CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp7 : Mut = M3I

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp73M3IM3862InonsynatGatT395936850.93079111849-11851
ORF1ab/nsp73M3IM3862InonsynatGatA39591900.047991911849-11851
ORF1ab/nsp73M3IM3862InonsynatGatC3959840.021217511849-11851

Details of the mutation M3I within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp73M3IatGatT36853959All0.000705
ORF1ab/nsp73M3IatGatA1903959All0.000036
ORF1ab/nsp73M3IatGatC843959All0.000016
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11291129B.1.3670.894612
ORF1ab/nsp73M3IatGatT699699B.1.1.2690.945873
ORF1ab/nsp73M3IatGatT305330B.1.1.70.000273
ORF1ab/nsp73M3IatGatA17330B.1.1.70.000015
ORF1ab/nsp73M3IatGatC8330B.1.1.70.000007
ORF1ab/nsp73M3IatGatT183206AY.430.000811
ORF1ab/nsp73M3IatGatA22206AY.430.000097
ORF1ab/nsp73M3IatGatC1206AY.430.000004
ORF1ab/nsp73M3IatGatT160184AY.40.000249
ORF1ab/nsp73M3IatGatC18184AY.40.000028
ORF1ab/nsp73M3IatGatA6184AY.40.000009
ORF1ab/nsp73M3IatGatT138145B.10.001264
ORF1ab/nsp73M3IatGatA4145B.10.000037
ORF1ab/nsp73M3IatGatC3145B.10.000027
ORF1ab/nsp73M3IatGatT107108B.1.1.700.036494
ORF1ab/nsp73M3IatGatC1108B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp73M3IatGatT9898AY.420.003943
ORF1ab/nsp73M3IatGatT6669B.1.617.20.000249
ORF1ab/nsp73M3IatGatA269B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp73M3IatGatC169B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp73M3IatGatT6365AY.1030.000391
ORF1ab/nsp73M3IatGatA165AY.1030.000006
ORF1ab/nsp73M3IatGatC165AY.1030.000006
ORF1ab/nsp73M3IatGatA5353A.2.50.026447
ORF1ab/nsp73M3IatGatT5151B.1.1770.000672
ORF1ab/nsp73M3IatGatT5050B.1.3260.378788
ORF1ab/nsp73M3IatGatT2949AY.30.000288
ORF1ab/nsp73M3IatGatC1849AY.30.000179
ORF1ab/nsp73M3IatGatA249AY.30.00002
ORF1ab/nsp73M3IatGatT4042B.1.10.000726
ORF1ab/nsp73M3IatGatA242B.1.10.000036
ORF1ab/nsp73M3IatGatT3839AY.860.031535
ORF1ab/nsp73M3IatGatC139AY.860.00083
ORF1ab/nsp73M3IatGatT2837AY.440.00017
ORF1ab/nsp73M3IatGatC837AY.440.000049
ORF1ab/nsp73M3IatGatA137AY.440.000006
ORF1ab/nsp73M3IatGatT2935B.1.20.000255
ORF1ab/nsp73M3IatGatC535B.1.20.000044
ORF1ab/nsp73M3IatGatA135B.1.20.000009
ORF1ab/nsp73M3IatGatT3232B.1.4970.010072
ORF1ab/nsp73M3IatGatT2929AA.10.210145
ORF1ab/nsp73M3IatGatT2424AY.290.000379
ORF1ab/nsp73M3IatGatA1622AY.1190.000565
ORF1ab/nsp73M3IatGatT622AY.1190.000212
ORF1ab/nsp73M3IatGatA2121B.1.3200.026152
ORF1ab/nsp73M3IatGatT2020B.1.1600.000624
ORF1ab/nsp73M3IatGatT1819AZ.20.014778
ORF1ab/nsp73M3IatGatC119AZ.20.000821
ORF1ab/nsp73M3IatGatT1518B.1.2210.001065
ORF1ab/nsp73M3IatGatC318B.1.2210.000213
ORF1ab/nsp73M3IatGatT813B.1.2580.000532
ORF1ab/nsp73M3IatGatA513B.1.2580.000333
ORF1ab/nsp73M3IatGatT1012B.1.3510.000297
ORF1ab/nsp73M3IatGatA212B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp73M3IatGatT911AY.4.20.000195
ORF1ab/nsp73M3IatGatC211AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp73M3IatGatT711B.1.6090.003356
ORF1ab/nsp73M3IatGatA411B.1.6090.001918
ORF1ab/nsp73M3IatGatT1111C.350.008514
ORF1ab/nsp73M3IatGatT711P.10.00011
ORF1ab/nsp73M3IatGatA411P.10.000063
ORF1ab/nsp73M3IatGatT810AY.250.000048
ORF1ab/nsp73M3IatGatA210AY.250.000012
ORF1ab/nsp73M3IatGatT810B0.001022
ORF1ab/nsp73M3IatGatC210B0.000256
ORF1ab/nsp73M3IatGatT99A.2.40.030303
ORF1ab/nsp73M3IatGatT99B.1.1.500.00611
ORF1ab/nsp73M3IatGatT77AY.1020.000186
ORF1ab/nsp73M3IatGatT56AY.1200.000186
ORF1ab/nsp73M3IatGatC16AY.1200.000037
ORF1ab/nsp73M3IatGatT66AY.980.000474
ORF1ab/nsp73M3IatGatT46B.1.5260.000094
ORF1ab/nsp73M3IatGatA26B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp73M3IatGatT66C.370.000696
ORF1ab/nsp73M3IatGatT55AY.140.00044
ORF1ab/nsp73M3IatGatT25AY.230.000139
ORF1ab/nsp73M3IatGatA25AY.230.000139
ORF1ab/nsp73M3IatGatC15AY.230.00007
ORF1ab/nsp73M3IatGatT55AY.370.00158
ORF1ab/nsp73M3IatGatT55AY.39.10.000198
ORF1ab/nsp73M3IatGatT55AY.610.000524
ORF1ab/nsp73M3IatGatA35AY.99.20.000276
ORF1ab/nsp73M3IatGatC25AY.99.20.000184
ORF1ab/nsp73M3IatGatT55B.1.1.3170.002058
ORF1ab/nsp73M3IatGatT55B.1.4270.000252
ORF1ab/nsp73M3IatGatT55B.1.5770.003436
ORF1ab/nsp73M3IatGatT34AY.200.000117
ORF1ab/nsp73M3IatGatA14AY.200.000039
ORF1ab/nsp73M3IatGatT44AY.330.000267
ORF1ab/nsp73M3IatGatT44AY.520.003257
ORF1ab/nsp73M3IatGatA24AY.540.000191
ORF1ab/nsp73M3IatGatT24AY.540.000191
ORF1ab/nsp73M3IatGatA24AY.60.000082
ORF1ab/nsp73M3IatGatT24AY.60.000082
ORF1ab/nsp73M3IatGatT44B.1.1.2220.000816
ORF1ab/nsp73M3IatGatT44B.1.1.280.001245
ORF1ab/nsp73M3IatGatT44B.1.1.3720.002755
ORF1ab/nsp73M3IatGatT44B.1.177.770.002905
ORF1ab/nsp73M3IatGatT34B.1.2340.000396
ORF1ab/nsp73M3IatGatC14B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp73M3IatGatT44B.1.5960.000349
