CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | G3676del | del | GGT | --- | 1352241 | 1352241 | 1 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | G3676S | nonsyn | Ggt | Agt | 19753 | 19751 | 0.999899 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | G3676S | nonsyn | GgT | AgC | 19753 | 1 | 0.0000506252 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | G3676S | nonsyn | GGT | TCA | 19753 | 1 | 0.0000506252 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | G3676C | nonsyn | Ggt | Tgt | 1983 | 1982 | 0.999496 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | G3676C | nonsyn | GgT | TgC | 1983 | 1 | 0.000504286 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | G3676R | nonsyn | Ggt | Cgt | 539 | 194 | 0.359926 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | G3676R | nonsyn | GgT | AgA | 539 | 174 | 0.32282 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | G3676R | nonsyn | GgT | CgA | 539 | 170 | 0.315399 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | G3676R | nonsyn | GgT | CgC | 539 | 1 | 0.00185529 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | G3676L | nonsyn | GGT | CTA | 348 | 175 | 0.502874 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | G3676L | nonsyn | GGt | CTt | 348 | 172 | 0.494253 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | G3676L | nonsyn | GGT | CTC | 348 | 1 | 0.00287356 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | G3676V | nonsyn | gGt | gTt | 344 | 338 | 0.982558 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | G3676V | nonsyn | gGT | gTA | 344 | 6 | 0.0174419 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | G3676I | nonsyn | GGt | ATt | 335 | 167 | 0.498507 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | G3676I | nonsyn | GGT | ATA | 335 | 167 | 0.498507 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | G3676I | nonsyn | GGT | ATC | 335 | 1 | 0.00298507 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | G3676G | syn | ggT | ggC | 149 | 101 | 0.677852 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | G3676G | syn | ggT | ggG | 149 | 42 | 0.281879 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | G3676G | syn | ggT | ggA | 149 | 6 | 0.0402685 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | G3676D | nonsyn | gGt | gAt | 74 | 73 | 0.986486 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | G3676D | nonsyn | gGT | gAC | 74 | 1 | 0.0135135 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | G3676del1 | del | GgT | -gN | 70 | 42 | 0.6 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | G3676del1 | del | ggT | gg- | 70 | 14 | 0.2 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | G3676del1 | del | Ggt | -gt | 70 | 8 | 0.114286 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | G3676del1 | del | GgT | -gG | 70 | 5 | 0.0714286 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | G3676del1 | del | GgT | Ng- | 70 | 1 | 0.0142857 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del2 | G3676del2 | del | GGt | --t | 19 | 12 | 0.631579 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del2 | G3676del2 | del | GGT | --N | 19 | 3 | 0.157895 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del2 | G3676del2 | del | gGT | g-- | 19 | 2 | 0.105263 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del2 | G3676del2 | del | GGT | --G | 19 | 2 | 0.105263 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107Y | G3676Y | nonsyn | GGT | TAC | 10 | 6 | 0.6 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107Y | G3676Y | nonsyn | GGt | TAt | 10 | 4 | 0.4 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107K | G3676K | nonsyn | GGT | AAA | 8 | 8 | 1 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107N | G3676N | nonsyn | GGt | AAt | 8 | 8 | 1 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107X | G3676X | nonsyn | GGT | TAA | 6 | 3 | 0.5 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107X | G3676X | nonsyn | GgT | TgA | 6 | 3 | 0.5 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107F | G3676F | nonsyn | GGt | TTt | 3 | 3 | 1 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107A | G3676A | nonsyn | gGt | gCt | 2 | 2 | 1 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107H | G3676H | nonsyn | GGT | CAC | 1 | 1 | 1 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107W | G3676W | nonsyn | GgT | TgG | 1 | 1 | 1 | 11291-11293 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107P | G3676P | nonsyn | GGT | CCG | 1 | 1 | 1 | 11291-11293 |
Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1352241 | 1352241 | All | 0.258632 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1081563 | 1081563 | B.1.1.7 | 0.96824 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 61903 | 61903 | P.1 | 0.975219 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 41660 | 41660 | B.1.526 | 0.979198 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 31059 | 31059 | B.1.351 | 0.923276 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 20834 | 20834 | P.1.14 | 0.995889 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 19751 | 19753 | All | 0.003778 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | GgT | AgC | 1 | 19753 | All | 0 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | GGT | TCA | 1 | 19753 | All | 0 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 15537 | 15538 | B.1.1.7 | 0.013909 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | GGT | TCA | 1 | 15538 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 13376 | 13376 | B.1.637 | 0.977421 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 8418 | 8418 | B.1.525 | 0.952586 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 8373 | 8373 | C.37 | 0.971797 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 7715 | 7715 | Q.1 | 0.974608 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 6675 | 6675 | Q.3 | 0.968093 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 6026 | 6026 | Q.8 | 0.993734 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 6002 | 6002 | P.1.17 | 0.970883 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 3952 | 3952 | P.1.15 | 0.918216 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 3600 | 3600 | P.1.10 | 0.970089 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 3215 | 3215 | B.1.351.2 | 0.972769 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 3214 | 3214 | B.1.1.318 | 0.969825 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 3144 | 3144 | B.1 | 0.028798 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 3064 | 3064 | P.1.7 | 0.978289 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2969 | 2969 | B.1.1 | 0.05386 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2686 | 2686 | B.1.628 | 0.946441 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2653 | 2653 | P.1.16 | 0.992518 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2502 | 2502 | P.1.1 | 0.79479 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2116 | 2116 | Q.4 | 0.962256 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 1982 | 1983 | All | 0.000379 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | GgT | TgC | 1 | 1983 | All | 0 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1931 | 1931 | P.1.12 | 0.934656 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 1842 | 1842 | B.1.1.176 | 0.809315 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1572 | 1572 | B.1.351.5 | 0.942446 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1541 | 1541 | B.1.619.1 | 0.988454 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1199 | 1199 | AZ.2 | 0.984401 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1152 | 1152 | AZ.1 | 0.999133 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1139 | 1139 | P.1.17.1 | 0.9965 