CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp7 : CodonNum = 32

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp732C32CC3891CsyntgTtgC1674116741111936-11938
ORF1ab/nsp732C32FC3891FnonsyntGttTt3333111936-11938
ORF1ab/nsp732C32SC3891SnonsynTgtAgt22170.77272711936-11938
ORF1ab/nsp732C32SC3891SnonsyntGttCt2250.22727311936-11938
ORF1ab/nsp732C32delC3891deldelTGT---99111936-11938
ORF1ab/nsp732C32YC3891YnonsyntGttAt66111936-11938
ORF1ab/nsp732C32del1C3891del1delTgt-gt66111936-11938
ORF1ab/nsp732C32RC3891RnonsynTgtCgt33111936-11938
ORF1ab/nsp732C32del2C3891del2delTGt--t22111936-11938
ORF1ab/nsp732C32GC3891GnonsynTgtGgt11111936-11938
ORF1ab/nsp732C32WC3891WnonsyntgTtgG11111936-11938
ORF1ab/nsp732C32XC3891XnonsyntGTtAA11111936-11938
ORF1ab/nsp732C32IC3891InonsynTGtATt11111936-11938
ORF1ab/nsp732C32TC3891TnonsynTGtACt11111936-11938

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC1674116741All0.003202
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC1537515375AY.270.995081
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC447447B.1.617.20.001683
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC158158AY.610.016555
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC139139C.230.80814
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC9494B.1.1.3170.038699
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC6969AY.370.021808
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC6060B.1.10.001088
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC4545AY.250.000271
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt3333All0.000006
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC3333AY.75.10.00595
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC3333B.1.1.70.00003
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC2828B.10.000256
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC2525AY.40.000039
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC2424AY.190.027366
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC2424AY.440.000146
ORF1ab/nsp732C32STgtAgt1722All0.000003
ORF1ab/nsp732C32StGttCt522All0.000001
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC1717AY.160.006454
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC1515AY.740.001735
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC1414AY.260.000396
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC1111AY.130.001771
ORF1ab/nsp732C32delTGT---99All0.000002
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC99AY.16.10.004229
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC99AY.470.00028
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC99B.1.1.10.00294
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC99B.1.20.000079
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC77AY.1030.000043
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC77AY.620.00305
ORF1ab/nsp732C32YtGttAt66All0.000001
ORF1ab/nsp732C32del1Tgt-gt66All0.000001
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC66AY.1100.000676
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC55AY.430.000022
ORF1ab/nsp732C32STgtAgt55AY.440.00003
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt55AY.50.000103
ORF1ab/nsp732C32STgtAgt35B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp732C32StGttCt25B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt44AY.430.000018
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC44AY.750.000224
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC44AY.9.20.000147
ORF1ab/nsp732C32RTgtCgt33All0.000001
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC33AY.390.000074
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC33AY.550.002752
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC33AY.650.001599
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC33AY.660.003209
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC33AY.670.001393
ORF1ab/nsp732C32delTGT---33B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp732C32del2TGt--t22All0
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp732C32del1Tgt-gt22AY.250.000012
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC22AY.330.000134
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC22AY.420.00008
ORF1ab/nsp732C32STgtAgt22AY.50.000041
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC22AY.600.001876
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC22AY.680.000547
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt22AY.710.00095
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC22AY.710.00095
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt22B.10.000018
ORF1ab/nsp732C32STgtAgt12B.1.10.000018
ORF1ab/nsp732C32StGttCt12B.1.10.000018
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC22B.1.2360.004107
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC22B.1.360.000292
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt22B.1.6210.000177
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC22P.1.170.000324
ORF1ab/nsp732C32YtGttAt11A0.000387
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11A0.000387
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11A.20.000662
ORF1ab/nsp732C32ITGtATt11All0
ORF1ab/nsp732C32TTGtACt11All0
ORF1ab/nsp732C32GTgtGgt11All0
ORF1ab/nsp732C32WtgTtgG11All0
ORF1ab/nsp732C32XtGTtAA11All0
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11AY.100.00053
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp732C32STgtAgt11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp732C32STgtAgt11AY.230.00007
ORF1ab/nsp732C32del1Tgt-gt11AY.260.000028
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11AY.320.000532
ORF1ab/nsp732C32XtGTtAA11AY.390.000025
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp732C32STgtAgt11AY.40.000002
ORF1ab/nsp732C32del1Tgt-gt11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp732C32STgtAgt11AY.430.000004
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11AY.490.003195
ORF1ab/nsp732C32del1Tgt-gt11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11AY.530.000288
ORF1ab/nsp732C32YtGttAt11AY.670.000464
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11AY.690.000187
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11AY.790.001211
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11AY.80.000606
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11AY.90.000068
ORF1ab/nsp732C32RTgtCgt11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11AY.930.000273
ORF1ab/nsp732C32GTgtGgt11B.10.000009
ORF1ab/nsp732C32delTGT---11B.10.000009
ORF1ab/nsp732C32STgtAgt11B.10.000009
ORF1ab/nsp732C32ITGtATt11B.10.000009
ORF1ab/nsp732C32TTGtACt11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11B.1.1.2200.001859
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt11B.1.1.3560.008547
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt11B.1.1.4330.001425
ORF1ab/nsp732C32delTGT---11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11B.1.1.4640.001473
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp732C32RTgtCgt11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp732C32del1Tgt-gt11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt11B.1.1.80.003584
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11B.1.1430.021277
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp732C32YtGttAt11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp732C32YtGttAt11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp732C32del2TGt--t11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp732C32delTGT---11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp732C32STgtAgt11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp732C32WtgTtgG11B.1.390.003906
ORF1ab/nsp732C32delTGT---11B.1.4150.014286
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11B.1.6040.017241
ORF1ab/nsp732C32CtgTtgC11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp732C32StGttCt11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp732C32YtGttAt11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp732C32del2TGt--t11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp732C32YtGttAt11B.4.40.018868
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt11B.4.50.011905
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt11B.60.00091
ORF1ab/nsp732C32StGttCt11D.20.000075
ORF1ab/nsp732C32FtGttTt11D.20.000075
ORF1ab/nsp732C32delTGT---11N.40.004255
ORF1ab/nsp732C32RTgtCgt11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp732C32delTGT---11Q.20.000613