CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | M3934I | nonsyn | atG | atT | 6993 | 6671 | 0.953954 | 12065-12067 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | M3934I | nonsyn | atG | atA | 6993 | 241 | 0.034463 | 12065-12067 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | M3934I | nonsyn | atG | atC | 6993 | 81 | 0.011583 | 12065-12067 |
Details of the mutation M75I within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 6671 | 6993 | All | 0.001276 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 241 | 6993 | All | 0.000046 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atC | 81 | 6993 | All | 0.000015 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1894 | 1895 | B.1.1 | 0.034359 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 1 | 1895 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 611 | 682 | B.1.1.7 | 0.000547 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 67 | 682 | B.1.1.7 | 0.00006 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atC | 4 | 682 | B.1.1.7 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 606 | 606 | B.1.429 | 0.014258 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 393 | 411 | B.1.2 | 0.003461 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 18 | 411 | B.1.2 | 0.000158 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 376 | 376 | B.1.1.307 | 0.951899 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 346 | 359 | AY.4 | 0.000539 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 12 | 359 | AY.4 | 0.000019 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atC | 1 | 359 | AY.4 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 352 | 352 | B.1.1.37 | 0.067888 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 194 | 221 | B.1.617.2 | 0.00073 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 27 | 221 | B.1.617.2 | 0.000102 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 151 | 153 | AY.44 | 0.000919 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 2 | 153 | AY.44 | 0.000012 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 119 | 123 | B.1.177 | 0.001567 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 4 | 123 | B.1.177 | 0.000053 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 116 | 116 | B.1.243 | 0.008072 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 110 | 115 | AY.43 | 0.000487 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 5 | 115 | AY.43 | 0.000022 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 102 | 107 | B.1 | 0.000934 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atC | 5 | 107 | B.1 | 0.000046 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 87 | 91 | AY.103 | 0.00054 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 4 | 91 | AY.103 | 0.000025 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 78 | 82 | P.1 | 0.001229 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 4 | 82 | P.1 | 0.000063 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 62 | 75 | B.1.526 | 0.001457 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 13 | 75 | B.1.526 | 0.000306 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 68 | 68 | B.1.160 | 0.002121 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 65 | 67 | AY.25 | 0.000391 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 2 | 67 | AY.25 | 0.000012 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 48 | 49 | D.2 | 0.003602 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atC | 1 | 49 | D.2 | 0.000075 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atC | 46 | 47 | B.1.258.11 | 0.018232 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 47 | B.1.258.11 | 0.000396 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 43 | 44 | AY.39 | 0.001063 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 1 | 44 | AY.39 | 0.000025 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 40 | 40 | B.1.1.214 | 0.002218 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 36 | 37 | AY.102 | 0.000955 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atC | 1 | 37 | AY.102 | 0.000027 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 37 | 37 | AY.80 | 0.041761 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 34 | 36 | AY.3 | 0.000338 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 2 | 36 | AY.3 | 0.00002 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 26 | 26 | B.1.1.28 | 0.008092 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 25 | 25 | B.1.1.306 | 0.01096 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 25 | 25 | B.1.36.17 | 0.012352 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 24 | 24 | B.1.221 | 0.001705 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 18 | 21 | B.1.258.17 | 0.001871 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 3 | 21 | B.1.258.17 | 0.000312 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 14 | 20 | B.1.1.519 | 0.000556 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atC | 5 | 20 | B.1.1.519 | 0.000199 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 1 | 20 | B.1.1.519 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 19 | 19 | B.1.433 | 0.060703 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 17 | 17 | B.1.637 | 0.001242 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 16 | 16 | AY.61 | 0.001676 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atC | 14 | 15 | B.1.400 | 0.006006 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 15 | B.1.400 | 0.000429 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 14 | 14 | AY.5 | 0.000289 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 14 | 14 | AY.54 | 0.001335 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 8 | 14 | P.1.14 | 0.000382 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 6 | 14 | P.1.14 | 0.000287 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 13 | 13 | AY.20 | 0.000505 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 13 | 13 | AY.47 | 0.000404 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 12 | 12 | AY.42 | 0.000483 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 12 | 12 | AY.6 | 0.000494 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 11 | 11 | B.1.1.198 | 0.016153 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 11 | 11 | B.1.177.33 | 0.018092 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 10 | 10 | B.1.240 | 0.002156 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 10 | 10 | P.2 | 0.001866 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 9 | 9 | AY.3.1 | 0.000767 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 9 | 9 | B.1.177.52 | 0.015817 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 9 | 9 | B.1.36 | 0.001313 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 8 | 8 | B.1.1.434 | 0.002788 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 8 | 8 | B.1.427 | 0.000404 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 7 | 7 | B.1.1.409 | 0.01983 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 7 | 7 | B.1.177.67 | 0.053435 