CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : CodonNum = 277

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp6277G277SG3846SnonsynGgtAgt15101510111801-11803
ORF1ab/nsp6277G277GG3846GsynggTggC4432730.61625311801-11803
ORF1ab/nsp6277G277GG3846GsynggTggA4431600.36117411801-11803
ORF1ab/nsp6277G277GG3846GsynggTggG443100.022573411801-11803
ORF1ab/nsp6277G277CG3846CnonsynGgtTgt7474111801-11803
ORF1ab/nsp6277G277VG3846VnonsyngGtgTt3131111801-11803
ORF1ab/nsp6277G277delG3846deldelGGT---1818111801-11803
ORF1ab/nsp6277G277DG3846DnonsyngGtgAt22111801-11803
ORF1ab/nsp6277G277del1G3846del1delGgT-gC210.511801-11803
ORF1ab/nsp6277G277KG3846KnonsynGGTAAA210.511801-11803
ORF1ab/nsp6277G277del1G3846del1delggTgg-210.511801-11803
ORF1ab/nsp6277G277KG3846KnonsynGGTAAG210.511801-11803
ORF1ab/nsp6277G277TG3846TnonsynGGtACt11111801-11803
ORF1ab/nsp6277G277RG3846RnonsynGgtCgt11111801-11803

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt15101510All0.000289
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt480480B.1.1.2891
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt449449B.1.4290.010564
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC273443All0.000052
ORF1ab/nsp6277G277GggTggA160443All0.000031
ORF1ab/nsp6277G277GggTggG10443All0.000002
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC171171B.1.5250.01935
ORF1ab/nsp6277G277GggTggA128128AY.790.154964
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt121121B.1.10.002195
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt7474All0.000014
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt7171B.1.1.70.000064
ORF1ab/nsp6277G277GggTggA2139B.1.617.20.000079
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC1839B.1.617.20.000068
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt3535AY.40.000054
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt3232AY.440.000195
ORF1ab/nsp6277G277VgGtgTt3131All0.000006
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt2828B.470.571429
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt2626B.10.000238
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC2224B.1.1.70.00002
ORF1ab/nsp6277G277GggTggG224B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt2323B.1.1.70.000021
ORF1ab/nsp6277G277delGGT---1818All0.000003
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC1818AY.430.00008
ORF1ab/nsp6277G277VgGtgTt1717AY.40.000026
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt1717B.1.617.20.000064
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt1616AY.1030.000099
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt1515B.1.617.20.000056
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt1313AY.30.000129
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt1313B.1.20.000114
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt1111AY.430.000049
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt1111AY.60.000452
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt1111C.370.001277
ORF1ab/nsp6277G277GggTggA1010AY.420.000402
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt99B.1.6370.000658
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC67AY.250.000036
ORF1ab/nsp6277G277GggTggG17AY.250.000006
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt77AY.98.10.000339
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt66AY.116.10.001869
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt66B.1.10.000109
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC66B.1.3510.000178
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt55AY.290.000079
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt55AY.390.000124
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC55AY.440.00003
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt55AY.50.000103
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt55B.1.177.860.000917
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt55B.1.258.170.00052
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt55B.1.36.170.00247
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt44AY.1020.000106
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt44AY.200.000155
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt44AY.30.00004
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt44AY.39.10.000158
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt44AY.430.000018
ORF1ab/nsp6277G277VgGtgTt44B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt44B.1.4270.000202
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt44P.10.000063
ORF1ab/nsp6277G277delGGT---33B.10.000027
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt33B.10.000027
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt33B.1.1.280.000934
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt33B.1.1.3780.021898
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt33B.1.1.4340.001046
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt33B.1.1280.001906
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt33B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC33B.1.177.40.000633
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt33B.1.2430.000209
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC33B.1.5540.013216
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt33B.1.5870.005693
ORF1ab/nsp6277G277delGGT---220.111111
ORF1ab/nsp6277G277DgGtgAt22All0
ORF1ab/nsp6277G277KGGTAAG12All0
ORF1ab/nsp6277G277del1GgT-gC12All0
ORF1ab/nsp6277G277KGGTAAA12All0
ORF1ab/nsp6277G277del1ggTgg-12All0
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt22AY.1000.000092
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp6277G277del1GgT-gC12AY.1030.000006
ORF1ab/nsp6277G277del1ggTgg-12AY.1030.000006
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt22AY.1140.000462
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC22AY.1140.000462
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt22AY.120.10.000642
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt22AY.230.000139
