CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : Mut = C197C

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp6197C197CC3766CsyntgCtgT45424542111561-11563

Details of the mutation C197C within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT45424542All0.000869
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT10961096AY.390.027084
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT10211021B.1.617.20.003844
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT355355B.1.1.70.000318
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT222222B.1.160.240.982301
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT177177AY.40.000275
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT9494AY.540.008963
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT9191B.1.20.000801
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT8686AY.1030.000534
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT8282B.1.360.011964
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT7272B.1.5260.001692
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT6464B.1.10.001161
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT5757B.1.1610.982759
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT5252AY.440.000317
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT5151B.1.4270.002575
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT4444R.10.00396
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT4343B.10.000394
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT4040AY.30.000398
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT3535AY.430.000155
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT3333AY.290.000521
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT3030C.370.003482
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT2929AY.1000.001334
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT2929P.10.000457
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT2828AY.1020.000742
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT2626AY.470.000809
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT2626B.1.177.810.004922
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT2525B.1.1.5190.000993
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT2525B.1.177.730.014156
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT2020AY.39.10.000792
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT2020B.1.1.4151
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1919AY.50.000392
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1818AY.1170.001521
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1717B.1.1770.000224
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1717B.1.2320.009135
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1717B.1.258.170.001768
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1717B.1.5750.005158
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1515B.1.4000.006435
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1414AY.980.001106
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1313B.1.4560.042484
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1212B.1.3510.000357
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1212B.1.3910.013529
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1010AY.940.004427
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT99AY.250.000054
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT99AY.4.20.000195
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT99AY.420.000362
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT99B.1.2580.000599
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT88AY.160.003037
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT88AY.230.000558
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT88B.1.1600.00025
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT88B.1.177.70.001319
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT77AY.120.002212
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT77AY.460.000729
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT77B.1.177.600.001529
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT66AY.360.000889
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT66AY.680.001642
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT66B.1.4290.000141
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT66B.1.6210.000531
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT55A.2.50.002495
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT55A.270.008278
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT55AY.260.000142
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT55AY.70.00098
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT55B.1.5610.001985
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT55B.1.6090.002397
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT55B.400.001821
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT440.222222
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44A.23.10.002817
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44AY.1070.001864
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44AY.1190.000141
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44AY.120.10.001284
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44AY.200.000155
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44AY.330.000267
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44AY.34.10.00204
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44AY.60.000165
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44AY.99.20.000369
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44B.1.1.3110.001433
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44B.1.1.330.001684
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44B.1.1.4200.004024
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44B.1.4330.01278
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44B.1.5250.000453
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44Q.20.002454
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33AY.1060.001005
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33AY.1100.000338
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33AY.1110.000549
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33AY.1160.00086
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33AY.140.000264
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33AY.340.000291
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33AY.410.000882
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33AY.46.50.000595
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33AY.610.000314
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33AZ.20.002463
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33B.1.1.700.001023
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33B.1.140.052632
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33B.1.177.40.000633
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33B.1.438.10.000322
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33D.20.000225
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33P.1.150.000697
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.20.000712
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.3.10.000171
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.300.000791
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.450.000243
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.5.30.000675
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.550.001835
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.590.001059
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.810.003984
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.840.000875
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B0.000256
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.1.2140.000111
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.1.2940.002532
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.1.3480.001592
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.1.3980.006452
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.1690.029851
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.2340.000264
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.258.20.009009
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.351.20.000605
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.4030.006536
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.4160.002538
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.4990.002101
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.5640.000852
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.621.10.001012
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22C.230.011628
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22P.20.000373
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22P.30.00319
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22Q.80.00033
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11A0.000387
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AD.20.000219
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AU.20.002421
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.1040.001984
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.110.001339
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.210.001898
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.270.000065
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.320.000532
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.380.000499
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.570.000656
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.580.000907
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.750.000056
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.920.000287
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.1350.004695
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.1610.003534
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.1700.001247
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.1980.001468
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.3070.002532
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.3390.010526
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.4640.001473
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.570.011494
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.830.00271
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.110.30.000718
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1460.004237
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.177.690.001484
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.177.80.000752
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.2390.001221
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.258.110.000396
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.30.002618
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.3060.005714
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.351.50.0006
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.36.100.004785
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.36.160.001425
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.36.260.002857
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.4280.00102
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.4970.000315
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.5050.004386
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.5200.021739
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.5230.002451
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.5990.00365
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.6020.006536
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.6190.000871
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.6320.006711
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.550.00295
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11P.1.140.000048