CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : CodonNum = 189

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a189Y189YsyntaTtaC67296729125957-25959
ORF3a189Y189CnonsyntAttGt173217300.99884525957-25959
ORF3a189Y189CnonsyntATtGC173220.0011547325957-25959
ORF3a189Y189HnonsynTatCat279279125957-25959
ORF3a189Y189FnonsyntAttTt121121125957-25959
ORF3a189Y189SnonsyntAttCt6666125957-25959
ORF3a189Y189deldelTAT---3030125957-25959
ORF3a189Y189XnonsyntaTtaA430.7525957-25959
ORF3a189Y189XnonsyntaTtaG410.2525957-25959
ORF3a189Y189NnonsynTatAat33125957-25959
ORF3a189Y189DnonsynTatGat22125957-25959
ORF3a189Y189del1delTat-at11125957-25959
ORF3a189Y189GnonsynTAtGGt11125957-25959

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a189Y189YtaTtaC67296729All0.001287
ORF3a189Y189YtaTtaC60696069AY.40.009446
ORF3a189Y189CtAttGt17301732All0.000331
ORF3a189Y189CtATtGC21732All0
ORF3a189Y189CtAttGt399399B.1.1.70.000357
ORF3a189Y189CtAttGt304304AY.40.000473
ORF3a189Y189HTatCat279279All0.000053
ORF3a189Y189CtAttGt250250AY.200.009716
ORF3a189Y189HTatCat168168P.10.002647
ORF3a189Y189FtAttTt121121All0.000023
ORF3a189Y189YtaTtaC9595AY.430.000421
ORF3a189Y189FtAttTt8585AY.1110.015568
ORF3a189Y189YtaTtaC7676B.1.617.20.000286
ORF3a189Y189CtAttGt7575B.1.1.3510.209497
ORF3a189Y189CtAttGt7272AY.290.001136
ORF3a189Y189StAttCt6666All0.000013
ORF3a189Y189StAttCt6666B.1.1.70.000059
ORF3a189Y189YtaTtaC6161AY.440.000371
ORF3a189Y189CtAttGt6060B.1.617.20.000226
ORF3a189Y189CtAttGt5252B.1.1.170.866667
ORF3a189Y189YtaTtaC4848B.1.1.1410.096579
ORF3a189Y189YtaTtaC4040B.1.1.70.000036
ORF3a189Y189CtAttGt3838B.1.1770.0005
ORF3a189Y189CtAttGt3636AY.1030.000224
ORF3a189Y189YtaTtaC3535B.1.10.000635
ORF3a189Y189YtaTtaC3333AY.30.000328
ORF3a189Y189CtAttGt3333B.1.177.600.007208
ORF3a189Y189delTAT---3030All0.000006
ORF3a189Y189YtaTtaC3030AY.390.000741
ORF3a189Y189CtAttGt2828AY.30.000278
ORF3a189Y189YtaTtaC2626AY.1030.000161
ORF3a189Y189HTatCat2424AY.440.000146
ORF3a189Y189HTatCat2424B.1.20.000211
ORF3a189Y189YtaTtaC2323AY.4.50.002472
ORF3a189Y189CtAttGt2222AY.250.000132
ORF3a189Y189CtAttGt2222B.1.2580.001464
ORF3a189Y189CtAttGt2121AY.440.000128
ORF3a189Y189CtAttGt1818B.1.1600.000561
ORF3a189Y189YtaTtaC1818B.1.1770.000237
ORF3a189Y189CtAttGt1515AY.430.000066
ORF3a189Y189CtAttGt1414AY.3.10.001194
ORF3a189Y189CtAttGt1313AY.390.000321
ORF3a189Y189YtaTtaC1212B.10.00011
ORF3a189Y189YtaTtaC1111AY.420.000443
ORF3a189Y189FtAttTt1111AY.440.000067
ORF3a189Y189CtAttGt1111B.1.10.0002
ORF3a189Y189CtAttGt1010AY.1000.00046
ORF3a189Y189YtaTtaC1010AY.1200.000372
ORF3a189Y189CtAttGt1010B.1.1.3060.004384
ORF3a189Y189CtAttGt1010B.1.258.110.003964
ORF3a189Y189CtAttGt99AY.1140.00208
ORF3a189Y189CtAttGt99AY.260.000255
ORF3a189Y189HTatCat99B.1.1.70.000008
ORF3a189Y189CtAttGt99B.1.6300.04712
ORF3a189Y189YtaTtaC88AY.1000.000368
ORF3a189Y189CtAttGt88AY.330.000534
ORF3a189Y189YtaTtaC88AY.50.000165
ORF3a189Y189FtAttTt88B.1.1.70.000007
ORF3a189Y189CtAttGt88B.1.4000.003432
ORF3a189Y189CtAttGt88P.10.000126
ORF3a189Y189CtAttGt77AY.230.000488
ORF3a189Y189HTatCat77AY.40.000011
ORF3a189Y189YtaTtaC77P.10.00011
ORF3a189Y189CtAttGt460.222222
ORF3a189Y189CtATtGC260.111111
ORF3a189Y189YtaTtaC66AY.4.2.10.000894
ORF3a189Y189CtAttGt66AY.420.000241
ORF3a189Y189CtAttGt66AY.90.000406
ORF3a189Y189HTatCat66B.10.000055
ORF3a189Y189delTAT---66B.1.1.70.000005
ORF3a189Y189CtAttGt66B.1.1470.004535
ORF3a189Y189CtAttGt66B.1.20.000053
