CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp8 : CodonNum = 185

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp8185I185VI4127VnonsynAttGtt14281428112644-12646
ORF1ab/nsp8185I185II4127IsynatTatC102920.90196112644-12646
ORF1ab/nsp8185I185II4127IsynatTatA102100.098039212644-12646
ORF1ab/nsp8185I185TI4127TnonsynaTtaCt4242112644-12646
ORF1ab/nsp8185I185NI4127NnonsynaTtaAt2121112644-12646
ORF1ab/nsp8185I185MI4127MnonsynatTatG1818112644-12646
ORF1ab/nsp8185I185delI4127deldelATT---1414112644-12646
ORF1ab/nsp8185I185SI4127SnonsynaTtaGt1212112644-12646
ORF1ab/nsp8185I185LI4127LnonsynAttCtt640.66666712644-12646
ORF1ab/nsp8185I185LI4127LnonsynAtTCtA620.33333312644-12646
ORF1ab/nsp8185I185PI4127PnonsynATTCCA22112644-12646
ORF1ab/nsp8185I185FI4127FnonsynAttTtt11112644-12646

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt14281428All0.000273
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt707707B.1.4040.920573
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt228228B.1.617.20.000859
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC92102All0.000018
ORF1ab/nsp8185I185IatTatA10102All0.000002
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt7979B.1.1.70.000071
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt5252B.10.000476
ORF1ab/nsp8185I185TaTtaCt4242All0.000008
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt4040AY.40.000062
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC3737B.1.2580.002462
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt3232B.1.177.820.015274
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt3030B.1.1.5190.001191
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt2525AY.30.000249
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt2525B.1.1110.029377
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt2424B.1.5260.000564
ORF1ab/nsp8185I185NaTtaAt2121All0.000004
ORF1ab/nsp8185I185MatTatG1818All0.000003
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC916B.1.1.70.000008
ORF1ab/nsp8185I185IatTatA716B.1.1.70.000006
ORF1ab/nsp8185I185delATT---1414All0.000003
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt1313AY.440.000079
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt1212A.290.06383
ORF1ab/nsp8185I185SaTtaGt1212All0.000002
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt1212AY.430.000053
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt1212AY.50.000248
ORF1ab/nsp8185I185MatTatG1212B.1.3510.000357
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC1212B.1.617.20.000045
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt1212P.10.000189
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt1010AY.1170.000845
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt99B.1.20.000079
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt88AY.330.000534
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt77AY.390.000173
ORF1ab/nsp8185I185NaTtaAt77AY.440.000043
ORF1ab/nsp8185I185TaTtaCt77B.1.1.70.000006
ORF1ab/nsp8185I185LAttCtt46All0.000001
ORF1ab/nsp8185I185LAtTCtA26All0
ORF1ab/nsp8185I185MatTatG55AY.1030.000031
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt55AY.410.00147
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt55AY.750.00028
ORF1ab/nsp8185I185SaTtaGt55B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC55P.10.000079
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt44AY.250.000024
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC44AY.250.000024
ORF1ab/nsp8185I185TaTtaCt44AY.40.000006
ORF1ab/nsp8185I185TaTtaCt44AY.430.000018
ORF1ab/nsp8185I185TaTtaCt44B.1.20.000035
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC44B.1.3510.000119
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt44B.1.5960.000349
ORF1ab/nsp8185I185TaTtaCt44P.10.000063
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC23AY.1020.000053
ORF1ab/nsp8185I185IatTatA13AY.1020.000027
ORF1ab/nsp8185I185NaTtaAt33AY.1030.000019
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt33AY.1100.000338
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt33AY.46.40.000494
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt33AY.99.20.000276
ORF1ab/nsp8185I185delATT---33B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt33B.1.2410.002435
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt33B.1.4970.000944
ORF1ab/nsp8185I185NaTtaAt33B.1.617.20.000011
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt220.111111
ORF1ab/nsp8185I185SaTtaGt220.111111
ORF1ab/nsp8185I185TaTtaCt220.111111
ORF1ab/nsp8185I185LAtTCtA220.111111
ORF1ab/nsp8185I185PATTCCA220.111111
ORF1ab/nsp8185I185PATTCCA22All0
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC22AY.1030.000012
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt22AY.110.002677
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt22AY.200.000078
ORF1ab/nsp8185I185NaTtaAt22AY.250.000012
