CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp8 : CodonNum = 143

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp8143D143GD4085GnonsyngAtgGt149714950.99866412518-12520
ORF1ab/nsp8143D143GD4085GnonsyngATgGG149720.0013360112518-12520
ORF1ab/nsp8143D143DD4085DsyngaTgaC247247112518-12520
ORF1ab/nsp8143D143ND4085NnonsynGatAat9090112518-12520
ORF1ab/nsp8143D143VD4085VnonsyngAtgTt70680.97142912518-12520
ORF1ab/nsp8143D143VD4085VnonsyngATgTA7010.014285712518-12520
ORF1ab/nsp8143D143VD4085VnonsyngATgTG7010.014285712518-12520
ORF1ab/nsp8143D143YD4085YnonsynGatTat4949112518-12520
ORF1ab/nsp8143D143AD4085AnonsyngAtgCt4141112518-12520
ORF1ab/nsp8143D143delD4085deldelGAT---4040112518-12520
ORF1ab/nsp8143D143ED4085EnonsyngaTgaA1680.512518-12520
ORF1ab/nsp8143D143ED4085EnonsyngaTgaG1680.512518-12520
ORF1ab/nsp8143D143HD4085HnonsynGatCat66112518-12520
ORF1ab/nsp8143D143PD4085PnonsynGAtCCt22112518-12520
ORF1ab/nsp8143D143del1D4085del1delGaTAa-22112518-12520
ORF1ab/nsp8143D143TD4085TnonsynGATACA11112518-12520
ORF1ab/nsp8143D143del2D4085del2delGAt--t11112518-12520

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt14951497All0.000286
ORF1ab/nsp8143D143GgATgGG21497All0
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt980980B.1.1.3160.906568
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC247247All0.000047
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC101101B.1.1.2840.010847
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat9090All0.000017
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt8787AY.440.00053
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt7979AY.40.000123
ORF1ab/nsp8143D143VgAtgTt6870All0.000013
ORF1ab/nsp8143D143VgATgTA170All0
ORF1ab/nsp8143D143VgATgTG170All0
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt6868R.20.985507
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat4949All0.000009
ORF1ab/nsp8143D143VgAtgTt4545AY.40.00007
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt4444B.10.000403
ORF1ab/nsp8143D143AgAtgCt4141All0.000008
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---4040All0.000008
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt3131B.1.10.000562
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat2828AY.40.000044
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt2424B.1.3780.164384
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt2424B.1.4270.001212
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt2323B.1.1.70.000021
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt2121B.1.617.20.000079
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC2121P.10.000331
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat2020AY.1170.00169
ORF1ab/nsp8143D143EgaTgaG816All0.000002
ORF1ab/nsp8143D143EgaTgaA816All0.000002
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC1515B.1.1.70.000013
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt1414B.1.1.2070.016548
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC1212AY.1020.000318
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat1212B.1.1.70.000011
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---1111B.1.1.70.00001
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC1111B.1.617.20.000041
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat1010B.1.1.70.000009
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt99AY.250.000054
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt99B.1.20.000079
ORF1ab/nsp8143D143VgAtgTt88B.1.1770.000105
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC77AY.40.000011
ORF1ab/nsp8143D143AgAtgCt77B.1.1.70.000006
ORF1ab/nsp8143D143AgAtgCt77B.1.1770.000092
ORF1ab/nsp8143D143VgAtgTt77B.1.20.000062
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat77B.1.6230.003755
ORF1ab/nsp8143D143HGatCat66All0.000001
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat66AY.1030.000037
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC66AY.1200.000223
ORF1ab/nsp8143D143AgAtgCt66AY.290.000095
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat66AY.40.000009
ORF1ab/nsp8143D143AgAtgCt66AY.40.000009
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt66AY.430.000027
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC66B.1.3510.000178
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt55AY.1130.000712
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt55AY.46.60.000361
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat55B.1.1770.000066
ORF1ab/nsp8143D143EgaTgaG55B.1.4270.000252
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC44AY.200.000155
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC44AY.250.000024
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat44AY.290.000063
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC44AY.290.000063
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---44AY.430.000018
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat44AY.440.000024
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC33AY.1000.000138
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC33AY.390.000074
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---33AY.40.000005
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC33AY.470.000093
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt33B.1.1.4820.069767
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt33B.1.1.5190.000119
ORF1ab/nsp8143D143AgAtgCt33B.1.1310.026316
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC33B.1.20.000026
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt33B.1.5960.000261
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat33B.1.617.20.000011
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt33C.370.000348
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt33P.10.000047
ORF1ab/nsp8143D143GgATgGG220.111111
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---220.111111
ORF1ab/nsp8143D143del1GaTAa-220.111111
ORF1ab/nsp8143D143PGAtCCt220.111111
ORF1ab/nsp8143D143del1GaTAa-22All0
ORF1ab/nsp8143D143PGAtCCt22All0
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC22AY.1030.000012
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC22AY.1160.000574
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat22AY.250.000012
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC22AY.30.00002
ORF1ab/nsp8143D143EgaTgaA22AY.30.00002
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt22AY.340.000194
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC22AY.340.000194
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt22AY.390.000049
ORF1ab/nsp8143D143EgaTgaA12AY.40.000002
