CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp6 : CodonNum = 177

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp6177G177GG3746GsynggTggC3313210.96978811501-11503
ORF1ab/nsp6177G177GG3746GsynggTggG33170.02114811501-11503
ORF1ab/nsp6177G177GG3746GsynggTggA33130.0090634411501-11503
ORF1ab/nsp6177G177CG3746CnonsynGgtTgt3073060.99674311501-11503
ORF1ab/nsp6177G177CG3746CnonsynGgTTgC30710.0032573311501-11503
ORF1ab/nsp6177G177delG3746deldelGGT---4949111501-11503
ORF1ab/nsp6177G177VG3746VnonsyngGtgTt29270.93103511501-11503
ORF1ab/nsp6177G177VG3746VnonsyngGTgTC2910.034482811501-11503
ORF1ab/nsp6177G177VG3746VnonsyngGTgTG2910.034482811501-11503
ORF1ab/nsp6177G177SG3746SnonsynGgtAgt2525111501-11503
ORF1ab/nsp6177G177AG3746AnonsyngGtgCt1010111501-11503
ORF1ab/nsp6177G177DG3746DnonsyngGtgAt980.88888911501-11503
ORF1ab/nsp6177G177DG3746DnonsyngGTgAC910.11111111501-11503
ORF1ab/nsp6177G177XG3746XnonsynGgTTgA77111501-11503
ORF1ab/nsp6177G177RG3746RnonsynGgtCgt530.611501-11503
ORF1ab/nsp6177G177RG3746RnonsynGgTCgG510.211501-11503
ORF1ab/nsp6177G177RG3746RnonsynGgTAgG510.211501-11503
ORF1ab/nsp6177G177KG3746KnonsynGGTAAA320.66666711501-11503
ORF1ab/nsp6177G177IG3746InonsynGGtATt320.66666711501-11503
ORF1ab/nsp6177G177KG3746KnonsynGGTAAG310.33333311501-11503
ORF1ab/nsp6177G177IG3746InonsynGGTATC310.33333311501-11503
ORF1ab/nsp6177G177EG3746EnonsyngGTgAG22111501-11503
ORF1ab/nsp6177G177TG3746TnonsynGGtACt22111501-11503
ORF1ab/nsp6177G177del1G3746del1delGgt-gt22111501-11503
ORF1ab/nsp6177G177YG3746YnonsynGGtTAt210.511501-11503
ORF1ab/nsp6177G177YG3746YnonsynGGTTAC210.511501-11503
ORF1ab/nsp6177G177NG3746NnonsynGGTAAC11111501-11503
ORF1ab/nsp6177G177PG3746PnonsynGGTCCG11111501-11503
ORF1ab/nsp6177G177MG3746MnonsynGGTATG11111501-11503

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC321331All0.000061
ORF1ab/nsp6177G177GggTggG7331All0.000001
ORF1ab/nsp6177G177GggTggA3331All0.000001
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt306307All0.000059
ORF1ab/nsp6177G177CGgTTgC1307All0
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC196196AV.10.989899
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt6363AY.40.000098
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt5454B.1.617.20.000203
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---4949All0.000009
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt3737AY.1030.00023
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC3434AY.1030.000211
ORF1ab/nsp6177G177VgGtgTt2729All0.000005
ORF1ab/nsp6177G177VgGTgTG129All0
ORF1ab/nsp6177G177VgGTgTC129All0
ORF1ab/nsp6177G177SGgtAgt2525All0.000005
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt2525AY.440.000152
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt2323AY.610.00241
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt2121AY.1180.001316
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt2121AY.50.000434
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt1616B.1.1.2840.001718
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC1013B.1.1.70.000009
ORF1ab/nsp6177G177GggTggG313B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC1212AY.40.000019
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC1112B.1.617.20.000041
ORF1ab/nsp6177G177GggTggG112B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp6177G177AgGtgCt1010All0.000002
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC1010AY.410.002939
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---1010B.1.1.70.000009
ORF1ab/nsp6177G177DgGtgAt89All0.000002
ORF1ab/nsp6177G177DgGTgAC19All0
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC88AY.420.000322
ORF1ab/nsp6177G177XGgTTgA77All0.000001
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt77AY.260.000198
ORF1ab/nsp6177G177SGgtAgt77AY.40.000011
ORF1ab/nsp6177G177VgGtgTt660.333333
ORF1ab/nsp6177G177SGgtAgt66AY.4.20.00013
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---66B.1.617.20.000023
ORF1ab/nsp6177G177RGgtCgt35All0.000001
ORF1ab/nsp6177G177RGgTAgG15All0
ORF1ab/nsp6177G177RGgTCgG15All0
ORF1ab/nsp6177G177XGgTTgA55B.10.000046
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC44AY.1020.000106
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC44AY.430.000018
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC44AY.550.00367
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt44AY.75.10.000721
ORF1ab/nsp6177G177IGGtATt23All0
ORF1ab/nsp6177G177KGGTAAA23All0
ORF1ab/nsp6177G177IGGTATC13All0
ORF1ab/nsp6177G177KGGTAAG13All0
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt33AY.1110.000549
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC33AY.230.000209
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC33AY.250.000018
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt33AY.430.000013
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt33AY.550.002752
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC33AY.980.000237
ORF1ab/nsp6177G177VgGtgTt33B.10.000027
ORF1ab/nsp6177G177RGgTCgG13B.1.1.4110.014706
ORF1ab/nsp6177G177RGgTAgG13B.1.1.4110.014706
ORF1ab/nsp6177G177RGgtCgt13B.1.1.4110.014706
ORF1ab/nsp6177G177AgGtgCt33B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp6177G177AgGtgCt33B.1.4290.000071
ORF1ab/nsp6177G177AgGtgCt220.111111
ORF1ab/nsp6177G177IGGtATt220.111111
ORF1ab/nsp6177G177TGGtACt220.111111
ORF1ab/nsp6177G177TGGtACt22All0
ORF1ab/nsp6177G177EgGTgAG22All0
ORF1ab/nsp6177G177del1Ggt-gt22All0
ORF1ab/nsp6177G177YGGTTAC12All0
ORF1ab/nsp6177G177YGGtTAt12All0
ORF1ab/nsp6177G177VgGtgTt22AY.250.000012
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC22AY.30.00002
ORF1ab/nsp6177G177VgGtgTt22AY.40.000003
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---22AY.40.000003
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---22AY.430.000009
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC22AY.440.000012
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---22AY.650.001066
ORF1ab/nsp6177G177VgGTgTG12AY.990.001049
