CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp5A-B : Mut = V233V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp5A-B233V233VV3496VsyngtGgtT12599710.77124710751-10753
ORF1ab/nsp5A-B233V233VV3496VsyngtGgtA12592870.22795910751-10753
ORF1ab/nsp5A-B233V233VV3496VsyngtGgtC125910.00079428110751-10753

Details of the mutation V233V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT9711259All0.000186
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA2871259All0.000055
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtC11259All0
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT568568B.1.5260.013351
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT171213B.1.1.70.000153
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA42213B.1.1.70.000038
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT110119AY.40.000171
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA9119AY.40.000014
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA6770AY.250.000403
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT370AY.250.000018
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA5959B.1.4440.936508
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA2128B.1.617.20.000079
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT628B.1.617.20.000023
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtC128B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA1223B.10.00011
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT1123B.10.000101
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA2223B.1.5750.006675
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT123B.1.5750.000303
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT89B.1.1770.000105
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA19B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT68AY.440.000037
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA28AY.440.000012
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA88B.1.20.00007
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA68P.10.000095
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT28P.10.000032
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT57AY.30.00005
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA27AY.30.00002
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT66AY.420.000241
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA66D.20.00045
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT35AY.430.000013
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA25AY.430.000009
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT55B.1.177.320.006748
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT33AY.1180.000188
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT33AY.1190.000106
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT33AY.140.000264
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA23AY.16.10.00094
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT13AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT23AY.200.000078
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA13AY.200.000039
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT33AY.39.10.000119
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA33AY.980.000237
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT23B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA13B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT33B.1.177.40.000633
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT33B.1.3200.003736
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT33B.1.3490.002144
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA12AY.1020.000027
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT12AY.1020.000027
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT22AY.1030.000012
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT22AY.1140.000462
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT22AY.230.000139
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT22AY.3.10.000171
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA22AY.34.10.00102
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT22AY.390.000049
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA12AY.470.000031
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT12AY.470.000031
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT22B.1.351.20.000605
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT22B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT22P.1.140.000096
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA11AY.340.000097
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT11AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT11AY.530.000288
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT11AY.670.000464
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA11AY.840.000437
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT11AY.860.00083
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT11AY.870.000833
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA11AY.880.000884
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT11B.1.1.3790.03125
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA11B.1.1190.010526
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA11B.1.36.220.001208
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA11B.1.3750.00082
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT11B.1.6300.005236
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT11B.400.000364
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtA11Q.30.000145
ORF1ab/nsp5A-B233V233VgtGgtT11Q.80.000165