CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : CodonNum = 18 & Codon = ---

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a18G18deldelGGT---572572125444-25446

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a18G18delGGT---572572All0.000109
ORF3a18G18delGGT---171171B.1.1.70.000153
ORF3a18G18delGGT---7979AY.440.000481
ORF3a18G18delGGT---6060B.1.20.000528
ORF3a18G18delGGT---3737AY.40.000058
ORF3a18G18delGGT---2323AY.250.000138
ORF3a18G18delGGT---1919AY.1030.000118
ORF3a18G18delGGT---1919B.1.617.20.000072
ORF3a18G18delGGT---1818P.10.000284
ORF3a18G18delGGT---1515B.1.1770.000198
ORF3a18G18delGGT---1111B.10.000101
ORF3a18G18delGGT---88AY.4.50.00086
ORF3a18G18delGGT---88B.1.1.5190.000318
ORF3a18G18delGGT---88B.1.4290.000188
ORF3a18G18delGGT---77B.1.1.3170.002882
ORF3a18G18delGGT---66B.1.10.000109
ORF3a18G18delGGT---55AY.290.000079
ORF3a18G18delGGT---55AY.430.000022
ORF3a18G18delGGT---33AY.50.000062
ORF3a18G18delGGT---33AY.60.000123
ORF3a18G18delGGT---33B.1.2210.000213
ORF3a18G18delGGT---33U.30.011583
ORF3a18G18delGGT---22AY.1110.000366
ORF3a18G18delGGT---22AY.1180.000125
ORF3a18G18delGGT---22AY.200.000078
ORF3a18G18delGGT---22AY.270.000129
ORF3a18G18delGGT---22AY.470.000062
ORF3a18G18delGGT---22B.1.1.2140.000111
ORF3a18G18delGGT---22B.1.177.40.000422
ORF3a18G18delGGT---22B.1.4090.001563
ORF3a18G18delGGT---22B.1.4270.000101
ORF3a18G18delGGT---11A.2.50.000499
ORF3a18G18delGGT---11AY.1050.000643
ORF3a18G18delGGT---11AY.1170.000085
ORF3a18G18delGGT---11AY.1200.000037
ORF3a18G18delGGT---11AY.190.00114
ORF3a18G18delGGT---11AY.230.00007
ORF3a18G18delGGT---11AY.260.000028
ORF3a18G18delGGT---11AY.3.10.000085
ORF3a18G18delGGT---11AY.330.000067
ORF3a18G18delGGT---11AY.39.10.00004
ORF3a18G18delGGT---11AY.46.20.000635
ORF3a18G18delGGT---11AY.5.40.000277
ORF3a18G18delGGT---11AY.600.000938
ORF3a18G18delGGT---11AY.90.000068
ORF3a18G18delGGT---11AY.9.20.000037
ORF3a18G18delGGT---11AY.980.000079
ORF3a18G18delGGT---11AY.990.001049
ORF3a18G18delGGT---11B0.000128
ORF3a18G18delGGT---11B.1.1.4090.002833
ORF3a18G18delGGT---11B.1.1.630.000386
ORF3a18G18delGGT---11B.1.1420.002899
ORF3a18G18delGGT---11B.1.160.230.004831
ORF3a18G18delGGT---11B.1.160.330.004425
ORF3a18G18delGGT---11B.1.177.110.001698
ORF3a18G18delGGT---11B.1.177.190.001431
ORF3a18G18delGGT---11B.1.177.580.001332
ORF3a18G18delGGT---11B.1.177.60.000977
ORF3a18G18delGGT---11B.1.177.70.000165
ORF3a18G18delGGT---11B.1.177.760.002494
ORF3a18G18delGGT---11B.1.221.10.002907
ORF3a18G18delGGT---11B.1.2580.000067
ORF3a18G18delGGT---11B.1.258.100.011364
ORF3a18G18delGGT---11B.1.3510.00003
ORF3a18G18delGGT---11B.1.36.170.000494
ORF3a18G18delGGT---11B.1.36.180.00042
ORF3a18G18delGGT---11B.1.3890.001002
ORF3a18G18delGGT---11B.1.5090.000866
ORF3a18G18delGGT---11B.1.5260.000024
ORF3a18G18delGGT---11B.1.5950.000261
ORF3a18G18delGGT---11B.1.6280.000352
ORF3a18G18delGGT---11B.1.6380.052632
ORF3a18G18delGGT---11B.3.10.001658
ORF3a18G18delGGT---11P.1.150.000232