CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : Mut = F108del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp6108F108delF3677deldelTTT---13505371350537111294-11296

Details of the mutation F108del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---13505371350537All0.258306
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---10809041080904B.1.1.70.96765
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---6182461824P.10.973974
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---4158541585B.1.5260.977436
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---3101131011B.1.3510.921849
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---2083120831P.1.140.995746
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---1337313373B.1.6370.977201
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---84138413B.1.5250.95202
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---82438243C.370.956708
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---77127712Q.10.974229
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---66756675Q.30.968093
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---60256025Q.80.993569
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---60006000P.1.170.97056
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---39513951P.1.150.917983
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---36003600P.1.100.970089
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---32133213B.1.1.3180.969523
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---32123212B.1.351.20.971861
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---30493049P.1.70.973499
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---29882988B.10.027369
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---29492949B.1.10.053498
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---26752675B.1.6280.942565
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---26522652P.1.160.992144
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---24912491P.1.10.791296
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---21162116Q.40.962256
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---19291929P.1.120.933688
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---15711571B.1.351.50.941847
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---15411541B.1.619.10.988454
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11991199AZ.20.984401
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11521152AZ.10.999133
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11391139P.1.17.10.9965
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11331133B.1.351.30.992989
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11271127B.1.6190.981707
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11011101P.1.130.989218
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---10561056B.1.6200.999054
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---10151015P.1.40.991211
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---975975B.1.214.20.584532
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---895895Q.70.994444
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---840840P.1.20.971098
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---630630AZ.30.957447
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---611611Q.20.374847
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---513513P.1.60.998054
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---390390B.1.6250.917647
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---383383B.1.4700.537921
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---367367C.37.10.960733
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---284284B.1.6340.972603
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---279279AZ.40.936242
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---231231C.1.20.982979
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---226226AZ.50.792982
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---206206P.1.80.985646
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---205205P.1.90.985577
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---200200B.1.1.5280.961538
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---195195AV.10.984848
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---194194B.1.2410.157468
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---190190B.1.6300.994764
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---188188B.1.3750.154098
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---150150Q.60.993377
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---148148B.1.177.730.083805
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---143143B.1.1.5250.781421
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---143143B.1.6360.959732
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---122122P.1.10.10.99187
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---121121AZ.2.10.98374
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---119119AZ.61
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---112112B.1.1700.482759
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---9797P.1.110.989796
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---8080B.1.1.5070.695652
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---7474AY.440.00045
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---7474B.1.617.20.000279
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---6767B.1.1.2050.249071
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---6363B.1.177.70.010386
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---5959Q.51
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---5656B0.007157
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---5656B.1.2210.003978
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---5252B.1.1770.000685
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---4646B.1.6391
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---4545B.1.20.000396
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---4545B.1.243.11
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---4242AY.430.000186
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---4141B.1.1.4090.116147
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---3939B.1.258.170.004055
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---3737B.1.1.3120.070746
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---3232B.1.1.280.00996
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---3232B.1.36.290.016555
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---2929B.1.6230.015558
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---2929P.1.31
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---2828B.1.1.5190.001112
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---2828C.36.3.10.076087
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---2727B.1.1.2200.050186
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---2626B.1.214.30.185714
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---2525AY.290.000394
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---2424B.1.1600.000749
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---2424B.1.4290.000565
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---2424P.1.10.21
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---2323AY.680.006296
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---2222AY.260.000623
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---2121AY.1160.006022
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---2121B.1.1.1610.074205
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---2121B.1.1.3060.009206
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---1919B.1.6381
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---1818B.1.2370.089552
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---1818B.1.6090.008629
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---1717B.1.5960.001481
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---1515A.2.50.007485
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---1414AY.30.000139
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---1313P.1.51
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---1212B.1.6210.001062
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---1111AY.1030.000068
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---1111AY.390.000272
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---1111AY.450.001339
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---1111B.1.2580.000732
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---1010AY.46.60.000722
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---1010B.1.1.2940.012658
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ORF1ab/nsp6108F108delTTT---99AY.250.000054
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ORF1ab/nsp6108F108delTTT---88B.1.1.3750.095238
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---77AT.10.035897
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---77AY.1020.000186
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---77AY.9.20.000257
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---77B.1.1.340.092105
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---77B.1.3240.011236
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---77B.1.360.001021
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---77B.1.4110.025926
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---66AY.330.000401
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---66AY.420.000241
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ORF1ab/nsp6108F108delTTT---550.277778
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---55AY.200.000194
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---55AY.340.000485
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ORF1ab/nsp6108F108delTTT---55AY.560.008026
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---55B.1.1.10.001633
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---55B.1.1.100.005574
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---55B.1.1.700.001705
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ORF1ab/nsp6108F108delTTT---55B.1.2140.018315
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---55B.1.258.140.004902
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---55B.1.5330.048077
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---55B.1.5750.001517
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---55C.36.30.002836
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---55C.390.09434
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---44AY.1210.000541
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---44AY.4.2.10.000596
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---44B.1.1.1420.070175
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---44B.1.1.3720.002755
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---44B.1.1.5240.083333
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---44B.1.177.810.000757
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---44B.1.4270.000202
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---44B.1.617.10.000516
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---44B.1.6180.016129
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---44C.10.009569
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---44D.20.0003
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---44P.50.054795
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---44R.10.00036
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---33AY.1130.000427
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---33AY.16.10.00141
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---33AY.46.20.001906
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---33AY.50.000062
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---33AY.600.002814
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---33B.1.1.1410.006036
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---33B.1.1.2410.006211
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---33B.1.1.3890.018182
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---33B.1.1.390.001529
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---33B.1.1.4320.003797
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---33B.1.177.600.000655
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---33B.1.3110.000824
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---33B.1.3670.002377
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---33B.1.5610.001191
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---33B.1.5800.012195
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---33P.20.00056
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22AY.1170.000169
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22AY.350.000466
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22AY.480.00093
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22AY.540.000191
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22AY.7.20.001119
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22AY.750.000112
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22AY.980.000158
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22B.1.1.1170.019417
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22B.1.1.2540.022472
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22B.1.1.2690.002706
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22B.1.1.2910.001485
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22B.1.1.2990.02439
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22B.1.1.3020.004149
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22B.1.1.3170.000823
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22B.1.1.370.000386
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22B.1.1.3700.025316
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22B.1.1.4340.000697
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22B.1.1.5230.003125
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22B.1.1.540.006042
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22B.1.177.310.022989
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22B.1.177.60.001953
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22B.1.3490.00143
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22B.1.351.10.076923
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22B.550.0059
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22C.360.001821
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---22P.30.00319
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11A0.000387
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11A.10.000282
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11AE.80.000489
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11AY.10.000396
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11AY.120.2.10.000498
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11AY.190.00114
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11AY.20.000356
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11AY.300.000396
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11AY.580.000907
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11AY.590.00053
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11AY.60.000041
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11AY.610.000105
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11AY.620.000436
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11AY.670.000464
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11AY.700.000209
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11AY.710.000475
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11AY.780.001541
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11AY.850.000427
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11AY.910.00073
ORF1ab/nsp6108F108delTTT---11AY.930.000273
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