CoV-GLUE Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp8 : Mut = T148I

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORF	CodonNum	Mut	ORF1abMut	MutType	RefCodon	MutCodon	AACount	CodonCount	CodonProp	Genome Position
ORF1ab/nsp8	148	T148I	T4090I	nonsyn	aCt	aTt	10123	10123	1	12533-12535

Details of the mutation T148I within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORF	CodonNum	Mut	RefCodon	MutCodon	CodonCount	AACount	Lineage	LineageCodonProp
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	10123	10123	All	0.001936
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1699	1699	C.36.3	0.963698
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1662	1662	B.1.1.7	0.001488
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1001	1001	AY.4	0.001558
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	843	843	C.36	0.76776
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	754	754	AY.39	0.018632
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	448	448	AY.101	0.219716
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	329	329	C.36.3.1	0.894022
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	289	289	B.1.617.2	0.001088
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	241	241	C.36.1	1
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	147	147	B.1.313	0.967105
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	135	135	B.1.621	0.01195
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	120	120	B.1	0.001099
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	101	101	B.1.177	0.00133
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	89	89	AY.100	0.004095
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	82	82	AY.5	0.001693
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	81	81	AY.103	0.000503
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	80	80	B.1.429	0.001882
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	73	73	B.1.2	0.000643
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	71	71	B.1.240	0.015305
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	66	66	AY.3	0.000656
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	66	66	AY.44	0.000402
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	58	58	B.1.1	0.001052
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	57	57	AY.43	0.000253
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	55	55	AY.120.1	0.017657
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	55	55	AY.25	0.000331
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	51	51	P.1	0.000803
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	50	50	B.1.1.222	0.0102
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	49	49	B.1.526	0.001152
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	48	48	B.28	0.157377
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	44	44	AY.26	0.001246
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	40	40	B.1.36	0.005836
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	37	37	AY.116	0.010611
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	37	37	B.1.311	0.010159
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	29	29	C.36.2	1
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	28	28	AY.102	0.000742
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	26	26	B.1.521	0.129353
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	25	25	AY.46	0.002602
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	25	25	B.1.265	0.031766
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	24	24	AY.99.2	0.002212
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	24	24	B	0.003067
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	23	23	AY.111	0.004212
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	23	23	B.1.1.242	1
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	23	23	B.1.1.378	0.167883
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	23	23	B.1.177.53	0.055024
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	21	21	A.2.5	0.010479
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	21	21	AY.119	0.000741
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	20	20	AY.34	0.001939
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	19	19	AY.118	0.00119
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	17	17	AY.4.2	0.000369
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	17	17	B.1.206	0.013866
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	17	17	B.1.351	0.000505
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	16	16	AY.106	0.005358
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	16	16	B.1.177.81	0.003029
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	16	16	B.1.627	0.032323
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	15	15	AY.6	0.000617
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	15	15	C.17	0.833333
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	15	15	R.1	0.00135
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	14	14	AY.121	0.001894
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	14	14	B.1.258	0.000932
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	13	13	AY.20	0.000505
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	13	13	AY.47	0.000404
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	13	13	B.1.243	0.000905
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	12	12	AY.42	0.000483
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	11	11	AY.117	0.00093
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	11	11	AY.54	0.001049
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	11	11	B.1.1.1	0.003594
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	11	11	B.1.1.519	0.000437
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	11	11	B.1.221	0.000781
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	11	11	B.1.427	0.000555
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	10	10	B.1.1.176	0.004394
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	9	9	AY.36	0.001334
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	9	9	B.1.1.294	0.011392
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	9	9	Q.3	0.001305
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	8	8	AY.14	0.000704
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	8	8	B.1.234	0.001056
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	8	8	B.1.525	0.000905
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	7	7	AY.29	0.00011
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	7	7	AY.61	0.000733
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	7	7	B.1.1.28	0.002179
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	7	7	B.1.1.414	1
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	7	7	B.1.160	0.000218
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	7	7	B.1.177.7	0.001154
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	7	7	B.1.177.83	0.01037
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	7	7	B.1.258.3	0.011725
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	7	7	C.37	0.000812
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	7	7	P.7	0.030568
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	7	7	Q.8	0.001154
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	6	6	AY.24	0.002586
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	6	6	AY.29.1	0.001323
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	6	6	AY.39.1	0.000238
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	6	6	AY.46.6	0.000433
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	6	6	B.1.1.434	0.002091
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	6	6	B.1.470	0.008427
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	6	6	B.1.546	0.022222
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	6	6	B.1.595	0.001566
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	6	6	B.1.596	0.000523
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	6	6	C.39	0.113208
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	5	5	AY.33	0.000334
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	5	5	AY.46.4	0.000823
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	5	5	AY.9.1	0.000419
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	5	5	AY.9.2	0.000184
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	5	5	AY.95	0.003805
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	5	5	B.1.1.317	0.002058
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	5	5	B.1.23	0.030303
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	4	4	AY.23	0.000279
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	4	4	AY.41	0.001176
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	4	4	AY.5.4	0.001107
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	4	4	AY.74	0.000463
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	4	4	AY.98	0.000316
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	4	4	AY.98.1	0.000194
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	4	4	B.1.1.214	0.000222
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	4	4	B.1.351.2	0.00121
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	4	4	B.1.438.1	0.000429
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	4	4	B.1.575	0.001214
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	4	4	B.1.577	0.002749
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	4	4	P.1.10	0.001078
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	4	4	P.1.7	0.001277
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	4	4	Q.1	0.000505
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	3	3	AY.114	0.000693
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	3	3	AY.16	0.001139
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	3	3	AY.2	0.001068
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	3	3	AY.45	0.000365
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	3	3	AY.75.1	0.000541
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	3	3	AY.90	0.002053
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	3	3	B.1.1.174	0.010135
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	3	3	B.1.1.232	0.005445
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	3	3	B.1.177.11	0.005093
