CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp5A-B : Mut = L272L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp5A-B272L272LL3535LsynctGctT42562375870.88311210868-10870
ORF1ab/nsp5A-B272L272LL3535LsynCtgTtg4256241340.097128910868-10870
ORF1ab/nsp5A-B272L272LL3535LsynctGctA425627050.016564110868-10870
ORF1ab/nsp5A-B272L272LL3535LsynctGctC425621360.0031953410868-10870

Details of the mutation L272L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT3758742562All0.007189
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg413442562All0.000791
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA70542562All0.000135
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC13642562All0.000026
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1444114494AY.40.022476
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg3214494AY.40.00005
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA1214494AY.40.000019
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC914494AY.40.000014
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT45524553AY.140.400634
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg14553AY.140.000088
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT45014501B.1.177.40.949979
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT28172936B.1.1.70.002522
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg892936B.1.1.70.00008
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC162936B.1.1.70.000014
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA142936B.1.1.70.000013
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg14641464AY.480.68093
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT10141360B.1.617.20.003818
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA1721360B.1.617.20.000648
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg1711360B.1.617.20.000644
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC31360B.1.617.20.000011
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11881244B.1.3510.035315
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA551244B.1.3510.001635
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg11244B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT10191188AY.430.004515
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA1151188AY.430.00051
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg521188AY.430.00023
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC21188AY.430.000009
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg10861086B.1.1.2770.823976
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT741906B.10.006787
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg109906B.10.000998
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA53906B.10.000485
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC3906B.10.000027
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg590888B.1.20.005195
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT285888B.1.20.00251
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC13888B.1.20.000114
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT681681B.1.177.90.906791
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT443461B.1.1770.005833
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg13461B.1.1770.000171
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC3461B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA2461B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT386386B.1.177.300.969849
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT330381AY.250.001985
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg50381AY.250.000301
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA1381AY.250.000006
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT249266AY.1030.001546
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA10266AY.1030.000062
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg7266AY.1030.000043
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT234256B.1.10.004245
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC11256B.1.10.0002
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg9256B.1.10.000163
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA2256B.1.10.000036
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT252252B.1.4270.012725
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT219220B.1.1.5190.008697
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg1220B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT204204P.70.89083
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT184196P.10.002899
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg8196P.10.000126
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA3196P.10.000047
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC1196P.10.000016
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT188188AY.510.170909
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT151173AY.440.000919
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg13173AY.440.000079
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA9173AY.440.000055
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT153166AY.1020.004057
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA12166AY.1020.000318
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg1166AY.1020.000027
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT166166AY.260.004699
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg162162K.31
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT152153B.1.177.210.011623
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg1153B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA133144B.1.6370.009719
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg7144B.1.6370.000512
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT3144B.1.6370.000219
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC1144B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT109134AY.390.002694
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg18134AY.390.000445
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA7134AY.390.000173
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT95109AY.420.003822
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg14109AY.420.000563
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT97103B.1.2430.00675
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg6103B.1.2430.000418
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT8796AY.1200.003235
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg496AY.1200.000149
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC496AY.1200.000149
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA196AY.1200.000037
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT7981B.1.5250.00894
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC281B.1.5250.000226
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT6277AY.30.000617
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg1377AY.30.000129
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC177AY.30.00001
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA177AY.30.00001
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT7374AY.4.20.001583
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC174AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT4673AY.200.001788
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA2373AY.200.000894
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg473AY.200.000155
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT4669B.1.4290.001082
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg1469B.1.4290.000329
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC569B.1.4290.000118
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA469B.1.4290.000094
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT5962AY.540.005625
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg362AY.540.000286
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT3657B.1.2210.002557
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC2057B.1.2210.001421
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg157B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT5355AY.46.40.008719
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg255AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT5154AY.230.003557
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg254AY.230.000139
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA154AY.230.00007
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT5454AY.650.028785
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT4749B.1.1600.001466
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg249B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT4648AY.980.003634
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg248AY.980.000158
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT4548B.1.360.006566
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg248B.1.360.000292
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA148B.1.360.000146
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT4444AY.46.60.003177
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT4043AY.50.000826
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg243AY.50.000041
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA143AY.50.000021
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT3741B.1.6210.003275
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg441B.1.6210.000354
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2840AY.1000.001288
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg840AY.1000.000368
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA340AY.1000.000138
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC140AY.1000.000046
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT4040B.1.240.11
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT4040B.1.258.220.106667
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT3739AY.3.10.003155
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg239AY.3.10.000171
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT3438AY.1180.00213
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA338AY.1180.000188
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg138AY.1180.000063
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT3538AY.1190.001236
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg238AY.1190.000071
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA138AY.1190.000035
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT3237B.1.5260.000752
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg337B.1.5260.000071
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA237B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT3435AY.330.00227
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC135AY.330.000067
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2934C.370.003366
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg434C.370.000464
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA134C.370.000116
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2831AY.610.002934
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC131AY.610.000105
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA131AY.610.000105
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg131AY.610.000105
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg2230AY.370.006953
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT830AY.370.002528
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1430B.1.2580.000932
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg1230B.1.2580.000799
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA330B.1.2580.0002
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC130B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2929AY.1040.05754
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2929B.1.1.10.009474
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA1528AY.99.20.001382
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1028AY.99.20.000922
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg228AY.99.20.000184
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC128AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2727AY.7.10.003043
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2627AY.98.10.001259
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC127AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2626AY.60.001069
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2626AY.640.015476
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2626B.1.1.1570.023744
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2325AY.290.000363
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg125AY.290.000016
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC125AY.290.000016
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2224B.1.1.2220.004488