ORF3a189Y189CtAttGt66B.1.5960.000523
ORF3a189Y189YtaTtaC55AY.230.000349
ORF3a189Y189YtaTtaC55AY.290.000079
ORF3a189Y189delTAT---55AY.430.000022
ORF3a189Y189CtAttGt55AY.470.000156
ORF3a189Y189HTatCat55AY.50.000103
ORF3a189Y189YtaTtaC55AY.590.002648
ORF3a189Y189YtaTtaC55AY.720.006803
ORF3a189Y189CtAttGt55B.1.1390.003666
ORF3a189Y189CtAttGt55B.1.617.10.000645
ORF3a189Y189XtaTtaA34All0.000001
ORF3a189Y189XtaTtaG14All0
ORF3a189Y189YtaTtaC44AY.1190.000141
ORF3a189Y189CtAttGt44AY.270.000259
ORF3a189Y189CtAttGt44AY.7.10.000451
ORF3a189Y189CtAttGt44AY.99.20.000369
ORF3a189Y189YtaTtaC44B.1.1.5190.000159
ORF3a189Y189CtAttGt44B.1.1.5190.000159
ORF3a189Y189YtaTtaC44B.1.1260.005102
ORF3a189Y189HTatCat44B.1.177.690.005935
ORF3a189Y189CtAttGt44B.1.5260.000094
ORF3a189Y189YtaTtaC44B.1.5950.001044
ORF3a189Y189FtAttTt44B.1.617.20.000015
ORF3a189Y189CtAttGt44Q.80.00066
ORF3a189Y189YtaTtaC33A.2.50.001497
ORF3a189Y189YtaTtaC33AD.20.000657
ORF3a189Y189NTatAat33All0.000001
ORF3a189Y189CtAttGt33AY.1020.00008
ORF3a189Y189YtaTtaC33AY.1180.000188
ORF3a189Y189CtAttGt33AY.1190.000106
ORF3a189Y189YtaTtaC33AY.200.000117
ORF3a189Y189HTatCat33AY.290.000047
ORF3a189Y189CtAttGt33AY.370.000948
ORF3a189Y189YtaTtaC33AY.370.000948
ORF3a189Y189CtAttGt33AY.4.20.000065
ORF3a189Y189YtaTtaC33AY.4.20.000065
ORF3a189Y189YtaTtaC33AY.520.002443
ORF3a189Y189CtAttGt33AY.60.000123
ORF3a189Y189CtAttGt33AY.770.003382
ORF3a189Y189YtaTtaC33AY.98.10.000145
ORF3a189Y189delTAT---33B.1.1770.00004
ORF3a189Y189HTatCat33B.1.1770.00004
ORF3a189Y189YtaTtaC33B.1.2470.044776
ORF3a189Y189YtaTtaC33B.1.4290.000071
ORF3a189Y189YtaTtaC33B.1.5260.000071
ORF3a189Y189CtAttGt33B.1.5750.00091
ORF3a189Y189delTAT---33B.1.617.20.000011
ORF3a189Y189FtAttTt33P.1.60.005837
ORF3a189Y189DTatGat22All0
ORF3a189Y189CtAttGt22AY.1060.00067
ORF3a189Y189YtaTtaC22AY.130.000322
ORF3a189Y189YtaTtaC22AY.250.000012
ORF3a189Y189CtAttGt22AY.29.10.000441
ORF3a189Y189NTatAat22AY.3.10.000171
ORF3a189Y189YtaTtaC22AY.340.000194
ORF3a189Y189FtAttTt22AY.420.00008
ORF3a189Y189YtaTtaC22AY.450.000243
ORF3a189Y189CtAttGt22AY.50.000041
ORF3a189Y189CtAttGt22AY.5.10.007519
ORF3a189Y189CtAttGt22AY.610.00021
ORF3a189Y189YtaTtaC22B.1.1.1340.022727
ORF3a189Y189delTAT---22B.1.20.000018
ORF3a189Y189CtAttGt22B.1.258.170.000208
ORF3a189Y189HTatCat22B.1.4270.000101
ORF3a189Y189CtAttGt22B.1.466.20.000782
ORF3a189Y189YtaTtaC22B.1.466.20.000782
ORF3a189Y189CtAttGt22B.1.5090.001732
ORF3a189Y189CtAttGt22B.1.5880.00182
ORF3a189Y189YtaTtaC22B.1.5880.00182
ORF3a189Y189HTatCat22B.1.617.20.000008
ORF3a189Y189CtAttGt22B.1.6210.000177
ORF3a189Y189CtAttGt22B.1.6340.006849
ORF3a189Y189HTatCat22B.400.000729
ORF3a189Y189CtAttGt22B.6.60.001778
ORF3a189Y189CtAttGt22C.370.000232
ORF3a189Y189HTatCat22D.20.00015
ORF3a189Y189HTatCat22P.1.130.001797
ORF3a189Y189HTatCat22P.1.140.000096
ORF3a189Y189CtAttGt22P.1.140.000096
ORF3a189Y189CtAttGt22P.1.20.002312
ORF3a189Y189CtAttGt22P.20.000373
ORF3a189Y189HTatCat11A0.000387
ORF3a189Y189GTAtGGt11All0
ORF3a189Y189del1Tat-at11All0
ORF3a189Y189FtAttTt11AY.1000.000046
ORF3a189Y189YtaTtaC11AY.1010.00049
ORF3a189Y189HTatCat11AY.1020.000027
ORF3a189Y189HTatCat11AY.1030.000006
ORF3a189Y189YtaTtaC11AY.1080.001103
ORF3a189Y189YtaTtaC11AY.1100.000113
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.1160.000287
ORF3a189Y189YtaTtaC11AY.120.000316
ORF3a189Y189delTAT---11AY.1200.000037
