CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : CodonNum = 197

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp6197C197FC3766FnonsyntGctTc77989779730.99979511561-11563
ORF1ab/nsp6197C197FC3766FnonsyntGCtTT77989160.00020515711561-11563
ORF1ab/nsp6197C197CC3766CsyntgCtgT45424542111561-11563
ORF1ab/nsp6197C197SC3766SnonsynTgcAgc1971420.72081211561-11563
ORF1ab/nsp6197C197SC3766SnonsyntGCtCA197300.15228411561-11563
ORF1ab/nsp6197C197SC3766SnonsyntGctCc197230.11675111561-11563
ORF1ab/nsp6197C197SC3766SnonsynTgCAgT19720.010152311561-11563
ORF1ab/nsp6197C197YC3766YnonsyntGctAc176176111561-11563
ORF1ab/nsp6197C197RC3766RnonsynTgcCgc96950.98958311561-11563
ORF1ab/nsp6197C197RC3766RnonsynTgCAgA9610.010416711561-11563
ORF1ab/nsp6197C197GC3766GnonsynTgcGgc67650.97014911561-11563
ORF1ab/nsp6197C197GC3766GnonsynTgCGgG6710.014925411561-11563
ORF1ab/nsp6197C197GC3766GnonsynTgCGgT6710.014925411561-11563
ORF1ab/nsp6197C197delC3766deldelTGC---5757111561-11563
ORF1ab/nsp6197C197WC3766WnonsyntgCtgG1414111561-11563
ORF1ab/nsp6197C197XC3766XnonsyntgCtgA960.66666711561-11563
ORF1ab/nsp6197C197XC3766XnonsyntGCtAA920.22222211561-11563
ORF1ab/nsp6197C197XC3766XnonsyntGCtAG910.11111111561-11563
ORF1ab/nsp6197C197LC3766LnonsyntGCtTG740.57142911561-11563
ORF1ab/nsp6197C197LC3766LnonsyntGCtTA730.42857111561-11563
ORF1ab/nsp6197C197IC3766InonsynTGcATc530.611561-11563
ORF1ab/nsp6197C197IC3766InonsynTGCATT520.411561-11563
ORF1ab/nsp6197C197VC3766VnonsynTGcGTc520.411561-11563
ORF1ab/nsp6197C197VC3766VnonsynTGCGTG510.211561-11563
ORF1ab/nsp6197C197VC3766VnonsynTGCGTA510.211561-11563
ORF1ab/nsp6197C197VC3766VnonsynTGCGTT510.211561-11563
ORF1ab/nsp6197C197del1C3766del1deltgCtg-420.511561-11563
ORF1ab/nsp6197C197del1C3766del1delTgC-gM420.511561-11563
ORF1ab/nsp6197C197PC3766PnonsynTGcCCc22111561-11563
ORF1ab/nsp6197C197del2C3766del2deltGCt--11111561-11563

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc7797377989All0.014913
ORF1ab/nsp6197C197FtGCtTT1677989All0.000003
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc7076070771AY.250.425609
ORF1ab/nsp6197C197FtGCtTT1170771AY.250.000066
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc49614961AY.40.007721
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT45424542All0.000869
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT10961096AY.390.027084
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT10211021B.1.617.20.003844
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc579579B.1.617.20.00218
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc398398AY.3.10.033933
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT355355B.1.1.70.000318
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc224224AY.1130.031895
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT222222B.1.160.240.982301
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc142197All0.000027
ORF1ab/nsp6197C197StGCtCA30197All0.000006
ORF1ab/nsp6197C197StGctCc23197All0.000004
ORF1ab/nsp6197C197STgCAgT2197All0
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc182182AY.390.004497
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT177177AY.40.000275
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc176176All0.000034
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc9898AY.40.000153
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc9596All0.000018
ORF1ab/nsp6197C197RTgCAgA196All0
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT9494AY.540.008963
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT9191B.1.20.000801
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT8686AY.1030.000534
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc8686AY.430.000381
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc8282AY.440.000499
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT8282B.1.360.011964
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc7878AY.1200.0029
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT7272B.1.5260.001692
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc6567All0.000012
ORF1ab/nsp6197C197GTgCGgG167All0
ORF1ab/nsp6197C197GTgCGgT167All0
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT6464B.1.10.001161
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---5757All0.000011
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT5757B.1.1610.982759
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT5252AY.440.000317
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT5151B.1.4270.002575
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT4444R.10.00396
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT4343B.10.000394
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc4242AY.510.038182
ORF1ab/nsp6197C197StGCtCA2241B.1.1.70.00002
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc1841B.1.1.70.000016
ORF1ab/nsp6197C197StGctCc141B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT4040AY.30.000398
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc3737AY.470.001151
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc3737AY.920.010629
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT3535AY.430.000155
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT3333AY.290.000521
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT3030C.370.003482
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT2929AY.1000.001334
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc2929AY.1030.00018
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT2929P.10.000457
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT2828AY.1020.000742
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc2828AY.1170.002366
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc2727AY.230.001883
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT2626AY.470.000809
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT2626B.1.177.810.004922
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc2626B.1.617.20.000098
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc2526B.1.617.20.000094
ORF1ab/nsp6197C197RTgCAgA126B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc2525AY.1190.000883
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT2525B.1.1.5190.000993
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT2525B.1.177.730.014156
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc2222B.1.1.70.00002
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc2121AY.46.60.001516
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT2020AY.39.10.000792
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc2020AY.460.002082
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT2020B.1.1.4151
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc2020B.1.1.70.000018
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc1919AY.420.000764
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1919AY.50.000392
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc1919B.10.000174
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1818AY.1170.001521
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc1717AY.980.001343
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1717B.1.1770.000224
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1717B.1.2320.009135
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1717B.1.258.170.001768
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1717B.1.5750.005158
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc1616AY.410.004703
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---1616B.1.1.70.000014
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1515B.1.4000.006435
ORF1ab/nsp6197C197WtgCtgG1414All0.000003
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc1414AY.1170.001183
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1414AY.980.001106
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc1414AY.990.01469
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc1414B0.001789