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1133 | 1133 | B.1.351.3 | 0.992989 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1129 | 1129 | B.1.619 | 0.983449 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1101 | 1101 | P.1.13 | 0.989218 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1056 | 1056 | B.1.620 | 0.999054 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1015 | 1015 | P.1.4 | 0.991211 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 983 | 983 | Q.2 | 0.603067 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 977 | 977 | B.1.214.2 | 0.585731 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 895 | 895 | Q.7 | 0.994444 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 840 | 840 | P.1.2 | 0.971098 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 630 | 630 | AZ.3 | 0.957447 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 611 | 611 | Q.2 | 0.374847 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 567 | 567 | P.1.1 | 0.180114 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | Ggt | Cgt | 194 | 539 | All | 0.000037 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | AgA | 174 | 539 | All | 0.000033 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | CgA | 170 | 539 | All | 0.000033 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | CgC | 1 | 539 | All | 0 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 513 | 513 | P.1.6 | 0.998054 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 455 | 456 | P.1 | 0.007168 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | GgT | AgC | 1 | 456 | P.1 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 392 | 392 | B.1.625 | 0.922353 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 383 | 383 | B.1.470 | 0.537921 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 367 | 367 | C.37.1 | 0.960733 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGT | CTA | 175 | 348 | All | 0.000033 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGt | CTt | 172 | 348 | All | 0.000033 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGT | CTC | 1 | 348 | All | 0 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 338 | 344 | All | 0.000065 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGT | gTA | 6 | 344 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGt | ATt | 167 | 335 | All | 0.000032 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGT | ATA | 167 | 335 | All | 0.000032 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGT | ATC | 1 | 335 | All | 0 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 284 | 284 | B.1.634 | 0.972603 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | Ggt | Cgt | 98 | 284 | P.1 | 0.001544 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | CgA | 94 | 284 | P.1 | 0.001481 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | AgA | 91 | 284 | P.1 | 0.001434 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | CgC | 1 | 284 | P.1 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 279 | 279 | AZ.4 | 0.936242 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 236 | 236 | B.1.637 | 0.017245 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 231 | 231 | C.1.2 | 0.982979 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 226 | 226 | AZ.5 | 0.792982 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 220 | 220 | B.1.351 | 0.00654 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 207 | 207 | P.1.9 | 0.995192 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 206 | 206 | P.1.8 | 0.985646 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 202 | 202 | B.1.1.528 | 0.971154 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 195 | 195 | AV.1 | 0.984848 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 195 | 195 | AY.4 | 0.000304 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 194 | 194 | AY.44 | 0.001181 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 194 | 194 | B.1.241 | 0.157468 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 190 | 190 | B.1.630 | 0.994764 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGt | CTt | 95 | 190 | P.1 | 0.001497 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGT | CTA | 94 | 190 | P.1 | 0.001481 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGT | CTC | 1 | 190 | P.1 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 189 | 189 | B.1.375 | 0.154918 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGt | ATt | 92 | 184 | P.1 | 0.001449 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGT | ATA | 91 | 184 | P.1 | 0.001434 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGT | ATC | 1 | 184 | P.1 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 153 | 153 | B.1.177.73 | 0.086636 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 150 | 150 | Q.6 | 0.993377 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggC | 101 | 149 | All | 0.000019 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggG | 42 | 149 | All | 0.000008 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggA | 6 | 149 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 143 | 143 | B.1.1.525 | 0.781421 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 143 | 143 | B.1.636 | 0.959732 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | Ggt | Cgt | 56 | 142 | B.1.1.7 | 0.00005 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | AgA | 44 | 142 | B.1.1.7 | 0.000039 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | CgA | 42 | 142 | B.1.1.7 | 0.000038 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 136 | 136 | B.1.525 | 0.01539 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 136 | 136 | P.1.15 | 0.031599 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 129 | 129 | B.1.214.3 | 0.921429 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 126 | 126 | B.1.526 | 0.002962 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 123 | 123 | Q.3 | 0.017839 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 122 | 122 | P.1.10.1 | 0.99187 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 121 | 121 | AZ.2.1 | 0.98374 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 119 | 119 | AZ.6 | 1 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 112 | 112 | B.1.170 | 0.482759 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 107 | 107 | B.1.214.4 | 0.972727 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 100 | 100 | AY.4 | 0.000156 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 98 | 98 | C.37 | 0.011374 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 97 | 97 | P.1.11 | 0.989796 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 95 | 95 | B.1 | 0.00087 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGT | CTA | 45 | 87 | B.1.1.7 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGt | CTt | 42 | 87 | B.1.1.7 | 0.000038 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGT | ATA | 43 | 85 | B.1.1.7 | 0.000038 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGt | ATt | 42 | 85 | B.1.1.7 | 0.000038 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 81 | 81 | B.1.1.507 | 0.704348 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 79 | 79 | Q.1 | 0.00998 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 76 | 76 | AY.44 | 0.000463 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 75 | 75 | B.1.617.2 | 0.000282 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | gGt | gAt | 73 | 74 | All | 0.000014 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | gGT | gAC | 1 | 74 | All | 0 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | GgT | -gN | 42 | 70 | All | 0.000008 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | ggT | gg- | 14 | 70 | All | 0.000003 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | Ggt | -gt | 8 | 70 | All | 0.000002 