CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : CodonNum = 188 & Codon = Tgt

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a188G188CnonsynGgtTgt49854985125954-25956

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a188G188CGgtTgt49854985All0.000953
ORF3a188G188CGgtTgt45594559B.1.1.70.004081
ORF3a188G188CGgtTgt133133AY.7.10.014989
ORF3a188G188CGgtTgt111111Q.80.018305
ORF3a188G188CGgtTgt2525B.1.1.10.008167
ORF3a188G188CGgtTgt2525Q.10.003158
ORF3a188G188CGgtTgt1818AY.40.000028
ORF3a188G188CGgtTgt1313B.10.000119
ORF3a188G188CGgtTgt1313B.1.10.000236
ORF3a188G188CGgtTgt99B.1.360.001313
ORF3a188G188CGgtTgt99B.1.617.20.000034
ORF3a188G188CGgtTgt77P.10.00011
ORF3a188G188CGgtTgt44AY.440.000024
ORF3a188G188CGgtTgt44B.1.1.250.002274
ORF3a188G188CGgtTgt44B.1.20.000035
ORF3a188G188CGgtTgt44B.1.36.100.019139
ORF3a188G188CGgtTgt44B.1.596.10.037383
ORF3a188G188CGgtTgt33AY.34.10.00153
ORF3a188G188CGgtTgt33AY.430.000013
ORF3a188G188CGgtTgt33B.1.1.3060.001315
ORF3a188G188CGgtTgt22AY.1190.000071
ORF3a188G188CGgtTgt22AY.30.00002
ORF3a188G188CGgtTgt22AY.60.000082
ORF3a188G188CGgtTgt22B.1.1.100.00223
ORF3a188G188CGgtTgt11A0.000387
ORF3a188G188CGgtTgt11A.20.000662
ORF3a188G188CGgtTgt11AY.1020.000027
ORF3a188G188CGgtTgt11AY.1080.001103
ORF3a188G188CGgtTgt11AY.1170.000085
ORF3a188G188CGgtTgt11AY.1180.000063
ORF3a188G188CGgtTgt11AY.250.000006
ORF3a188G188CGgtTgt11AY.260.000028
ORF3a188G188CGgtTgt11AY.270.000065
ORF3a188G188CGgtTgt11AY.29.10.000221
ORF3a188G188CGgtTgt11AY.330.000067
ORF3a188G188CGgtTgt11AY.4.20.000022
ORF3a188G188CGgtTgt11AY.50.000021
ORF3a188G188CGgtTgt11B0.000128
ORF3a188G188CGgtTgt11B.1.1.3180.000302
ORF3a188G188CGgtTgt11B.1.1.5190.00004
ORF3a188G188CGgtTgt11B.1.1770.000013
ORF3a188G188CGgtTgt11B.1.2430.00007
ORF3a188G188CGgtTgt11B.1.2580.000067
ORF3a188G188CGgtTgt11B.1.3540.043478
ORF3a188G188CGgtTgt11B.1.36.170.000494
ORF3a188G188CGgtTgt11B.1.3960.000706
ORF3a188G188CGgtTgt11B.1.4290.000024
ORF3a188G188CGgtTgt11B.1.5260.000024
ORF3a188G188CGgtTgt11D.20.000075
ORF3a188G188CGgtTgt11P.1.10.000318