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.1210.000135
ORF3a189Y189YtaTtaC11AY.1210.000135
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.130.000161
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.140.000088
ORF3a189Y189FtAttTt11AY.230.00007
ORF3a189Y189XtaTtaG11AY.240.000431
ORF3a189Y189HTatCat11AY.250.000006
ORF3a189Y189YtaTtaC11AY.3.10.000085
ORF3a189Y189HTatCat11AY.390.000025
ORF3a189Y189delTAT---11AY.40.000002
ORF3a189Y189XtaTtaA11AY.40.000002
ORF3a189Y189FtAttTt11AY.40.000002
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.4.2.10.000149
ORF3a189Y189DTatGat11AY.4.50.000107
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.450.000122
ORF3a189Y189YtaTtaC11AY.460.000104
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.46.40.000165
ORF3a189Y189YtaTtaC11AY.46.40.000165
ORF3a189Y189YtaTtaC11AY.470.000031
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.510.000909
ORF3a189Y189YtaTtaC11AY.540.000095
ORF3a189Y189YtaTtaC11AY.610.000105
ORF3a189Y189HTatCat11AY.660.00107
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.680.000274
ORF3a189Y189delTAT---11AY.680.000274
ORF3a189Y189YtaTtaC11AY.690.000187
ORF3a189Y189delTAT---11AY.7.20.000559
ORF3a189Y189YtaTtaC11AY.90.000068
ORF3a189Y189delTAT---11AY.90.000068
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.9.10.000084
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.900.000684
ORF3a189Y189CtAttGt11AY.930.000273
ORF3a189Y189CtAttGt11B0.000128
ORF3a189Y189delTAT---11B0.000128
ORF3a189Y189CtAttGt11B.10.000009
ORF3a189Y189delTAT---11B.10.000009
ORF3a189Y189NTatAat11B.10.000009
ORF3a189Y189HTatCat11B.1.10.000018
ORF3a189Y189HTatCat11B.1.1.1010.01
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.1.1980.001468
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.1.2840.000107
ORF3a189Y189YtaTtaC11B.1.1.3260.001761
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.1.330.000421
ORF3a189Y189FtAttTt11B.1.1.3480.000796
ORF3a189Y189HTatCat11B.1.1.370.000193
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.1.370.000193
ORF3a189Y189YtaTtaC11B.1.1.3880.045455
ORF3a189Y189YtaTtaC11B.1.1.390.00051
ORF3a189Y189FtAttTt11B.1.1.4020.011111
ORF3a189Y189HTatCat11B.1.1.4320.001266
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.1.4800.025
ORF3a189Y189GTAtGGt11B.1.1.5190.00004
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.130.002375
ORF3a189Y189del1Tat-at11B.1.1600.000031
ORF3a189Y189HTatCat11B.1.1600.000031
ORF3a189Y189HTatCat11B.1.177.170.000821
ORF3a189Y189YtaTtaC11B.1.177.170.000821
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.177.240.001295
ORF3a189Y189delTAT---11B.1.177.510.004566
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.177.530.002392
ORF3a189Y189YtaTtaC11B.1.177.620.001192
ORF3a189Y189YtaTtaC11B.1.20.000009
ORF3a189Y189DTatGat11B.1.20.000009
ORF3a189Y189XtaTtaA11B.1.20.000009
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.214.20.0006
ORF3a189Y189YtaTtaC11B.1.2210.000071
ORF3a189Y189YtaTtaC11B.1.2430.00007
ORF3a189Y189YtaTtaC11B.1.2580.000067
ORF3a189Y189YtaTtaC11B.1.3240.001605
ORF3a189Y189YtaTtaC11B.1.3510.00003
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.351.20.000303
ORF3a189Y189YtaTtaC11B.1.360.000146
ORF3a189Y189delTAT---11B.1.36.10.00114
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.36.170.000494
ORF3a189Y189CtAttGt11B.1.4290.000024
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