CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : Mut = M143I

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp6143M143IM3712InonsynatGatT701068690.97988611399-11401
ORF1ab/nsp6143M143IM3712InonsynatGatC7010760.010841711399-11401
ORF1ab/nsp6143M143IM3712InonsynatGatA7010650.0092724711399-11401

Details of the mutation M143I within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT68697010All0.001314
ORF1ab/nsp6143M143IatGatC767010All0.000015
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA657010All0.000012
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT30983108AY.40.004822
ORF1ab/nsp6143M143IatGatC83108AY.40.000012
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA23108AY.40.000003
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT23102310B.1.1.3110.827364
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT698747B.1.1.70.000625
ORF1ab/nsp6143M143IatGatC37747B.1.1.70.000033
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA12747B.1.1.70.000011
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT121122B.1.3510.003597
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA1122B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT5760B.1.617.20.000215
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA360B.1.617.20.000011
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT4750AY.430.000208
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA350AY.430.000013
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT3746AY.250.000223
ORF1ab/nsp6143M143IatGatC846AY.250.000048
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA146AY.250.000006
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT3636Q.10.004548
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT2229B.10.000202
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA629B.10.000055
ORF1ab/nsp6143M143IatGatC129B.10.000009
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT2424AY.390.000593
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT2024B.1.20.000176
ORF1ab/nsp6143M143IatGatC324B.1.20.000026
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA124B.1.20.000009
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT1924P.10.000299
ORF1ab/nsp6143M143IatGatC524P.10.000079
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT1121B.1.1770.000145
ORF1ab/nsp6143M143IatGatC821B.1.1770.000105
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA221B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT1919AY.30.000189
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT1619AY.440.000097
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA319AY.440.000018
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT1819B.1.10.000327
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA119B.1.10.000018
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT1617AY.1190.000565
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA117AY.1190.000035
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT1717B.1.1600.00053
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT1717B.1.177.350.011748
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT1717P.1.140.000813
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT1515AY.450.001825
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT1313B.1.438.10.001394
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT1212B.1.5250.001358
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT1111AY.290.000174
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA510AY.1030.000031
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT510AY.1030.000031
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT99AY.200.00035
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT99B.1.6280.003171
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT88AY.420.000322
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT47AY.340.000388
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA37AY.340.000291
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT57AY.4.20.000108
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA27AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT67AY.50.000124
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA17AY.50.000021
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT77B.1.5260.000165
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT66B.1.1.3180.001811
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT66B.1.1.5190.000238
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT66B.1.5950.001566
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT35AY.9.20.00011
ORF1ab/nsp6143M143IatGatC15AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA15AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT55B.1.4270.000252
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT35C.36.30.001702
ORF1ab/nsp6143M143IatGatC25C.36.30.001134
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT44A.270.006623
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT44AY.1200.000149
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT44AY.90.00027
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT44B.1.1.2140.000222
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT44B.1.1.2360.027586
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT44B.1.177.330.006579
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT44B.1.2210.000284
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT34B.1.4290.000071
ORF1ab/nsp6143M143IatGatC14B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT44P.1.150.000929
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT33AY.10.001187
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT33AY.330.0002
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT23AY.46.60.000144
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA13AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA33AY.850.001282
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT33B.1.1.540.009063
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT220.111111
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT22A.2.50.000998
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT22A.23.10.001408
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT22AY.1010.000981
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT12AY.1130.000142
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA12AY.1130.000142
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA22AY.1180.000125
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT22AY.260.000057
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT22AY.4.2.10.000298
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT12AY.470.000031
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA12AY.470.000031
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT22AY.510.001818
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT22AY.60.000082
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT22AZ.10.001735
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT22B.1.1.4090.005666
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT22B.1.177.210.000153
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT22B.1.177.420.001789
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT22B.1.3960.001411
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT22B.1.5640.000852
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT22B.1.5770.001375
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA11A.50.001923
ORF1ab/nsp6143M143IatGatC11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11AY.140.000088
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11AY.160.00038
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11AY.190.00114
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11AY.270.000065
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11AY.360.000148
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA11AY.380.000499
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11AY.460.000104
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11AY.540.000095
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA11AY.590.00053
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA11AY.840.000437
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11AY.980.000079
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA11AY.990.001049
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11B.1.1.100.001115
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11B.1.1.2200.001859
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA11B.1.1.2790.001121
ORF1ab/nsp6143M143IatGatC11B.1.1.2860.002899
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11B.1.1.3160.000925
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11B.1.1.3390.010526
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11B.1.1.3760.005952
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11B.1.1.3890.006061
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11B.1.1700.00431
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11B.1.177.170.000821
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11B.1.177.80.000752
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11B.1.36.390.002217
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11C.370.000116
ORF1ab/nsp6143M143IatGatA11D.20.000075
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11P.1.20.001156
ORF1ab/nsp6143M143IatGatT11Q.20.000613