CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : CodonNum = 239 & Codon = Cag

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a239E239QnonsynGagCag1657231657180.9999726107-26109

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a239E239QGagCag165718165723All0.031696
ORF3a239E239QGagCag162865162870AY.250.979604
ORF3a239E239QGagCag14741474B.1.617.20.00555
ORF3a239E239QGagCag241241AY.1130.034316
ORF3a239E239QGagCag156156AY.440.00095
ORF3a239E239QGagCag136136AY.40.000212
ORF3a239E239QGagCag8080AY.1200.002974
ORF3a239E239QGagCag7676AY.430.000337
ORF3a239E239QGagCag7373AY.920.020971
ORF3a239E239QGagCag6868AY.46.60.00491
ORF3a239E239QGagCag6666AY.1030.00041
ORF3a239E239QGagCag5353AY.1170.004479
ORF3a239E239QGagCag4040AY.1020.001061
ORF3a239E239QGagCag3838AY.1140.008782
ORF3a239E239QGagCag3333AY.750.001849
ORF3a239E239QGagCag3333B.10.000302
ORF3a239E239QGagCag3131AY.390.000766
ORF3a239E239QGagCag2121AY.1190.000741
ORF3a239E239QGagCag1313AY.460.001353
ORF3a239E239QGagCag1212AY.30.000119
ORF3a239E239QGagCag1212AY.470.000373
ORF3a239E239QGagCag1212B0.001534
ORF3a239E239QGagCag1010AY.450.001217
ORF3a239E239QGagCag1010AY.540.000953
ORF3a239E239QGagCag99AY.260.000255
ORF3a239E239QGagCag99B.1.5960.000784
ORF3a239E239QGagCag88AY.9.20.000294
ORF3a239E239QGagCag77AY.930.001912
ORF3a239E239QGagCag66AY.1180.000376
ORF3a239E239QGagCag66AY.46.10.00616
ORF3a239E239QGagCag66AY.960.012448
ORF3a239E239QGagCag55AY.1000.00023
ORF3a239E239QGagCag55AY.230.000349
ORF3a239E239QGagCag55AY.950.003805
ORF3a239E239QGagCag55B.1.20.000044
ORF3a239E239QGagCag44AY.34.10.00204
ORF3a239E239QGagCag44AY.46.20.002541
ORF3a239E239QGagCag44AY.50.000083
ORF3a239E239QGagCag44AY.620.001743
ORF3a239E239QGagCag44AY.980.000316
ORF3a239E239QGagCag44AY.98.10.000194
ORF3a239E239QGagCag44B.1.10.000073
ORF3a239E239QGagCag33AY.330.0002
ORF3a239E239QGagCag33AY.520.002443
ORF3a239E239QGagCag33AY.580.002722
ORF3a239E239QGagCag33AY.9.10.000251
ORF3a239E239QGagCag33AY.910.002191
ORF3a239E239QGagCag33AY.99.20.000276
ORF3a239E239QGagCag22AU.30.004219
ORF3a239E239QGagCag22AY.1090.001479
ORF3a239E239QGagCag22AY.200.000078
ORF3a239E239QGagCag22AY.290.000032
ORF3a239E239QGagCag22AY.39.10.000079
ORF3a239E239QGagCag22B.1.1.5260.007092
ORF3a239E239QGagCag11A0.000387
ORF3a239E239QGagCag11AY.1010.00049
ORF3a239E239QGagCag11AY.1050.000643
ORF3a239E239QGagCag11AY.1060.000335
ORF3a239E239QGagCag11AY.1070.000466
ORF3a239E239QGagCag11AY.1080.001103
ORF3a239E239QGagCag11AY.120.10.000321
ORF3a239E239QGagCag11AY.130.000161
ORF3a239E239QGagCag11AY.140.000088
ORF3a239E239QGagCag11AY.4.30.000842
ORF3a239E239QGagCag11AY.4.50.000107
ORF3a239E239QGagCag11AY.400.000964
ORF3a239E239QGagCag11AY.480.000465
ORF3a239E239QGagCag11AY.5.40.000277
ORF3a239E239QGagCag11AY.500.000799
ORF3a239E239QGagCag11AY.510.000909
ORF3a239E239QGagCag11AY.590.00053
ORF3a239E239QGagCag11AY.640.000595
ORF3a239E239QGagCag11AY.680.000274
ORF3a239E239QGagCag11AY.700.000209
ORF3a239E239QGagCag11AY.740.000116
ORF3a239E239QGagCag11AY.75.10.00018
ORF3a239E239QGagCag11AY.790.001211
ORF3a239E239QGagCag11B.1.2180.005155
ORF3a239E239QGagCag11B.1.3350.010309
ORF3a239E239QGagCag11B.1.3750.00082
ORF3a239E239QGagCag11B.1.4160.001269
ORF3a239E239QGagCag11B.1.466.20.000391
ORF3a239E239QGagCag11B.1.5800.004065
ORF3a239E239QGagCag11B.1.6210.000089
ORF3a239E239QGagCag11B.1.6230.000536
ORF3a239E239QGagCag11B.1.6290.013333
ORF3a239E239QGagCag11B.1.700.02439
ORF3a239E239QGagCag11P.1.150.000232
ORF3a239E239QGagCag11P.1.70.000319
ORF3a239E239QGagCag11P.20.000187