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc1414B.1.4270.000707
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc1313AY.1020.000345
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1313B.1.4560.042484
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc812AY.40.000012
ORF1ab/nsp6197C197StGctCc312AY.40.000005
ORF1ab/nsp6197C197StGCtCA112AY.40.000002
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1212B.1.3510.000357
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1212B.1.3910.013529
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc1212P.10.000189
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc1111AY.260.000311
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc1111AY.450.001339
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc1111AY.790.013317
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc1010AY.50.000206
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc1010AY.750.00056
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT1010AY.940.004427
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc1010B.1.1.70.000009
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc1010C.370.001161
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc590.277778
ORF1ab/nsp6197C197FtGCtTT490.222222
ORF1ab/nsp6197C197XtgCtgA69All0.000001
ORF1ab/nsp6197C197XtGCtAA29All0
ORF1ab/nsp6197C197XtGCtAG19All0
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT99AY.250.000054
ORF1ab/nsp6197C197WtgCtgG99AY.30.00009
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc99AY.30.00009
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT99AY.4.20.000195
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT99AY.420.000362
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT99B.1.2580.000599
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc88AY.1160.002294
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT88AY.160.003037
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT88AY.230.000558
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc68AY.430.000027
ORF1ab/nsp6197C197StGCtCA18AY.430.000004
ORF1ab/nsp6197C197StGctCc18AY.430.000004
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc88AY.46.40.001316
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT88B.1.1600.00025
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT88B.1.177.70.001319
ORF1ab/nsp6197C197LtGCtTG47All0.000001
ORF1ab/nsp6197C197LtGCtTA37All0.000001
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT77AY.120.002212
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc77AY.390.000173
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc77AY.430.000031
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT77AY.460.000729
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc77AY.50.000145
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc77B.1.1.70.000006
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT77B.1.177.600.001529
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc66AY.1030.000037
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc66AY.1090.004438
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT66AY.360.000889
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc66AY.510.005455
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT66AY.680.001642
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc66AY.820.008141
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc66B.1.20.000053
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT66B.1.4290.000141
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT66B.1.6210.000531
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT55A.2.50.002495
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT55A.270.008278
ORF1ab/nsp6197C197ITGcATc35All0.000001
ORF1ab/nsp6197C197ITGCATT25All0
ORF1ab/nsp6197C197VTGcGTc25All0
ORF1ab/nsp6197C197VTGCGTA15All0
ORF1ab/nsp6197C197VTGCGTG15All0
ORF1ab/nsp6197C197VTGCGTT15All0
ORF1ab/nsp6197C197StGCtCA55AY.1000.00023
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc55AY.1030.000031
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT55AY.260.000142
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc55AY.40.000008
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc55AY.430.000022
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT55AY.70.00098
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---55B.10.000046
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc35B.10.000027
ORF1ab/nsp6197C197StGctCc25B.10.000018
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc55B.1.1.4160.004525
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc55B.1.2400.001078
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc55B.1.4290.000118
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT55B.1.5610.001985
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT55B.1.6090.002397
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc55B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT55B.400.001821
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT440.222222
ORF1ab/nsp6197C197ITGcATc240.111111
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc240.111111
ORF1ab/nsp6197C197ITGCATT240.111111
ORF1ab/nsp6197C197STgCAgT240.111111
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44A.23.10.002817
ORF1ab/nsp6197C197del1TgC-gM24All0
ORF1ab/nsp6197C197del1tgCtg-24All0
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc44AY.1030.000025
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44AY.1070.001864
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc44AY.1080.00441
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44AY.1190.000141
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44AY.120.10.001284
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44AY.200.000155
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc44AY.200.000155
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc44AY.260.000113
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc44AY.330.000267
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44AY.330.000267
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44AY.34.10.00204
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc44AY.5.40.001107
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44AY.60.000165
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc44AY.670.001857
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc44AY.910.002922
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44AY.99.20.000369
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc44AY.99.20.000369
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44B.1.1.3110.001433
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44B.1.1.330.001684
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44B.1.1.4200.004024
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc44B.1.1770.000053
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc44B.1.177.600.000874
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc44B.1.4270.000202
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44B.1.4330.01278
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44B.1.5250.000453
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---44B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc34D.20.000225
ORF1ab/nsp6197C197StGctCc14D.20.000075
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT44Q.20.002454
ORF1ab/nsp6197C197VTGCGTT130.055556
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc130.055556
ORF1ab/nsp6197C197VTGcGTc130.055556
ORF1ab/nsp6197C197VTGCGTG130.055556
ORF1ab/nsp6197C197GTgCGgG130.055556
ORF1ab/nsp6197C197GTgCGgT130.055556
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc33AY.1010.001471
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc33AY.1020.00008
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33AY.1060.001005
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33AY.1100.000338
