CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : CodonNum = 224

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp6224Y224YY3793YsyntaCtaT20952095111642-11644
ORF1ab/nsp6224Y224delY3793deldelTAC---125125111642-11644
ORF1ab/nsp6224Y224HY3793HnonsynTacCac5555111642-11644
ORF1ab/nsp6224Y224SY3793SnonsyntActCc730.42857111642-11644
ORF1ab/nsp6224Y224SY3793SnonsyntACtCA720.28571411642-11644
ORF1ab/nsp6224Y224SY3793SnonsyntACtCT720.28571411642-11644
ORF1ab/nsp6224Y224CY3793CnonsyntActGc66111642-11644
ORF1ab/nsp6224Y224del2Y3793del2deltACt--66111642-11644
ORF1ab/nsp6224Y224XY3793XnonsyntACtGA520.411642-11644
ORF1ab/nsp6224Y224XY3793XnonsyntaCtaA520.411642-11644
ORF1ab/nsp6224Y224XY3793XnonsyntaCtaG510.211642-11644
ORF1ab/nsp6224Y224del1Y3793del1deltaCta-430.7511642-11644
ORF1ab/nsp6224Y224del1Y3793del1delTAcC-c410.2511642-11644
ORF1ab/nsp6224Y224FY3793FnonsyntActTc33111642-11644
ORF1ab/nsp6224Y224LY3793LnonsyntACtTG11111642-11644
ORF1ab/nsp6224Y224NY3793NnonsynTacAac11111642-11644

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT20952095All0.000401
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11531153AZ.11
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT134134B.1.1.70.00012
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT129129P.10.002032
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---125125All0.000024
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT113113AY.430.000501
ORF1ab/nsp6224Y224HTacCac5555All0.000011
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT5353AY.40.000082
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT5050B.1.20.00044
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT3333B.1.1.3480.026274
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT3232AY.440.000195
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT2929AY.450.003529
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT2828AY.30.000278
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT2626B.1.1.4200.026157
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT2323B.1.438.10.002467
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---2121B.1.617.20.000079
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---1818B.1.1.70.000016
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT1717B.1.617.20.000064
ORF1ab/nsp6224Y224HTacCac1616AY.40.000025
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT1414AY.250.000084
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT1414B.1.1770.000184
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT1313AY.4.20.000282
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT1212B.10.00011
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---1111AY.9.20.000404
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT1010B.1.177.210.000765
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT99AY.290.000142
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT99B.1.177.810.001704
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT99B.1.6210.000797
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT88AY.1030.00005
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT88B.1.1.2220.001632
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT88B.1.2580.000532
ORF1ab/nsp6224Y224StActCc37All0.000001
ORF1ab/nsp6224Y224StACtCA27All0
ORF1ab/nsp6224Y224StACtCT27All0
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---77AY.430.000031
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT77AY.50.000145
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---77AY.75.10.001262
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT77B.1.1.3170.002882
ORF1ab/nsp6224Y224del2tACt--66All0.000001
ORF1ab/nsp6224Y224CtActGc66All0.000001
ORF1ab/nsp6224Y224HTacCac66AY.99.20.000553
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---66B.10.000055
ORF1ab/nsp6224Y224HTacCac66B.1.1.70.000005
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT66P.1.150.001394
ORF1ab/nsp6224Y224XtaCtaA25All0
ORF1ab/nsp6224Y224XtACtGA25All0
ORF1ab/nsp6224Y224XtaCtaG15All0
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---55AY.40.000008
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT55C.370.00058
ORF1ab/nsp6224Y224StActCc240.111111
ORF1ab/nsp6224Y224StACtCA240.111111
ORF1ab/nsp6224Y224del1taCta-34All0.000001
ORF1ab/nsp6224Y224del1TAcC-c14All0
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT44AY.1000.000184
ORF1ab/nsp6224Y224HTacCac44AY.440.000024
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---44AY.470.000124
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT44AY.750.000224
ORF1ab/nsp6224Y224HTacCac44B.10.000037
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT44B.1.1.5190.000159
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT44B.1.2430.000278
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT44B.1.4290.000094
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT44B.1.5260.000094
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT44B.1.5640.001704
ORF1ab/nsp6224Y224FtActTc33All0.000001
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT33AY.230.000209
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---33AY.250.000018
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---33AY.260.000085
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---33AY.330.0002
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT33AY.470.000093
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---33AY.9.10.000251
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT33B.1.1.280.000934
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT33B.1.1.700.001023
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT33B.1.177.70.000495
ORF1ab/nsp6224Y224HTacCac33B.1.20.000026
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT33B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT33B.1.360.000438
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT33B.1.5490.021583
ORF1ab/nsp6224Y224XtACtGA220.111111
ORF1ab/nsp6224Y224CtActGc220.111111
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---22AY.240.000862
ORF1ab/nsp6224Y224HTacCac22AY.250.000012
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT22AY.260.000057
