CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp8 : CodonNum = 175

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp8175D175DD4117DsyngaCgaT14641464112614-12616
ORF1ab/nsp8175D175ND4117NnonsynGacAac224224112614-12616
ORF1ab/nsp8175D175GD4117GnonsyngAcgGc110110112614-12616
ORF1ab/nsp8175D175YD4117YnonsynGacTac8282112614-12616
ORF1ab/nsp8175D175ED4117EnonsyngaCgaA2727112614-12616
ORF1ab/nsp8175D175AD4117AnonsyngAcgCc1616112614-12616
ORF1ab/nsp8175D175delD4117deldelGAC---1515112614-12616
ORF1ab/nsp8175D175VD4117VnonsyngACgTT850.62512614-12616
ORF1ab/nsp8175D175VD4117VnonsyngAcgTc830.37512614-12616
ORF1ab/nsp8175D175HD4117HnonsynGacCac33112614-12616
ORF1ab/nsp8175D175FD4117FnonsynGACTTT33112614-12616
ORF1ab/nsp8175D175CD4117CnonsynGACTGT22112614-12616
ORF1ab/nsp8175D175del1D4117del1delgaCga-11112614-12616
ORF1ab/nsp8175D175del2D4117del2delGACA--11112614-12616
ORF1ab/nsp8175D175ID4117InonsynGACATA11112614-12616

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT14641464All0.00028
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT560560B.1.36.310.980736
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT264264B.1.5990.963504
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac224224All0.000043
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT114114B.1.1.70.000102
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc110110All0.000021
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac8282All0.000016
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac7272AY.260.002038
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT6363B.1.6050.375
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac4747B.1.1.70.000042
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT3838B.10.000348
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT3737AY.40.000058
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc3636B.1.2320.019344
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT3333B.1.617.20.000124
ORF1ab/nsp8175D175EgaCgaA2727All0.000005
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT2525P.1.170.004044
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT2323AY.470.000715
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT2222AY.250.000132
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT2222AY.440.000134
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT2020B.1.2470.298507
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc1919AY.4.50.002042
ORF1ab/nsp8175D175EgaCgaA1717B.1.1770.000224
ORF1ab/nsp8175D175AgAcgCc1616All0.000003
ORF1ab/nsp8175D175delGAC---1515All0.000003
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT1515B.1.1770.000198
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac1515D.20.001126
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac1414AY.1030.000087
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac1414AY.40.000022
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT1414B.1.360.002043
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT1212B.1.36.80.012
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac1212P.10.000189
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT1111AY.1030.000068
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac1010AY.250.00006
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT1010P.1.100.002695
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT99B.1.20.000079
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT99B.1.4290.000212
ORF1ab/nsp8175D175VgACgTT58All0.000001
ORF1ab/nsp8175D175VgAcgTc38All0.000001
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac88C.370.000929
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT88P.10.000126
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT77AY.740.00081
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT77B.1.10.000127
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT77B.1.36.170.003458
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac77P.10.00011
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc66AY.20.002137
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc66AY.99.20.000553
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT66B.1.1.3170.00247
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac66B.1.1.70.000005
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT66B.1.1600.000187
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT66B.1.2430.000418
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT66B.1.5260.000141
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac55AY.390.000124
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac55AY.430.000022
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT55AY.430.000022
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac55B.10.000046
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT55B.1.1.5190.000199
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac55B.1.1600.000156
ORF1ab/nsp8175D175VgACgTT440.222222
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT44AY.1020.000106
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT44AY.1170.000338
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac44AY.290.000063
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc44AY.30.00004
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac44AY.430.000018
ORF1ab/nsp8175D175delGAC---44B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc44B.1.20.000035
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac44B.1.20.000035
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT44B.1.3960.002823
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac44B.1.5260.000094
ORF1ab/nsp8175D175FGACTTT33All0.000001
ORF1ab/nsp8175D175HGacCac33All0.000001
ORF1ab/nsp8175D175AgAcgCc33AY.1020.00008
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc33AY.250.000018
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT33AY.30.00003
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc33AY.300.001187
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac33AY.40.000005
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT33AY.610.000314
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT33AY.98.10.000145
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac33B.1.1.3020.006224
ORF1ab/nsp8175D175AgAcgCc33B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc33B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc33B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp8175D175AgAcgCc33B.1.258.170.000312
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT33B.1.3110.000824
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT33B.1.3690.000856
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT33B.1.5820.001472
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT33B.1.5870.005693
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT33C.370.000348
ORF1ab/nsp8175D175EgaCgaA220.111111
ORF1ab/nsp8175D175CGACTGT220.111111
ORF1ab/nsp8175D175FGACTTT220.111111
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT220.111111