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | GgT | -gG | 5 | 70 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | GgT | Ng- | 1 | 70 | All | 0 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 67 | 67 | B.1.1.205 | 0.249071 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 65 | 65 | AY.119 | 0.002295 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 65 | 65 | B.1.177.7 | 0.010715 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 61 | 61 | B.1.36.29 | 0.031557 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 59 | 59 | Q.5 | 1 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 57 | 57 | B.1.177 | 0.000751 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 57 | 57 | B.1.221 | 0.004049 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 56 | 56 | B | 0.007157 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 55 | 55 | AY.44 | 0.000335 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 46 | 46 | B.1.2 | 0.000405 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 46 | 46 | B.1.639 | 1 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 45 | 45 | AY.43 | 0.000199 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 45 | 45 | B.1.243.1 | 1 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 44 | 44 | B.1.1.524 | 0.916667 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 42 | 42 | B.1.1 | 0.000762 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 42 | 42 | B.1.429 | 0.000988 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 42 | 42 | P.1.17 | 0.006794 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 42 | 42 | Q.4 | 0.0191 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 41 | 41 | B.1.1.409 | 0.116147 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | Ggt | Cgt | 14 | 40 | C.37 | 0.001625 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | CgA | 13 | 40 | C.37 | 0.001509 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | AgA | 13 | 40 | C.37 | 0.001509 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 39 | 39 | B.1.258.17 | 0.004055 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggC | 37 | 37 | AY.120 | 0.001376 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 37 | 37 | B.1.1.312 | 0.070746 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 35 | 35 | B.1.617.2 | 0.000132 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 33 | 33 | B.1.617.2 | 0.000124 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 33 | 33 | B.1.623 | 0.017704 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 32 | 32 | B.1.346 | 0.04194 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 32 | 32 | B.1.36.29 | 0.016555 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 31 | 31 | B.1.1.28 | 0.009648 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 29 | 29 | B.1.601 | 0.878788 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 29 | 29 | P.1.3 | 1 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 28 | 28 | B.1.1.519 | 0.001112 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 28 | 28 | C.36.3.1 | 0.076087 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 28 | 28 | P.1.7 | 0.00894 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 27 | 27 | B.1.1.220 | 0.050186 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 27 | 27 | B.1.351.5 | 0.016187 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGT | CTA | 14 | 27 | C.37 | 0.001625 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGt | CTt | 13 | 27 | C.37 | 0.001509 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGT | ATA | 13 | 26 | C.37 | 0.001509 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGt | ATt | 13 | 26 | C.37 | 0.001509 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 25 | 25 | AY.29 | 0.000394 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | GgT | -gN | 22 | 25 | B.1.1.7 | 0.00002 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | Ggt | -gt | 2 | 25 | B.1.1.7 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | ggT | gg- | 1 | 25 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 25 | 25 | B.1.160 | 0.00078 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 24 | 24 | P.1.10.2 | 1 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 23 | 23 | AY.68 | 0.006296 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 23 | 23 | B.1.1.318 | 0.00694 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggC | 22 | 23 | B.1.311 | 0.006041 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggG | 1 | 23 | B.1.311 | 0.000275 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 22 | 22 | AY.26 | 0.000623 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 21 | 21 | AY.116 | 0.006022 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 21 | 21 | B.1.1.161 | 0.074205 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 21 | 21 | B.1.1.306 | 0.009206 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 21 | 21 | B.1.351.2 | 0.006354 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | AgA | 7 | 21 | P.1.4 | 0.006836 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | Ggt | Cgt | 7 | 21 | P.1.4 | 0.006836 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | CgA | 7 | 21 | P.1.4 | 0.006836 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | gGt | gAt | 20 | 20 | AY.4 | 0.000031 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 20 | 20 | P.1.12 | 0.009681 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del2 | GGt | --t | 12 | 19 | All | 0.000002 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del2 | GGT | --N | 3 | 19 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del2 | GGT | --G | 2 | 19 | All | 0 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del2 | gGT | g-- | 2 | 19 | All | 0 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | gGt | gAt | 19 | 19 | AY.44 | 0.000116 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 19 | 19 | B.1.638 | 1 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 18 | 18 | AY.103 | 0.000112 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 18 | 18 | B.1.237 | 0.089552 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 18 | 18 | B.1.609 | 0.008629 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 18 | 18 | P.1.14 | 0.00086 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggG | 17 | 17 | AY.102 | 0.000451 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 17 | 17 | B.1.470 | 0.023876 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 17 | 17 | B.1.596 | 0.001481 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggG | 9 | 17 | B.1.617.2 | 0.000034 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggC | 8 | 17 | B.1.617.2 | 0.00003 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 17 | 17 | P.1.10 | 0.004581 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 15 | 15 | A.2.5 | 0.007485 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 15 | 15 | B.1.241 | 0.012175 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 14 | 14 | AY.43 | 0.000062 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | Ggt | -gt | 6 | 14 | B.1 | 0.000055 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | GgT | -gN | 4 | 14 | B.1 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | ggT | gg- | 2 | 14 | B.