ORF1ab/nsp6277G277VgGtgTt22AY.3.10.000171
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt22AY.340.000194
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt22AY.40.000003
ORF1ab/nsp6277G277GggTggG12AY.40.000002
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC12AY.40.000002
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC22AY.5.40.000553
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt22AY.920.000575
ORF1ab/nsp6277G277GggTggG22B.10.000018
ORF1ab/nsp6277G277VgGtgTt22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt22B.1.1260.002551
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt22B.1.177.730.001133
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt22B.1.1950.01005
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt22B.1.2390.002442
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt22B.1.5250.000226
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt22B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC11A.10.000282
ORF1ab/nsp6277G277TGGtACt11All0
ORF1ab/nsp6277G277RGgtCgt11All0
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11AY.10.000396
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp6277G277GggTggA11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt11AY.200.000039
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11AY.250.000006
ORF1ab/nsp6277G277delGGT---11AY.250.000006
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11AY.260.000028
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt11AY.260.000028
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11AY.270.000065
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp6277G277KGGTAAA11AY.30.00001
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11AY.330.000067
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11AY.360.000148
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC11AY.390.000025
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp6277G277GggTggG11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp6277G277delGGT---11AY.40.000002
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp6277G277delGGT---11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11AY.400.000964
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt11AY.420.00004
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11AY.420.00004
ORF1ab/nsp6277G277delGGT---11AY.430.000004
ORF1ab/nsp6277G277DgGtgAt11AY.440.000006
ORF1ab/nsp6277G277KGGTAAG11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11AY.470.000031
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11AY.610.000105
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt11AY.620.000436
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11AY.640.000595
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp6277G277delGGT---11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt11AY.850.000427
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11AY.910.00073
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11AY.940.000443
ORF1ab/nsp6277G277GggTggG11AY.990.001049
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC11B0.000128
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B0.000128
ORF1ab/nsp6277G277VgGtgTt11B.10.000009
ORF1ab/nsp6277G277DgGtgAt11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp6277G277delGGT---11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp6277G277VgGtgTt11B.1.1.1890.001513
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.1.2370.005405
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.1.3690.000446
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.1.40.002976
ORF1ab/nsp6277G277delGGT---11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp6277G277TGGtACt11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp6277G277VgGtgTt11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.177.100.000878
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp6277G277delGGT---11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp6277G277delGGT---11B.1.177.90.001332
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp6277G277RGgtCgt11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.2650.001271
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt11B.1.3010.005917
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.3360.002439
ORF1ab/nsp6277G277delGGT---11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC11B.1.36.80.001
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt11B.1.3990.001934
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.4130.004255
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.4590.004082
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC11B.1.4590.004082
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp6277G277VgGtgTt11B.1.5890.007576
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp6277G277VgGtgTt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp6277G277delGGT---11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp6277G277CGgtTgt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp6277G277delGGT---11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp6277G277GggTggG11B.1.6250.002353
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.1.760.011364
ORF1ab/nsp6277G277GggTggG11B.230.002924
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.3.10.001658
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11B.390.002331
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11C.350.000774
ORF1ab/nsp6277G277VgGtgTt11D.20.000075
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC11D.20.000075
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11N.30.005814
ORF1ab/nsp6277G277delGGT---11N.40.004255
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11N.50.001767
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC11P.10.000016
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC11P.1.130.000898
ORF1ab/nsp6277G277GggTggC11P.20.000187
ORF1ab/nsp6277G277SGgtAgt11P.30.001595