CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : CodonNum = 185

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a185Q185HnonsyncaGcaT22977181600.79035625945-25947
ORF3a185Q185HnonsyncaGcaC2297748170.20964425945-25947
ORF3a185Q185QsyncaGcaA234234125945-25947
ORF3a185Q185RnonsyncAgcGg1941870.96391825945-25947
ORF3a185Q185RnonsyncAGcGT19460.030927825945-25947
ORF3a185Q185RnonsyncAGcGA19410.0051546425945-25947
ORF3a185Q185PnonsyncAgcCg7272125945-25947
ORF3a185Q185LnonsyncAgcTg5353125945-25947
ORF3a185Q185KnonsynCagAag3636125945-25947
ORF3a185Q185deldelCAG---3232125945-25947
ORF3a185Q185EnonsynCagGag99125945-25947
ORF3a185Q185del2delcAGc--77125945-25947
ORF3a185Q185XnonsynCagTag55125945-25947
ORF3a185Q185del1delcaGca-11125945-25947
ORF3a185Q185NnonsynCaGAaT11125945-25947

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a185Q185HcaGcaT1816022977All0.003473
ORF3a185Q185HcaGcaC481722977All0.000921
ORF3a185Q185HcaGcaT95829600B.1.258.170.996257
ORF3a185Q185HcaGcaC189600B.1.258.170.001871
ORF3a185Q185HcaGcaC28843682AY.40.004489
ORF3a185Q185HcaGcaT7983682AY.40.001242
ORF3a185Q185HcaGcaT22742275B.1.1.1760.999121
ORF3a185Q185HcaGcaC12275B.1.1.1760.000439
ORF3a185Q185HcaGcaT503783B.1.1.70.00045
ORF3a185Q185HcaGcaC280783B.1.1.70.000251
ORF3a185Q185HcaGcaT427430B.1.1.2140.02368
ORF3a185Q185HcaGcaC3430B.1.1.2140.000166
ORF3a185Q185HcaGcaC399399B.1.5030.992537
ORF3a185Q185HcaGcaC174334B.1.20.001532
ORF3a185Q185HcaGcaT160334B.1.20.001409
ORF3a185Q185HcaGcaT197331B.1.617.20.000742
ORF3a185Q185HcaGcaC134331B.1.617.20.000505
ORF3a185Q185HcaGcaT290290B.1.258.41
ORF3a185Q185HcaGcaT286288AY.260.008097
ORF3a185Q185HcaGcaC2288AY.260.000057
ORF3a185Q185HcaGcaT182268AY.430.000806
ORF3a185Q185HcaGcaC86268AY.430.000381
ORF3a185Q185HcaGcaT252266B.1.1770.003318
ORF3a185Q185HcaGcaC14266B.1.1770.000184
ORF3a185Q185HcaGcaT238248B.10.00218
ORF3a185Q185HcaGcaC10248B.10.000092
ORF3a185Q185QcaGcaA234234All0.000045
ORF3a185Q185HcaGcaT204204AY.530.058654
ORF3a185Q185RcAgcGg187194All0.000036
ORF3a185Q185RcAGcGT6194All0.000001
ORF3a185Q185RcAGcGA1194All0
ORF3a185Q185HcaGcaT136187AY.440.000828
ORF3a185Q185HcaGcaC51187AY.440.00031
ORF3a185Q185HcaGcaT177177AY.190.201824
ORF3a185Q185HcaGcaT164164B.1.1.3720.112948
ORF3a185Q185HcaGcaT86153AY.1030.000534