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | GgT | Ng- | 1 | 14 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | GgT | -gG | 1 | 14 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 14 | 14 | B.1.628 | 0.004933 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGT | ATA | 7 | 14 | P.1.4 | 0.006836 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGt | ATt | 7 | 14 | P.1.4 | 0.006836 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGT | CTA | 7 | 14 | P.1.4 | 0.006836 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGt | CTt | 7 | 14 | P.1.4 | 0.006836 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 13 | 13 | AZ.3 | 0.019757 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 13 | 13 | B.1.258 | 0.000865 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 13 | 13 | P.1.5 | 1 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 12 | 12 | B.1.1.222 | 0.002448 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 12 | 12 | B.1.1.519 | 0.000477 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 12 | 12 | B.1.617.2 | 0.000045 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 12 | 12 | B.1.621 | 0.001062 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 11 | 11 | AY.103 | 0.000068 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 11 | 11 | AY.110 | 0.00124 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 11 | 11 | AY.39 | 0.000272 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 11 | 11 | AY.45 | 0.001339 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107Y | GGT | TAC | 6 | 10 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107Y | GGt | TAt | 4 | 10 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 10 | 10 | AY.25 | 0.00006 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 10 | 10 | AY.4 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 10 | 10 | AY.46.6 | 0.000722 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggC | 7 | 10 | B.1 | 0.000064 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggG | 3 | 10 | B.1 | 0.000027 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 10 | 10 | B.1.1.294 | 0.012658 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 10 | 10 | B.1.76 | 0.113636 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 10 | 10 | B.6.6 | 0.008889 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 9 | 9 | A.2.5.2 | 0.014151 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 9 | 9 | AY.21 | 0.017078 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 9 | 9 | AY.3 | 0.00009 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | gGt | gAt | 9 | 9 | AY.3.1 | 0.000767 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 9 | 9 | AY.4.2 | 0.000195 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 9 | 9 | AY.47 | 0.00028 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 9 | 9 | AY.9 | 0.000608 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 9 | 9 | B.1 | 0.000082 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 9 | 9 | B.1.524 | 0.012658 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | AgA | 3 | 9 | B.1.625 | 0.007059 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | CgA | 3 | 9 | B.1.625 | 0.007059 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | Ggt | Cgt | 3 | 9 | B.1.625 | 0.007059 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | Ggt | Cgt | 3 | 9 | P.1.15 | 0.000697 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | AgA | 3 | 9 | P.1.15 | 0.000697 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | CgA | 3 | 9 | P.1.15 | 0.000697 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | AgA | 3 | 9 | P.1.2 | 0.003468 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | CgA | 3 | 9 | P.1.2 | 0.003468 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | Ggt | Cgt | 3 | 9 | P.1.2 | 0.003468 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107N | GGt | AAt | 8 | 8 | All | 0.000002 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107K | GGT | AAA | 8 | 8 | All | 0.000002 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 8 | 8 | AY.23 | 0.000558 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 8 | 8 | AY.9.2 | 0.000294 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 8 | 8 | B.1.1.34 | 0.105263 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 8 | 8 | B.1.1.375 | 0.095238 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 7 | 8 | B.1.1.7 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | GgT | TgC | 1 | 8 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 4 | 8 | P.1 | 0.000063 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGT | gTA | 4 | 8 | P.1 | 0.000063 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 7 | 7 | AS.1 | 0.066667 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 7 | 7 | AT.1 | 0.035897 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 7 | 7 | AY.102 | 0.000186 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del2 | GGt | --t | 6 | 7 | B.1.1.7 | 0.000005 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del2 | GGT | --N | 1 | 7 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 7 | 7 | B.1.214.2 | 0.004197 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 7 | 7 | B.1.324 | 0.011236 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 7 | 7 | B.1.36 | 0.001021 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 7 | 7 | B.1.411 | 0.025926 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 7 | 7 | B.1.524 | 0.009845 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | GgT | -gN | 5 | 7 | B.1.526 | 0.000118 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | GgT | -gG | 2 | 7 | B.1.526 | 0.000047 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 7 | 7 | C.37.1 | 0.018325 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 7 | 7 | P.1.4 | 0.006836 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107X | GGT | TAA | 3 | 6 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107X | GgT | TgA | 3 | 6 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 6 | 6 | AY.3 | 0.00006 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 6 | 6 | AY.33 | 0.000401 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 6 | 6 | AY.39 | 0.000148 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 6 | 6 | AY.42 | 0.000241 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 6 | 6 | B.1.139 | 0.004399 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 6 | 6 | B.1.214 | 0.021978 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 6 | 6 | B.1.258.11 | 0.002378 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 6 | 6 | B.1.351.3 | 0.005259 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 6 | 6 | B.1.427 | 0.000303 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGT | CTA | 3 | 6 | B.1.625 | 0.007059 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGT | ATA | 3 | 6 | B.1.625 | 0.007059 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGt | ATt | 3 | 6 | B.1.625 | 0.007059 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGt | CTt | 3 | 6 | B.1.625 | 0.007059 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGt | CTt | 3 | 6 | P.1.15 | 0.000697 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGT | ATA | 3 | 6 | P.1.15 | 0.000697 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGT | CTA | 3 | 6 | P.1.15 | 0.000697 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGt | ATt | 3 | 6 | P.1.15 | 0.000697 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGt | ATt | 3 | 6 | P.1.2 | 0.003468 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGT | CTA | 3 | 6 | P.1.2 | 0.003468 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGt | CTt | 3 | 6 | P.1.2 | 0.003468 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGT | ATA | 3 | 6 | P.1.2 | 0.003468 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 5 | 5 | 0.277778 | |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 5 | 5 | AY.100 | 0.00023 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 5 | 5 | AY.120.2 | 0.006427 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 5 | 5 | AY.20 | 0.000194 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 5 | 5 | AY.34 | 0.000485 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 5 | 5 | AY.36 | 0.000741 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 5 | 5 | AY.4 | 0.000008 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggG | 3 | 5 | AY.4 | 0.000005 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggC | 2 | 5 | AY.4 | 0.000003 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 5 | 5 | AY.56 | 0.008026 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 5 | 5 | AZ.2 | 0.004105 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggC | 5 | 5 | B.1.1 | 0.000091 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 5 | 5 | B.1.1.1 | 0.001633 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 5 | 5 | B.1.1.10 | 0.005574 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 5 | 5 | B.1.1.70 | 0.001705 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 5 | 5 | B.1.157 | 0.014925 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | ggT | gg- | 4 | 5 | B.1.2 | 0.000035 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | GgT | -gN | 1 | 5 | B.1.2 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 5 | 5 | B.1.258.14 | 0.004902 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107Y | GGT | TAC | 5 | 5 | B.1.351.1 | 0.192308 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107K | GGT | AAA | 5 | 5 | B.1.525 | 0.000566 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107N | GGt | AAt | 5 | 5 | B.1.525 | 0.000566 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | AgA | 5 | 5 | B.1.525 | 0.000566 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | Ggt | Cgt | 3 | 5 | B.1.526 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | CgA | 1 | 5 | B.1.526 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | AgA | 1 | 5 | B.1.526 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 5 | 5 | B.1.533 | 0.048077 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 5 | 5 | B.1.575 | 0.001517 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 5 | 5 | B.1.617.1 | 0.000645 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 5 | 5 | B.1.619.1 | 0.003207 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 5 | 5 | B.1.636 | 0.033557 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 5 | 5 | C.36.3 | 0.002836 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 5 | 5 | C.39 | 0.09434 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 4 | 4 | AY.102 | 0.000106 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 4 | 4 | AY.103 | 0.000025 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | gGt | gAt | 4 | 4 | AY.103 | 0.000025 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 4 | 4 | AY.121 | 0.000541 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | gGt | gAt | 4 | 4 | AY.25 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 4 | 4 | AY.4.2.1 | 0.000596 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | gGt | gAt | 4 | 4 | AY.43 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 4 | 4 | AY.46.2 | 0.002541 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 4 | 4 | AY.5 | 0.000083 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | GgT | -gN | 2 | 4 | B.1.1 | 0.000036 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | GgT | -gG | 1 | 4 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | ggT | gg- | 1 | 4 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 4 | 4 | B.1.1.142 | 0.070175 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 4 | 4 | B.1.1.28 | 0.001245 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 4 | 4 | B.1.1.372 | 0.002755 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 4 | 4 | B.1.1.432 | 0.005063 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 4 | 4 | B.1.177 | 0.000053 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 4 | 4 | B.1.177.60 | 0.000874 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 4 | 4 | B.1.177.81 | 0.000757 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 4 | 4 | B.1.2 | 0.000035 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggC | 4 | 4 | B.1.2 | 0.000035 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 4 | 4 | B.1.214.1 | 0.08 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 4 | 4 | B.1.367 | 0.00317 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 4 | 4 | B.1.618 | 0.016129 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 4 | 4 | B.1.619 | 0.003484 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 4 | 4 | C.1 | 0.009569 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 4 | 4 | D.2 | 0.0003 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggA | 4 | 4 | P.1 | 0.000063 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 4 | 4 | P.1.2 | 0.004624 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 4 | 4 | P.5 | 0.054795 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 4 | 4 | Q.8 | 0.00066 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 4 | 4 | R.1 | 0.00036 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107F | GGt | TTt | 3 | 3 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 3 | 3 | AY.100 | 0.000138 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | AY.102 | 0.00008 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 3 | 3 | AY.113 | 0.000427 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 3 | 3 | AY.16.1 | 0.00141 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 3 | 3 | AY.25 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 3 | 3 | AY.46.2 | 0.001906 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 3 | 3 | AY.5 | 0.000062 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 3 | 3 | AY.5 | 0.000062 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 3 | 3 | AY.53 | 0.000863 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 3 | 3 | AY.60 | 0.002814 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 3 | 3 | B.1 | 0.000027 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 3 | 3 | B.1.1.141 | 0.006036 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 3 | 3 | B.1.1.241 | 0.006211 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 3 | 3 | B.1.1.372 | 0.002066 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 3 | 3 | B.1.1.389 | 0.018182 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 3 | 3 | B.1.1.39 | 0.001529 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 3 | 3 | B.1.1.448 | 0.006098 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107Y | GGt | TAt | 2 | 3 | B.1.1.7 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107Y | GGT | TAC | 1 | 3 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggC | 3 | 3 | B.1.160 | 0.000094 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 3 | 3 | B.1.2 | 0.000026 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 3 | 3 | B.1.210 | 0.006397 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 3 | 3 | B.1.234 | 0.000396 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 3 | 3 | B.1.240 | 0.000647 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 3 | 3 | B.1.311 | 0.000824 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | GgT | -gN | 3 | 3 | B.1.351 | 0.000089 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | CgA | 1 | 3 | B.1.351 | 0.00003 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | AgA | 1 | 3 | B.1.351 | 0.00003 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | Ggt | Cgt | 1 | 3 | B.1.351 | 0.00003 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 3 | 3 | B.1.429 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 3 | 3 | B.1.561 | 0.001191 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 3 | 3 | B.1.580 | 0.012195 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 3 | 3 | B.1.596 | 0.000261 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | gGt | gAt | 3 | 3 | B.1.617.2 | 0.000011 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 3 | 3 | B.1.625 | 0.007059 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | GgT | -gN | 3 | 3 | P.1 | 0.000047 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del2 | GGt | --t | 2 | 3 | P.1 | 0.000032 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del2 | gGT | g-- | 1 | 3 | P.1 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | P.1.1 | 0.000953 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | Ggt | Cgt | 1 | 3 | P.1.10 | 0.000269 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | AgA | 1 | 3 | P.1.10 | 0.000269 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | CgA | 1 | 3 | P.1.10 | 0.000269 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | Ggt | Cgt | 1 | 3 | P.1.12 | 0.000484 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | AgA | 1 | 3 | P.1.12 | 0.000484 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | CgA | 1 | 3 | P.1.12 | 0.000484 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 3 | 3 | P.2 | 0.00056 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107A | gGt | gCt | 2 | 2 | All | 0 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.117 | 0.000169 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.120 | 0.000074 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.120.1 | 0.000642 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 2 | 2 | AY.20 | 0.000078 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 2 | 2 | AY.25 | 0.000012 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 2 | 2 | AY.29 | 0.000032 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 2 | 2 | AY.3 | 0.00002 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 2 | 2 | AY.33 | 0.000134 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.35 | 0.000466 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | AY.39 | 0.000049 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggC | 2 | 2 | AY.39 | 0.000049 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | AY.43 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 2 | 2 | AY.43 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggC | 1 | 2 | AY.44 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggG | 1 | 2 | AY.44 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.46.4 | 0.000329 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.48 | 0.00093 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.54 | 0.000191 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.7.2 | 0.001119 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.75 | 0.000112 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.91 | 0.001461 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 2 | 2 | AY.96 | 0.004149 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.98 | 0.000158 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 2 | 2 | B | 0.000256 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.1 | 0.000036 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.1.117 | 0.019417 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.1.254 | 0.022472 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.1.269 | 0.002706 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.1.291 | 0.001485 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.1.299 | 0.02439 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.1.302 | 0.004149 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.1.317 | 0.000823 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.1.37 | 0.000386 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.1.370 | 0.025316 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 2 | 2 | B.1.1.434 | 0.000697 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.1.434 | 0.000697 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | Ggt | Cgt | 2 | 2 | B.1.1.453 | 0.016949 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.1.523 | 0.003125 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.1.54 | 0.006042 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107N | GGt | AAt | 2 | 2 | B.1.1.7 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107F | GGt | TTt | 2 | 2 | B.1.1.7 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggC | 2 | 2 | B.1.1.7 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107K | GGT | AAA | 2 | 2 | B.1.1.7 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | gGt | gAt | 1 | 2 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107X | GGT | TAA | 1 | 2 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | gGT | gAC | 1 | 2 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107X | GgT | TgA | 1 | 2 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 2 | 2 | B.1.177 | 0.000026 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.177.31 | 0.022989 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.177.6 | 0.001953 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 2 | 2 | B.1.177.73 | 0.001133 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.349 | 0.00143 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGt | ATt | 1 | 2 | B.1.351 | 0.00003 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGT | CTA | 1 | 2 | B.1.351 | 0.00003 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGT | ATA | 1 | 2 | B.1.351 | 0.00003 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGt | CTt | 1 | 2 | B.1.351 | 0.00003 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.351.1 | 0.076923 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 2 | 2 | B.1.36.7 | 0.008 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107X | GGT | TAA | 1 | 2 | B.1.525 | 0.000113 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107X | GgT | TgA | 1 | 2 | B.1.525 | 0.000113 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGT | CTA | 1 | 2 | B.1.526 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGt | CTt | 1 | 2 | B.1.526 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGT | ATA | 1 | 2 | B.1.526 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGt | ATt | 1 | 2 | B.1.526 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.530 | 0.014286 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.576 | 0.001813 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.595 | 0.000522 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del2 | GGt | --t | 2 | 2 | B.1.628 | 0.000705 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | B.55 | 0.0059 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | C.36 | 0.001821 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGT | gTA | 1 | 2 | C.37 | 0.000116 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 2 | C.37 | 0.000116 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 2 | 2 | D.2 | 0.00015 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107X | GGT | TAA | 1 | 2 | P.1.1 | 0.000318 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107X | GgT | TgA | 1 | 2 | P.1.1 | 0.000318 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGt | CTt | 1 | 2 | P.1.10 | 0.000269 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGT | CTA | 1 | 2 | P.1.10 | 0.000269 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGt | ATt | 1 | 2 | P.1.10 | 0.000269 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGT | ATA | 1 | 2 | P.1.10 | 0.000269 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGT | CTA | 1 | 2 | P.1.12 | 0.000484 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGt | ATt | 1 | 2 | P.1.12 | 0.000484 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107I | GGT | ATA | 1 | 2 | P.1.12 | 0.000484 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGt | CTt | 1 | 2 | P.1.12 | 0.000484 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGT | CTA | 1 | 2 | P.1.14 | 0.000048 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 2 | P.1.14 | 0.000048 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | Ggt | Cgt | 1 | 2 | P.1.14 | 0.000048 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGT | gTA | 1 | 2 | P.1.14 | 0.000048 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGt | CTt | 1 | 2 | P.1.14 | 0.000048 