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 7 | 7 | P.1.7 | 0.002235 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 6 | 6 | AY.100 | 0.000276 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 6 | 6 | AY.26 | 0.00017 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 6 | 6 | AY.46.4 | 0.000987 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 6 | 6 | B.1.1.464 | 0.008837 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 6 | 6 | B.1.177.81 | 0.001136 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 6 | 6 | C.40 | 0.166667 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 6 | 6 | P.1.15 | 0.001394 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 5 | 5 | AY.27 | 0.000324 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 5 | 5 | AY.39.1 | 0.000198 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 5 | 5 | AY.75 | 0.00028 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 5 | 5 | B.1.1.316 | 0.004625 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 5 | 5 | B.1.1.423 | 0.3125 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 5 | 5 | B.1.177.8 | 0.003762 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 5 | 5 | B.1.396 | 0.003529 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 5 | 5 | C.36.3 | 0.002836 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 4 | 4 | AY.118 | 0.000251 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 4 | 4 | AY.120 | 0.000149 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 4 | 4 | AY.121 | 0.000541 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 4 | 4 | AY.29 | 0.000063 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 4 | AY.33 | 0.0002 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 1 | 4 | AY.33 | 0.000067 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 4 | 4 | AY.4.1 | 0.00295 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 4 | 4 | AY.4.5 | 0.00043 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 4 | AY.46 | 0.000208 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 2 | 4 | AY.46 | 0.000208 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 4 | 4 | AY.69 | 0.000747 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 4 | 4 | AY.9.2 | 0.000147 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 4 | 4 | AY.98.1 | 0.000194 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 4 | 4 | B.1.1.228 | 0.012195 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 4 | 4 | B.1.1.291 | 0.00297 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 4 | 4 | B.1.1.370 | 0.050633 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 4 | 4 | B.1.258.3 | 0.0067 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 4 | 4 | B.1.351 | 0.000119 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 4 | B.1.36.29 | 0.001552 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 1 | 4 | B.1.36.29 | 0.000517 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 4 | 4 | B.1.596 | 0.000349 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 4 | 4 | B.1.621 | 0.000354 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 4 | 4 | P.1.12 | 0.001936 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 4 | 4 | R.1 | 0.00036 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 2 | 3 | AY.110 | 0.000225 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 3 | AY.110 | 0.000113 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 3 | AY.114 | 0.000462 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 1 | 3 | AY.114 | 0.000231 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | AY.117 | 0.000254 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 2 | 3 | AY.16.1 | 0.00094 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 3 | AY.16.1 | 0.00047 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | AY.4.2 | 0.000065 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | AY.45 | 0.000365 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | AY.48 | 0.001395 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | AY.59 | 0.001589 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | AY.74 | 0.000347 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | AY.92 | 0.000862 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.1.305 | 0.011583 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.1.417 | 0.008108 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.1.458 | 0.125 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.110.3 | 0.002155 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.177.44 | 0.001557 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.177.53 | 0.007177 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.243.2 | 0.043478 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 2 | 3 | B.1.258 | 0.000133 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 3 | B.1.258 | 0.000067 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.36.10 | 0.014354 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.36.8 | 0.003 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.538 | 0.024194 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.609 | 0.001438 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.627 | 0.006061 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | B.40 | 0.001093 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | C.37 | 0.000348 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | P.7 | 0.0131 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 3 | 3 | Q.8 | 0.000495 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | AY.108 | 0.002205 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | AY.111 | 0.000366 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | AY.113 | 0.000285 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | AY.116 | 0.000574 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | AY.13 | 0.000322 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | AY.23 | 0.000139 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | AY.37 | 0.000632 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | AY.5.2 | 0.004926 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | AY.68 | 0.000547 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | AY.84 | 0.000875 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | AY.9.1 | 0.000167 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | AY.98 | 0.000158 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | AY.99 | 0.002099 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | B | 0.000256 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.1.159 | 0.009346 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.1.216 | 0.001781 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.1.326 | 0.003521 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.1.333 | 0.002153 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.1.354 | 0.008772 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 2 | B.1.1.369 | 0.000446 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 1 | 2 | B.1.1.369 | 0.000446 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.177.32 | 0.002699 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.36.18 | 0.00084 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.397 | 0.009709 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.452 | 0.027397 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 1 | 2 | B.1.561 | 0.000397 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 2 | B.1.561 | 0.000397 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.617.1 | 0.000258 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.628 | 0.000705 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | N.5 | 0.003534 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | P.1.17 | 0.000324 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 2 | 2 | Q.1 | 0.000253 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | A | 0.000387 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | A.1 | 0.000282 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | A.2.5.2 | 0.001572 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AE.8 | 0.000489 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.10 | 0.00053 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atC | 1 | 1 | AY.101 | 0.00049 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.104 | 0.001984 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.106 | 0.000335 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.107 | 0.000466 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.119 | 0.000035 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.12 | 0.000316 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.19 | 0.00114 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.24 | 0.000431 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.34 | 0.000097 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.35 | 0.000233 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.38 | 0.000499 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.46.2 | 0.000635 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.46.6 | 0.000072 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.5.4 | 0.000277 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.52 | 0.000814 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.55 | 0.000917 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 1 | 1 | AY.60 | 0.000938 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.62 | 0.000436 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.71 | 0.000475 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.75.1 | 0.00018 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.8 | 0.000606 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atC | 1 | 1 | AY.86 | 0.00083 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.88 | 0.000884 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.9 | 0.000068 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.99.1 | 0.001553 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | AY.99.2 | 0.000092 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 1 | 1 | B.1.1.10 | 0.001115 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.157 | 0.000913 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.170 | 0.001247 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.200 | 0.007463 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.220 | 0.001859 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.230 | 0.009174 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.232 | 0.001815 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.25 | 0.000569 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.254 | 0.011236 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.304 | 0.002809 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 1 | 1 | B.1.1.318 | 0.000302 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.375 | 0.011905 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.376 | 0.005952 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.39 | 0.00051 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.51 | 0.001718 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.160.30 | 0.002976 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.163 | 0.02439 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.12 | 0.000152 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.15 | 0.000631 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.17 | 0.000821 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.23 | 0.003236 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.7 | 0.000165 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.73 | 0.000566 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.83 | 0.001481 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.86 | 0.000183 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.199 | 0.004132 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.211 | 0.025 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atC | 1 | 1 | B.1.221.3 | 0.000833 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.222 | 0.001692 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.234 | 0.000132 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.237 | 0.004975 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 1 | 1 | B.1.260 | 0.003344 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.264 | 0.012346 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.302 | 0.013333 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.351.3 | 0.000876 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.36.27 | 0.000763 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.36.7 | 0.004 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.361 | 0.001289 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.391 | 0.001127 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.399 | 0.001934 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.408 | 0.00369 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atC | 1 | 1 | B.1.416 | 0.001269 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.428 | 0.00102 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.456 | 0.003268 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.470 | 0.001404 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.501 | 0.007353 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.525 | 0.000113 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.575 | 0.000303 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.595 | 0.000261 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.597 | 0.00463 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atA | 1 | 1 | B.1.623 | 0.000536 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.625 | 0.002353 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.69 | 0.035714 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.93 | 0.000934 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | B.36 | 0.076923 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | P.1.16 | 0.000374 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | P.1.9 | 0.004808 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | Q.4 | 0.000455 |
ORF1ab/nsp7 | 75 | M75I | atG | atT | 1 | 1 | V.2 | 0.032258 |
CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
|