ORF3a185Q185HcaGcaC67153AY.1030.000416
ORF3a185Q185HcaGcaT92130AY.250.000553
ORF3a185Q185HcaGcaC38130AY.250.000229
ORF3a185Q185HcaGcaT120120B.1.2580.007986
ORF3a185Q185HcaGcaT114114B.1.258.51
ORF3a185Q185HcaGcaT8898B.1.10.001596
ORF3a185Q185HcaGcaC1098B.1.10.000181
ORF3a185Q185HcaGcaT9092B.1.3510.002675
ORF3a185Q185HcaGcaC292B.1.3510.000059
ORF3a185Q185HcaGcaC9292B.1.36.20.989247
ORF3a185Q185HcaGcaT8188AY.60.003331
ORF3a185Q185HcaGcaC788AY.60.000288
ORF3a185Q185HcaGcaT4882P.10.000756
ORF3a185Q185HcaGcaC3482P.10.000536
ORF3a185Q185PcAgcCg7272All0.000014
ORF3a185Q185HcaGcaC6969AY.360.010227
ORF3a185Q185HcaGcaT6667AY.750.003697
ORF3a185Q185HcaGcaC167AY.750.000056
ORF3a185Q185HcaGcaT6767B.1.1390.04912
ORF3a185Q185HcaGcaT5765B.1.4270.002878
ORF3a185Q185HcaGcaC865B.1.4270.000404
ORF3a185Q185HcaGcaC4663B.1.4290.001082
ORF3a185Q185HcaGcaT1763B.1.4290.0004
ORF3a185Q185HcaGcaT5759AY.340.005527
ORF3a185Q185HcaGcaC259AY.340.000194
ORF3a185Q185QcaGcaA5555B.1.1.70.000049
ORF3a185Q185LcAgcTg5353All0.00001
ORF3a185Q185HcaGcaT3053AY.390.000741
ORF3a185Q185HcaGcaC2353AY.390.000568
ORF3a185Q185HcaGcaT5151B.1.1.4670.980769
ORF3a185Q185HcaGcaT4546B.1.360.006566
ORF3a185Q185HcaGcaC146B.1.360.000146
ORF3a185Q185HcaGcaC2445AY.1190.000847
ORF3a185Q185HcaGcaT2145AY.1190.000741
ORF3a185Q185QcaGcaA4545B.1.10.000816
ORF3a185Q185HcaGcaT4141B.1.258.230.97619
ORF3a185Q185HcaGcaT3340AY.1020.000875
ORF3a185Q185HcaGcaC740AY.1020.000186
ORF3a185Q185HcaGcaC2840B.1.177.70.004616
ORF3a185Q185HcaGcaT1240B.1.177.70.001978
ORF3a185Q185HcaGcaT3838B.1.1.5190.001509
ORF3a185Q185RcAgcGg3738B.1.1.70.000033
ORF3a185Q185RcAGcGA138B.1.1.70.000001
ORF3a185Q185KCagAag3636All0.000007
ORF3a185Q185PcAgcCg3636B.1.1.70.000032
ORF3a185Q185HcaGcaT3434B.1.177.50.042236
ORF3a185Q185HcaGcaT3434B.1.4380.222222
ORF3a185Q185delCAG---3232All0.000006
ORF3a185Q185HcaGcaT2532AY.30.000249
ORF3a185Q185HcaGcaC732AY.30.00007
ORF3a185Q185RcAgcGg3131AY.440.000189
ORF3a185Q185HcaGcaT3030B.1.1.3200.545455
ORF3a185Q185HcaGcaT2930B.1.6090.013902
ORF3a185Q185HcaGcaC130B.1.6090.000479
ORF3a185Q185HcaGcaT2128B.1.5260.000494
ORF3a185Q185HcaGcaC728B.1.5260.000165
ORF3a185Q185HcaGcaC2627AY.1010.012751
ORF3a185Q185HcaGcaT127AY.1010.00049
ORF3a185Q185HcaGcaT2527AY.75.10.004508
ORF3a185Q185HcaGcaC227AY.75.10.000361
