CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp8 : Mut = T141T

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp8141T141TT4083TsynacGacT456641450.90779712512-12514
ORF1ab/nsp8141T141TT4083TsynacGacA45664040.088480112512-12514
ORF1ab/nsp8141T141TT4083TsynacGacC4566170.0037231712512-12514

Details of the mutation T141T within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT41454566All0.000793
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA4044566All0.000077
ORF1ab/nsp8141T141TacGacC174566All0.000003
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT599667B.1.1.70.000536
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA66667B.1.1.70.000059
ORF1ab/nsp8141T141TacGacC2667B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT425448AY.40.000661
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA22448AY.40.000034
ORF1ab/nsp8141T141TacGacC1448AY.40.000002
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT328328AW.11
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT205217B.1.1600.006393
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA12217B.1.1600.000374
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT202210B.1.20.001779
ORF1ab/nsp8141T141TacGacC5210B.1.20.000044
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA3210B.1.20.000026
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT190190B.1.1.2720.989583
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT173190B.1.617.20.000651
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA17190B.1.617.20.000064
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT105112AY.430.000465
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA7112AY.430.000031
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT111112B.1.4290.002612
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA1112B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT8197AY.440.000493
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA1697AY.440.000097
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT7094B.10.000641
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA2394B.10.000211
ORF1ab/nsp8141T141TacGacC194B.10.000009
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT8086AY.1030.000497
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA686AY.1030.000037
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT7577AY.30.000746
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA277AY.30.00002
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT6668AY.1020.00175
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA268AY.1020.000053
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT6767AY.250.000403
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT6767AY.750.003754
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT6565B.1.4000.027885
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT6063AY.390.001483
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA363AY.390.000074
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT5556P.10.000866
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA156P.10.000016
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT5254B.1.1.5190.002065
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA254B.1.1.5190.000079
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT4546AY.75.10.008114
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA146AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT2646B.1.5260.000611
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA2046B.1.5260.00047
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT4646P.20.008585
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT4444B.1.1.1570.040183
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT4444B.1.3490.031451
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT3942B.1.10.000707
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA342B.1.10.000054
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA3642B.1.1770.000474
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT642B.1.1770.000079
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT4141AY.90.002771
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT3838AY.330.002538
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT3536AY.610.003667
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA136AY.610.000105
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT3434B.1.1.10.011107
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA2931B.1.1.700.009891
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT231B.1.1.700.000682
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT2829B.1.3510.000832
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA129B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT2728B.1.1.370.005207
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA128B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT2727AY.200.001049
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT2424AE.80.011736
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT2224AY.4.20.000477
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA224AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA1321AY.230.000907
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT821AY.230.000558
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA1521P.1.140.000717
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT621P.1.140.000287
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT1718AY.420.000684
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA118AY.420.00004
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT1717B.1.1.2220.003468
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA1616B.1.4160.020305
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT1616B.1.6280.005638
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT1515AY.290.000237
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT1414AY.60.000576
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA1113AY.46.40.00181
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT213AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT1112B.1.177.810.002083
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA112B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT1010AY.1190.000353
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT1010AY.350.00233
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT1010AY.980.00079
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT1010B.1.360.001459
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT1010P.1.150.002323
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT99A.10.002537
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT99B.1.1990.03719
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT88AY.360.001186
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT78AY.39.10.000277
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA18AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT88AY.450.000973
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT88AY.790.009685
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA88B.1.5170.003416
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT88B.1.5500.109589
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT77AY.1100.000789
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT77AY.1160.002007
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT67AY.50.000124
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA17AY.50.000021
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT77B.1.1.1890.01059
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT77B.1.1.2170.025455
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT37B.1.2210.000213
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA37B.1.2210.000213
ORF1ab/nsp8141T141TacGacC17B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT67B.1.4270.000303
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA17B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA56AY.1000.00023
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT16AY.1000.000046
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT66AY.1130.000854
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT66B.1.1.4640.008837
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT66B.1.2320.003224
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT66B.1.2340.000792
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT66B.1.2650.007624
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT66B.1.3660.029268
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT66B.1.5960.000523
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT45A0.001548
ORF1ab/nsp8141T141TacGacC15A0.000387
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA35AY.4.30.002525
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT25AY.4.30.001684
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT45AY.470.000124
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA15AY.470.000031
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT55AY.98.10.000242
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT55AY.99.20.000461
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT35B0.000383
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA25B0.000256
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT55B.1.1.1540.2
