CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : CodonNum = 192 & Codon = atT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp6192M192IM3761InonsynatGatT5994290.71619411546-11548

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT429599All0.000082
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT234234AD.10.962963
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT2252B.1.1.70.00002
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT1143AY.4.20.000239
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT3838B.1.1.2190.19
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT819AY.40.000012
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT1718AY.430.000075
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT1516AY.1030.000093
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT811B.1.617.20.00003
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT110B.10.000009
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT99AY.250.000054
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT77B.1.1.1910.033333
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT36B.1.20.000026
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT350.166667
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT35AY.440.000018
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT25B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT34AY.1000.000138
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT24AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT14B.1.10.000018
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT34B.1.4270.000151
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT23AY.1020.000053
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT33B.1.1.500.002037
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT22AY.30.00002
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT22AY.46.50.000397
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT22AY.980.000158
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT12B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT22B.1.5770.001375
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT12B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT12Q.10.000126
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT11AY.140.000088
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT11AY.160.00038
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT11AY.270.000065
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT11AY.360.000148
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT11AY.460.000104
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT11AY.610.000105
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT11AY.910.00073
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT11B.1.1.3150.008475
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT11B.1.1.3980.003226
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT11B.1.36.220.001208
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT11B.1.4080.00369
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT11P.10.000016
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT11P.1.60.001946
ORF1ab/nsp6192M192IatGatT11R.10.00009