CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp8 : Mut = L103L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp8103L103LL4045LsynctCctT13305124020.93213112398-12400
ORF1ab/nsp8103L103LL4045LsynctCctA133058780.065990212398-12400
ORF1ab/nsp8103L103LL4045LsynctCctG13305240.0018038312398-12400
ORF1ab/nsp8103L103LL4045LsynCtCTtA1330510.000075159712398-12400

Details of the mutation L103L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1240213305All0.002372
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA87813305All0.000168
ORF1ab/nsp8103L103LctCctG2413305All0.000005
ORF1ab/nsp8103L103LCtCTtA113305All0
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT44804486B.1.1.70.004011
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA54486B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp8103L103LctCctG14486B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT12051205AZ.20.989327
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA499848B.1.617.20.001879
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT347848B.1.617.20.001307
ORF1ab/nsp8103L103LctCctG1848B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp8103L103LCtCTtA1848B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT747766AY.40.001163
ORF1ab/nsp8103L103LctCctG17766AY.40.000026
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA2766AY.40.000003
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT677679AY.430.002999
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA2679AY.430.000009
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT366366B.1.360.053399
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT275276B.1.20.002421
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA1276B.1.20.000009
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT272272AY.90.018386
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT272272B.1.5950.070981
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT236236B.1.1.3370.848921
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT213220B.10.001951
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA7220B.10.000064
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT211212AY.250.001269
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA1212AY.250.000006
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA197200AY.140.017338
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT3200AY.140.000264
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT182182B.1.10.003302
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT139139AY.420.005592
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT132132AY.9.10.011052
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT123123AZ.2.11
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT121121AY.1030.000751
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA72110AY.1020.001909
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT38110AY.1020.001008
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT99107AY.440.000603
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA8107AY.440.000049
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT9293P.10.001449
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA193P.10.000016
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT8888B.1.4290.002071
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT8383AY.370.026233
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT8080B.1.1.1530.087623
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT7272B.1.1770.000948
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT6060AY.30.000597
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA3159AY.1170.00262
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT2859AY.1170.002366
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT5959AY.410.017343
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT5858AY.50.001198
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT4848B.1.36.10.054732
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT3535AY.690.006534
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT3535AY.900.023956
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT3232AY.1190.00113
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT2932AY.470.000902
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA232AY.470.000062
ORF1ab/nsp8103L103LctCctG132AY.470.000031
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT3232B.1.1.5190.001271
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT3232B.1.2340.004222
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT2531AY.390.000618
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA631AY.390.000148
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT2727B.1.4270.001363
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT2626AY.9.20.000955
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT2525B.1.6370.001827
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1624AY.1200.000595
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA824AY.1200.000297
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT2424B.1.1600.000749
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT2424B.1.36.170.011858
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT2323AY.4.20.000499
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT2323Q.80.003793
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT2222AY.98.10.001065
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT2222B.1.2210.001563
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT2222B.6.41
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT2121AU.20.050847
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT2021AY.260.000566
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA121AY.260.000028
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT2021B.1.3510.000595
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA121B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT2020B.1.177.40.004221
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1320P.1.150.00302
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA420P.1.150.000929
ORF1ab/nsp8103L103LctCctG320P.1.150.000697
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1919B.1.2580.001264
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1718AY.450.002069
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA118AY.450.000122
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1718B.1.1.3180.00513
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA118B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1818B.1.5250.002037
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1818P.1.100.00485
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1717AY.610.001781
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1717Q.10.002148
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1616AY.1210.002165
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1516B.1.2430.001044
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA116B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1516B.1.5960.001307
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA116B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1515AY.780.023112
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1515B.1.1.2140.000832
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1515P.1.10.004765
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1414B.1.3690.003993
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1414B.1.6210.001239
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1414P.1.140.000669
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1313B.1.4000.005577
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1313B.1.5260.000306
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1212AY.1000.000552
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1212AY.290.000189
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1212AY.330.000801
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1212B.1.5750.003641
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1111AY.120.10.003531
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1111AY.200.000428
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1010AY.1060.003349
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1010AY.240.00431
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1010B.1.617.10.00129
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1010B.1.621.10.005058
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT1010C.370.001161
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT79AY.1100.000789
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA29AY.1100.000225
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT99AY.230.000628
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT99AY.750.000504
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT89B0.001022
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA19B0.000128
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT99B.1.1.3060.003946
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT88AY.460.000833
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT88AY.46.60.000578
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT88AY.75.10.001442
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT88AY.980.000632
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT88B.1.1.4060.051948
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT88B.1.4560.026144
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT88P.1.70.002554
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT88P.20.001493
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA67AY.1070.002796
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT17AY.1070.000466
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT77AY.39.10.000277
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT77B.1.1.280.002179
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT67B.1.177.810.001136
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA17B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT77B.1.258.170.000728
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT77B.1.617.30.020896
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT46AY.540.000381
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA26AY.540.000191
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT66AY.570.003937
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT66AY.860.004979
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT66B.1.1.2840.000644
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT66B.1.1.4160.00543
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT66B.1.1.750.06383
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT66B.1.177.730.003398
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT66B.1.3080.206897
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT66B.1.3240.009631
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT66B.1.351.30.005259
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT55AY.120.00158
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT45AY.130.000644
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA15AY.130.000161
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT45AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA15AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT55AY.34.10.00255
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT55AY.4.40.002046
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT55AY.60.000206
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT55AY.680.001369
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT55AY.880.004421
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT55B.1.1470.003779
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT55B.1.177.850.027174
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT55B.1.177.860.000917
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT55B.1.3110.001373
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT55B.1.36.100.023923
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT55B.1.36.290.002587
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT55B.1.36.80.005
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT55B.1.4330.015974
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT55B.1.6200.00473
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT55P.1.170.000809
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT44AY.1110.000733
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT44AY.380.001997
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT44AY.4.2.10.000596
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT44AY.560.006421
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA24AY.630.000774
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT24AY.630.000774
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT44AY.840.00175
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT44B.1.1.1100.363636
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT44B.1.1.3020.008299
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT44B.1.1.3510.011173
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT44B.1.177.350.002764
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT44B.1.177.560.00267
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT44B.1.177.600.000874
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT34B.1.3960.002117
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA14B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT44B.1.4990.004202
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT44B.1.6090.001918
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT34R.10.00027
ORF1ab/nsp8103L103LctCctG14R.10.00009
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT33AA.10.021739
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT33AY.1080.003308
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT33AY.1160.00086
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT33AY.210.005693
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT33AY.340.000291
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT33AY.350.000699
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT33AY.360.000445
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT33AY.46.40.000494
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT23AY.520.001629
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA13AY.520.000814
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT23AY.710.00095
ORF1ab/nsp8103L103LctCctA13AY.710.000475
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT33AY.740.000347
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT33AY.820.004071
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT33AY.870.002498
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT33B.1.1.1740.010135
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT33B.1.1.1980.004405
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT33B.1.1.2220.000612
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT33B.1.1.330.001263
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT33B.1.1.390.001529
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT33B.1.1.3980.009677
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT33B.1.177.70.000495
ORF1ab/nsp8103L103LctCctT33B.1.177.820.001432
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