CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : Mut = I162V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp6162I162VI3731VnonsynAttGtt1185381185330.99995811456-11458
ORF1ab/nsp6162I162VI3731VnonsynAtTGtA11853840.000033744511456-11458
ORF1ab/nsp6162I162VI3731VnonsynAtTGtC11853810.0000084361111456-11458

Details of the mutation I162V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt118533118538All0.022671
ORF1ab/nsp6162I162VAtTGtA4118538All0.000001
ORF1ab/nsp6162I162VAtTGtC1118538All0
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt100356100357AY.30.99818
ORF1ab/nsp6162I162VAtTGtC1100357AY.30.00001
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt1172511725AY.3.10.999659
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt956956B.1.617.20.0036
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt634634AY.250.003813
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt626626AY.1170.052907
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt468468AY.920.134444
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt446446AY.470.013873
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt325325AY.1190.011475
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt226226AY.840.098863
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt200200AY.1050.128617
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt178178AY.5.30.060054
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt147147AY.1030.000913
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt142142AY.46.60.010253
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt135135AY.4.20.002928
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt133133AY.50.002746
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt112112AY.420.004506
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt102102AY.40.000159
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt100100AY.1020.002651
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt9797AY.230.006766
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt8585AY.1160.024376
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt8383AY.440.000505
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt8282AY.1130.011676
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt6565AY.1100.007325
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt6565AY.430.000288
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt5656B.1.1.70.00005
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt4848AY.390.001186
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt4747AY.1060.01574
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt4747AY.450.005719
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt4444AY.950.033486
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt4141B.10.000376
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt3939AY.730.025948
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt3939B0.004985
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt3737AY.460.003851
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt3636AY.790.043584
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt3434AY.990.035677
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt2929AY.550.026606
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt2828AY.620.0122
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt2727AY.1180.001692
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt2424AY.820.032564
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt2222AY.46.10.022587
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt2222AY.540.002098
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt2222AY.850.009398
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt2020AY.960.041494
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt1919AY.910.013879
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt1919B.1.20.000167
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt1818AY.200.0007
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt1717AY.1140.003929
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt1414AY.39.10.000555
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt1313AY.590.006886
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt1313B.1.5960.001133
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt1212AY.260.00034
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt1111AY.930.003004
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt1111AY.98.10.000533
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt99AY.320.004792
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt99AY.580.008167
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt99AY.70.001764
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt99AY.710.004276
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt99AY.750.000504
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt99AY.99.20.000829
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt88AY.370.002528
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt88AY.380.003994
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt88AY.410.002352
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt88AY.630.003095
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt88AY.690.001493
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt88AY.9.20.000294
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt77AY.1080.007718
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt77AY.570.004593
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt77P.10.00011
ORF1ab/nsp6162I162VAtTGtA460.222222
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt260.111111
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt66AY.1200.000223
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt55AY.130.000805
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt55AY.900.003422
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt55B.1.3510.000149
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt44AY.330.000267
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt44AY.4.30.003367
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt44AY.680.001095
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt44AY.700.000834
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt44AY.740.000463
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt44AY.75.10.000721
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt44AY.880.003537
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt33AY.1110.000549
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt33AY.340.000291
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt33B.1.258.170.000312
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt22AU.20.004843
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt22AY.1000.000092
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt22AY.1010.000981
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt22AY.46.20.001271
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt22AY.5.40.000553
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt22AY.60.000082
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt22AY.670.000929
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt22AY.7.20.001119
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt22B.1.1.3750.02381
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt22B.1.1890.008584
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt22B.1.4740.003802
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt22B.1.6040.034483
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt22D.20.00015
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11AY.160.00038
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11AY.360.000148
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11AY.530.000288
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11AY.610.000105
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11AY.650.000533
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11AY.90.000068
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11AY.980.000079
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11B.1.177.230.003236
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11B.1.3620.001541
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11B.1.4360.001029
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11B.1.5600.00463
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11B.1.5800.004065
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11B.1.6000.005848
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp6162I162VAttGtt11P.1.120.000484