CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : CodonNum = 92 & Codon = aCg

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp692M92TM3661TnonsynaTgaCg1321310.99242411246-11248

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg131132All0.000025
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg3838B.1.1.70.000034
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg2222P.1.160.00823
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg99AY.60.00037
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg88AY.440.000049
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg55AY.40.000008
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg55B.1.4290.000118
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg55P.10.000079
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg44A.2.50.001996
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg44B.1.10.000073
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg33AY.39.10.000119
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg33B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg22AY.1180.000125
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg22AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg11AY.140.000088
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg11AY.230.00007
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg11AY.290.000016
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg11AY.30.00001
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg11AY.330.000067
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg11AY.350.000233
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg11AY.430.000004
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg11B.10.000009
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg11B.1.1.4420.018519
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg11B.1.1.80.003584
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg11B.1.5510.00129
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg11B.1.5880.00091
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp692M92TaTgaCg11B.1.6280.000352