CoV-GLUEGenomeCountriesLineagesMutationsInsertionsDeletionsUpdated:

CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : Mut = M183I

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp6183M183IM3752InonsynatGatT13883131650.94828211519-11521
ORF1ab/nsp6183M183IM3752InonsynatGatA138836670.048044411519-11521
ORF1ab/nsp6183M183IM3752InonsynatGatC13883510.0036735611519-11521

Details of the mutation M183I within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT1316513883All0.002518
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA66713883All0.000128
ORF1ab/nsp6183M183IatGatC5113883All0.00001
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT36723747B.1.1.70.003287
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA683747B.1.1.70.000061
ORF1ab/nsp6183M183IatGatC73747B.1.1.70.000006
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT15561556B.1.619.10.998076
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT14131424AY.430.00626
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA101424AY.430.000044
ORF1ab/nsp6183M183IatGatC11424AY.430.000004
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT13821382A.23.10.973239
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT10861086B.1.6190.945993
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT777810B.1.617.20.002926
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA28810B.1.617.20.000105
ORF1ab/nsp6183M183IatGatC5810B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA306325B.1.4250.916168
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT19325B.1.4250.056886
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT277278B.1.20.002439
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA1278B.1.20.000009
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT257270B.1.360.037496
ORF1ab/nsp6183M183IatGatC13270B.1.360.001897
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT234243B.10.002143
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA8243B.10.000073
ORF1ab/nsp6183M183IatGatC1243B.10.000009
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT221222AY.440.001345
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA1222AY.440.000006
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT181195AY.40.000282
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA8195AY.40.000012
ORF1ab/nsp6183M183IatGatC6195AY.40.000009
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT159168AY.1020.004216
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA9168AY.1020.000239
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT159159B.1.9.40.97546
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT130132AY.50.002684
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA2132AY.50.000041
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT125125B.1.2410.101461
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT100100B.1.5240.140647
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT7475AY.390.001829
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA175AY.390.000025
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA7174B.1.1.2840.007625
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT374B.1.1.2840.000322
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT4952AY.1170.004141
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA252AY.1170.000169
ORF1ab/nsp6183M183IatGatC152AY.1170.000085
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT5252B.1.5990.189781
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT4549AY.250.000271
ORF1ab/nsp6183M183IatGatC249AY.250.000012
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA249AY.250.000012
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT4448P.10.000693
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA448P.10.000063
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA4247B.1.5260.000987
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT547B.1.5260.000118
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT4344AY.39.10.001703
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA144AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT4244AY.450.005111
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA244AY.450.000243
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT3638AY.1030.000224
ORF1ab/nsp6183M183IatGatC138AY.1030.000006
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA138AY.1030.000006
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT3236B.1.10.000581
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA236B.1.10.000036
ORF1ab/nsp6183M183IatGatC236B.1.10.000036
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT3435AY.980.002686
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA135AY.980.000079
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT3233B.1.1770.000421
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA133B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT3131AY.1190.001095
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT2630AY.460.002706
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA430AY.460.000416
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT2929B.1.3750.02377
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT2828B.1.1.3120.053537
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT2222B.1.258.170.002287
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT2121B.1.2210.001492
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT1821B.1.4290.000424
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA321B.1.4290.000071
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT2020AY.1060.006698
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT1220AY.1200.000446
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA820AY.1200.000297
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT1720AY.4.20.000369
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA320AY.4.20.000065
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT2020B.1.214.30.142857
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA1719B.1.1600.00053
ORF1ab/nsp6183M183IatGatC219B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT1717B.1.5750.005158
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT1717B.1.6370.001242
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA1616AY.670.007428
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT1616B.1.1.3780.116788
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT1616P.1.140.000765
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT1515B0.001917
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT1515B.1.3510.000446
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT1214AY.290.000189
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA214AY.290.000032
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT1414AY.60.000576
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT1214B.1.1.2160.010686
ORF1ab/nsp6183M183IatGatC214B.1.1.2160.001781
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT1414B.1.2350.035264
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT1414B.1.5960.00122
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT1113AY.30.000109
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA213AY.30.00002
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT1313AY.420.000523
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT1313B.1.2340.001715
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT1112Q.80.001814
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA112Q.80.000165
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT811AY.330.000534
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA311AY.330.0002
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT1010B.1.4560.03268
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT99AY.3.10.000767
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT99AY.340.000873
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT99B.1.1.10.00294
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT99B.1.1.4860.014196
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT88AY.200.000311
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT88AY.70.001568
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT88B.1.1.2140.000444
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA78B.1.177.820.003341
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT18B.1.177.820.000477
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT67AY.34.10.00306
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA17AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT77AY.5.40.001937
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT77AY.590.003708
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT77B.1.1.2300.06422
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT77B.1.1.4640.010309
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT47B.1.36.80.004
ORF1ab/nsp6183M183IatGatC37B.1.36.80.003
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT77B.1.3610.009021
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT67B.1.4270.000303
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA17B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT77B.1.90.04321
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT67R.10.00054
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA17R.10.00009
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT66AT.10.030769
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT66AY.1140.001387
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT56AY.99.20.000461
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA16AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT56B.1.1.2940.006329
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA16B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT66B.1.1.5190.000238
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT66B.1.36.220.007246
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT66B.1.3690.001711
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT66B.1.621.10.003035
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT56D.20.000375
ORF1ab/nsp6183M183IatGatC16D.20.000075
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT55AY.1160.001434