ORF1ab/nsp6177G177VgGTgTC12AY.990.001049
ORF1ab/nsp6177G177SGgtAgt22B.10.000018
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---22B.10.000018
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt22B.10.000018
ORF1ab/nsp6177G177GggTggA12B.10.000009
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC12B.10.000009
ORF1ab/nsp6177G177DgGtgAt22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt12B.1.10.000018
ORF1ab/nsp6177G177CGgTTgC12B.1.10.000018
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp6177G177SGgtAgt22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---22C.360.001821
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt110.055556
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11A0.000387
ORF1ab/nsp6177G177VgGtgTt11A.2.20.001689
ORF1ab/nsp6177G177MGGTATG11All0
ORF1ab/nsp6177G177PGGTCCG11All0
ORF1ab/nsp6177G177NGGTAAC11All0
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp6177G177VgGtgTt11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt11AY.120.000316
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp6177G177VgGtgTt11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt11AY.130.000161
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt11AY.250.000006
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11AY.250.000006
ORF1ab/nsp6177G177GggTggA11AY.290.000016
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11AY.30.00001
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt11AY.30.00001
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC11AY.320.000532
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11AY.390.000025
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp6177G177del1Ggt-gt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp6177G177DgGtgAt11AY.40.000002
ORF1ab/nsp6177G177AgGtgCt11AY.40.000002
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt11AY.420.00004
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11AY.420.00004
ORF1ab/nsp6177G177VgGtgTt11AY.430.000004
ORF1ab/nsp6177G177SGgtAgt11AY.430.000004
ORF1ab/nsp6177G177KGGTAAA11AY.430.000004
ORF1ab/nsp6177G177KGGTAAA11AY.440.000006
ORF1ab/nsp6177G177PGGTCCG11AY.440.000006
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt11AY.460.000104
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC11AY.520.000814
ORF1ab/nsp6177G177VgGtgTt11AY.60.000041
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11AY.610.000105
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11AY.620.000436
ORF1ab/nsp6177G177VgGtgTt11AY.650.000533
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11AY.750.000056
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11AY.780.001541
ORF1ab/nsp6177G177YGGTTAC11AY.840.000437
ORF1ab/nsp6177G177VgGtgTt11AY.840.000437
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC11AY.90.000068
ORF1ab/nsp6177G177EgGTgAG11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp6177G177DgGTgAC11AY.990.001049
ORF1ab/nsp6177G177EgGTgAG11AY.990.001049
ORF1ab/nsp6177G177NGGTAAC11AY.990.001049
ORF1ab/nsp6177G177KGGTAAG11AY.990.001049
ORF1ab/nsp6177G177IGGTATC11AY.990.001049
ORF1ab/nsp6177G177MGGTATG11AY.990.001049
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt11B0.000128
ORF1ab/nsp6177G177DgGtgAt11B.10.000009
ORF1ab/nsp6177G177RGgtCgt11B.10.000009
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp6177G177VgGtgTt11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11B.1.1.1390.022727
ORF1ab/nsp6177G177VgGtgTt11B.1.1.1640.005155
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11B.1.1.1920.002309
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp6177G177SGgtAgt11B.1.1.4110.014706
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC11B.1.1.430.014925
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt11B.1.1.4640.001473
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC11B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp6177G177SGgtAgt11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp6177G177VgGtgTt11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp6177G177GggTggG11B.1.130.002375
ORF1ab/nsp6177G177AgGtgCt11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt11B.1.1700.00431
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp6177G177GggTggG11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp6177G177GggTggG11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp6177G177SGgtAgt11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp6177G177DgGtgAt11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp6177G177GggTggA11B.1.3380.008621
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC11B.1.36.350.002604
ORF1ab/nsp6177G177RGgtCgt11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp6177G177XGgTTgA11B.1.4430.004673
ORF1ab/nsp6177G177SGgtAgt11B.1.5230.002451
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp6177G177VgGtgTt11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp6177G177SGgtAgt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp6177G177XGgTTgA11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp6177G177VgGtgTt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp6177G177del1Ggt-gt11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp6177G177YGGtTAt11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp6177G177DgGtgAt11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11B.1.6300.005236
ORF1ab/nsp6177G177DgGtgAt11B.60.00091
ORF1ab/nsp6177G177VgGtgTt11C.300.001727
ORF1ab/nsp6177G177SGgtAgt11C.36.30.000567
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11C.370.000116
ORF1ab/nsp6177G177SGgtAgt11D.20.000075
ORF1ab/nsp6177G177DgGtgAt11D.20.000075
ORF1ab/nsp6177G177VgGtgTt11D.20.000075
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11N.40.004255
ORF1ab/nsp6177G177CGgtTgt11P.10.000016
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC11P.1.150.000232
ORF1ab/nsp6177G177GggTggC11P.20.000187
ORF1ab/nsp6177G177delGGT---11Q.20.000613
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