ORF1ab/nsp73M3IatGatT44B.1.617.10.000516
ORF1ab/nsp73M3IatGatT33AY.1160.00086
ORF1ab/nsp73M3IatGatT33AY.29.10.000662
ORF1ab/nsp73M3IatGatT23AY.340.000194
ORF1ab/nsp73M3IatGatA13AY.340.000097
ORF1ab/nsp73M3IatGatT33AY.380.001498
ORF1ab/nsp73M3IatGatT23AY.390.000049
ORF1ab/nsp73M3IatGatA13AY.390.000025
ORF1ab/nsp73M3IatGatT23AY.450.000243
ORF1ab/nsp73M3IatGatA13AY.450.000122
ORF1ab/nsp73M3IatGatT33AY.9.10.000251
ORF1ab/nsp73M3IatGatT33B.1.1.5190.000119
ORF1ab/nsp73M3IatGatT33B.1.1260.003827
ORF1ab/nsp73M3IatGatT33B.1.177.600.000655
ORF1ab/nsp73M3IatGatT33B.1.177.710.030303
ORF1ab/nsp73M3IatGatT33B.1.5240.004219
ORF1ab/nsp73M3IatGatT33P.1.10.000953
ORF1ab/nsp73M3IatGatT33Q.10.000379
ORF1ab/nsp73M3IatGatT12AY.240.000431
ORF1ab/nsp73M3IatGatA12AY.240.000431
ORF1ab/nsp73M3IatGatT22AY.350.000466
ORF1ab/nsp73M3IatGatA22AY.470.000062
ORF1ab/nsp73M3IatGatA12AY.50.000021
ORF1ab/nsp73M3IatGatT12AY.50.000021
ORF1ab/nsp73M3IatGatT22AY.670.000929
ORF1ab/nsp73M3IatGatT22AY.740.000231
ORF1ab/nsp73M3IatGatA22AY.75.10.000361
ORF1ab/nsp73M3IatGatA22AY.780.003082
ORF1ab/nsp73M3IatGatT22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp73M3IatGatC22B.1.1.2260.011628
ORF1ab/nsp73M3IatGatT22B.1.177.190.002861
ORF1ab/nsp73M3IatGatT22B.1.177.780.019417
ORF1ab/nsp73M3IatGatT22B.1.3110.000549
ORF1ab/nsp73M3IatGatT22B.1.360.000292
ORF1ab/nsp73M3IatGatT22B.1.36.290.001035
ORF1ab/nsp73M3IatGatT22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp73M3IatGatT22B.1.5290.111111
ORF1ab/nsp73M3IatGatT22B.1.617.30.00597
ORF1ab/nsp73M3IatGatC12B.400.000364
ORF1ab/nsp73M3IatGatT12B.400.000364
ORF1ab/nsp73M3IatGatC12D.20.000075
ORF1ab/nsp73M3IatGatT12D.20.000075
ORF1ab/nsp73M3IatGatT22P.1.140.000096
ORF1ab/nsp73M3IatGatT22P.20.000373
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11A.2.20.001689
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11A.230.010526
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11A.30.002096
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11AN.10.02
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp73M3IatGatA11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11AY.120.000316
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11AY.260.000028
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11AY.270.000065
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11AY.300.000396
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11AY.460.000104
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11AY.680.000274
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11AY.750.000056
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11AY.90.000068
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11AY.920.000287
ORF1ab/nsp73M3IatGatA11B.1.1.1410.002012
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.1.3760.005952
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.1.5210.005348
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.110.30.000718
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.1280.000635
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.177.310.011494
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.177.860.000183
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.1890.004292
ORF1ab/nsp73M3IatGatC11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.2500.014493
ORF1ab/nsp73M3IatGatC11B.1.2600.003344
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.30.002618
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.3210.034483
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.36.390.002217
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.36.90.003215
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.3890.001002
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.4480.002625
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.4590.004082
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.4620.007246
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.5230.002451
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.5300.007143
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.5330.009615
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.5380.008065
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.5440.006024
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.5470.02439
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.5970.00463
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11B.60.00091
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11L.10.001905
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11P.1.17.10.000875
ORF1ab/nsp73M3IatGatT11P.60.003145