CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF3a : CodonNum = 156

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF3a156Y156CnonsyntAttGt13091309125858-25860
ORF3a156Y156YsyntaTtaC584584125858-25860
ORF3a156Y156HnonsynTatCat276276125858-25860
ORF3a156Y156deldelTAT---7474125858-25860
ORF3a156Y156NnonsynTatAat37350.94594625858-25860
ORF3a156Y156NnonsynTaTAaC3720.054054125858-25860
ORF3a156Y156FnonsyntAttTt24220.91666725858-25860
ORF3a156Y156FnonsyntATtTC2420.083333325858-25860
ORF3a156Y156SnonsyntAttCt88125858-25860
ORF3a156Y156XnonsyntaTtaG740.57142925858-25860
ORF3a156Y156XnonsyntaTtaA730.42857125858-25860
ORF3a156Y156InonsynTATATC420.525858-25860
ORF3a156Y156InonsynTAtATt420.525858-25860
ORF3a156Y156del1deltATtG-320.66666725858-25860
ORF3a156Y156del1deltaTta-310.33333325858-25860
ORF3a156Y156LnonsynTAtCTt11125858-25860

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF3a156Y156CtAttGt13091309All0.00025
ORF3a156Y156CtAttGt663663AP.10.995495
ORF3a156Y156YtaTtaC584584All0.000112
ORF3a156Y156YtaTtaC471471B.1.1.70.000422
ORF3a156Y156HTatCat276276All0.000053
ORF3a156Y156CtAttGt179179B.1.1.70.00016
ORF3a156Y156HTatCat145145AY.40.000226
ORF3a156Y156CtAttGt104104B.1.1.700.035471
ORF3a156Y156delTAT---7474All0.000014
ORF3a156Y156CtAttGt4646P.1.150.010688
ORF3a156Y156CtAttGt4545AY.40.00007
ORF3a156Y156YtaTtaC4242B.1.1.1410.084507
ORF3a156Y156NTatAat3537All0.000007
ORF3a156Y156NTaTAaC237All0
ORF3a156Y156CtAttGt3333B.1.1.630.012731
ORF3a156Y156CtAttGt3333Q.10.004169
ORF3a156Y156HTatCat3131B.1.1.70.000028
ORF3a156Y156CtAttGt3030B.10.000275
ORF3a156Y156CtAttGt2929B.1.617.20.000109
ORF3a156Y156NTatAat2525B.1.1.70.000022
ORF3a156Y156FtAttTt2224All0.000004
ORF3a156Y156FtATtTC224All0
ORF3a156Y156HTatCat2222B.10.000202
ORF3a156Y156CtAttGt2222B.1.10.000399
ORF3a156Y156delTAT---1919B.1.1.70.000017
ORF3a156Y156YtaTtaC1717Q.80.002803
ORF3a156Y156CtAttGt1414AY.1030.000087
ORF3a156Y156CtAttGt1313AY.3.10.001108
ORF3a156Y156HTatCat1212AY.1030.000075
ORF3a156Y156CtAttGt1111AY.610.001153
ORF3a156Y156CtAttGt1010AY.1020.000265
ORF3a156Y156CtAttGt1010AY.250.00006
ORF3a156Y156CtAttGt1010B.1.1.5190.000397
ORF3a156Y156StAttCt88All0.000002
ORF3a156Y156HTatCat88AY.60.000329
ORF3a156Y156XtaTtaG47All0.000001
ORF3a156Y156XtaTtaA37All0.000001
ORF3a156Y156CtAttGt77AY.1190.000247
ORF3a156Y156FtAttTt77AY.40.000011
ORF3a156Y156YtaTtaC77AY.40.000011
ORF3a156Y156HTatCat77AY.420.000282
ORF3a156Y156HTatCat77Q.10.000884
ORF3a156Y156StAttCt66AY.40.000009
ORF3a156Y156delTAT---66B.10.000055
ORF3a156Y156YtaTtaC66B.1.617.20.000023
ORF3a156Y156YtaTtaC55AY.1000.00023
ORF3a156Y156CtAttGt55B.1.1.3970.011261
ORF3a156Y156CtAttGt55B.1.3510.000149
