CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : Mut = K263R

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp6263K263RK3832RnonsynaAgaGg1781760.98876411759-11761
ORF1ab/nsp6263K263RK3832RnonsynaAGaGA17820.01123611759-11761

Details of the mutation K263R within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg176178All0.000034
ORF1ab/nsp6263K263RaAGaGA2178All0
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg3030B.1.1.70.000027
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg1313B.1.617.20.000049
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg1313P.1.140.000621
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg1212B.1.1.2220.002448
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg1010AY.430.000044
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg99AY.40.000014
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg88B.1.5260.000188
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg77B.1.20.000062
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg77B.1.6370.000512
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg66AY.230.000418
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg66B.10.000055
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg55AY.46.40.000823
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg55B.1.2580.000333
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg33B.1.1.1280.021277
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg33B.1.4330.009585
ORF1ab/nsp6263K263RaAGaGA220.111111
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg22AY.1030.000012
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg22AY.200.000078
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg22AY.260.000057
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg22AY.30.00002
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg22B.1.351.20.000605
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg22B.1.4000.000858
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg22B.1.6090.000959
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg11AY.290.000016
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg11AY.50.000021
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg11B.1.1.2410.00207
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg11B.1.1.4860.001577
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg11B.1.3750.00082
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg11B.1.3800.006623
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg11P.10.000016
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg11Q.30.000145
ORF1ab/nsp6263K263RaAgaGg11Q.40.000455