CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : CodonNum = 24 & Codon = Att

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp624V24IV3593InonsynGttAtt6706680.99701511042-11044

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt668670All0.000128
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt350350B.1.160.260.847458
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt120120B.1.1.70.000107
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt5454AY.40.000084
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt1414B.1.1600.000437
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt1313B.10.000119
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt1313B.1.617.20.000049
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt77B.1.36.10.007982
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt77B.1.5260.000165
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt66AY.250.000036
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt55AY.46.50.000992
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt55B.1.10.000091
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt55P.10.000079
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt440.222222
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt44AY.1020.000106
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt44AY.1030.000025
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt44AY.440.000024
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt33AY.1130.000427
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt33AY.430.000013
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt33B.1.20.000026
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt33B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt33B.1.4290.000071
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt33P.1.140.000143
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt22AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt22B.1.177.440.001038
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt22B.1.36.170.000988
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt22B.1.36.290.001035
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt22B.1.4270.000101
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt11AT.10.005128
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt11AY.200.000039
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt11AY.240.000431
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt11AY.260.000028
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt11AY.30.00001
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt11AY.450.000122
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt11AY.470.000031
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt11AY.50.000021
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt11B.1.160.160.000929
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt11B.1.2220.001692
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt11B.1.2600.003344
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt11Q.10.000126
ORF1ab/nsp624V24IGttAtt11Z.10.00289