CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : CodonNum = 84 & Codon = gtT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp684V84VV3653VsyngtCgtT454144210.97357411222-11224

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT44214541All0.000846
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT865865B.1.36.10.986317
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT475476B.1.617.20.001789
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT381381B.1.4270.01924
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT326326B.1.3980.970238
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT292294B.1.1.70.000261
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT289289AY.250.001738
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT256264AY.430.001134
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT252258B.10.002308
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT133165AY.40.000207
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT7878B.1.214.20.046763
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT7575AY.1030.000466
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT6969B.1.3510.002051
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT5555AY.1020.001458
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT5454B.1.177.630.145946
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT5353AY.1190.001871
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT5151B.1.1.3110.018266
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT4545AY.440.000274
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT4343AY.930.011742
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT4141AY.30.000408
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT3535B.1.20.000308
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT3131P.10.000488
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT3030AY.360.004446
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT2930B.1.10.000526
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT2727AY.420.001086
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT2525AY.390.000618
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT2323B.1.1770.000303
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT1818AY.750.001008
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT1515B.1.4290.000353
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT214AY.1200.000074
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT1414AY.290.000221
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT1313AY.230.000907
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT1212B.1.1.280.003735
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT1111B.1.1600.000343
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT1111B.1.6210.000974
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT110AY.470.000031
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT1010B.1.6310.03367
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT88AY.260.000226
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT88AY.460.000833
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT77AY.9.10.000586
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT77B.1.351.20.002118
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT77B.1.6200.006623
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT56AY.200.000194
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT66B.1.1.2220.001224
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT66B.1.3110.001647
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT66B.1.5260.000141
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT35AY.580.002722
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT55B.1.2430.000348
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT55B.1.2580.000333
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT45B.1.5960.000349
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT55C.370.00058
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT44AY.10.001583
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT44AY.450.000487
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT44AY.50.000083
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT44AY.900.002738
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT44B.1.4000.001716
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT44P.1.140.000191
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33AY.1000.000138
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33AY.1090.002219
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33AY.1170.000254
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT23AY.39.10.000079
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33AY.4.2.10.000447
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33AY.480.001395
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33AY.820.004071
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT23AY.870.001665
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33AY.980.000237
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33B.1.1.3060.001315
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33B.1.120.024
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33B.1.2210.000213
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33B.1.5090.002597
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33B.1.5510.003871
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22A.2.5.10.009615
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22AY.1060.00067
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22AY.320.001065
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22AY.4.40.000818
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22AY.410.000588
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22AY.490.00639
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22AY.840.000875
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22AY.990.002099
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22AY.99.20.000184
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.1.1920.004619
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.1.2910.001485
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.1.3280.033898
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.1.3480.001592
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.1.370.000386
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.1.390.001019
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.1.4340.000697
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.177.20.009091
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.177.310.022989
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.1990.008264
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.2340.000264
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.2400.000431
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.360.000292
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.5110.068966
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.5750.000607
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.5770.001375
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22P.1.170.000324
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22P.50.027397
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22Q.30.00029
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.100.00053
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.130.000161
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.330.000067
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.39.1.10.000725
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.4.10.000737
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.530.000288
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.60.000041
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.610.000105
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.630.000387
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.690.000187
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.70.000196
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.700.000209
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.790.001211
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.1380.006061
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.1760.000439
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.1890.001513
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.1960.005714
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.2100.005714
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.2170.003636
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.3030.002762
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.3350.012987
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.3690.000446
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.4640.001473
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.510.001718
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.5260.003546
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1100.004525
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.177.100.000878
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.177.50.001242
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.177.620.001192
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.177.750.001041
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.177.860.000183
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.2240.025
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.2320.000537
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.2390.001221
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.36.80.001
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.3970.004854
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.4090.000781
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.4560.003268
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.4710.002732
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.5200.021739
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.5330.009615
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.5660.019231
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.5670.003333
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.5900.004545
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11D.20.000075
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11N.90.005952
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11P.30.001595
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11W.40.001351