CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : Mut = L98L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp698L98LL3667LsynttGttA6775400.79763711264-11266
ORF1ab/nsp698L98LL3667LsynTtgCtg6771370.20236311264-11266

Details of the mutation L98L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp698L98LttGttA540677All0.000103
ORF1ab/nsp698L98LTtgCtg137677All0.000026
ORF1ab/nsp698L98LttGttA114168B.1.1.70.000102
ORF1ab/nsp698L98LTtgCtg54168B.1.1.70.000048
ORF1ab/nsp698L98LttGttA127127B.1.4210.947761
ORF1ab/nsp698L98LttGttA8585B.1.3510.002527
ORF1ab/nsp698L98LTtgCtg3044B.1.20.000264
ORF1ab/nsp698L98LttGttA1444B.1.20.000123
ORF1ab/nsp698L98LttGttA1936AY.40.00003
ORF1ab/nsp698L98LTtgCtg1736AY.40.000026
ORF1ab/nsp698L98LttGttA2122B.10.000192
ORF1ab/nsp698L98LTtgCtg122B.10.000009
ORF1ab/nsp698L98LttGttA2222B.1.4270.001111
ORF1ab/nsp698L98LttGttA1313AY.90.000879
ORF1ab/nsp698L98LttGttA1013B.1.617.20.000038
ORF1ab/nsp698L98LTtgCtg313B.1.617.20.000011
ORF1ab/nsp698L98LTtgCtg1111B.1.4410.105769
ORF1ab/nsp698L98LttGttA1010B.1.177.810.001893
ORF1ab/nsp698L98LttGttA99B.1.1.5190.000357
ORF1ab/nsp698L98LttGttA66B.1.3060.034286
ORF1ab/nsp698L98LttGttA55AY.250.00003
ORF1ab/nsp698L98LttGttA55AY.430.000022
ORF1ab/nsp698L98LTtgCtg35AY.440.000018
ORF1ab/nsp698L98LttGttA25AY.440.000012
ORF1ab/nsp698L98LttGttA55B.1.160.260.012107
ORF1ab/nsp698L98LTtgCtg44AY.1160.001147
ORF1ab/nsp698L98LttGttA44AY.290.000063
ORF1ab/nsp698L98LttGttA44AY.39.10.000158
ORF1ab/nsp698L98LttGttA44AY.420.000161
ORF1ab/nsp698L98LTtgCtg44AY.470.000124
ORF1ab/nsp698L98LttGttA44AY.99.20.000369
ORF1ab/nsp698L98LttGttA33AY.1030.000019
ORF1ab/nsp698L98LttGttA33AY.120.10.000963
ORF1ab/nsp698L98LttGttA33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp698L98LttGttA33B.1.1.2840.000322
ORF1ab/nsp698L98LttGttA33B.1.3110.000824
ORF1ab/nsp698L98LttGttA33B.1.4690.01083
ORF1ab/nsp698L98LttGttA33B.1.5770.002062
ORF1ab/nsp698L98LTtgCtg23P.10.000032
ORF1ab/nsp698L98LttGttA13P.10.000016
ORF1ab/nsp698L98LttGttA22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp698L98LttGttA22AY.620.000871
ORF1ab/nsp698L98LttGttA22AY.9.10.000167
ORF1ab/nsp698L98LttGttA22B.1.1.4020.022222
ORF1ab/nsp698L98LttGttA22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp698L98LttGttA22B.1.4000.000858
ORF1ab/nsp698L98LttGttA22B.1.466.20.000782
ORF1ab/nsp698L98LttGttA11A.20.000662
ORF1ab/nsp698L98LTtgCtg11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp698L98LttGttA11AY.1040.001984
ORF1ab/nsp698L98LttGttA11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp698L98LttGttA11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp698L98LttGttA11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp698L98LttGttA11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp698L98LttGttA11AY.200.000039
ORF1ab/nsp698L98LttGttA11AY.230.00007
ORF1ab/nsp698L98LTtgCtg11AY.270.000065
ORF1ab/nsp698L98LttGttA11AY.30.00001
ORF1ab/nsp698L98LTtgCtg11AY.330.000067
ORF1ab/nsp698L98LttGttA11AY.390.000025
ORF1ab/nsp698L98LTtgCtg11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp698L98LttGttA11AY.450.000122
ORF1ab/nsp698L98LttGttA11AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp698L98LttGttA11AY.590.00053
ORF1ab/nsp698L98LttGttA11AY.610.000105
ORF1ab/nsp698L98LttGttA11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp698L98LttGttA11B0.000128
ORF1ab/nsp698L98LttGttA11B.1.130.002375
ORF1ab/nsp698L98LTtgCtg11B.1.160.280.002924
ORF1ab/nsp698L98LTtgCtg11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp698L98LTtgCtg11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp698L98LttGttA11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp698L98LttGttA11B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp698L98LttGttA11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp698L98LTtgCtg11D.20.000075
ORF1ab/nsp698L98LttGttA11P.1.150.000232