ORF1ab/nsp8175D175CGACTGT22All0
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT22AY.260.000057
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac22AY.30.00002
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac22AY.30.00002
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT22AY.39.10.000079
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac22AY.440.000012
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT22AY.5.40.000553
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT22AY.710.00095
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT22AY.75.10.000361
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc22B.10.000018
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT22B.1.1.1570.001826
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc22B.1.1.3480.001592
ORF1ab/nsp8175D175EgaCgaA22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc22B.1.1490.006849
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac22B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT22B.1.4000.000858
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc22B.1.466.20.000782
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc22P.10.000032
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac22P.1.130.001797
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc22P.1.170.000324
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11A.10.000282
ORF1ab/nsp8175D175IGACATA11All0
ORF1ab/nsp8175D175del1gaCga-11All0
ORF1ab/nsp8175D175del2GACA--11All0
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11AY.10.000396
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp8175D175VgAcgTc11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp8175D175AgAcgCc11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp8175D175EgaCgaA11AY.230.00007
ORF1ab/nsp8175D175delGAC---11AY.250.000006
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac11AY.250.000006
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac11AY.260.000028
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11AY.290.000016
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp8175D175EgaCgaA11AY.30.00001
ORF1ab/nsp8175D175del1gaCga-11AY.30.00001
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11AY.340.000097
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac11AY.390.000025
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc11AY.390.000025
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11AY.390.000025
ORF1ab/nsp8175D175EgaCgaA11AY.40.000002
ORF1ab/nsp8175D175VgAcgTc11AY.40.000002
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp8175D175delGAC---11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp8175D175delGAC---11AY.430.000004
ORF1ab/nsp8175D175AgAcgCc11AY.430.000004
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11AY.440.000006
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc11AY.440.000006
ORF1ab/nsp8175D175IGACATA11AY.440.000006
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc11AY.460.000104
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11AY.50.000021
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11AY.50.000021
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11AY.520.000814
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11AY.600.000938
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11AY.690.000187
ORF1ab/nsp8175D175delGAC---11AY.750.000056
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac11AY.750.000056
ORF1ab/nsp8175D175AgAcgCc11AY.750.000056
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac11AY.840.000437
ORF1ab/nsp8175D175VgACgTT11AY.850.000427
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11AY.860.00083
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11AY.990.001049
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11AY.99.10.001553
ORF1ab/nsp8175D175AgAcgCc11B.10.000009
ORF1ab/nsp8175D175delGAC---11B.10.000009
ORF1ab/nsp8175D175EgaCgaA11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp8175D175FGACTTT11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.1.1210.002427
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc11B.1.1.1760.000439
ORF1ab/nsp8175D175HGacCac11B.1.1.1860.003436
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.1.2630.001558
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.1.2770.000759
ORF1ab/nsp8175D175delGAC---11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.1.2970.002237
ORF1ab/nsp8175D175EgaCgaA11B.1.1.3100.015152
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp8175D175delGAC---11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.1.4400.011765
ORF1ab/nsp8175D175EgaCgaA11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp8175D175HGacCac11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac11B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp8175D175AgAcgCc11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.160.220.006757
ORF1ab/nsp8175D175HGacCac11B.1.160.260.002421
ORF1ab/nsp8175D175delGAC---11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11B.1.177.520.001757
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp8175D175AgAcgCc11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.230.006061
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.258.30.001675
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11B.1.3050.002151
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp8175D175delGAC---11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11B.1.36.390.002217
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac11B.1.3780.006849
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.4220.000812
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11B.1.4780.011765
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.5240.001406
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11B.1.5650.00081
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11B.1.5880.00091
ORF1ab/nsp8175D175AgAcgCc11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp8175D175VgAcgTc11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp8175D175del2GACA--11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.200.023256
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11B.3.10.001658
ORF1ab/nsp8175D175delGAC---11B.340.013699
ORF1ab/nsp8175D175GgAcgGc11B.60.00091
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac11B.6.60.000889
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11C.160.00106
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11C.360.000911
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11D.20.000075
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac11D.30.005917
ORF1ab/nsp8175D175YGacTac11N.30.005814
ORF1ab/nsp8175D175delGAC---11N.40.004255
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11P.1.150.000232
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11Q.10.000126
ORF1ab/nsp8175D175NGacAac11Q.80.000165
ORF1ab/nsp8175D175DgaCgaT11W.10.008696