CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp5A-B : Mut = L232F

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp5A-B232L232FL3495FnonsynCttTtt10001000110748-10750

Details of the mutation L232F within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt10001000All0.000191
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt205205B.1.1.70.000184
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt113113B.1.20.000995
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt8282B.1.5960.007145
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt8080AY.40.000125
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt7373B.1.351.20.022088
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt4040B.1.617.20.000151
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt3535AY.430.000155
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt3434B.1.1.1650.523077
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt2929B.1.2650.036849
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt2323AY.470.000715
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt2020B.1.1770.000263
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt1818AY.4.20.00039
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt1818P.10.000284
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt1515AY.440.000091
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt1515B.1.5260.000353
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt1414AY.420.000563
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt1313AY.250.000078
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt1111AY.30.000109
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt1010B.10.000092
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt88B.1.3510.000238
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt77P.1.140.000335
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt66B.1.221.20.024096
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt66B.1.4290.000141
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt66B.1.6370.000438
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt55A0.001935
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt44AY.1030.000025
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt44AY.1210.000541
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt44AY.460.000416
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt33A.270.004967
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt33AY.1020.00008
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt33AY.130.000483
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt33B.1.1.4340.001046
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt33B.1.1.5190.000119
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt33B.1.177.60.00293
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt33B.1.3890.003006
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt22A.2.50.000998
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt22AY.1050.001286
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt22AY.1130.000285
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt22AY.260.000057
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt22AY.290.000032
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt22AY.330.000134
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt22AY.39.10.000079
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt22AY.510.001818
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt22B.1.1.2160.001781
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt22B.1.351.50.001199
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt22B.1.6280.000705
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt22C.360.001821
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AY.270.000065
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AY.360.000148
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AY.370.000316
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AY.50.000021
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AY.590.00053
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AY.640.000595
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AY.650.000533
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AY.70.000196
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AY.740.000116
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AY.850.000427
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AY.920.000287
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AY.950.000761
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11AZ.20.000821
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.1.450.014085
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.220.001318
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.2390.001221
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.3610.001289
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.3970.004854
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.4870.019608
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.5030.002488
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.5440.006024
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.619.10.000641
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11B.1.6250.002353
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11C.350.000774
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11C.36.30.000567
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11Q.10.000126
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11Q.80.000165
ORF1ab/nsp5A-B232L232FCttTtt11R.10.00009