CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : Mut = M164I

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp6164M164IM3733InonsynatGatA276026670.96630411462-11464
ORF1ab/nsp6164M164IM3733InonsynatGatT2760780.028260911462-11464
ORF1ab/nsp6164M164IM3733InonsynatGatC2760150.0054347811462-11464

Details of the mutation M164I within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA26672760All0.00051
ORF1ab/nsp6164M164IatGatT782760All0.000015
ORF1ab/nsp6164M164IatGatC152760All0.000003
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA12461247B.1.617.20.004692
ORF1ab/nsp6164M164IatGatC11247B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA551553AY.430.002441
ORF1ab/nsp6164M164IatGatT2553AY.430.000009
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA187235B.1.1.70.000167
ORF1ab/nsp6164M164IatGatT48235B.1.1.70.000043
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA132132B.1.1.2100.754286
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA9090AY.460.009367
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA7171AY.390.001755
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA4747AY.440.000286
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA3636AY.990.037775
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA3334AY.1030.000205
ORF1ab/nsp6164M164IatGatT134AY.1030.000006
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA2531B.10.000229
ORF1ab/nsp6164M164IatGatT531B.10.000046
ORF1ab/nsp6164M164IatGatC131B.10.000009
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA2929B.1.177.650.019295
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA2021P.10.000315
ORF1ab/nsp6164M164IatGatT121P.10.000016
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA1919B.1.6370.001388
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA1414AY.120.004425
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA1113AY.40.000017
ORF1ab/nsp6164M164IatGatT213AY.40.000003
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA1113B.1.10.0002
ORF1ab/nsp6164M164IatGatT113B.1.10.000018
ORF1ab/nsp6164M164IatGatC113B.1.10.000018
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA1212AY.1170.001014
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA1212B.1.1770.000158
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA910AY.250.000054
ORF1ab/nsp6164M164IatGatT110AY.250.000006
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA99AY.1020.000239
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA88AY.100.00424
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA88AY.230.000558
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA88AY.840.0035
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA38B.1.5260.000071
ORF1ab/nsp6164M164IatGatT38B.1.5260.000071
ORF1ab/nsp6164M164IatGatC28B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA66B.1.3510.000178
ORF1ab/nsp6164M164IatGatC55B.1.5610.001985
ORF1ab/nsp6164M164IatGatT45D.20.0003
ORF1ab/nsp6164M164IatGatC15D.20.000075
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA44AY.1190.000141
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA24AY.1200.000074
ORF1ab/nsp6164M164IatGatT24AY.1200.000074
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA44AY.30.00004
ORF1ab/nsp6164M164IatGatT34AY.9.20.00011
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA14AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA34B.1.5960.000261
ORF1ab/nsp6164M164IatGatT14B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA33AY.200.000117
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA33AY.98.10.000145
ORF1ab/nsp6164M164IatGatT13B.1.20.000009
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA13B.1.20.000009
ORF1ab/nsp6164M164IatGatC13B.1.20.000009
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA22AY.1100.000225
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA22AY.1180.000125
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA22AY.120.10.000642
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA22AY.3.10.000171
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA12AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp6164M164IatGatC12AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA22AY.4.40.000818
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA22AY.450.000243
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA22AY.920.000575
ORF1ab/nsp6164M164IatGatT12AY.940.000443
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA12AY.940.000443
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA22B.1.1.100.00223
ORF1ab/nsp6164M164IatGatC12B.1.1.4160.000905
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA12B.1.1.4160.000905
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA22B.1.1.500.001358
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11AD.20.000219
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11AY.260.000028
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11AY.270.000065
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11AY.470.000031
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11AY.520.000814
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11AY.530.000288
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11AY.540.000095
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11AY.880.000884
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11AY.980.000079
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11B0.000128
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11B.1.1.300.076923
ORF1ab/nsp6164M164IatGatC11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp6164M164IatGatT11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11B.1.2600.003344
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp6164M164IatGatT11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11B.1.5880.00091
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11B.390.002331
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11C.350.000774
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp6164M164IatGatA11P.1.170.000162