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | CgA | 1 | 2 | P.1.14 | 0.000048 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 2 | 2 | P.3 | 0.00319 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggG | 1 | 1 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107W | GgT | TgG | 1 | 1 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | A | 0.000387 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | A.1 | 0.000282 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | A.2.5 | 0.000499 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | A.23.1 | 0.000704 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | gGt | gAt | 1 | 1 | AD.2 | 0.000219 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AE.8 | 0.000489 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107H | GGT | CAC | 1 | 1 | All | 0 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107W | GgT | TgG | 1 | 1 | All | 0 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107P | GGT | CCG | 1 | 1 | All | 0 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | AU.2 | 0.002421 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AV.1 | 0.005051 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.1 | 0.000396 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.100 | 0.000046 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.102 | 0.000027 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.105 | 0.000643 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.113 | 0.000142 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.116 | 0.000287 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.117 | 0.000085 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.118 | 0.000063 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.119 | 0.000035 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.120 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.120.2 | 0.001285 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.120.2.1 | 0.000498 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.13 | 0.000161 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.16.1 | 0.00047 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.19 | 0.00114 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.2 | 0.000356 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.2 | 0.000356 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | ggT | gg- | 1 | 1 | AY.23 | 0.00007 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.23 | 0.00007 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.23 | 0.00007 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | ggT | gg- | 1 | 1 | AY.25 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.25 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.26 | 0.000028 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.26 | 0.000028 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.30 | 0.000396 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.30 | 0.000396 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.36 | 0.000148 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | ggT | gg- | 1 | 1 | AY.39 | 0.000025 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.39 | 0.000025 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.39.1 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.4.2 | 0.000022 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del2 | gGT | g-- | 1 | 1 | AY.4.5 | 0.000107 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.42 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggG | 1 | 1 | AY.46 | 0.000104 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.46.4 | 0.000165 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.58 | 0.000907 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.59 | 0.00053 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.6 | 0.000041 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.6 | 0.000041 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.6 | 0.000041 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.61 | 0.000105 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.61 | 0.000105 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.62 | 0.000436 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.65 | 0.000533 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | ggT | gg- | 1 | 1 | AY.67 | 0.000464 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.67 | 0.000464 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.67 | 0.000464 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.70 | 0.000209 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.71 | 0.000475 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.75.1 | 0.00018 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.75.1 | 0.00018 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.78 | 0.001541 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.79 | 0.001211 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.85 | 0.000427 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.9.1 | 0.000084 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.9.1 | 0.000084 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.9.2 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.9.2 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.93 | 0.000273 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.95 | 0.000761 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggG | 1 | 1 | AY.98.1 | 0.000048 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.98.1 | 0.000048 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.99 | 0.001049 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.99.2 | 0.000092 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AZ.4 | 0.003356 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107F | GGt | TTt | 1 | 1 | B | 0.000128 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del2 | GGT | --N | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.10 | 0.001115 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.129 | 0.009174 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.135 | 0.004695 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.144 | 0.028571 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.148 | 0.008772 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.171 | 0.003676 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.176 | 0.000439 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.189 | 0.001513 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.198 | 0.001468 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.1.214 | 0.000055 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.222 | 0.000204 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.231 | 0.003096 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.237 | 0.005405 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.25 | 0.000569 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggG | 1 | 1 | B.1.1.257 | 0.009709 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.265 | 0.003155 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggG | 1 | 1 | B.1.1.277 | 0.000759 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.301 | 0.001179 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.305 | 0.003861 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.315 | 0.008475 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.317 | 0.000412 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.322 | 0.008772 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.33 | 0.000421 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.348 | 0.000796 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.374 | 0.002375 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.402 | 0.011111 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.409 | 0.002833 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.419 | 