CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : CodonNum = 84

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp684V84FV3653FnonsynGtcTtc477347660.99853311222-11224
ORF1ab/nsp684V84FV3653FnonsynGtCTtT477370.0014665811222-11224
ORF1ab/nsp684V84VV3653VsyngtCgtT454144210.97357411222-11224
ORF1ab/nsp684V84VV3653VsyngtCgtA45411110.02444411222-11224
ORF1ab/nsp684V84VV3653VsyngtCgtG454190.0019819411222-11224
ORF1ab/nsp684V84IV3653InonsynGtcAtc345345111222-11224
ORF1ab/nsp684V84AV3653AnonsyngTcgCc9191111222-11224
ORF1ab/nsp684V84delV3653deldelGTC---2222111222-11224
ORF1ab/nsp684V84LV3653LnonsynGtcCtc88111222-11224
ORF1ab/nsp684V84DV3653DnonsyngTcgAc22111222-11224
ORF1ab/nsp684V84del1V3653del1delGTC-AA11111222-11224
ORF1ab/nsp684V84NV3653NnonsynGTcAAc11111222-11224

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc47664773All0.000912
ORF1ab/nsp684V84FGtCTtT74773All0.000001
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT44214541All0.000846
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA1114541All0.000021
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtG94541All0.000002
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc14861486B.10.013611
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT865865B.1.36.10.986317
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc623629B.1.1.5230.973437
ORF1ab/nsp684V84FGtCTtT6629B.1.1.5230.009375
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc570570B.1.36.310.998249
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT475476B.1.617.20.001789
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA1476B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc416416B.1.1.3740.988124
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT381381B.1.4270.01924
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc345345All0.000066
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT326326B.1.3980.970238
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT292294B.1.1.70.000261
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA2294B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT289289AY.250.001738
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT256264AY.430.001134
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA8264AY.430.000035
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT252258B.10.002308
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA6258B.10.000055
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc177177B.1.10.003211
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc169169B.1.6260.965714
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT133165AY.40.000207
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA32165AY.40.00005
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc145145B.1.360.021156
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc132132B.1.6320.885906
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc9191All0.000017
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc8888B.1.1.2220.017952
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc8080B.1.1600.002495
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc7979B.1.1.3060.034634
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT7878B.1.214.20.046763
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc7676B.1.1.1630.580153
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT7575AY.1030.000466
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT6969B.1.3510.002051
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc6565B.1.20.000572
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc6565B.1.617.20.000245
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc5959B.1.2360.12115
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT5555AY.1020.001458
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT5454B.1.177.630.145946
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT5353AY.1190.001871
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT5151B.1.1.3110.018266
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc4747AY.250.000283
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT4545AY.440.000274
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT4343AY.930.011742
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT4141AY.30.000408
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc4040AY.430.000177
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc3939B.1.20.000343
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc3838AY.4.20.000824
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc3737B.1.1.70.000033
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT3535B.1.20.000308
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc3232B.1.1.70.000029
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc3232B.1.1770.000421
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc3232B.1.617.20.00012
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc3131B.1.36.160.04416
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc3131B.1.5400.300971
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT3131P.10.000488
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT3030AY.360.004446
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT2930B.1.10.000526
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA130B.1.10.000018
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT2727AY.420.001086
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT2525AY.390.000618
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA2323AY.4.50.002472
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT2323B.1.1770.000303
ORF1ab/nsp684V84delGTC---2222All0.000004
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT1818AY.750.001008
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc1717AY.40.000026
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc1717B.1.6090.00815
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc1616AY.430.000071
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc1616B.1.36.290.008277
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc1515B.1.1.5000.3
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT1515B.1.4290.000353
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc1515B.1.5540.066079
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA1214AY.1200.000446
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT214AY.1200.000074
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT1414AY.290.000221
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc1414B.1.2580.000932
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT1313AY.230.000907
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc1313B.1.1.5190.000516
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc1313B.1.36.80.013
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc1212B0.001534
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT1212B.1.1.280.003735
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc1212B.1.2400.002587
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc1111AY.1110.002015
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc1111AY.1160.003155
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT1111B.1.1600.000343
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT1111B.1.6210.000974
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtG910AY.470.00028
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT110AY.470.000031
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc1010B.10.000092
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT1010B.1.6310.03367
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc99B.1.1.120.067164
ORF1ab/nsp684V84LGtcCtc88All0.000002
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT88AY.260.000226
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc88AY.330.000534
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc88AY.440.000049
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT88AY.460.000833
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc88B.1.1990.033058
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc77AY.1050.004502
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc77AY.420.000282
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT77AY.9.10.000586
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc77AY.920.002011
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc77B.1.1.2410.014493
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc77B.1.1.470.037433
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc77B.1.1770.000092
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT77B.1.351.20.002118
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc77B.1.36.170.003458
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT77B.1.6200.006623
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT56AY.200.000194
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA16AY.200.000039
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc66AY.40.000009