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT55B.1.2400.001078
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT55B.1.6200.00473
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT55B.1.930.004669
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA44A.270.006623
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT34AY.1080.003308
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA14AY.1080.001103
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT44AY.1170.000338
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA34AY.4.2.10.000447
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT14AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT24AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp8141T141TacGacC24AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT44AY.410.001176
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT44B.1.1.2840.00043
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT44B.1.177.40.000844
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT44B.1.177.580.005326
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA24B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT24B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT34B.1.258.170.000312
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA14B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT44B.1.36.370.011111
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT44B.1.6090.001918
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT44B.1.6120.01061
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT44B.1.617.10.000516
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA34P.1.170.000485
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT14P.1.170.000162
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT34P.1.70.000958
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA14P.1.70.000319
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT44P.70.017467
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT23AY.1140.000462
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA13AY.1140.000231
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT33AY.1200.000112
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT33AY.1210.000406
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT33AY.260.000085
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA33AY.3.10.000256
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT23AY.460.000208
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA13AY.460.000104
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT33AY.7.10.000338
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT33AY.9.10.000251
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT33B.1.177.440.001557
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT33B.1.36.10.003421
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT23B.1.466.20.000782
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA13B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA33B.1.5250.000339
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT33B.1.6370.000219
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA23C.370.000232
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT13C.370.000116
ORF1ab/nsp8141T141TacGacC23D.20.00015
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT13D.20.000075
ORF1ab/nsp8141T141TacGacC220.111111
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22A.90.090909
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22AY.1060.00067
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22AY.1110.000366
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22AY.1180.000125
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22AY.130.000322
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT12AY.270.000065
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA12AY.270.000065
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22AY.34.10.00102
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22AY.370.000632
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA12AY.400.000964
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT12AY.400.000964
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22AY.5.40.000553
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22AY.540.000191
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22AY.850.000854
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22AY.960.004149
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA12B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT12B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22B.1.1.2630.003115
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22B.1.1.2940.002532
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22B.1.1.330.000842
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22B.1.1110.00235
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT12B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA12B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22B.1.177.160.001329
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22B.1.1790.007519
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA12B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT12B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22B.1.36.380.003284
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22B.1.36.80.002
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22B.1.3610.002577
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA22B.1.4360.002058
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22B.1.5700.005882
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22B.1.575.10.004878
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22Q.40.00091
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT22Q.80.00033
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11AE.70.083333
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11AL.10.012987
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA11AU.20.002421
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11AY.116.10.000311
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11AY.120.000316
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11AY.320.000532
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11AY.380.000499
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11AY.480.000465
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11AY.520.000814
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11AY.590.00053
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11AY.630.000387
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11AY.680.000274
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA11AY.690.000187
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11AY.710.000475
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11AY.99.10.001553
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.1.1740.003378
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA11B.1.1.2250.007194
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.1.2410.00207
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.1.2740.005051
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.1.2890.002083
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.1.310.066667
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.1.3260.001761
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.1.460.004367
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.1.4850.016667
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.1.5170.006803
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.160.160.000929
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA11B.1.177.170.000821
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA11B.1.177.430.001477
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.221.20.004016
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.2360.002053
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA11B.1.2410.000812
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.2600.003344
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.2910.019231
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA11B.1.2980.002114
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA11B.1.3260.007576
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA11B.1.4040.001302
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.4410.009615
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.4560.003268
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA11B.1.4650.003802
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.4680.005714
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.4690.00361
ORF1ab/nsp8141T141TacGacA11B.1.4730.019231
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.4800.002488
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.5090.000866
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.5460.003704
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.5650.00081
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.5740.002151
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.619.10.000641
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11B.1.9.40.006135
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11P.30.001595
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11R.10.00009
ORF1ab/nsp8141T141TacGacT11S.10.00495