CoV-GLUE Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp5A-B : Mut = T21I

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORF	CodonNum	Mut	ORF1abMut	MutType	RefCodon	MutCodon	AACount	CodonCount	CodonProp	Genome Position
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	T3284I	nonsyn	aCt	aTt	11765	11765	1	10115-10117

Details of the mutation T21I within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORF	CodonNum	Mut	RefCodon	MutCodon	CodonCount	AACount	Lineage	LineageCodonProp
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	11765	11765	All	0.00225
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	3237	3237	B.1.1.318	0.976765
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1218	1218	AZ.2	1
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1153	1153	AZ.1	1
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1030	1030	B.1.1.7	0.000922
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	817	817	P.1	0.012871
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	658	658	AZ.3	1
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	313	313	AY.4	0.000487
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	302	302	AY.103	0.001875
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	279	279	AY.44	0.001698
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	271	271	B.1.617.2	0.00102
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	253	253	AY.25	0.001522
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	151	151	AY.95	0.114916
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	134	134	B.1.2	0.00118
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	122	122	AZ.2.1	0.99187
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	119	119	AZ.6	1
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	116	116	AY.20	0.004508
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	94	94	B.1	0.000861
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	80	80	AY.3	0.000796
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	65	65	AY.43	0.000288
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	65	65	B.1.351	0.001932
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	59	59	B.1.526	0.001387
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	56	56	AY.99.2	0.005161
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	51	51	B.1.1	0.000925
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	46	46	B.1.525	0.005205
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	45	45	AY.118	0.002819
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	35	35	B.1.429	0.000824
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	32	32	AY.39	0.000791
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	27	27	AY.26	0.000764
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	26	26	AY.46.6	0.001877
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	25	25	B.1.243	0.00174
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	25	25	B.1.265	0.031766
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	24	24	AY.4.2	0.000521
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	24	24	B.1.617.1	0.003095
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	23	23	C.37	0.002669
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	21	21	AY.119	0.000741
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	21	21	AY.75	0.001176
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	18	18	B.1.221	0.001279
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	18	18	P.1.14	0.00086
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	17	17	AY.46	0.001769
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	17	17	AY.47	0.000529
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	17	17	R.1	0.00153
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	16	16	B.1.561	0.006352
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	15	15	B.1.1.519	0.000596
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	15	15	B.1.311	0.004119
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	14	14	AY.101	0.006866
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	14	14	AY.34	0.001358
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	14	14	P.2	0.002613
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	13	13	AY.116.1	0.004049
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	12	12	AY.113	0.001709
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	12	12	AY.114	0.002773
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	12	12	AY.29	0.000189
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	11	11	B.1.427	0.000555
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	11	11	B.1.639	0.23913
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	11	11	P.1.12	0.005324
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	11	11	P.1.15	0.002556
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	10	10	AY.100	0.00046
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	10	10	AY.42	0.000402
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	10	10	B.1.177	0.000132
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	10	10	B.1.177.21	0.000765
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	10	10	B.1.232	0.005373
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	10	10	B.1.510	0.263158
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	10	10	B.1.637	0.000731
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	9	9	AY.27	0.000582
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	9	9	B.1.177.81	0.001704
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	9	9	B.1.258.17	0.000936
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	9	9	P.1.7	0.002874
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	8	8	AY.33	0.000534
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	8	8	AY.45	0.000973
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	8	8	B.1.1.28	0.00249
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	8	8	B.1.1.374	0.019002
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	8	8	B.1.160	0.00025
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	8	8	B.1.177.4	0.001688
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	7	7	B.1.258	0.000466
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	7	7	B.1.596	0.00061
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	7	7	Q.1	0.000884
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	6	6	AT.1	0.030769
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	6	6	AY.120	0.000223
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	6	6	AY.39.1	0.000238
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	6	6	AY.9.1	0.000502
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	6	6	B.1.36.31	0.010508
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	6	6	P.1.1	0.001906
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	5	5	AY.117	0.000423
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	5	5	B.1.1.222	0.00102
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	5	5	B.1.276	0.084746
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	5	5	B.1.470	0.007022
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	5	5	B.1.626	0.028571
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	5	5	Q.8	0.000825
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	4	4	AY.110	0.000451
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	4	4	AY.3.1	0.000341
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	4	4	AY.48	0.00186
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	4	4	AY.5	0.000083
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	4	4	AY.6	0.000165
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	4	4	AY.77	0.00451
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	4	4	AY.93	0.001092
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	4	4	B.1.1.412	0.030534
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	4	4	B.1.1.515	0.08
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	4	4	B.1.241	0.003247
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	4	4	B.1.396	0.002823
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	4	4	B.1.623	0.002146
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	4	4	B.1.631	0.013468
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	4	4	Q.3	0.00058
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	3	3	A.2.5	0.001497
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	3	3	A.23.1	0.002113
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	3	3	AY.36	0.000445
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	3	3	AY.9.2	0.00011
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	3	3	B.1.258.10	0.034091
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	3	3	B.1.36.18	0.001261
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	3	3	B.1.551	0.003871