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc66AY.60.000247
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc66AY.910.004383
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc66AY.950.004566
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc66B.1.1.1740.02027
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc66B.1.1.1920.013857
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT66B.1.1.2220.001224
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc66B.1.1.250.003411
ORF1ab/nsp684V84delGTC---66B.1.1.70.000005
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc66B.1.1310.052632
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc66B.1.177.570.001686
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc66B.1.230.036364
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT66B.1.3110.001647
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc66B.1.4080.02214
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc66B.1.4290.000141
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT66B.1.5260.000141
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc66B.1.5380.048387
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc66B.4.10.113208
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA55A0.001935
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc55AY.1210.000677
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc55AY.40.000008
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT35AY.580.002722
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA25AY.580.001815
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA55AY.90.000338
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc55B.1.1.1890.007564
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc55B.1.1.3880.227273
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc55B.1.1.4620.043103
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT55B.1.2430.000348
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT55B.1.2580.000333
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT45B.1.5960.000349
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA15B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc55B.1.6370.000365
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT55C.370.00058
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT44AY.10.001583
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc44AY.1020.000106
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc44AY.250.000024
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT44AY.450.000487
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT44AY.50.000083
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA44AY.80.002424
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT44AY.900.002738
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc44AY.98.10.000194
ORF1ab/nsp684V84LGtcCtc44B.1.10.000073
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc44B.1.1.1610.014134
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc44B.1.1.2630.006231
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc44B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc44B.1.2430.000278
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT44B.1.4000.001716
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc44B.1.4710.010929
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT44P.1.140.000191
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33AY.1000.000138
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33AY.1090.002219
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33AY.1170.000254
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc33AY.300.001187
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT23AY.39.10.000079
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA13AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33AY.4.2.10.000447
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc33AY.460.000312
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33AY.480.001395
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33AY.820.004071
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT23AY.870.001665
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA13AY.870.000833
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33AY.980.000237
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc33B.1.1.1340.034091
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc33B.1.1.2160.002671
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33B.1.1.3060.001315
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc33B.1.1.4320.003797
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc33B.1.1.5060.111111
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33B.1.120.024
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33B.1.2210.000213
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc33B.1.258.170.000312
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc33B.1.36.220.003623
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc33B.1.3690.000856
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc33B.1.4390.017751
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33B.1.5090.002597
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT33B.1.5510.003871
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc33B.1.5960.000261
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc33B.1.617.20.000011
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22A.2.5.10.009615
ORF1ab/nsp684V84DgTcgAc22All0
ORF1ab/nsp684V84LGtcCtc22AY.1030.000012
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc22AY.1030.000012
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22AY.1060.00067
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc22AY.1210.000271
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22AY.320.001065
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc22AY.390.000049
ORF1ab/nsp684V84delGTC---22AY.40.000003
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22AY.4.40.000818
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22AY.410.000588
ORF1ab/nsp684V84delGTC---22AY.430.000009
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc22AY.440.000012
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22AY.490.00639
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc22AY.50.000041
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22AY.840.000875
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22AY.990.002099
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22AY.99.20.000184
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.1.1920.004619
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc22B.1.1.1980.002937
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.1.2910.001485
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc22B.1.1.2910.001485
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.1.3280.033898
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc22B.1.1.3350.025974
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.1.3480.001592
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.1.370.000386
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.1.390.001019
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc22B.1.1.4090.005666
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.1.4340.000697
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc22B.1.1.540.006042
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc22B.1.1170.025
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.177.20.009091
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.177.310.022989
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.1990.008264
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.2340.000264
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.2400.000431
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.360.000292
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc22B.1.36.100.009569
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc22B.1.3810.015625
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc22B.1.3960.001411
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc22B.1.4270.000101
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.5110.068966
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc22B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc22B.1.5270.007407
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc22B.1.5650.001621
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.5750.000607
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22B.1.5770.001375
ORF1ab/nsp684V84delGTC---22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc22B.1.6230.001073
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc22B.400.000729
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc22P.10.000032
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc22P.10.000032
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22P.1.170.000324
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22P.50.027397
