY.46.60.000072
ORF3a251G251VgGtgTt22AY.470.000062
ORF3a251G251DgGtgAt22AY.60.000082
ORF3a251G251delGGT---22AY.750.000112
ORF3a251G251DgGtgAt22AY.770.002255
ORF3a251G251DgGtgAt22AY.9.20.000073
ORF3a251G251GggTggG12AY.9.20.000037
ORF3a251G251GggTggA12AY.9.20.000037
ORF3a251G251CGgtTgt22AY.99.20.000184
ORF3a251G251GggTggC22B.1.1.10.000653
ORF3a251G251SGgtAgt22B.1.1.1330.016949
ORF3a251G251VgGtgTt22B.1.1.1610.007067
ORF3a251G251CGgtTgt22B.1.1.250.001137
ORF3a251G251CGgtTgt22B.1.1.3170.000823
ORF3a251G251DgGtgAt22B.1.1080.011628
ORF3a251G251VgGtgTt22B.1.1570.00597
ORF3a251G251SGgtAgt22B.1.177.540.001213
ORF3a251G251AgGtgCt22B.1.20.000018
ORF3a251G251SGgtAgt22B.1.258.170.000208
ORF3a251G251GggTggC22B.1.3510.000059
ORF3a251G251VgGtgTt22B.1.4290.000047
ORF3a251G251DgGtgAt22B.1.4560.006536
ORF3a251G251AgGtgCt22B.1.4970.00063
ORF3a251G251DgGtgAt22B.1.5600.009259
ORF3a251G251GggTggC22B.1.5960.000174
ORF3a251G251SGgtAgt22B.1.617.10.000258
ORF3a251G251delGGT---22B.1.617.20.000008
ORF3a251G251DgGtgAt22B.1.6210.000177
ORF3a251G251VgGtgTt22B.230.005848
ORF3a251G251VgGtgTt22B.30.001661
ORF3a251G251VgGtgTt22B.40.004415
ORF3a251G251SGgtAgt22P.10.000032
ORF3a251G251VgGtgTt22P.10.000032
ORF3a251G251del1Ggt-gt22P.20.000373
ORF3a251G251DgGtgAt11A0.000387
ORF3a251G251VgGtgTt11A.2.20.001689
ORF3a251G251VgGtgTt11A.2.30.004739
ORF3a251G251SGgtAgt11A.2.40.003367
ORF3a251G251VgGtgTt11A.2.50.000499
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