CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : Mut = Y153C

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp6153Y153CY3722CnonsyntAttGt27362736111429-11431

Details of the mutation Y153C within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt27362736All0.000523
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt925925B.1.1.2140.051298
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt613613B.1.214.20.367506
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt165165B.1.4270.008332
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt112112B.1.214.30.8
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt7272B.10.000659
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt6565AY.40.000101
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt5858B.1.20.000511
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt5757B.1.6351
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt4242B.1.1.2220.008568
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt4141AY.440.00025
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt3737B.1.617.20.000139
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt3535AY.1030.000217
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt3131B.1.360.004523
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt2323B.1.10.000417
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt2020AY.430.000089
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt1919B.1.4290.000447
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt1919C.350.014706
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt1818AY.116.10.005606
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt1818B.1.1.70.000016
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt1818B.1.2100.03838
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt1818B.1.36.80.018
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt1818B.1.6330.75
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt1616AY.29.10.003528
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt1616AY.4.20.000347
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt1515AY.1000.00069
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt1515B.1.5960.001307
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt1414B0.001789
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt1111AY.290.000174
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt1010AY.250.00006
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt1010B.1.1.5190.000397
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt1010B.1.4710.027322
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt1010B.1.6230.005365
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt99B.1.2140.032967
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt99B.1.3980.026786
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt88B.1.1.2160.007124
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt88B.1.177.570.002248
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt88B.1.5750.002427
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt77AY.260.000198
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt77B.1.1770.000092
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt66AY.200.000233
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt66AY.390.000148
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt66B.1.5950.001566
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt55B.1.177.810.000947
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt55B.1.214.10.1
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt55B.1.3670.003962
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt44B.1.1.3100.060606
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt44B.1.177.440.002076
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt44B.1.2580.000266
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt44P.10.000063
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt33AY.1190.000106
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt33AY.470.000093
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt33AY.50.000062
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt33B.1.1.570.034483
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt220.111111
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt22AY.1060.00067
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt22AY.1110.000366
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt22AY.30.00002
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt22AY.340.000194
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt22AY.360.000296
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt22B.1.1.150.027027
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt22B.1.177.350.001382
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt22B.1.36.290.001035
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt22B.1.4590.008163
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt22B.1.5410.00885
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt22D.20.00015
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11A.50.001923
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11AY.160.00038
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11AY.230.00007
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11AY.330.000067
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11AY.780.001541
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11AY.830.001724
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11AY.90.000068
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11AY.980.000079
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11AY.990.001049
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.1.1.1760.000439
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.1.1.4580.041667
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.1.1.5150.02
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.1.1.830.00271
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.1.177.500.004695
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.1.1790.003759
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.1.2700.005618
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.1.3890.001002
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.1.4620.007246
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.1.5580.004566
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.1.6000.005848
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.30.000831
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.350.007812
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11B.60.00091
ORF1ab/nsp6153Y153CtAttGt11P.1.140.000048