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT22Q.30.00029
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11A.190.009434
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11A.2.20.001689
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11A.280.002646
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11A.300.142857
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11AE.40.043478
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc11AE.80.000489
ORF1ab/nsp684V84NGTcAAc11All0
ORF1ab/nsp684V84del1GTC-AA11All0
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.100.00053
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11AY.100.00053
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA11AY.110.001339
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA11AY.120.20.001285
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.130.000161
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11AY.160.00038
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA11AY.170.008197
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc11AY.200.000039
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11AY.250.000006
ORF1ab/nsp684V84delGTC---11AY.250.000006
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11AY.30.00001
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.330.000067
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11AY.330.000067
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.39.1.10.000725
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.4.10.000737
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp684V84delGTC---11AY.420.00004
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc11AY.440.000006
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11AY.460.000104
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc11AY.50.000021
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc11AY.520.000814
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.530.000288
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc11AY.530.000288
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.60.000041
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.610.000105
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.630.000387
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.690.000187
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.70.000196
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.700.000209
ORF1ab/nsp684V84del1GTC-AA11AY.710.000475
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc11AY.720.001361
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11AY.750.000056
ORF1ab/nsp684V84delGTC---11AY.750.000056
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11AY.780.001541
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11AY.790.001211
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11AY.980.000079
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA11B0.000128
ORF1ab/nsp684V84delGTC---11B.10.000009
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc11B.10.000009
ORF1ab/nsp684V84NGTcAAc11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1.1350.004695
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.1380.006061
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc11B.1.1.1760.000439
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.1760.000439
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1.1760.000439
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.1890.001513
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1.1940.00495
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.1960.005714
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1.2000.007463
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.2100.005714
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp684V84delGTC---11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.2170.003636
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1.2820.011628
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.3030.002762
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.3350.012987
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1.340.013158
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1.3630.005988
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.3690.000446
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1.3970.002252
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1.3980.003226
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1.4370.010417
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1.440.00241
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.4640.001473
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1.4860.001577
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.510.001718
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.5260.003546
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1.560.017857
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp684V84LGtcCtc11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1.990.02381
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.1100.004525
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1130.015625
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.1280.000635
ORF1ab/nsp684V84LGtcCtc11B.1.160.70.002079
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.177.100.000878
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.177.350.000691
ORF1ab/nsp684V84delGTC---11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.177.50.001242
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.177.620.001192
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.177.650.000665
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.177.750.001041
ORF1ab/nsp684V84delGTC---11B.1.177.760.002494
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.177.860.000183
ORF1ab/nsp684V84DgTcgAc11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc11B.1.2060.000816
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.2100.002132
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.2140.003663
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.2240.025
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.2290.009709
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.2320.000537
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc11B.1.2390.001221
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.2390.001221
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.2470.014925
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.3290.000608
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.3360.002439
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.3500.002933
ORF1ab/nsp684V84DgTcgAc11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.36.80.001
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.3660.004878
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.3870.04
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.3890.001002
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.3970.004854
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.4040.001302
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.4090.000781
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.4260.001009
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc11B.1.4280.00102
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc11B.1.4360.001029
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.4380.006536
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.4560.003268
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.4710.002732
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.4850.014925
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.5050.004386
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.5200.021739
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.5330.009615
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc11B.1.5600.00463
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.5660.019231
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.5670.003333
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.5900.004545
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA11B.1.5990.00365
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtA11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11B.1.780.008547
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc11B.400.000364
ORF1ab/nsp684V84AgTcgCc11D.20.000075
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11D.20.000075
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc11D.20.000075
ORF1ab/nsp684V84delGTC---11N.40.004255
ORF1ab/nsp684V84FGtCTtT11N.80.03125
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11N.90.005952
ORF1ab/nsp684V84delGTC---11P.1.150.000232
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11P.30.001595
ORF1ab/nsp684V84delGTC---11Q.80.000165
ORF1ab/nsp684V84IGtcAtc11Q.80.000165
ORF1ab/nsp684V84FGtcTtc11R.10.00009
ORF1ab/nsp684V84VgtCgtT11W.40.001351