ORF3a185Q185HcaGcaT2526B.1.1600.00078
ORF3a185Q185HcaGcaC126B.1.1600.000031
ORF3a185Q185HcaGcaT1625AY.1000.000736
ORF3a185Q185HcaGcaC925AY.1000.000414
ORF3a185Q185HcaGcaT2425C.350.018576
ORF3a185Q185HcaGcaC125C.350.000774
ORF3a185Q185HcaGcaT1824AY.50.000372
ORF3a185Q185HcaGcaC624AY.50.000124
ORF3a185Q185HcaGcaC1724B.1.1.2220.003468
ORF3a185Q185HcaGcaT724B.1.1.2220.001428
ORF3a185Q185RcAgcGg2424P.20.004479
ORF3a185Q185QcaGcaA2323AY.30.000229
ORF3a185Q185RcAgcGg2222AY.1030.000137
ORF3a185Q185HcaGcaT2022AY.790.024213
ORF3a185Q185HcaGcaC222AY.790.002421
ORF3a185Q185HcaGcaT1621AY.230.001116
ORF3a185Q185HcaGcaC521AY.230.000349
ORF3a185Q185PcAgcCg2121B.1.1310.184211
ORF3a185Q185HcaGcaT1820AY.330.001202
ORF3a185Q185HcaGcaC220AY.330.000134
ORF3a185Q185HcaGcaT1720AY.39.10.000673
ORF3a185Q185HcaGcaC320AY.39.10.000119
ORF3a185Q185HcaGcaC1820B.1.3960.012703
ORF3a185Q185HcaGcaT220B.1.3960.001411
ORF3a185Q185HcaGcaT1819AY.9.20.000661
ORF3a185Q185HcaGcaC119AY.9.20.000037
ORF3a185Q185HcaGcaT1719B.1.258.240.182796
ORF3a185Q185HcaGcaC219B.1.258.240.021505
ORF3a185Q185RcAgcGg1919B.1.617.20.000072
ORF3a185Q185LcAgcTg1717AY.250.000102
ORF3a185Q185HcaGcaC1017AY.610.001048
ORF3a185Q185HcaGcaT717AY.610.000733
ORF3a185Q185HcaGcaT1316AY.46.60.000939
ORF3a185Q185HcaGcaC316AY.46.60.000217
ORF3a185Q185HcaGcaT1316B0.001662
ORF3a185Q185HcaGcaC316B0.000383
ORF3a185Q185HcaGcaT1516B.1.1.2160.013357
ORF3a185Q185HcaGcaC116B.1.1.2160.00089
ORF3a185Q185QcaGcaA1515B.1.617.20.000056
ORF3a185Q185HcaGcaC814AY.4.20.000174
ORF3a185Q185HcaGcaT614AY.4.20.00013
ORF3a185Q185HcaGcaC714AY.420.000282
ORF3a185Q185HcaGcaT714AY.420.000282
ORF3a185Q185HcaGcaT1114AY.470.000342
ORF3a185Q185HcaGcaC314AY.470.000093
ORF3a185Q185LcAgcTg1414B.1.617.20.000053
ORF3a185Q185RcAgcGg1313AY.40.00002
ORF3a185Q185KCagAag1313B.1.1.70.000012
ORF3a185Q185HcaGcaT1313B.1.2210.000923
ORF3a185Q185HcaGcaT1212AY.1210.001624
ORF3a185Q185HcaGcaT1012AY.450.001217
ORF3a185Q185HcaGcaC212AY.450.000243
ORF3a185Q185HcaGcaT1111A.171
ORF3a185Q185HcaGcaT711AY.98.10.000339
ORF3a185Q185HcaGcaC411AY.98.10.000194
ORF3a185Q185HcaGcaT1111B.1.2320.005911
ORF3a185Q185HcaGcaT1011B.1.5250.001132
ORF3a185Q185HcaGcaC111B.1.5250.000113
ORF3a185Q185HcaGcaT1011D.20.00075
ORF3a185Q185HcaGcaC111D.20.000075
ORF3a185Q185HcaGcaT710AY.290.00011