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA224B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1920A0.007353
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg120A0.000387
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1820AY.380.008987
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC120AY.380.000499
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg120AY.380.000499
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1620AY.460.001665
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA420AY.460.000416
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1220AY.470.000373
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg820AY.470.000249
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1618AY.750.000896
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg118AY.750.000056
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA118AY.750.000056
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1518AY.9.20.000551
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC318AY.9.20.00011
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1818B.1.3400.077253
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1617AD.20.003503
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg117AD.20.000219
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1717B.1.1.280.005291
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1717B.1.1.2970.038031
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1517B.1.617.10.001934
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg217B.1.617.10.000258
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1616AE.40.695652
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1016AY.90.000676
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg616AY.90.000406
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1316P.1.140.000621
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg316P.1.140.000143
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1515AY.1090.011095
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1515AY.7.20.008389
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1515B.1.351.20.004539
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1515B.1.466.20.005869
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT915B.1.5960.000784
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg415B.1.5960.000349
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA215B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1414AY.1210.001894
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1414B.1.1.3040.039326
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg1414B.1.1.3690.006247
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1214B.1.177.810.002272
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA114B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg114B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC1214B.1.4530.038835
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT214B.1.4530.006472
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1414B.1.5910.148936
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1313B.1.1.2160.011576
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1313Q.80.002144
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1012AY.1170.000845
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg112AY.1170.000085
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA112AY.1170.000085
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1212AY.160.004556
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT812AY.16.10.003759
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg412AY.16.10.00188
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg912AY.350.002097
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT312AY.350.000699
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1212AY.630.004642
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT812AY.920.002298
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA312AY.920.000862
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg112AY.920.000287
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1212B.1.1.4340.004183
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1212C.36.30.006807
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1112Q.30.001595
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg112Q.30.000145
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1111AY.130.001771
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1111AY.340.001067
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1011AY.450.001217
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg111AY.450.000122
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1011AY.9.10.000837
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC111AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1111B.1.5240.015471
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1111B.1.5670.036667
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1010AY.1130.001424
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT910AY.39.10.000357
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg110AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1010AZ.10.008673
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1010B.1.1.5120.285714
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1010B.1.177.570.00281
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT910B.1.3110.002471
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg110B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT810B.1.36.80.008
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA210B.1.36.80.002
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1010B.1.5600.046296
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT99AY.270.000582
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT99AY.4.50.000967
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT99AY.75.10.001623
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA79AY.840.003062
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT29AY.840.000875
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT99B.1.177.790.021077
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT99B.1.2400.00194
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT99B.1.2410.007305
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT69P.20.00112
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg29P.20.000373
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA19P.20.000187
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT78AY.4.2.10.001043
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA18AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT78AY.620.00305
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA18AY.620.000436
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT88AY.990.008395
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT88B.1.1.170.133333
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT88B.1.160.300.02381
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT68B.1.2340.000792
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg18B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC18B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT88B.1.36.160.011396
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg38D.20.000225
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT38D.20.000225
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC18D.20.000075
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA18D.20.000075
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT77A.23.10.00493
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT77AZ.20.005747
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT77B.1.1.2140.000388
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT67B.1.1.3060.00263
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA17B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT77B.1.1.500.004752
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT46AY.1080.00441
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg26AY.1080.002205
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT56AY.320.002662
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA16AY.320.000532
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT66AY.520.004886
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT66B.1.1.2430.02449
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT66B.1.1.4280.056604
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT66B.1.1.700.002046
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT66B.1.36.240.037037
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT66B.1.5230.014706
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT66B.1.5950.001566
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA36B.1.6090.001438
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT26B.1.6090.000959
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg16B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT55AY.100.00265
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC35AY.1100.000338
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg15AY.1100.000113
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT15AY.1100.000113
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT35AY.1160.00086
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA25AY.1160.000574
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT55AY.240.002155
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT45AY.46.20.002541
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC15AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT45AY.530.00115
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg15AY.530.000288
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA35AY.560.004815
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT25AY.560.00321
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT55AY.810.00996
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT55B.1.1.3480.003981
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT55B.1.1.3720.003444
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT35B.1.1.390.001529
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg25B.1.1.390.001019
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT55B.1.177.100.00439
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT55B.1.2030.3125
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg45B.1.4970.001259
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT15B.1.4970.000315
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg55K.10.119048
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT55N.50.008834
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT55P.1.170.000809
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT55R.10.00045
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44AY.116.10.001246
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44AY.4.40.001637
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44AY.700.000834
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg34AY.870.002498
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT14AY.870.000833
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT34AY.930.000819
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg14AY.930.000273
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B0.000511
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.1.1530.004381
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.1.2840.00043
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT34B.1.1.2940.003797
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg14B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT34B.1.1.3180.000905
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC14B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.1.330.001684
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.1.3730.095238
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.1.4090.011331
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.177.350.002764
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.177.860.000734
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.36.290.002069
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.3690.001141
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.5750.001214
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.80.00789
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44C.350.003096
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44P.1.10.001271
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44P.1.70.001277
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg230.111111
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT130.055556
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33AY.300.001187
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg23AY.360.000296
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT13AY.360.000148
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA23AY.46.10.002053
