CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | Q4151H | nonsyn | caG | caT | 15959 | 15946 | 0.999185 | 12716-12718 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | Q4151H | nonsyn | caG | caC | 15959 | 13 | 0.000814587 | 12716-12718 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | Q4151Q | syn | caG | caA | 306 | 306 | 1 | 12716-12718 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | Q4151R | nonsyn | cAg | cGg | 142 | 141 | 0.992958 | 12716-12718 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | Q4151R | nonsyn | cAG | cGT | 142 | 1 | 0.00704225 | 12716-12718 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del | Q4151del | del | CAG | --- | 27 | 27 | 1 | 12716-12718 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11X | Q4151X | nonsyn | Cag | Tag | 7 | 7 | 1 | 12716-12718 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11K | Q4151K | nonsyn | Cag | Aag | 6 | 5 | 0.833333 | 12716-12718 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11K | Q4151K | nonsyn | CaG | AaA | 6 | 1 | 0.166667 | 12716-12718 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11L | Q4151L | nonsyn | cAg | cTg | 2 | 2 | 1 | 12716-12718 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del2 | Q4151del2 | del | cAG | c-- | 2 | 2 | 1 | 12716-12718 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del1 | Q4151del1 | del | caG | ca- | 2 | 1 | 0.5 | 12716-12718 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del1 | Q4151del1 | del | cAG | c-N | 2 | 1 | 0.5 | 12716-12718 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11P | Q4151P | nonsyn | cAg | cCg | 1 | 1 | 1 | 12716-12718 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11N | Q4151N | nonsyn | CaG | AaT | 1 | 1 | 1 | 12716-12718 |
Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 15946 | 15959 | All | 0.00305 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caC | 13 | 15959 | All | 0.000002 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 8684 | 8684 | AY.7.1 | 0.978699 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 5049 | 5051 | AY.7 | 0.989612 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caC | 2 | 5051 | AY.7 | 0.000392 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 1728 | 1728 | AY.7.2 | 0.966443 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 306 | 306 | All | 0.000059 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 141 | 142 | All | 0.000027 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAG | cGT | 1 | 142 | All | 0 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 133 | 133 | AY.42 | 0.005351 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 86 | 86 | AY.4 | 0.000134 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 84 | 84 | B.1.617.2 | 0.000316 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 74 | 74 | B.1.1.7 | 0.000066 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 43 | 44 | B.1.1.7 | 0.000038 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAG | cGT | 1 | 44 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 36 | 39 | AY.4 | 0.000056 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caC | 3 | 39 | AY.4 | 0.000005 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 38 | 38 | AY.4 | 0.000059 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 38 | 38 | AY.6 | 0.001563 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del | CAG | --- | 27 | 27 | All | 0.000005 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 19 | 19 | AY.7 | 0.003724 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 17 | 17 | AY.11 | 0.022758 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 16 | 16 | B.1.526 | 0.000376 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 12 | 12 | AY.25 | 0.000072 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 12 | 12 | AY.43 | 0.000053 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 12 | 12 | AY.5 | 0.000248 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 12 | 12 | AY.88 | 0.01061 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 12 | 12 | B.1.2 | 0.000106 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 11 | 11 | AY.113 | 0.001566 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 10 | 10 | AY.121 | 0.001353 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 10 | 10 | AY.25 | 0.00006 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 10 | 10 | B.1.603 | 0.106383 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 8 | 8 | B.1.617.2 | 0.00003 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11X | Cag | Tag | 7 | 7 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 7 | 7 | AY.42 | 0.000282 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 7 | 7 | AY.84 | 0.003062 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 6 | 7 | B.1 | 0.000055 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caC | 1 | 7 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 6 | 7 | B.1.1.7 | 0.000005 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caC | 1 | 7 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 7 | 7 | B.1.621 | 0.00062 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11K | Cag | Aag | 5 | 6 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11K | CaG | AaA | 1 | 6 | All | 0 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 6 | 6 | AY.111 | 0.001099 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del | CAG | --- | 6 | 6 | AY.25 | 0.000036 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 6 | 6 | AY.3 | 0.00006 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 6 | 6 | B.1.2 | 0.000053 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 5 | 5 | AY.20 | 0.000194 