ORF3a156Y156HTatCat55B.1.617.20.000019
ORF3a156Y156FtATtTC240.111111
ORF3a156Y156FtAttTt240.111111
ORF3a156Y156ITAtATt240.111111
ORF3a156Y156ITATATC240.111111
ORF3a156Y156NTatAat240.111111
ORF3a156Y156NTaTAaC240.111111
ORF3a156Y156ITAtATt24All0
ORF3a156Y156ITATATC24All0
ORF3a156Y156HTatCat44AY.230.000279
ORF3a156Y156FtAttTt44AY.30.00004
ORF3a156Y156delTAT---44AY.430.000018
ORF3a156Y156HTatCat44B.1.1.500.002716
ORF3a156Y156FtAttTt44B.1.2340.000528
ORF3a156Y156YtaTtaC44B.1.4290.000094
ORF3a156Y156CtAttGt44C.230.023256
ORF3a156Y156YtaTtaC33A.50.005769
ORF3a156Y156del1tATtG-23All0
ORF3a156Y156del1taTta-13All0
ORF3a156Y156YtaTtaC33AY.1030.000019
ORF3a156Y156HTatCat33AY.1190.000106
ORF3a156Y156CtAttGt33AY.1200.000112
ORF3a156Y156HTatCat33AY.250.000018
ORF3a156Y156NTatAat33AY.290.000047
ORF3a156Y156CtAttGt33AY.440.000018
ORF3a156Y156YtaTtaC33B.10.000027
ORF3a156Y156delTAT---33B.1.1770.00004
ORF3a156Y156delTAT---33B.1.177.40.000633
ORF3a156Y156CtAttGt33B.1.20.000026
ORF3a156Y156del1tATtG-220.111111
ORF3a156Y156YtaTtaC220.111111
ORF3a156Y156delTAT---220.111111
ORF3a156Y156CtAttGt22AY.200.000078
ORF3a156Y156YtaTtaC22AY.260.000057
ORF3a156Y156CtAttGt22AY.30.00002
ORF3a156Y156HTatCat22AY.30.00002
ORF3a156Y156delTAT---22AY.40.000003
ORF3a156Y156CtAttGt22AY.430.000009
ORF3a156Y156HTatCat22AY.440.000012
ORF3a156Y156HTatCat22AY.470.000062
ORF3a156Y156YtaTtaC22B.1.10.000036
ORF3a156Y156delTAT---22B.1.1.3150.016949
ORF3a156Y156XtaTtaG12B.1.1.70.000001
ORF3a156Y156XtaTtaA12B.1.1.70.000001
ORF3a156Y156HTatCat22B.1.1600.000062
ORF3a156Y156CtAttGt22B.1.1770.000026
ORF3a156Y156delTAT---22B.1.5250.000226
ORF3a156Y156delTAT---22B.1.617.20.000008
ORF3a156Y156delTAT---22B.1.6210.000177
ORF3a156Y156delTAT---22P.10.000032
ORF3a156Y156delTAT---22P.1.150.000465
ORF3a156Y156delTAT---11A0.000387
ORF3a156Y156YtaTtaC11A0.000387
ORF3a156Y156delTAT---11AD.20.000219
ORF3a156Y156LTAtCTt11All0
ORF3a156Y156CtAttGt11AY.1130.000142
ORF3a156Y156CtAttGt11AY.1170.000085
ORF3a156Y156HTatCat11AY.1170.000085
ORF3a156Y156delTAT---11AY.1200.000037
ORF3a156Y156delTAT---11AY.250.000006
ORF3a156Y156YtaTtaC11AY.250.000006
ORF3a156Y156delTAT---11AY.290.000016
ORF3a156Y156YtaTtaC11AY.3.10.000085
ORF3a156Y156HTatCat11AY.320.000532
ORF3a156Y156CtAttGt11AY.360.000148
ORF3a156Y156YtaTtaC11AY.370.000316
ORF3a156Y156delTAT---11AY.390.000025
ORF3a156Y156XtaTtaA11AY.40.000002
ORF3a156Y156XtaTtaG11AY.4.20.000022
ORF3a156Y156YtaTtaC11AY.4.20.000022
ORF3a156Y156delTAT---11AY.4.50.000107
ORF3a156Y156HTatCat11AY.430.000004
ORF3a156Y156YtaTtaC11AY.430.000004
ORF3a156Y156FtAttTt11AY.440.000006
ORF3a156Y156YtaTtaC11AY.440.000006
ORF3a156Y156HTatCat11AY.46.20.000635