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT13AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA23AY.5.40.000553
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT13AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33AY.500.002398
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT23AY.680.000547
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg13AY.680.000274
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33AY.830.005172
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC23AY.950.001522
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT13AY.950.000761
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.1.100.003344
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.1.3170.001235
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.1.630.001157
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.120.024
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.160.160.002788
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.160.280.008772
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.177.120.000455
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC33B.1.177.450.001144
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.177.560.002003
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.177.70.000495
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT23B.1.177.730.001133
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg13B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.2600.010033
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.351.30.002629
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.36.180.001261
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg33B.1.5090.002597
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.621.10.001517
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.6280.001057
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33C.360.002732
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33P.1.17.10.002625
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.10.000791
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.1050.001286
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.1110.000366
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.1140.000462
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT12AY.120.000316
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg12AY.120.000316
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg22AY.120.20.002571
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.34.10.00102
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.410.000588
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.46.50.000397
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.490.00639
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.5.30.000675
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.590.001059
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.70.000392
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.730.001331
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.770.002255
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.790.002421
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.800.002257
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA12AY.850.000427
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT12AY.850.000427
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.970.003401
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.1.1890.003026
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.1.2030.033898
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.1.250.001137
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA12B.1.1.3010.001179
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT12B.1.1.3010.001179
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.1.3070.005063
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.1.3150.016949
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.1.3260.003521
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.1.3270.2
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.1.3760.011905
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.1.5230.003125
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.160.150.009901
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.1620.01005
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC12B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT12B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.177.60.001953
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC22B.1.177.600.000437
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.177.750.002081
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg22B.1.1990.008264
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.221.30.001667
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.258.170.000208
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg22B.1.3420.2
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.3440.016393
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.36.10.002281
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT12B.1.3610.001289
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg12B.1.3610.001289
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.3670.001585
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.3960.001411
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.4080.00738
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.415.10.015152
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.4160.002538
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.4650.007605
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.4700.002809
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.5770.001375
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.5970.009259
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.930.001867
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22C.160.002121
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22C.250.25
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22C.36.3.10.005435
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22L.30.007092
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22N.90.011905
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22P.1.150.000465
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22Q.10.000253
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11A.10.000282
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11A.30.002096
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg11AH.30.003802
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.180.010101
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.210.001898
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.400.000964
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.46.30.000934
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.550.000917
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.600.000938
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.660.00107
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctA11AY.690.000187
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.710.000475
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.860.00083
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.880.000884
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.890.004902
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.900.000684
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.910.00073
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.960.002075
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AZ.30.00152
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.1170.009709
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.1350.004695
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.1490.016393
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.1590.004673
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.1740.003378
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.1760.000439
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.1850.076923
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.1940.00495
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.2130.021739
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.2250.007194
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.2530.002506
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.260.005236
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg11B.1.1.2980.000862
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.3020.002075
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.3320.03125
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.3510.002793
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.3550.015385
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.3890.006061
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.3990.090909
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.4300.041667
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.4330.001425
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.440.00241
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.4420.018519
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.4800.025
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg11B.1.1.610.008772
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.890.006061
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1180.006711
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1390.000733
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.140.017544
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg11B.1.1460.004237
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1730.026316
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC11B.1.177.230.003236
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.177.770.000726
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctC11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1890.004292
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1920.009259
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.2010.005682
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.2140.003663
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.2320.000537
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg11B.1.258.40.003448
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg11B.1.2790.000514
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg11B.1.2930.0125
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.2980.002114
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.3010.005917
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.3050.002151
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.3240.001605
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.3490.000715
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.350.008475
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.36.100.004785
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.36.220.001208
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.36.390.002217
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.3620.001541
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.3890.001002
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.3910.001127
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.4360.001029
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg11B.1.4370.020833
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.4500.011364
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.4590.004082
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.4680.005714
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.5030.002488
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.5170.000427
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg11B.1.5480.035714
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.5520.015152
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.5570.05
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.5700.002941
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.596.10.009346
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.6180.004032
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.6200.000946
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.6250.002353
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg11B.1.6270.00202
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.6340.003425
ORF1ab/nsp5A-B272L272LCtgTtg11B.1.780.008547
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.840.020833
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.910.002075
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.30.000831
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.400.000364
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.6.60.000889
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11C.230.005814
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11N.60.007092
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11P.1.160.000374
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11P.30.001595