0.007407 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.432 | 0.001266 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.440 | 0.011765 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.448 | 0.002033 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del2 | GGT | --G | 1 | 1 | B.1.1.448 | 0.002033 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.456 | 0.055556 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.462 | 0.008621 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.487 | 0.005587 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | GgT | -gN | 1 | 1 | B.1.1.519 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.524 | 0.020833 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.63 | 0.000386 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.63 | 0.000386 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107H | GGT | CAC | 1 | 1 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.70 | 0.000341 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.1.70 | 0.000341 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.72 | 0.030303 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.99 | 0.02381 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.128 | 0.000635 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.160 | 0.000031 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.160 | 0.000031 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.160.14 | 0.002119 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.160.16 | 0.000929 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.177.17 | 0.000821 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.177.2 | 0.004545 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177.21 | 0.000076 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177.35 | 0.000691 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177.44 | 0.000519 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.177.44 | 0.000519 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177.51 | 0.004566 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggG | 1 | 1 | B.1.177.54 | 0.000606 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177.56 | 0.000668 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177.67 | 0.007634 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177.75 | 0.001041 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.177.81 | 0.000189 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177.84 | 0.006667 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del2 | GGT | --N | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107A | gGt | gCt | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.214.3 | 0.007143 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.218 | 0.005155 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.221 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.232 | 0.000537 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.237 | 0.004975 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.240 | 0.000216 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.243 | 0.00007 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.247 | 0.014925 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.258.14 | 0.00098 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.258.17 | 0.000104 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.258.3 | 0.001675 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.314 | 0.007519 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del2 | GGT | --G | 1 | 1 | B.1.351.5 | 0.0006 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.356 | 0.001727 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.36 | 0.000146 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.36.10 | 0.004785 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.369 | 0.000285 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.429 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | ggT | gg- | 1 | 1 | B.1.429 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggG | 1 | 1 | B.1.438.1 | 0.000107 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.462 | 0.007246 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.466.2 | 0.000391 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.468 | 0.005714 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.523 | 0.002451 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | GgT | -gN | 1 | 1 | B.1.525 | 0.000113 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.525 | 0.000113 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107Y | GGt | TAt | 1 | 1 | B.1.525 | 0.000113 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.544 | 0.006024 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.547 | 0.02439 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.561 | 0.000397 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.565 | 0.00081 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.582 | 0.000491 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.595 | 0.000261 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGt | CTt | 1 | 1 | B.1.596 | 0.000087 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | B.1.596 | 0.000087 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.599 | 0.00365 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.621.1 | 0.000506 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | GgT | -gG | 1 | 1 | B.1.623 | 0.000536 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.623 | 0.000536 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del2 | GGt | --t | 1 | 1 | B.1.625 | 0.002353 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.627 | 0.00202 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | B.23 | 0.002924 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | C.1.1 | 0.076923 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | C.35 | 0.000774 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggA | 1 | 1 | C.37 | 0.000116 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del2 | GGt | --t | 1 | 1 | C.37 | 0.000116 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | C.39 | 0.018868 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | C.40 | 0.027778 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del1 | ggT | gg- | 1 | 1 | D.2 | 0.000075 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggG | 1 | 1 | D.2 | 0.000075 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | N.4 | 0.004255 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | N.9 | 0.005952 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107K | GGT | AAA | 1 | 1 | P.1.1 | 0.000318 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107N | GGt | AAt | 1 | 1 | P.1.1 | 0.000318 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107L | GGT | CTA | 1 | 1 | P.1.1 | 0.000318 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107Y | GGt | TAt | 1 | 1 | P.1.1 | 0.000318 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107R | GgT | AgA | 1 | 1 | P.1.1 | 0.000318 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107V | gGt | gTt | 1 | 1 | P.1.12 | 0.000484 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | P.1.13 | 0.000898 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107G | ggT | ggA | 1 | 1 | P.1.14 | 0.000048 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107P | GGT | CCG | 1 | 1 | P.1.15 | 0.000232 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | P.1.16 | 0.000374 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | P.1.17.1 | 0.000875 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107S | Ggt | Agt | 1 | 1 | Q.6 | 0.006623 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107A | gGt | gCt | 1 | 1 | U.3 | 0.003861 |
ORF1ab/nsp6 | 107 | G107del | GGT | --- | 1 | 1 | Z.1 | 0.00289 |
![]() |
![]() |
CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
|