CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : Mut = S106del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp6106S106delS3675deldelTCT---13546861354686111288-11290

Details of the mutation S106del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---13546861354686All0.2591
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---10816501081650B.1.1.70.968318
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---6191961919P.10.975471
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---4166841668B.1.5260.979387
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---3108631086B.1.3510.924078
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---2083420834P.1.140.995889
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---1337613376B.1.6370.977421
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---84248424B.1.5250.953265
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---83798379C.370.972493
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---77187718Q.10.974987
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---66756675Q.30.968093
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---60266026Q.80.993734
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---60026002P.1.170.970883
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---39523952P.1.150.918216
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---36003600P.1.100.970089
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---32163216B.1.1.3180.970428
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---32153215B.1.351.20.972769
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---31623162B.10.028962
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---30663066P.1.70.978927
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---29792979B.1.10.054042
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---26892689B.1.6280.947498
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---26532653P.1.160.992518
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---25062506P.1.10.796061
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---21162116Q.40.962256
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---19311931P.1.120.934656
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---18431843B.1.1.1760.809754
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---15721572B.1.351.50.942446
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---15411541B.1.619.10.988454
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---11991199AZ.20.984401
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---11521152AZ.10.999133
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---11391139P.1.17.10.9965
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---11331133B.1.351.30.992989
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---11301130B.1.6190.984321
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---11011101P.1.130.989218
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---10561056B.1.6200.999054
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---10151015P.1.40.991211
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---981981B.1.214.20.588129
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---895895Q.70.994444
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---840840P.1.20.971098
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---630630AZ.30.957447
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---611611Q.20.374847
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---513513P.1.60.998054
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---397397AY.260.011239
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---393393B.1.6250.924706
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---382382B.1.4700.536517
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---367367C.37.10.960733
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---284284B.1.6340.972603
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---279279AZ.40.936242
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---231231C.1.20.982979
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---226226AZ.50.792982
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---207207P.1.90.995192
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---206206P.1.80.985646
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---202202B.1.1.5280.971154
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---195195AV.10.984848
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---194194B.1.2410.157468
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---190190B.1.6300.994764
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---189189B.1.3750.154918
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---154154B.1.177.730.087203
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---150150Q.60.993377
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---144144B.1.1.5250.786885
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---143143B.1.6360.959732
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---129129B.1.214.30.921429
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---122122P.1.10.10.99187
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---121121AZ.2.10.98374
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---119119AZ.61
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---112112B.1.1700.482759
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---107107B.1.214.40.972727
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---101101AY.40.000157
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---9797P.1.110.989796
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ORF1ab/nsp6106S106delTCT---8181B.1.617.20.000305
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ORF1ab/nsp6106S106delTCT---6565B.1.177.70.010715
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---5959Q.51
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---5757B.1.1770.000751
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ORF1ab/nsp6106S106delTCT---5656B0.007157
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ORF1ab/nsp6106S106delTCT---4646B.1.6391
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ORF1ab/nsp6106S106delTCT---4444AY.430.000195
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ORF1ab/nsp6106S106delTCT---3939B.1.258.170.004055
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---3737B.1.1.3120.070746
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---3535B.1.6230.018777
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---3232B.1.3460.04194
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---3232B.1.36.290.016555
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---3131B.1.1.280.009648
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---2929B.1.1.5190.001152
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---2929P.1.31
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---2828C.36.3.10.076087
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---2727B.1.1.2200.050186
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---2525AY.290.000394
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---2525B.1.1600.00078
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---2424P.1.10.21
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---2323AY.680.006296
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---2121AY.1160.006022
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---2121B.1.1.1610.074205
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---2121B.1.1.3060.009206
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ORF1ab/nsp6106S106delTCT---1818B.1.2370.089552
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ORF1ab/nsp6106S106delTCT---88B.1.1.3750.095238
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ORF1ab/nsp6106S106delTCT---55B.1.1.700.001705
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---55B.1.1570.014925
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---55B.1.258.140.004902
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---55B.1.5330.048077
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---55B.1.5750.001517
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---55B.1.617.10.000645
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---55C.36.30.002836
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---55C.390.09434
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ORF1ab/nsp6106S106delTCT---44AY.4.2.10.000596
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---44AY.50.000083
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ORF1ab/nsp6106S106delTCT---44B.1.1.3720.002755
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---44B.1.1.4320.005063
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---44B.1.177.600.000874
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---44B.1.177.810.000757
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---44B.1.214.10.08
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---44B.1.3670.00317
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---44B.1.6180.016129
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---44C.10.009569
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---44D.20.0003
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---44P.50.054795
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---44R.10.00036
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---33AY.1130.000427
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---33AY.16.10.00141
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---33AY.46.20.001906
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---33AY.600.002814
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---33B.1.1.1410.006036
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ORF1ab/nsp6106S106delTCT---33B.1.1.3890.018182
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---33B.1.1.390.001529
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---33B.1.2100.006397
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---33B.1.2340.000396
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---33B.1.3110.000824
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---33B.1.5610.001191
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---33B.1.5800.012195
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---33P.20.00056
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22AY.1170.000169
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22AY.120.10.000642
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22AY.350.000466
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22AY.480.00093
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22AY.540.000191
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22AY.7.20.001119
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22AY.750.000112
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22AY.910.001461
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22AY.980.000158
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22B.1.1.1170.019417
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22B.1.1.2540.022472
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22B.1.1.2690.002706
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22B.1.1.2910.001485
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22B.1.1.2990.02439
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22B.1.1.3020.004149
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22B.1.1.3170.000823
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22B.1.1.370.000386
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22B.1.1.3700.025316
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22B.1.1.4340.000697
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22B.1.1.5230.003125
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22B.1.1.540.006042
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22B.1.177.310.022989
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22B.1.177.60.001953
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22B.1.3490.00143
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22B.1.351.10.076923
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22B.1.5300.014286
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22B.1.5760.001813
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22B.1.621.10.001012
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22B.550.0059
ORF1ab/nsp6106S106delTCT---22C.360.001821
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