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC22AY.330.000134
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC22AY.40.000003
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC22AY.460.000208
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp8185I185TaTtaCt22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp8185I185TaTtaCt22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt22B.1.1.3110.000716
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt22B.1.1460.008475
ORF1ab/nsp8185I185SaTtaGt22B.1.177.420.001789
ORF1ab/nsp8185I185TaTtaCt22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt22B.1.4700.002809
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt22B.1.5250.000226
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt22R.10.00018
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp8185I185FAttTtt11All0
ORF1ab/nsp8185I185TaTtaCt11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp8185I185IatTatA11AY.1040.001984
ORF1ab/nsp8185I185delATT---11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp8185I185NaTtaAt11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp8185I185NaTtaAt11AY.130.000161
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11AY.160.00038
ORF1ab/nsp8185I185NaTtaAt11AY.230.00007
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11AY.230.00007
ORF1ab/nsp8185I185delATT---11AY.250.000006
ORF1ab/nsp8185I185SaTtaGt11AY.250.000006
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11AY.290.000016
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC11AY.290.000016
ORF1ab/nsp8185I185NaTtaAt11AY.30.00001
ORF1ab/nsp8185I185delATT---11AY.30.00001
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC11AY.30.00001
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC11AY.390.000025
ORF1ab/nsp8185I185TaTtaCt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11AY.420.00004
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC11AY.420.00004
ORF1ab/nsp8185I185delATT---11AY.430.000004
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC11AY.430.000004
ORF1ab/nsp8185I185TaTtaCt11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11AY.470.000031
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11AY.550.000917
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11AY.590.00053
ORF1ab/nsp8185I185delATT---11AY.750.000056
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp8185I185NaTtaAt11AY.840.000437
ORF1ab/nsp8185I185MatTatG11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11AY.980.000079
ORF1ab/nsp8185I185NaTtaAt11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp8185I185delATT---11AY.990.001049
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11B0.000128
ORF1ab/nsp8185I185IatTatA11B.10.000009
ORF1ab/nsp8185I185FAttTtt11B.10.000009
ORF1ab/nsp8185I185delATT---11B.10.000009
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11B.1.1.1890.001513
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp8185I185delATT---11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11B.1.1.3360.016667
ORF1ab/nsp8185I185delATT---11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp8185I185LAttCtt11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11B.1.1100.004525
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp8185I185delATT---11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp8185I185TaTtaCt11B.1.1890.004292
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp8185I185TaTtaCt11B.1.2390.001221
ORF1ab/nsp8185I185TaTtaCt11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp8185I185SaTtaGt11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp8185I185LAttCtt11B.1.36.90.003215
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC11B.1.3980.002976
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11B.1.416.10.001563
ORF1ab/nsp8185I185TaTtaCt11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp8185I185TaTtaCt11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp8185I185LAttCtt11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp8185I185IatTatC11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp8185I185TaTtaCt11B.1.5270.003704
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11B.1.5600.00463
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11B.1.5610.000397
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11B.1.5680.001111
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp8185I185TaTtaCt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11B.1.6040.017241
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11B.1.810.021277
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11B.410.008
ORF1ab/nsp8185I185SaTtaGt11C.160.00106
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11C.260.007353
ORF1ab/nsp8185I185TaTtaCt11D.20.000075
ORF1ab/nsp8185I185delATT---11N.40.004255
ORF1ab/nsp8185I185VAttGtt11P.1.20.001156
ORF1ab/nsp8185I185LAttCtt11P.1.70.000319