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33AY.1110.000549
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33AY.1160.00086
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33AY.140.000264
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33AY.340.000291
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc33AY.39.10.000119
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33AY.410.000882
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---33AY.430.000013
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc33AY.46.10.00308
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc33AY.46.20.001906
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33AY.46.50.000595
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33AY.610.000314
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc33AY.620.001307
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---33AY.750.000168
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc33AY.930.000819
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33AZ.20.002463
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc33B.10.000027
ORF1ab/nsp6197C197XtgCtgA23B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp6197C197XtGCtAA13B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33B.1.1.700.001023
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33B.1.140.052632
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33B.1.177.40.000633
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc23B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp6197C197FtGCtTT13B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc33B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc33B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33B.1.438.10.000322
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc33B.1.5960.000261
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33D.20.000225
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT33P.1.150.000697
ORF1ab/nsp6197C197WtgCtgG220.111111
ORF1ab/nsp6197C197LtGCtTG220.111111
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc22AD.20.000438
ORF1ab/nsp6197C197PTGcCCc22All0
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc22AU.30.004219
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc22AY.1000.000092
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc22AY.1100.000225
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc22AY.1180.000125
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc22AY.140.000176
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc22AY.170.016393
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc22AY.190.002281
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.20.000712
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc22AY.200.000078
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---22AY.230.000139
ORF1ab/nsp6197C197LtGCtTA22AY.250.000012
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc22AY.270.000129
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.3.10.000171
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.300.000791
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc22AY.34.10.00102
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc22AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc22AY.440.000012
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.450.000243
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc22AY.50.000041
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc22AY.5.30.000675
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.5.30.000675
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.550.001835
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc22AY.580.001815
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.590.001059
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc22AY.610.00021
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---22AY.650.001066
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc22AY.750.000112
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.810.003984
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc22AY.840.000875
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.840.000875
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B0.000256
ORF1ab/nsp6197C197PTGcCCc22B.10.000018
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc22B.10.000018
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc22B.10.000018
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.1.2140.000111
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.1.2940.002532
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc22B.1.1.3170.000823
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.1.3480.001592
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.1.3980.006452
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.1690.029851
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc22B.1.177.600.000437
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.2340.000264
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc22B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.258.20.009009
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.351.20.000605
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc22B.1.3750.001639
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.4030.006536
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.4160.002538
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc22B.1.4160.002538
ORF1ab/nsp6197C197StGctCc12B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp6197C197StGCtCA12B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.4990.002101
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc22B.1.5230.004902
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc22B.1.5250.000226
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc22B.1.5640.000852
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.5640.000852
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc22B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.621.10.001012
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22C.230.011628
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22P.20.000373
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22P.30.00319
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc22P.30.00319
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT22Q.80.00033
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11A0.000387
ORF1ab/nsp6197C197XtGCtAG11A0.000387
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11A0.000387
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc11A.10.000282
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11A.2.5.20.001572
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AD.20.000219
ORF1ab/nsp6197C197del2tGCt--11All0
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AU.20.002421
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.1040.001984
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.110.001339
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc11AY.120.000316
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11AY.130.000161
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.210.001898
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc11AY.230.00007
ORF1ab/nsp6197C197StGctCc11AY.230.00007
ORF1ab/nsp6197C197StGctCc11AY.250.000006
ORF1ab/nsp6197C197del1tgCtg-11AY.250.000006
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11AY.250.000006
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.270.000065
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11AY.290.000016
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc11AY.30.00001
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.320.000532
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11AY.320.000532
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc11AY.340.000097
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc11AY.340.000097