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 5 | 5 | AY.44 | 0.00003 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 5 | 5 | AY.47 | 0.000156 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 5 | 5 | AY.53 | 0.001438 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 5 | 5 | AY.75 | 0.00028 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 5 | 5 | B.1.1.466 | 0.043478 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 5 | 5 | B.1.526 | 0.000118 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 5 | 5 | B.1.617.2 | 0.000019 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 4 | 4 | AY.103 | 0.000025 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 4 | 4 | AY.4.3 | 0.003367 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 4 | 4 | AY.5.3 | 0.00135 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 4 | 4 | AY.58 | 0.00363 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 4 | 4 | AY.61 | 0.000419 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del | CAG | --- | 4 | 4 | B.1.1.7 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 4 | 4 | B.1.243 | 0.000278 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 4 | 4 | B.1.351 | 0.000119 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caC | 2 | 3 | AY.103 | 0.000012 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 1 | 3 | AY.103 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 3 | 3 | AY.106 | 0.001005 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 3 | 3 | AY.29 | 0.000047 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 3 | 3 | AY.46.1 | 0.00308 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 3 | 3 | AY.92 | 0.000862 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 3 | 3 | B.1.1.519 | 0.000119 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11X | Cag | Tag | 3 | 3 | B.1.2 | 0.000026 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 3 | 3 | B.1.2 | 0.000026 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 3 | 3 | B.1.617.1 | 0.000387 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 2 | 2 | 0.111111 | |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11K | Cag | Aag | 1 | 2 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11K | CaG | AaA | 1 | 2 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del2 | cAG | c-- | 2 | 2 | All | 0 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11L | cAg | cTg | 2 | 2 | All | 0 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del1 | caG | ca- | 1 | 2 | All | 0 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del1 | cAG | c-N | 1 | 2 | All | 0 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 2 | 2 | AY.101 | 0.000981 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 2 | 2 | AY.102 | 0.000053 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 2 | 2 | AY.117 | 0.000169 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 2 | 2 | AY.12 | 0.000632 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 2 | 2 | AY.29 | 0.000032 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 2 | 2 | AY.4.2.1 | 0.000298 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 2 | 2 | AY.42 | 0.00008 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 2 | 2 | AY.45 | 0.000243 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 2 | 2 | AY.46.6 | 0.000144 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 2 | 2 | AY.49 | 0.00639 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 2 | 2 | AY.56 | 0.00321 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 2 | 2 | AY.64 | 0.00119 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 2 | 2 | AY.90 | 0.001369 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 2 | 2 | AY.98 | 0.000158 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 2 | 2 | AY.99.1 | 0.003106 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 2 | 2 | B.1.1 | 0.000036 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 2 | 2 | B.1.1.303 | 0.005525 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 2 | 2 | B.1.1.434 | 0.000697 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 2 | 2 | B.1.1.70 | 0.000682 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 2 | 2 | B.1.427 | 0.000101 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 2 | 2 | B.1.525 | 0.000226 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11X | Cag | Tag | 2 | 2 | B.1.596 | 0.000174 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 2 | 2 | D.2 | 0.00015 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 2 | 2 | N.5 | 0.003534 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11X | Cag | Tag | 1 | 1 | A.2.2 | 0.001689 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11N | CaG | AaT | 1 | 1 | All | 0 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11P | cAg | cCg | 1 | 1 | All | 0 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 1 | 1 | AY.100 | 0.000046 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.102 | 0.000027 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 1 | 1 | AY.102 | 0.000027 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 1 | 1 | AY.103 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del | CAG | --- | 1 | 1 | AY.111 | 0.000183 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.116 | 0.000287 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.119 | 0.000035 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 1 | 1 | AY.119 | 0.000035 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.120 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.20 | 0.000039 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 1 | 1 | AY.21 | 0.001898 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 1 | 1 | AY.24 | 