CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : Mut = Y154C

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp6154Y154CY3723CnonsyntAttGt4244230.99764211432-11434
ORF1ab/nsp6154Y154CY3723CnonsyntATtGC42410.0023584911432-11434

Details of the mutation Y154C within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt423424All0.000081
ORF1ab/nsp6154Y154CtATtGC1424All0
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt236236C.36.10.979253
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt5454B.1.1.70.000048
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt2626AY.1030.000161
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt2626P.1.10.008259
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt1111B.1.617.20.000041
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt99C.360.008197
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt77AY.20.002493
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt55AY.360.000741
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt44AY.440.000024
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt44AY.540.000381
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt44B.1.1.10.001307
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt44C.370.000464
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt33AD.20.000657
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt33AY.1200.000112
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt33AY.40.000005
ORF1ab/nsp6154Y154CtATtGC12AY.1130.000142
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt12AY.1130.000142
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt22AY.260.000057
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt22B.1.1.2140.000111
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt22P.30.00319
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt11AY.10.000396
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt11AY.130.000161
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt11AY.250.000006
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt11AY.270.000065
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt11AY.370.000316
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt11AY.430.000004
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt11AY.60.000041
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt11AY.620.000436
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt11AY.840.000437
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt11B.1.1.1960.005714
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp6154Y154CtAttGt11B.1.3690.000285