ORF3a156Y156HTatCat11AY.46.60.000072
ORF3a156Y156YtaTtaC11AY.50.000021
ORF3a156Y156CtAttGt11AY.5.30.000337
ORF3a156Y156CtAttGt11AY.510.000909
ORF3a156Y156HTatCat11AY.520.000814
ORF3a156Y156CtAttGt11AY.60.000041
ORF3a156Y156delTAT---11AY.680.000274
ORF3a156Y156NTatAat11AY.7.10.000113
ORF3a156Y156CtAttGt11AY.870.000833
ORF3a156Y156HTatCat11AY.9.10.000084
ORF3a156Y156HTatCat11AY.98.10.000048
ORF3a156Y156YtaTtaC11AY.99.20.000092
ORF3a156Y156delTAT---11B0.000128
ORF3a156Y156StAttCt11B.10.000009
ORF3a156Y156NTatAat11B.10.000009
ORF3a156Y156FtAttTt11B.10.000009
ORF3a156Y156LTAtCTt11B.10.000009
ORF3a156Y156NTatAat11B.1.10.000018
ORF3a156Y156CtAttGt11B.1.1.1610.003534
ORF3a156Y156delTAT---11B.1.1.1700.001247
ORF3a156Y156YtaTtaC11B.1.1.2200.001859
ORF3a156Y156CtAttGt11B.1.1.2210.010101
ORF3a156Y156YtaTtaC11B.1.1.3170.000412
ORF3a156Y156XtaTtaG11B.1.1.3720.000689
ORF3a156Y156YtaTtaC11B.1.1.3770.001381
ORF3a156Y156delTAT---11B.1.1.4090.002833
ORF3a156Y156YtaTtaC11B.1.1.5240.020833
ORF3a156Y156NTatAat11B.1.1.750.010638
ORF3a156Y156delTAT---11B.1.1400.018868
ORF3a156Y156CtAttGt11B.1.1420.002899
ORF3a156Y156XtaTtaG11B.1.1470.000756
ORF3a156Y156delTAT---11B.1.1600.000031
ORF3a156Y156delTAT---11B.1.160.230.004831
ORF3a156Y156XtaTtaA11B.1.1770.000013
ORF3a156Y156CtAttGt11B.1.177.410.0025
ORF3a156Y156delTAT---11B.1.177.510.004566
ORF3a156Y156delTAT---11B.1.177.620.001192
ORF3a156Y156CtAttGt11B.1.177.860.000183
ORF3a156Y156YtaTtaC11B.1.20.000009
ORF3a156Y156NTatAat11B.1.20.000009
ORF3a156Y156delTAT---11B.1.2210.000071
ORF3a156Y156HTatCat11B.1.221.10.002907
ORF3a156Y156YtaTtaC11B.1.2430.00007
ORF3a156Y156FtAttTt11B.1.258.170.000104
ORF3a156Y156HTatCat11B.1.3110.000275
ORF3a156Y156HTatCat11B.1.3200.001245
ORF3a156Y156delTAT---11B.1.351.50.0006
ORF3a156Y156delTAT---11B.1.36.170.000494
ORF3a156Y156YtaTtaC11B.1.36.370.002778
ORF3a156Y156delTAT---11B.1.416.10.001563
ORF3a156Y156HTatCat11B.1.4290.000024
ORF3a156Y156FtAttTt11B.1.4290.000024
ORF3a156Y156HTatCat11B.1.4530.003236
ORF3a156Y156YtaTtaC11B.1.466.20.000391
ORF3a156Y156CtAttGt11B.1.466.20.000391
ORF3a156Y156CtAttGt11B.1.5610.000397
ORF3a156Y156CtAttGt11B.1.5760.000907
ORF3a156Y156delTAT---11B.1.5960.000087
ORF3a156Y156HTatCat11B.1.6120.002653
ORF3a156Y156delTAT---11B.1.617.10.000129
ORF3a156Y156del1taTta-11B.1.617.10.000129
ORF3a156Y156FtAttTt11B.1.617.20.000004
ORF3a156Y156StAttCt11B.1.617.20.000004
ORF3a156Y156CtAttGt11B.1.6210.000089
ORF3a156Y156delTAT---11B.1.6380.052632
ORF3a156Y156CtAttGt11C.370.000116
ORF3a156Y156HTatCat11P.10.000016
ORF3a156Y156CtAttGt11P.10.000016
ORF3a156Y156HTatCat11P.1.140.000048
ORF3a156Y156CtAttGt11P.30.001595
ORF3a156Y156HTatCat11Q.70.001111