CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | M3752I | nonsyn | atG | atT | 13883 | 13165 | 0.948282 | 11519-11521 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | M3752I | nonsyn | atG | atA | 13883 | 667 | 0.0480444 | 11519-11521 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | M3752I | nonsyn | atG | atC | 13883 | 51 | 0.00367356 | 11519-11521 |
Details of the mutation M183I within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 13165 | 13883 | All | 0.002518 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 667 | 13883 | All | 0.000128 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atC | 51 | 13883 | All | 0.00001 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3672 | 3747 | B.1.1.7 | 0.003287 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 68 | 3747 | B.1.1.7 | 0.000061 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atC | 7 | 3747 | B.1.1.7 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1556 | 1556 | B.1.619.1 | 0.998076 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1413 | 1424 | AY.43 | 0.00626 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 10 | 1424 | AY.43 | 0.000044 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atC | 1 | 1424 | AY.43 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1382 | 1382 | A.23.1 | 0.973239 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1086 | 1086 | B.1.619 | 0.945993 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 777 | 810 | B.1.617.2 | 0.002926 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 28 | 810 | B.1.617.2 | 0.000105 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atC | 5 | 810 | B.1.617.2 | 0.000019 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 306 | 325 | B.1.425 | 0.916168 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 19 | 325 | B.1.425 | 0.056886 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 277 | 278 | B.1.2 | 0.002439 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 278 | B.1.2 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 257 | 270 | B.1.36 | 0.037496 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atC | 13 | 270 | B.1.36 | 0.001897 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 234 | 243 | B.1 | 0.002143 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 8 | 243 | B.1 | 0.000073 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atC | 1 | 243 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 221 | 222 | AY.44 | 0.001345 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 222 | AY.44 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 181 | 195 | AY.4 | 0.000282 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 8 | 195 | AY.4 | 0.000012 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atC | 6 | 195 | AY.4 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 159 | 168 | AY.102 | 0.004216 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 9 | 168 | AY.102 | 0.000239 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 159 | 159 | B.1.9.4 | 0.97546 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 130 | 132 | AY.5 | 0.002684 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 2 | 132 | AY.5 | 0.000041 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 125 | 125 | B.1.241 | 0.101461 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 100 | 100 | B.1.524 | 0.140647 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 74 | 75 | AY.39 | 0.001829 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 75 | AY.39 | 0.000025 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 71 | 74 | B.1.1.284 | 0.007625 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 74 | B.1.1.284 | 0.000322 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 49 | 52 | AY.117 | 0.004141 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 2 | 52 | AY.117 | 0.000169 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atC | 1 | 52 | AY.117 | 0.000085 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 52 | 52 | B.1.599 | 0.189781 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 45 | 49 | AY.25 | 0.000271 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atC | 2 | 49 | AY.25 | 0.000012 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 2 | 49 | AY.25 | 0.000012 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 44 | 48 | P.1 | 0.000693 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 4 | 48 | P.1 | 0.000063 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 42 | 47 | B.1.526 | 0.000987 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 5 | 47 | B.1.526 | 0.000118 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 43 | 44 | AY.39.1 | 0.001703 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 44 | AY.39.1 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 42 | 44 | AY.45 | 0.005111 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 2 | 44 | AY.45 | 0.000243 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 36 | 38 | AY.103 | 0.000224 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atC | 1 | 38 | AY.103 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 38 | AY.103 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 32 | 36 | B.1.1 | 0.000581 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 2 | 36 | B.1.1 | 0.000036 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atC | 2 | 36 | B.1.1 | 0.000036 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 34 | 35 | AY.98 | 0.002686 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 35 | AY.98 | 0.000079 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 32 | 33 | B.1.177 | 0.000421 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 33 | B.1.177 | 0.000013 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 31 | 31 | AY.119 | 0.001095 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 26 | 30 | AY.46 | 0.002706 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 4 | 30 | AY.46 | 0.000416 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 29 | 29 | B.1.375 | 0.02377 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 28 | 28 | B.1.1.312 | 0.053537 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 22 | 22 | B.1.258.17 | 0.002287 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 21 | 21 | B.1.221 | 0.001492 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 18 | 21 | B.1.429 | 0.000424 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 3 | 21 | B.1.429 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 20 | 20 | AY.106 | 0.006698 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 12 | 20 | AY.120 | 0.000446 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 8 | 20 | AY.120 | 0.000297 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 17 | 20 | AY.4.2 | 0.000369 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 3 | 20 | AY.4.2 | 0.000065 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 20 | 20 | B.1.214.3 | 0.142857 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 17 | 19 | B.1.160 | 0.00053 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atC | 2 | 19 | B.1.160 | 0.000062 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 17 | 17 | B.1.575 | 0.005158 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 17 | 17 | B.1.637 | 0.001242 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 16 | 16 | AY.67 | 0.007428 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 16 | 16 | B.1.1.378 | 0.116788 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 16 | 16 | P.1.14 | 0.000765 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 15 | 15 | B | 0.001917 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 15 | 15 | B.1.351 | 0.000446 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 12 | 14 | AY.29 | 0.000189 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 2 | 14 | AY.29 | 0.000032 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 14 | 14 | AY.6 | 0.000576 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 12 | 14 | B.1.1.216 | 0.010686 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atC | 2 | 14 | B.1.1.216 | 0.001781 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 14 | 14 | B.1.235 | 0.035264 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 14 | 14 | B.1.596 | 0.00122 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 11 | 13 | AY.3 | 0.000109 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 2 | 13 | AY.3 | 0.00002 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 13 | 13 | AY.42 | 0.000523 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 13 | 13 | B.1.234 | 0.001715 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 11 | 12 | Q.8 | 0.001814 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 12 | Q.8 | 0.000165 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 8 | 11 | AY.33 | 0.000534 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 3 | 11 | AY.33 | 0.0002 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 10 | 10 | B.1.456 | 0.03268 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 9 | 9 | AY.3.1 | 0.000767 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 9 | 9 | AY.34 | 0.000873 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 9 | 9 | B.1.1.1 | 0.00294 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 9 | 9 | B.1.1.486 | 0.014196 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 8 | 8 | AY.20 | 0.000311 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 8 | 8 | AY.7 | 0.001568 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 8 | 8 | B.1.1.214 | 0.000444 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 7 | 8 | B.1.177.82 | 0.003341 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 8 | B.1.177.82 | 0.000477 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 6 | 7 | AY.34.1 | 0.00306 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 7 | AY.34.1 | 0.00051 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 7 | 7 | AY.5.4 | 0.001937 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 7 | 7 | AY.59 | 0.003708 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 7 | 7 | B.1.1.230 | 0.06422 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 7 | 7 | B.1.1.464 | 0.010309 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 4 | 7 | B.1.36.8 | 0.004 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atC | 3 | 7 | B.1.36.8 | 0.003 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 7 | 7 | B.1.361 | 0.009021 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 6 | 7 | B.1.427 | 0.000303 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 7 | B.1.427 | 0.00005 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 7 | 7 | B.1.9 | 0.04321 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 6 | 7 | R.1 | 0.00054 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 7 | R.1 | 0.00009 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 6 | 6 | AT.1 | 0.030769 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 6 | 6 | AY.114 | 0.001387 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 5 | 6 | AY.99.2 | 0.000461 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 6 | AY.99.2 | 0.000092 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 5 | 6 | B.1.1.294 | 0.006329 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 6 | B.1.1.294 | 0.001266 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 6 | 6 | B.1.1.519 | 0.000238 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 6 | 6 | B.1.36.22 | 0.007246 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 6 | 6 | B.1.369 | 0.001711 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 6 | 6 | B.1.621.1 | 0.003035 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 5 | 6 | D.2 | 0.000375 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atC | 1 | 6 | D.2 | 0.000075 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 5 | 5 | AY.116 | 0.001434 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 5 | 5 | AY.26 | 0.000142 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 5 | 5 | AY.4.5 | 0.000537 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 5 | AY.75 | 0.000168 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 2 | 5 | AY.75 | 0.000112 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 5 | 5 | B.1.1.239 | 0.16129 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 5 | 5 | B.1.243 | 0.000348 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 5 | 5 | B.1.36.29 | 0.002587 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 5 | 5 | B.1.497 | 0.001574 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 4 | 4 | A | 0.001548 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 4 | 4 | AY.104 | 0.007937 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 4 | 4 | AY.22 | 0.008368 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 4 | AY.23 | 0.000209 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 4 | AY.23 | 0.00007 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 4 | B.1.1.306 | 0.001315 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 4 | B.1.1.306 | 0.000438 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 4 | 4 | B.1.1.33 | 0.001684 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 4 | 4 | B.1.1.70 | 0.001364 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 4 | 4 | B.1.177.16 | 0.002658 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 4 | 4 | B.1.405 | 0.049383 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 4 | 4 | B.1.617.1 | 0.000516 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 4 | 4 | B.1.628 | 0.001409 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 4 | 4 | B.1.9.5 | 0.022727 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 3 | A.2.5.3 | 0.030928 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 2 | 3 | AY.100 | 0.000092 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 3 | AY.100 | 0.000046 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 3 | AY.118 | 0.000188 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 3 | AY.121 | 0.000271 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 3 | AY.121 | 0.000135 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 3 | AY.4.2.1 | 0.000298 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atC | 1 | 3 | AY.4.2.1 | 0.000149 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 3 | AY.41 | 0.000882 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 3 | AY.46.1 | 0.00308 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 3 | AY.46.2 | 0.001271 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 3 | AY.46.2 | 0.000635 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 3 | AY.5.3 | 0.001012 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 3 | AY.68 | 0.000821 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 3 | AY.84 | 0.001312 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 3 | AY.85 | 0.001282 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 3 | AY.91 | 0.002191 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 3 | AY.92 | 0.000862 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 3 | AZ.2 | 0.002463 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.1.170 | 0.003741 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.1.189 | 0.004539 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.1.50 | 0.002037 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.1.57 | 0.034483 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 3 | 3 | B.1.177.4 | 0.000633 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.309 | 0.142857 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atC | 2 | 3 | B.1.36.10 | 0.009569 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 3 | B.1.36.10 | 0.004785 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.623 | 0.001609 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.88.1 | 0.014423 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 3 | P.1.17 | 0.000485 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 3 | P.1.7 | 0.000958 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 3 | 3 | Q.1 | 0.000379 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 2 | 2 | AD.2 | 0.000438 