ORF3a185Q185HcaGcaC310AY.290.000047
ORF3a185Q185HcaGcaT1010AY.3.10.000853
ORF3a185Q185QcaGcaA1010AY.40.000016
ORF3a185Q185HcaGcaT810AY.460.000833
ORF3a185Q185HcaGcaC210AY.460.000208
ORF3a185Q185HcaGcaT1010AY.910.007305
ORF3a185Q185QcaGcaA1010B.1.2430.000696
ORF3a185Q185HcaGcaT910B.1.5960.000784
ORF3a185Q185HcaGcaC110B.1.5960.000087
ORF3a185Q185ECagGag99All0.000002
ORF3a185Q185HcaGcaC69AY.200.000233
ORF3a185Q185HcaGcaT39AY.200.000117
ORF3a185Q185PcAgcCg99AY.250.000054
ORF3a185Q185QcaGcaA99B.10.000082
ORF3a185Q185HcaGcaT99B.1.160.160.008364
ORF3a185Q185HcaGcaT99B.1.2360.01848
ORF3a185Q185HcaGcaT99B.1.3670.007132
ORF3a185Q185HcaGcaT99B.1.596.10.084112
ORF3a185Q185HcaGcaT99K.30.055556
ORF3a185Q185HcaGcaT58A0.001935
ORF3a185Q185HcaGcaC38A0.001161
ORF3a185Q185HcaGcaT68AY.1180.000376
ORF3a185Q185HcaGcaC28AY.1180.000125
ORF3a185Q185HcaGcaT48AY.1200.000149
ORF3a185Q185HcaGcaC48AY.1200.000149
ORF3a185Q185HcaGcaC48AY.99.20.000369
ORF3a185Q185HcaGcaT48AY.99.20.000369
ORF3a185Q185QcaGcaA88B.1.20.00007
ORF3a185Q185HcaGcaT58B.1.2430.000348
ORF3a185Q185HcaGcaC38B.1.2430.000209
ORF3a185Q185QcaGcaA88B.1.258.110.003171
ORF3a185Q185HcaGcaT88B.1.36.290.004139
ORF3a185Q185HcaGcaT88P.1.70.002554
ORF3a185Q185del2cAGc--77All0.000001
ORF3a185Q185HcaGcaT77AS.10.066667
ORF3a185Q185QcaGcaA77AY.1020.000186
ORF3a185Q185HcaGcaT47AY.270.000259
ORF3a185Q185HcaGcaC37AY.270.000194
ORF3a185Q185HcaGcaT77AY.29.10.001544
ORF3a185Q185QcaGcaA77B.1.1.3050.027027
ORF3a185Q185delCAG---77B.1.1.70.000006
ORF3a185Q185HcaGcaT77B.1.177.330.011513
ORF3a185Q185HcaGcaC67B.1.2340.000792
ORF3a185Q185HcaGcaT17B.1.2340.000132
ORF3a185Q185HcaGcaT67B.1.6210.000531
ORF3a185Q185HcaGcaC17B.1.6210.000089
ORF3a185Q185HcaGcaT77B.4.10.132075
ORF3a185Q185HcaGcaC56AY.120.2.10.002491
ORF3a185Q185HcaGcaT16AY.120.2.10.000498
ORF3a185Q185KCagAag66B.1.10.000109
ORF3a185Q185HcaGcaT66B.1.1.1920.013857
ORF3a185Q185HcaGcaC46B.1.1.2970.008949
ORF3a185Q185HcaGcaT26B.1.1.2970.004474
ORF3a185Q185HcaGcaT66B.1.1.630.002315
ORF3a185Q185HcaGcaT66B.1.177.690.008902
ORF3a185Q185HcaGcaT56B.1.3750.004098
ORF3a185Q185HcaGcaC16B.1.3750.00082
ORF3a185Q185HcaGcaT56B.1.6370.000365
ORF3a185Q185HcaGcaC16B.1.6370.000073
ORF3a185Q185HcaGcaC66C.320.139535
ORF3a185Q185HcaGcaT46P.20.000747
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