CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp9 : Mut = L112del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp9112L112delL4252deldelCTA---4141113019-13021

Details of the mutation L112del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---4141All0.000008
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---99B.1.1.70.000008
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---33AY.430.000013
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---22AY.250.000012
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---22AY.40.000003
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---22B.1.3110.000549
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---11AY.190.00114
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---11AY.60.000041
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---11AY.720.001361
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---11AY.750.000056
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---11AY.990.001049
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---11AY.99.10.001553
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---11B.1.4150.014286
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---11B.1.6300.005236
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---11B.340.013699
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---11C.170.055556
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---11N.40.004255
ORF1ab/nsp9112L112delCTA---11Q.20.000613