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 2 | AY.110 | 0.000225 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 2 | AY.46.6 | 0.000144 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 2 | AY.55 | 0.000917 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 2 | AY.55 | 0.000917 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 2 | AY.7.1 | 0.000225 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 2 | AY.95 | 0.001522 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 2 | AY.98.1 | 0.000097 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.1.28 | 0.000622 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.1.54 | 0.006042 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.177.33 | 0.003289 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.177.57 | 0.000562 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.177.60 | 0.000437 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.319 | 0.006098 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.324 | 0.00321 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.36.36 | 0.001204 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.362 | 0.003082 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.399 | 0.003868 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.459 | 0.008163 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.468 | 0.011429 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atC | 1 | 2 | B.1.525 | 0.000113 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 2 | B.1.525 | 0.000113 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.564 | 0.000852 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.617.3 | 0.00597 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 2 | C.37 | 0.000232 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 2 | 2 | P.1.4 | 0.001953 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 2 | P.2 | 0.000187 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 2 | P.2 | 0.000187 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | A.1 | 0.000282 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | A.2.4 | 0.003367 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 1 | A.2.5 | 0.000499 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | A.5 | 0.001923 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 1 | AW.1 | 0.003049 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.1 | 0.000396 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.107 | 0.000466 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.111 | 0.000183 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.120.2 | 0.001285 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.14 | 0.000088 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.24 | 0.000431 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 1 | AY.27 | 0.000065 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.37 | 0.000316 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.38 | 0.000499 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.46.5 | 0.000198 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.47 | 0.000031 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.51 | 0.000909 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.53 | 0.000288 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.58 | 0.000907 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 1 | AY.64 | 0.000595 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.69 | 0.000187 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.70 | 0.000209 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.72 | 0.001361 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.75.1 | 0.00018 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.79 | 0.001211 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.86 | 0.00083 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.89 | 0.004902 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.9.2 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | AY.99 | 0.001049 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.10 | 0.001115 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.101 | 0.01 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.157 | 0.000913 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 1 | B.1.1.162 | 0.029412 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.175 | 0.076923 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.222 | 0.000204 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.269 | 0.001353 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.277 | 0.000759 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.286 | 0.002899 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.333 | 0.001076 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.37 | 0.000193 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.409 | 0.002833 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.420 | 0.001006 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.440 | 0.011765 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.448 | 0.002033 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.462 | 0.008621 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.51 | 0.001718 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.525 | 0.005464 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atA | 1 | 1 | B.1.1.86 | 0.035714 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.110 | 0.004525 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.147 | 0.000756 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.157 | 0.002985 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.160.12 | 0.00641 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.160.29 | 0.004219 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.6 | 0.000977 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.65 | 0.000665 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.7 | 0.000165 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.73 | 0.000566 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.86 | 0.000183 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.214.2 | 0.0006 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.240 | 0.000216 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.247 | 0.014925 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.258 | 0.000067 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.36.17 | 0.000494 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.36.19 | 0.009259 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.367 | 0.000792 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.377 | 0.004566 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.389 | 0.001002 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.426 | 0.001009 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.436 | 0.001029 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.442 | 0.035714 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.446 | 0.02 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.499 | 0.00105 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.511 | 0.034483 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.551 | 0.00129 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.574 | 0.002151 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.577 | 0.000687 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.595 | 0.000261 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.620 | 0.000946 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.621 | 0.000089 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.3 | 0.000831 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | B.6.6 | 0.000889 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | C.1 | 0.002392 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | C.14 | 0.004329 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | N.5 | 0.001767 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | P.1.15 | 0.000232 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | P.1.16 | 0.000374 |
ORF1ab/nsp6 | 183 | M183I | atG | atT | 1 | 1 | R.2 | 0.014493 |
![]() |
![]() |
CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
|