CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : Mut = L19L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp619L19LL3588LsynttGttA3192780.87147311027-11029
ORF1ab/nsp619L19LL3588LsynTtgCtg319390.12225711027-11029
ORF1ab/nsp619L19LL3588LsynTtGCtC31910.003134811027-11029
ORF1ab/nsp619L19LL3588LsynTtGCtT31910.003134811027-11029

Details of the mutation L19L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp619L19LttGttA278319All0.000053
ORF1ab/nsp619L19LTtgCtg39319All0.000007
ORF1ab/nsp619L19LTtGCtT1319All0
ORF1ab/nsp619L19LTtGCtC1319All0
ORF1ab/nsp619L19LttGttA126126B.1.1.1630.961832
ORF1ab/nsp619L19LttGttA3441B.1.1.70.00003
ORF1ab/nsp619L19LTtgCtg741B.1.1.70.000006
ORF1ab/nsp619L19LttGttA1818AY.40.000028
ORF1ab/nsp619L19LttGttA1818B.1.3510.000535
ORF1ab/nsp619L19LTtgCtg1011AY.330.000668
ORF1ab/nsp619L19LttGttA111AY.330.000067
ORF1ab/nsp619L19LttGttA1111B.1.36.360.006623
ORF1ab/nsp619L19LttGttA89B.10.000073
ORF1ab/nsp619L19LTtgCtg19B.10.000009
ORF1ab/nsp619L19LttGttA77AY.290.00011
ORF1ab/nsp619L19LttGttA56AY.1190.000177
ORF1ab/nsp619L19LTtgCtg16AY.1190.000035
ORF1ab/nsp619L19LttGttA45B.1.10.000073
ORF1ab/nsp619L19LTtgCtg15B.1.10.000018
ORF1ab/nsp619L19LttGttA55B.1.1460.021186
ORF1ab/nsp619L19LttGttA55B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp619L19LTtgCtg44AY.1000.000184
ORF1ab/nsp619L19LttGttA44AY.4.50.00043
ORF1ab/nsp619L19LTtgCtg34D.20.000225
ORF1ab/nsp619L19LTtGCtT14D.20.000075
ORF1ab/nsp619L19LttGttA33AY.440.000018
ORF1ab/nsp619L19LTtgCtg220.111111
ORF1ab/nsp619L19LttGttA12AY.1030.000006
ORF1ab/nsp619L19LTtGCtC12AY.1030.000006
ORF1ab/nsp619L19LTtgCtg12AY.230.00007
ORF1ab/nsp619L19LttGttA12AY.230.00007
ORF1ab/nsp619L19LttGttA22AY.910.001461
ORF1ab/nsp619L19LttGttA12B.1.130.002375
ORF1ab/nsp619L19LTtgCtg12B.1.130.002375
ORF1ab/nsp619L19LttGttA22B.1.4280.002041
ORF1ab/nsp619L19LttGttA22P.10.000032
ORF1ab/nsp619L19LttGttA11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp619L19LttGttA11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp619L19LTtgCtg11AY.190.00114
ORF1ab/nsp619L19LTtgCtg11AY.200.000039
ORF1ab/nsp619L19LttGttA11AY.250.000006
ORF1ab/nsp619L19LttGttA11AY.430.000004
ORF1ab/nsp619L19LttGttA11AY.750.000056
ORF1ab/nsp619L19LttGttA11AY.980.000079
ORF1ab/nsp619L19LTtgCtg11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp619L19LttGttA11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp619L19LttGttA11B.1.1.1230.017857
ORF1ab/nsp619L19LttGttA11B.1.1.1920.002309
ORF1ab/nsp619L19LttGttA11B.1.1.1940.00495
ORF1ab/nsp619L19LttGttA11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp619L19LttGttA11B.1.1.3090.005848
ORF1ab/nsp619L19LTtgCtg11B.1.1.3110.000358
ORF1ab/nsp619L19LTtgCtg11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp619L19LTtgCtg11B.1.1.470.005348
ORF1ab/nsp619L19LttGttA11B.1.1.580.005376
ORF1ab/nsp619L19LttGttA11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp619L19LTtgCtg11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp619L19LttGttA11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp619L19LttGttA11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp619L19LttGttA11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp619L19LTtgCtg11B.1.4220.000812
ORF1ab/nsp619L19LttGttA11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp619L19LttGttA11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp619L19LttGttA11C.370.000116