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	3	3	B.1.239	0.003663
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	3	3	B.1.258.17	0.000312
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	3	3	B.1.36.29	0.001552
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	3	3	B.1.411	0.011111
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	3	3	B.1.617.1	0.000387
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	3	3	P.1.17	0.000485
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	3	3	P.2	0.00056
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	A	0.000774
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	A.1	0.000564
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	AY.10	0.00106
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	AY.120	0.000074
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	AY.13	0.000322
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	AY.27	0.000129
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	AY.3.1	0.000171
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	AY.30	0.000791
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	AY.32	0.001065
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	AY.4.2.1	0.000298
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	AY.4.5	0.000215
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	AY.46.3	0.001867
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	AY.5.3	0.000675
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	AY.62	0.000871
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	AY.65	0.001066
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	AY.75	0.000112
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.1.153	0.002191
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.1.25	0.001137
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.1.285	0.013072
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.1.316	0.00185
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.1.33	0.000842
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.1.372	0.001377
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.1.380	0.019608
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.1.420	0.002012
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.1.523	0.003125
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.1.62	0.054054
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.1.70	0.000682
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.167	0.015625
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.170	0.008621
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.177.12	0.000303
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.214	0.007326
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.258.7	0.003824
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.351.3	0.001753
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.36.16	0.002849
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.36.18	0.00084
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.540	0.019417
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.565	0.001621
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.582	0.000981
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.588	0.00182
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.591	0.021277
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.609	0.000959
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.637	0.000146
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	B.1.81	0.042553
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	D.2	0.00015
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	N.5	0.003534
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	2	2	P.1.15	0.000465
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	A.2	0.000662
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	A.27	0.001656
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AU.2	0.002421
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AU.3	0.00211
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.1	0.000396
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.105	0.000643
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.108	0.001103
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.109	0.00074
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.110	0.000113
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.113	0.000142
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.116.1	0.000311
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.120.2	0.001285
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.16.1	0.00047
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.4.3	0.000842
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.51	0.000909
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.53	0.000288
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.56	0.001605
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.63	0.000387
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.66	0.00107
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.68	0.000274
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.69	0.000187
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.70	0.000209
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.73	0.000665
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.84	0.000437
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.87	0.000833
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.9	0.000068
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.91.1	0.004065
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	AY.92	0.000287
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.189	0.001513
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.207	0.001182
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.217	0.003636
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.279	0.001121
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.280	0.003086
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.31	0.066667
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.326	0.001761
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.332	0.03125
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.336	0.016667
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.353	0.020833
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.354	0.004386
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.374	0.002375
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.39	0.00051
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.409	0.002833
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.416	0.000905
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.462	0.008621
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.526	0.003546
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.111	0.001175
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.177.21	0.000076
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.177.33	0.001645
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.177.42	0.000894
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.177.44	0.000519
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.177.54	0.000606
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.177.75	0.001041
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.177.8	0.000752
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.177.86	0.000183
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.241	0.000812
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.324	0.001605
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.349	0.000715
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.351.5	0.0006
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.36.1	0.00114
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.36.10	0.004785
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.36.22	0.001208
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.36.8	0.001
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.361	0.001289
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.369	0.000285
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.375	0.00082
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.378	0.006849
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.390	0.010638
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.397	0.004854
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.398	0.002976
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.409	0.000781
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.416	0.001269
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.428	0.00102
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.448	0.002625
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.466.2	0.000391
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.561	0.000397
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.564	0.000426
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.568	0.001111
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.574	0.002151
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.605	0.005952
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.621.1	0.000506
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.631	0.003367
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.1.9.4	0.006135
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	B.6	0.00091
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	C.1.2	0.004255
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	C.16	0.00106
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	C.35	0.000774
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	L.3	0.003546
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	P.1.1	0.000318
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	P.1.12	0.000484
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	P.1.14	0.000048
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	P.1.16	0.000374
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	P.1.2	0.001156
ORF1ab/nsp8	148	T148I	aCt	aTt	1	1	W.3	0.005263

CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk

CoV-GLUE uses sequence data from GISAID. GISAID data provided via this web application is subject to GISAID's Terms and Conditions.