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---22AY.420.00008
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---22AY.650.001066
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---22AY.710.00095
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT22B.1.1.1920.004619
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT22B.1.1.2140.000111
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT22B.1.1.3070.005063
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT22B.1.1.3180.000604
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT22B.1.1.440.004819
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT22B.1.110.30.001437
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT22B.1.2340.000264
ORF1ab/nsp6224Y224FtActTc22B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT22B.1.3610.002577
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT22B.1.3970.009709
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT22B.1.5680.002222
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT22B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp6224Y224HTacCac22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11A0.000387
ORF1ab/nsp6224Y224StActCc11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp6224Y224CtActGc11AD.20.000219
ORF1ab/nsp6224Y224NTacAac11All0
ORF1ab/nsp6224Y224LtACtTG11All0
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp6224Y224HTacCac11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp6224Y224del1TAcC-c11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.240.000431
ORF1ab/nsp6224Y224HTacCac11AY.240.000431
ORF1ab/nsp6224Y224del2tACt--11AY.250.000006
ORF1ab/nsp6224Y224HTacCac11AY.30.00001
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.330.000067
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11AY.340.000097
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11AY.370.000316
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11AY.380.000499
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.390.000025
ORF1ab/nsp6224Y224CtActGc11AY.40.000002
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.460.000104
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.550.000917
ORF1ab/nsp6224Y224XtaCtaA11AY.600.000938
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11AY.610.000105
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.610.000105
ORF1ab/nsp6224Y224HTacCac11AY.610.000105
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11AY.620.000436
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.650.000533
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11AY.670.000464
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11AY.750.000056
ORF1ab/nsp6224Y224StACtCT11AY.750.000056
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11AY.780.001541
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.880.000884
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11AY.90.000068
ORF1ab/nsp6224Y224del1taCta-11AY.90.000068
ORF1ab/nsp6224Y224del1taCta-11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp6224Y224del1taCta-11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp6224Y224CtActGc11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp6224Y224HTacCac11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AY.950.000761
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11AZ.20.000821
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B0.000128
ORF1ab/nsp6224Y224CtActGc11B.10.000009
ORF1ab/nsp6224Y224FtActTc11B.10.000009
ORF1ab/nsp6224Y224XtaCtaG11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11B.1.1.1370.0125
ORF1ab/nsp6224Y224NTacAac11B.1.1.1480.008772
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.1.2530.002506
ORF1ab/nsp6224Y224HTacCac11B.1.1.3690.000446
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.1.3980.003226
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.1.4210.030303
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11B.1.1.4320.001266
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.1.4320.001266
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp6224Y224HTacCac11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.1.5260.003546
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.1.590.006494
ORF1ab/nsp6224Y224del2tACt--11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11B.1.1.710.006061
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.1470.000756
ORF1ab/nsp6224Y224HTacCac11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp6224Y224del2tACt--11B.1.160.160.000929
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11B.1.1610.017241
ORF1ab/nsp6224Y224del2tACt--11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.177.460.000918
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.177.560.000668
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.1990.004132
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp6224Y224HTacCac11B.1.2360.002053
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.258.20.004505
ORF1ab/nsp6224Y224del2tACt--11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.3560.001727
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp6224Y224HTacCac11B.1.36.80.001
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.3980.002976
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.4710.002732
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.5090.000866
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.1.5440.006024
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11B.1.575.10.002439
ORF1ab/nsp6224Y224HTacCac11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp6224Y224StACtCT11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp6224Y224del2tACt--11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp6224Y224LtACtTG11B.1.6190.000871
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11B.290.003509
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11C.360.000911
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11N.40.004255
ORF1ab/nsp6224Y224XtaCtaA11P.10.000016
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11P.20.000187
ORF1ab/nsp6224Y224delTAC---11Q.20.000613
ORF1ab/nsp6224Y224HTacCac11Q.80.000165
ORF1ab/nsp6224Y224YtaCtaT11W.10.008696