CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : Mut = Y242D

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp6242Y242DY3811DnonsynTatGat92900.97826111696-11698
ORF1ab/nsp6242Y242DY3811DnonsynTaTGaC9220.021739111696-11698

Details of the mutation Y242D within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat9092All0.000017
ORF1ab/nsp6242Y242DTaTGaC292All0
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat1818AY.460.001873
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat1212B.1.1.70.000011
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat99B.1.617.20.000034
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat88AY.50.000165
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat55AY.9.10.000419
ORF1ab/nsp6242Y242DTaTGaC240.111111
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat240.111111
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat44AY.430.000018
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat33AY.40.000005
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat22AY.440.000012
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat22B.10.000018
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat22P.10.000032
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11AY.120.2.10.000498
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11AY.200.000039
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11AY.30.00001
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11AY.410.000294
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11AY.420.00004
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11AY.60.000041
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11AY.690.000187
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11AY.940.000443
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11AY.970.001701
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11B.1.1.1840.058824
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11B.1.2600.003344
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11B.60.00091
ORF1ab/nsp6242Y242DTatGat11P.20.000187