0.000431 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del1 | cAG | c-N | 1 | 1 | AY.25 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11K | Cag | Aag | 1 | 1 | AY.29 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 1 | 1 | AY.3 | 0.00001 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 1 | 1 | AY.33 | 0.000067 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 1 | 1 | AY.36 | 0.000148 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 1 | 1 | AY.37 | 0.000316 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 1 | 1 | AY.38 | 0.000499 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 1 | 1 | AY.39 | 0.000025 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 1 | 1 | AY.39.1 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caC | 1 | 1 | AY.4.2 | 0.000022 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 1 | 1 | AY.40 | 0.000964 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 1 | 1 | AY.43 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.43 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 1 | 1 | AY.44 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 1 | 1 | AY.46 | 0.000104 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 1 | 1 | AY.5.3 | 0.000337 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 1 | 1 | AY.54 | 0.000095 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.67 | 0.000464 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11N | CaG | AaT | 1 | 1 | AY.67 | 0.000464 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 1 | 1 | AY.69 | 0.000187 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del | CAG | --- | 1 | 1 | AY.7 | 0.000196 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del | CAG | --- | 1 | 1 | AY.75 | 0.000056 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 1 | 1 | AY.75.1 | 0.00018 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11L | cAg | cTg | 1 | 1 | AY.9.2 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 1 | 1 | AY.90 | 0.000684 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 1 | 1 | AY.95 | 0.000761 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.98 | 0.000079 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 1 | 1 | AY.98.1 | 0.000048 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.98.1 | 0.000048 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del | CAG | --- | 1 | 1 | AY.99 | 0.001049 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 1 | 1 | AY.99 | 0.001049 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 1 | 1 | B | 0.000128 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del | CAG | --- | 1 | 1 | B | 0.000128 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11K | Cag | Aag | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11P | cAg | cCg | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11X | Cag | Tag | 1 | 1 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 1 | 1 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.1.139 | 0.022727 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 1 | 1 | B.1.1.214 | 0.000055 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.1.222 | 0.000204 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.1.28 | 0.000311 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 1 | 1 | B.1.1.286 | 0.002899 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 1 | 1 | B.1.1.311 | 0.000358 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 1 | 1 | B.1.1.318 | 0.000302 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.1.348 | 0.000796 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11K | Cag | Aag | 1 | 1 | B.1.1.519 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 1 | 1 | B.1.1.63 | 0.000386 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caC | 1 | 1 | B.1.126 | 0.001276 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.177.82 | 0.000477 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del2 | cAG | c-- | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del2 | cAG | c-- | 1 | 1 | B.1.240 | 0.000216 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caC | 1 | 1 | B.1.258 | 0.000067 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.258 | 0.000067 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.409 | 0.000781 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 1 | 1 | B.1.427 | 0.00005 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.497 | 0.000315 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 1 | 1 | B.1.517 | 0.000427 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11H | caG | caC | 1 | 1 | B.1.587 | 0.001898 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.595 | 0.000261 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del1 | caG | ca- | 1 | 1 | B.1.617.1 | 0.000129 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11K | Cag | Aag | 1 | 1 | B.1.617.2 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.617.2 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del | CAG | --- | 1 | 1 | C.36 | 0.000911 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del | CAG | --- | 1 | 1 | N.4 | 0.004255 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11Q | caG | caA | 1 | 1 | P.1 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11R | cAg | cGg | 1 | 1 | P.1 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del | CAG | --- | 1 | 1 | P.1.1 | 0.000318 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11L | cAg | cTg | 1 | 1 | Q.1 | 0.000126 |
ORF1ab/nsp9 | 11 | Q11del | CAG | --- | 1 | 1 | Q.2 | 0.000613 |
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CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
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