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT55AY.260.000142
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT55AY.4.50.000537
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT35AY.750.000168
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA25AY.750.000112
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT55B.1.1.2390.16129
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT55B.1.2430.000348
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT55B.1.36.290.002587
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT55B.1.4970.001574
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT44A0.001548
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT44AY.1040.007937
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT44AY.220.008368
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT34AY.230.000209
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA14AY.230.00007
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT34B.1.1.3060.001315
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA14B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT44B.1.1.330.001684
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT44B.1.1.700.001364
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT44B.1.177.160.002658
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA44B.1.4050.049383
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT44B.1.617.10.000516
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT44B.1.6280.001409
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT44B.1.9.50.022727
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT33A.2.5.30.030928
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA23AY.1000.000092
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT13AY.1000.000046
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT33AY.1180.000188
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT23AY.1210.000271
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA13AY.1210.000135
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT23AY.4.2.10.000298
ORF1ab/nsp6183M183IatGatC13AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT33AY.410.000882
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT33AY.46.10.00308
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT23AY.46.20.001271
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA13AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT33AY.5.30.001012
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT33AY.680.000821
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT33AY.840.001312
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT33AY.850.001282
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT33AY.910.002191
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT33AY.920.000862
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT33AZ.20.002463
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT33B.1.1.1700.003741
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT33B.1.1.1890.004539
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT33B.1.1.500.002037
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT33B.1.1.570.034483
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA33B.1.177.40.000633
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT33B.1.3090.142857
ORF1ab/nsp6183M183IatGatC23B.1.36.100.009569
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT13B.1.36.100.004785
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT33B.1.6230.001609
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT33B.1.88.10.014423
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT33P.1.170.000485
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT33P.1.70.000958
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT33Q.10.000379
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA22AD.20.000438
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT22AY.1100.000225
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT22AY.46.60.000144
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA12AY.550.000917
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT12AY.550.000917
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT22AY.7.10.000225
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT22AY.950.001522
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT22B.1.1.540.006042
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT22B.1.177.330.003289
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT22B.1.177.570.000562
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT22B.1.177.600.000437
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT22B.1.3190.006098
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT22B.1.3240.00321
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT22B.1.36.360.001204
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT22B.1.3620.003082
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT22B.1.3990.003868
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT22B.1.4590.008163
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT22B.1.4680.011429
ORF1ab/nsp6183M183IatGatC12B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT12B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT22B.1.5640.000852
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT22B.1.617.30.00597
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT22C.370.000232
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT22P.1.40.001953
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA12P.20.000187
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT12P.20.000187
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT110.055556
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11A.10.000282
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11A.2.40.003367
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11A.50.001923
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA11AW.10.003049
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.10.000396
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.1070.000466
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.120.20.001285
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.140.000088
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.240.000431
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA11AY.270.000065
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.370.000316
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.380.000499
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.470.000031
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.510.000909
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.530.000288
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.580.000907
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA11AY.640.000595
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.690.000187
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.700.000209
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.720.001361
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.790.001211
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.860.00083
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.890.004902
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11AY.990.001049
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.1.100.001115
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.1.1010.01
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.1.1570.000913
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA11B.1.1.1620.029412
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.1.1750.076923
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.1.2690.001353
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.1.2770.000759
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.1.2860.002899
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.1.3330.001076
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.1.4400.011765
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.1.4620.008621
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.1.510.001718
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.1.5250.005464
ORF1ab/nsp6183M183IatGatA11B.1.1.860.035714
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.1100.004525
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.1470.000756
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.160.120.00641
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.160.290.004219
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.177.650.000665
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.177.860.000183
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.214.20.0006
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.2470.014925
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.36.190.009259
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.3770.004566
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.3890.001002
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.4260.001009
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.4360.001029
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.4420.035714
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.4460.02
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.5110.034483
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.5510.00129
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.5740.002151
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.6200.000946
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.30.000831
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11B.6.60.000889
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11C.10.002392
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11C.140.004329
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11N.50.001767
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11P.1.150.000232
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11P.1.160.000374
ORF1ab/nsp6183M183IatGatT11R.20.014493

CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk

CoV-GLUE uses sequence data from GISAID. GISAID data provided via this web application is subject to GISAID's Terms and Conditions.