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.380.000499
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc11AY.390.000025
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc11AY.390.000025
ORF1ab/nsp6197C197StGctCc11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp6197C197LtGCtTG11AY.40.000002
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11AY.40.000002
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc11AY.420.00004
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc11AY.420.00004
ORF1ab/nsp6197C197XtgCtgA11AY.430.000004
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc11AY.440.000006
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc11AY.440.000006
ORF1ab/nsp6197C197VTGcGTc11AY.440.000006
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc11AY.460.000104
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc11AY.460.000104
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc11AY.50.000021
ORF1ab/nsp6197C197XtgCtgA11AY.50.000021
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc11AY.520.000814
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11AY.540.000095
ORF1ab/nsp6197C197VTGCGTA11AY.550.000917
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.570.000656
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.580.000907
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11AY.590.00053
ORF1ab/nsp6197C197StGctCc11AY.60.000041
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc11AY.610.000105
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11AY.620.000436
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc11AY.690.000187
ORF1ab/nsp6197C197StGctCc11AY.70.000196
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11AY.700.000209
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11AY.720.001361
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11AY.730.000665
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.750.000056
ORF1ab/nsp6197C197XtgCtgA11AY.750.000056
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11AY.770.001127
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11AY.780.001541
ORF1ab/nsp6197C197del1TgC-gM11AY.840.000437
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11AY.90.000068
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11AY.9.2.10.001976
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11AY.920.000287
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc11AY.920.000287
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11AY.950.000761
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc11AY.970.001701
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp6197C197del1TgC-gM11AY.990.001049
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11B0.000128
ORF1ab/nsp6197C197XtGCtAA11B.10.000009
ORF1ab/nsp6197C197LtGCtTA11B.10.000009
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.1350.004695
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.1610.003534
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.1700.001247
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.1980.001468
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11B.1.1.2070.001182
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp6197C197StGctCc11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11B.1.1.2650.003155
ORF1ab/nsp6197C197StGctCc11B.1.1.30.008696
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.3070.002532
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.3390.010526
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc11B.1.1.3590.027778
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp6197C197StGctCc11B.1.1.4160.000905
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc11B.1.1.4170.002703
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.4640.001473
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.570.011494
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp6197C197WtgCtgG11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp6197C197del2tGCt--11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp6197C197ITGcATc11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1.830.00271
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.110.30.000718
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.1460.004237
ORF1ab/nsp6197C197StGctCc11B.1.160.110.005714
ORF1ab/nsp6197C197StGctCc11B.1.160.280.002924
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11B.1.1610.017241
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11B.1.177.110.001698
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.177.690.001484
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11B.1.177.760.002494
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.177.80.000752
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11B.1.177.90.001332
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp6197C197del1tgCtg-11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc11B.1.214.20.0006
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc11B.1.214.30.007143
ORF1ab/nsp6197C197WtgCtgG11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp6197C197LtGCtTG11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.2390.001221
ORF1ab/nsp6197C197StGctCc11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.258.110.000396
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc11B.1.258.110.000396
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc11B.1.258.20.004505
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.30.002618
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.3060.005714
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc11B.1.3230.020833
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.351.50.0006
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.36.100.004785
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.36.160.001425
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.36.260.002857
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.4280.00102
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11B.1.4590.004082
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.4970.000315
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11B.1.4970.000315
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.5050.004386
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.5200.021739
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.5230.002451
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc11B.1.5680.001111
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11B.1.5680.001111
ORF1ab/nsp6197C197StGctCc11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.5990.00365
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.6020.006536
ORF1ab/nsp6197C197StGctCc11B.1.6060.006024
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.6190.000871
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11B.1.6270.00202
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.1.6320.006711
ORF1ab/nsp6197C197STgcAgc11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp6197C197RTgcCgc11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11B.530.011765
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11B.550.00295
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11C.360.000911
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11D.20.000075
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc11D.20.000075
ORF1ab/nsp6197C197XtgCtgA11D.20.000075
ORF1ab/nsp6197C197WtgCtgG11D.20.000075
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11N.40.004255
ORF1ab/nsp6197C197StGctCc11P.10.000016
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp6197C197CtgCtgT11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc11P.1.17.10.000875
ORF1ab/nsp6197C197FtGctTc11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp6197C197delTGC---11Q.20.000613
ORF1ab/nsp6197C197YtGctAc11Q.80.000165
ORF1ab/nsp6197C197GTgcGgc11Q.80.000165