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	3	3	B.1.576	0.00272
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	3	3	B.1.628	0.001057
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	AY.107	0.000932
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	AY.120.2	0.002571
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	AY.13	0.000322
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	AY.14	0.000176
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	AY.34.1	0.00102
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	AY.38	0.000999
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	AY.39.2	0.003082
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	AY.46.2	0.001271
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	AY.46.4	0.000329
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	AY.5.3	0.000675
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	AY.55	0.001835
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	AY.81	0.003984
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	AY.98	0.000158
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	B.1.1.128	0.014184
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	B.1.1.142	0.035088
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	B.1.1.294	0.002532
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	B.1.1.306	0.000877
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	B.1.1.319	0.035088
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	B.1.1.432	0.002532
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	B.1.1.434	0.000697
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	B.1.1.528	0.009615
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	B.1.1.95	0.039216
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	B.1.160.16	0.001859
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	B.1.177.7	0.00033
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	B.1.177.86	0.000367
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	B.1.214.2	0.001199
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	B.1.240	0.000431
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	B.1.438.1	0.000215
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	B.1.577	0.001375
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	B.1.621.1	0.001012
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	C.38	0.016129
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	L.1	0.00381
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	N.5	0.003534
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	2	2	P.1.10	0.000539
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	A.2.5.1	0.004808
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	AK.1	0.012658
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	AU.1	0.001266
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	AY.1	0.000396
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	AY.102	0.000027
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	AY.106	0.000335
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	AY.116	0.000287
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	AY.16	0.00038
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	AY.24	0.000431
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	AY.29.1	0.000221
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	AY.37	0.000316
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	AY.4.4	0.000409
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	AY.52	0.000814
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	AY.54	0.000095
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	AY.57	0.000656
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	AY.59	0.00053
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	AY.67	0.000464
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	AY.69	0.000187
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	AY.7	0.000196
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	AY.92	0.000287
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	AY.98.1	0.000048
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	AZ.5	0.003509
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B	0.000128
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.1	0.000327
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.121	0.002427
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.170	0.001247
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.187	0.00885
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.207	0.001182
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.214	0.000055
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.216	0.00089
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.220	0.001859
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.228	0.003049
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.241	0.00207
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.255	0.00303
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.258	0.003257
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.284	0.000107
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.317	0.000412
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.33	0.000421
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.348	0.000796
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.361	0.045455
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.369	0.000446
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.397	0.002252
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.1.429	0.004608
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.111	0.001175
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.146	0.004237
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.177.20	0.001517
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.177.33	0.001645
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.177.43	0.001477
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.177.53	0.002392
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.177.6	0.000977
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.177.80	0.001912
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.214.3	0.007143
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.234	0.000132
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.319	0.003049
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.340	0.004292
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.351.2	0.000303
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.351.3	0.000876
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.36	0.000146
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.36.1	0.00114
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.36.16	0.001425
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.36.22	0.001208
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.36.29	0.000517
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.36.38	0.001642
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.36.7	0.004
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.369	0.000285
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.375	0.00082
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.428	0.00102
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.456	0.003268
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.466.2	0.000391
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.468	0.005714
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.575	0.000303
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.595	0.000261
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.599	0.00365
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.619	0.000871
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.621	0.000089
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.70	0.02439
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	B.1.88.1	0.004808
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	C.16	0.00106
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	C.35	0.000774
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	C.37.1	0.002618
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	D.2	0.000075
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	P.1.17	0.000162
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	P.1.2	0.001156
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	P.1.4	0.000977
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	P.6	0.003145
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	Q.4	0.000455
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	Q.7	0.001111
ORF1ab/nsp5A-B	21	T21I	aCt	aTt	1	1	Z.1	0.00289

CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk

CoV-GLUE uses sequence data from GISAID. GISAID data provided via this web application is subject to GISAID's Terms and Conditions.