ORF1ab/nsp8143D143EgaTgaG12AY.40.000002
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt22AY.420.00008
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC22AY.440.000012
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---22AY.750.000112
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC22AY.75.10.000361
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt22AY.920.000575
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat22B.10.000018
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC22B.10.000018
ORF1ab/nsp8143D143VgAtgTt12B.10.000009
ORF1ab/nsp8143D143VgATgTG12B.10.000009
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp8143D143EgaTgaA22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp8143D143VgAtgTt12B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp8143D143VgATgTA12B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp8143D143VgAtgTt22B.1.160.200.017857
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt22B.1.360.000292
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt22B.1.36.80.002
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC22B.1.4280.002041
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC22B.1.438.10.000215
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC22B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp8143D143HGatCat22P.10.000032
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---11A0.000387
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11A0.000387
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat11AE.80.000489
ORF1ab/nsp8143D143del2GAt--t11All0
ORF1ab/nsp8143D143TGATACA11All0
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp8143D143AgAtgCt11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp8143D143HGatCat11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp8143D143EgaTgaG11AY.130.000161
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11AY.140.000088
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11AY.200.000039
ORF1ab/nsp8143D143AgAtgCt11AY.200.000039
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat11AY.230.00007
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---11AY.250.000006
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11AY.270.000065
ORF1ab/nsp8143D143AgAtgCt11AY.30.00001
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11AY.30.00001
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat11AY.330.000067
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp8143D143AgAtgCt11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC11AY.410.000294
ORF1ab/nsp8143D143AgAtgCt11AY.430.000004
ORF1ab/nsp8143D143AgAtgCt11AY.440.000006
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC11AY.450.000122
ORF1ab/nsp8143D143EgaTgaA11AY.460.000104
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---11AY.460.000104
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11AY.470.000031
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC11AY.50.000021
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11AY.50.000021
ORF1ab/nsp8143D143AgAtgCt11AY.540.000095
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC11AY.550.000917
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC11AY.610.000105
ORF1ab/nsp8143D143AgAtgCt11AY.690.000187
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---11AY.80.000606
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11AY.840.000437
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat11AY.950.000761
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC11AY.970.001701
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11AY.980.000079
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11B0.000128
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat11B.10.000009
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---11B.10.000009
ORF1ab/nsp8143D143EgaTgaA11B.10.000009
ORF1ab/nsp8143D143HGatCat11B.10.000009
ORF1ab/nsp8143D143VgAtgTt11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp8143D143AgAtgCt11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp8143D143AgAtgCt11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11B.1.1.3400.045455
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11B.1.1.3550.015385
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11B.1.1.4160.000905
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC11B.1.1.4190.007407
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC11B.1.1.4580.041667
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11B.1.1.4860.001577
ORF1ab/nsp8143D143del2GAt--t11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11B.1.130.002375
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat11B.1.1620.005025
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp8143D143HGatCat11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11B.1.177.100.000878
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp8143D143EgaTgaA11B.1.177.860.000183
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---11B.1.177.90.001332
ORF1ab/nsp8143D143TGATACA11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp8143D143VgAtgTt11B.1.221.20.004016
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC11B.1.2790.000514
ORF1ab/nsp8143D143EgaTgaG11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC11B.1.3620.001541
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat11B.1.5060.02381
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11B.1.5740.002151
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11B.1.5880.00091
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp8143D143VgAtgTt11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp8143D143AgAtgCt11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp8143D143AgAtgCt11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp8143D143VgAtgTt11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat11B.1.930.000934
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat11B.230.002924
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat11B.30.000831
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC11B.410.008
ORF1ab/nsp8143D143GgAtgGt11C.140.004329
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---11C.360.000911
ORF1ab/nsp8143D143YGatTat11D.20.000075
ORF1ab/nsp8143D143HGatCat11D.20.000075
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat11D.20.000075
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---11N.40.004255
ORF1ab/nsp8143D143NGatAat11P.10.000016
ORF1ab/nsp8143D143DgaTgaC11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---11Q.10.000126
ORF1ab/nsp8143D143delGAT---11Q.80.000165